Protein ID: 67458480 |
T4SS name [ID] | VirB [501] |
Gene symbol | virB4_1 |
Locus tag | RF_0088 |
Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 91953..94370 [+] |
Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | Q4UNB9 |
KEGG ID | rfe:RF_0088 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 7.9e-69, Aligned region: 194..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 1.9e-37, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 1.4e-05, Aligned region: 444..576 |
Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
>gi|67458480|ref|YP_246104.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia felis URRWXCal2] MKLFRTRAAKELRSKQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDLDIKKNVRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGARSFFNELYVSILY KPDTGGAAIVEYFLKKLRQKSNKTAWENDMKEMKENLQEMSTRVVNTFRSYGARLLGVRQTQSGSYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEARSPLGKKYAGMISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFANRTVAIGKMQLQQNRMIQSGDKATSQIAEINTALDMATSGDIGFGEHHLSLLCS ANNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLQLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LEKKDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEVDDIDLQKARVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSRISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDSTTRYFLIKQGIDAVVAKVNLDGMNNIISVL SGRVETVILLDQIREKYGNDPDKWLPIFYEAVKTL |
Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
>gi|67458392|ref|NC_007109.1|:91953-94370 Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome, complete genome ATGAAGTTATTTAGAACTAGAGCAGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGAAAGACCAACTTCGCATTTTA TTCCTTATAAATGTCATTGGGATAGTAATACTATTTTAACAAAAGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAA AATAAACGGATTTTCTTTTGAAACTGCTGATGATGAAGATTTAGACATTAAAAAGAATGTCAGAAATGCC TTACTTAAAAATATGGCTTCGGGAAATATCGTTATGTATTTCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAA TATTTGACGATACGGAATTTACTTATGATCCTACCGTAAAAGTACCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG TGCGGAATGGCGTAAGAAACATGCAGGTGCTAGGTCATTTTTTAACGAATTATATGTTAGTATTTTATAT AAGCCTGATACTGGCGGTGCTGCTATAGTTGAGTATTTTTTAAAGAAGCTTAGACAAAAATCTAATAAAA CCGCTTGGGAAAATGACATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACTAGAGTGGTTAATAC ATTCAGAAGTTACGGAGCAAGATTACTTGGAGTTCGTCAAACGCAGTCAGGTAGTTATTGTGAAATTTTA GAATTCCTTTCATCTTTAATCAATTGCGGCGATTCACCAGGTCCTATAGCATTACCGCGTGGTACTATTG ACGAATATTTACCGACTCATCGCTTATTTTTTGATTCTCGTACTATTGAAGCAAGAAGTCCGCTTGGCAA AAAATATGCCGGAATGATCAGCATACTTGAATACGGACCTAATACTTCGGCAGGAATTTTTGACGGATTT CTGCAAATGCCTTTTGAATTTGTCATGACTCAAAGCTTTGTCTTTGCTAATAGAACCGTAGCGATCGGTA AAATGCAATTACAGCAAAATAGAATGATACAATCCGGTGATAAAGCTACTTCGCAAATTGCTGAAATTAA TACGGCCCTTGATATGGCCACTAGCGGTGATATCGGTTTCGGTGAGCATCATTTATCGCTTTTATGTTCC GCGAATAATATTAAAGCTTTGGAAGATATATTATCAATGGCAGCAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTC AGCCGGTTAGAGAAAAAGTTAACATGGAACCTAGCTATTGGGGACAGTTGCCGGGAAATATGGATTATAT AGTACGTAAATCCACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTTGCCTCACAACATAATTATCCGCTCGGT AAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTACTTGATACTACTTCGGGTACGCCGTTTTATT TTAATTTCCATGTAAGGGATGTTGGACATACTCTAATTATCGGTCCAACCGGTGCCGGTAAAACAGTTCT TATGAATTTCTTATGTGCGGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGAGGA GCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAACGGAGTTTATACGGTAATTGATCCGGGATTAAAATGTAATTTTA ATCCCTTGCAGCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACATTTATTTTAGAGTGGCTTCGTGTACTTGTAAC TTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTATCTCAAGCAGTAAGCGGTAATTTTAGA TTAGAGAAAAAAGACAGAAGGCTTAGTAATGTTATAGCATTTCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTGG CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTTGGTAAAGGTTCACATGCTAAGATATTTGACAATGAAGTAGATGATAT TGATTTACAAAAAGCAAGGGTATTCGGTTTTGATATGACTGAATTACTTAAAGACCCTGTAAGCCTTGCA CCGGTATTGTTATATATTTTCCATCGCATTAATATCTCTTTAGATGGGCAGAAAACTATGATAGTACTTG ATGAAGCATGGGCTTTAATCGATAATCCGGTATTTGCACCTAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAG AAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTTGAAGATGCCGCAAAAAGTAGAATTAGTGAT ACGTTGATTCAACAAACAGCTACGCAGATTTTTTTACCTAATTTGAAAGCTACGGATATTTATCGTAGTG CATTTATGTTAAGTCAGCGAGAATATATTTTAATTAAAACTACCGACTCTACTACACGTTATTTTTTAAT AAAACAAGGAATAGATGCCGTAGTTGCTAAAGTTAACTTAGACGGTATGAATAATATAATTAGTGTTTTA TCCGGCAGGGTTGAGACTGTAATATTGCTCGATCAAATTAGAGAGAAATACGGCAATGATCCGGATAAGT GGTTACCTATATTTTATGAAGCAGTTAAAACATTATAG |