Protein ID: 59714411 |
T4SS name [ID] | VirB [213] |
Gene symbol | - |
Locus tag | VF_B0055 |
Strain | Vibrio fischeri ES114 |
Replicon | plasmid pES100 [GenBank: NC_006842] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 44803..45837 [+] |
Product | channel protein VirB6 |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q5DY49 |
KEGG ID | vfi:VF_B0055 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.1e-43, Aligned region: 40..263 |
Protein Sequence: 344 a.a. [Download] |
>gi|59714411|ref|YP_207185.1| channel protein VirB6 [Vibrio fischeri ES114] MKITVFNFIGTTIDDLTNNFIASGIGGLIDILQPFIIAGVTLYIMIRAYGQIFGKGEDLAIDLVIHGLTV IAVTTLVLNIHNYTYYVVEGLNAFASGVSGAINKTDGNIYNTLDELLESGIAQASYCFDKVGLLNDWGWG FAGIVIAGAIVTITLLSAVLIIGTKFLLTMLFVIGPLFIVFAIYPVTRRYFEGWVTKLMENALVQIFGVM IIGLSLSIISHFIYYKDASSTGVNPLGVSIQILIVSGILSWIIAQIPNLAGSLAGGFSSSSLSLAAAVAP MLAATAIGAKFLNGKNIPTGGISSETWGEQQSNQLRQGDSTSTPQATKMAQSVHDKIAEHNRNN |
Nucleotide Sequence: 1035 bp [Download] |
>gi|59714356|ref|NC_006842.1|:44803-45837 Vibrio fischeri ES114 plasmid pES100, complete sequence ATGAAAATTACCGTATTCAATTTTATTGGAACAACAATCGACGATCTAACAAACAACTTTATTGCATCAG GTATTGGGGGGTTAATTGATATATTACAACCCTTTATCATTGCAGGAGTCACCTTGTACATTATGATCAG AGCTTACGGCCAGATATTTGGTAAAGGTGAAGATCTCGCTATTGATTTAGTGATTCATGGCCTAACCGTG ATTGCCGTTACAACCTTGGTCTTAAATATTCACAATTACACTTATTATGTCGTCGAAGGACTCAATGCAT TTGCAAGTGGTGTATCAGGAGCCATCAATAAAACCGATGGAAATATCTATAATACCTTAGATGAACTTCT TGAAAGTGGCATTGCTCAAGCCTCTTATTGTTTTGATAAAGTCGGATTGCTTAATGATTGGGGATGGGGA TTTGCAGGAATAGTGATTGCAGGAGCTATCGTTACCATTACTTTGCTATCAGCTGTCCTAATTATTGGTA CTAAATTTCTTCTTACTATGTTATTCGTTATCGGACCCCTTTTTATTGTCTTTGCGATTTACCCTGTCAC CCGTCGATATTTTGAGGGATGGGTAACTAAGTTAATGGAAAACGCCTTGGTTCAAATCTTTGGGGTAATG ATCATTGGTCTATCACTCAGTATTATTAGTCATTTTATCTATTACAAAGATGCCAGTAGTACAGGAGTAA ATCCACTTGGCGTATCAATTCAAATTTTAATTGTGAGTGGCATTTTAAGTTGGATCATAGCTCAAATTCC TAATTTAGCTGGCTCACTGGCTGGTGGATTCTCATCAAGCTCTTTATCGTTAGCTGCTGCCGTTGCTCCT ATGCTTGCGGCAACTGCAATAGGAGCAAAATTTTTAAACGGTAAAAATATACCAACTGGCGGCATATCTT CTGAAACATGGGGAGAGCAACAATCGAACCAACTACGACAAGGTGATTCAACGTCAACACCACAAGCCAC CAAAATGGCTCAATCCGTTCACGATAAAATTGCAGAGCACAACCGAAACAATTAG |