| Protein ID: 350273161 |
 T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-4 |
| Locus tag | RJP_0112 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 148518..151193 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM27 |
| KEGG ID | rja:RJP_0112 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 7.9e-21, Aligned region: 521..715 |
| Protein Sequence: 891 a.a. [Download] |
| >gi|350273161|ref|YP_004884474.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MKILKSLVLLVLFMAMPAKADDAFSWMSTSFVGLKSLFGCLEVPKFTSFQEGNIGISLSKAGIWQSTGNT VQKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFSMPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTDNNSETLGTI PPDKDLDALSFTKMSDAVKYFNYSNGNSRIEVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNTLKLPNTVDNILTQELDS SIFAASALYTQSNLGDFDNRIIYSSAEQVCNMIDEERKSVCSGTGTATKYKNTDNGVIVGKPMITGAVQY FMGLINACPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVNSGSTQSSFIYYQATSGGTMDFTSD WQVSNMFSNSALMSDWSRNFSNYASFVDYINKNDWSANFLYFGRYAMIVEIGNGANSINPGDQQNIKLEY LITSDGTLPDPSVRGMPVDYNFATDAPQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIK PITYQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNLAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAVEVITRICKIAIVAFLIRE ESWSFFNTYFFSAFTDGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIA IITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLI FFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISSSNILT NNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYSLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMQDIDSVTKPI KKAAMAPARVFKDKIIDQNYKARKPEGGGEFTNKFLAERNDVKKEEGEKKE |
| Nucleotide Sequence: 2676 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:148518-151193 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATGGCGATGCCAGCTAAAGCCGATGATGCTT TTTCATGGATGTCAACCAGTTTTGTCGGGTTAAAAAGCTTATTCGGTTGTTTAGAAGTGCCTAAATTTAC AAGTTTTCAAGAGGGTAATATAGGAATTAGTTTATCTAAAGCCGGAATTTGGCAATCAACAGGTAATACT GTTCAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAATTGGTCTACTTCAGGTATTACTCCTGAACCTAGAAAATATC TAGTATTATATAGAATTGATCCAAGGTTTAGTATGCCGCAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAA ATTACAATTTGAAGCTTTAGGATTTCCTCGTTTTGTTACGGACAATAATAGTGAAACACTGGGGACTATA CCGCCTGATAAAGACCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATGCTGTTAAATATTTTAACTATT CTAACGGTAATTCGAGAATTGAAGTTAAGGCCGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTGGTAAAGATAA TTTTTTTAGCCCTAATACTCTAAAACTTCCTAATACCGTAGATAATATTTTAACACAGGAACTTGATAGC TCGATATTCGCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGAGATTTTGATAATAGAATAATTTATT CTTCTGCAGAGCAGGTGTGTAATATGATAGATGAGGAAAGAAAAAGTGTATGTAGCGGCACGGGTACTGC TACAAAGTATAAAAATACCGATAATGGAGTAATAGTCGGTAAGCCTATGATAACGGGAGCGGTACAGTAT TTCATGGGCTTAATTAATGCTTGTCCTGCTAATGCTGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTATTACGATC AAGGTAGAGGGATGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAAGGGACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTC AGGCAGTACTCAAAGTAGCTTTATATATTATCAAGCCACTAGCGGTGGTACTATGGATTTTACTAGCGAT TGGCAAGTTAGTAACATGTTTAGTAATTCAGCTTTAATGAGTGATTGGAGCCGAAATTTTTCAAATTATG CTAGTTTTGTAGATTATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTTGGTCGTTATGCGAT GATTGTTGAAATAGGTAATGGGGCAAATTCAATTAATCCTGGTGATCAACAAAATATAAAGTTAGAATAT TTAATAACGTCTGATGGTACATTACCTGATCCATCTGTTCGTGGTATGCCGGTAGATTATAACTTTGCGA CTGATGCCCCGCAAGATGGATATTTATGGTTAAGGGTTGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTAGT TAGTGTAAATTATGCTAATTATACCGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATATATAACGGTGCTATTAAA CCTATTACCTATCAGTTTAGAACTTTCAGTCAAAACTTTTATATTAAGTTAGTTAAAAATTCTGCAGTGC AGAATTTAGCTAAAGCTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGGCTAATGTTCGTTGCAGGAGCATT AAAATTAACTGCCGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATAGCTATAGTAGCTTTTTTAATTAGAGAA GAAAGTTGGAGCTTCTTTAATACATACTTCTTTAGTGCATTTACTGACGGTATTGATTTCTTTGTAACTA ACGTAGTAGGTGCTACAAGCTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATAC TAACGGTAGGATTTGGGGATTACTATTTATTGAATTATTACAGATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCT ATTATAACCATTTATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGTTATGTTATTG CATTCATAGGGGTAACTGTTATGATTTCATTGGCACCGTTTTTTATAATATTAATGTTATTTGAAAAAAC TAAAAGTTTATTTGATAATTGGATATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTACAGCCGACAATATTATTGATT TTCTTTTTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTGGTAGTTAGAGCCTGTTGGGATA CTCTTATACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAACAAATCTTGGTATTCCGATTAATTTCTCTTTTACATT ACCGTTCCTACCCGGAATACCTTTCTATGTGCCGGATGTTCCAGAAATTAGTAGCTCGAATATTCTAACG AACAATGCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTATTATTTTATTCATATTGCTTGATGTCAT ATAGTTTAGTAACTTTTGTAAATATAGTAGTTGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGAATATCAGG CAATTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCGTTATGCAGGATATAGATTCAGTAACAAAACCGATT AAAAAGGCTGCAATGGCTCCGGCTAGAGTTTTCAAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAGAA AACCGGAAGGAGGTGGTGAATTTACAAATAAATTTCTTGCTGAGCGTAATGATGTGAAGAAAGAGGAAGG AGAGAAGAAAGAATAA |