| Protein ID: 350273160 |
 T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-3 |
| Locus tag | RJP_0111 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 145446..148346 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM26 |
| KEGG ID | rja:RJP_0111 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.5e-31, Aligned region: 605..844 |
| Protein Sequence: 966 a.a. [Download] |
| >gi|350273160|ref|YP_004884473.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MQGNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKVGDSCYMRYTSDGKGGADSITGTITLNANANYVNTSK MLPDGTTLLIPDPTRYGEWLNTQVLVENSQPVNLQVVGQVSLCLAYIPKDNLQRTGAGSNLDDNGQMIPI PRINDTNNPPVSLIMDAKNNEWRNIAELYANDRVLVSVSPNFANTDATVKDAFKGVEVTKDCSENKTTYN PICGKYSVYSGEYVNACELKENYWNCQVTWRCPAWWEQVGCDWGALGCNYYCDKIRECTEKCMAWVNITR PAPENYLDDESFTFSWSDNTGKLFIDYSALQCSYNANIPPDDKCPDSVRDRSPKDKDYIGGVNCTSGICS DGDFQKNRRFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDAGSVSQALPSKLEFAKFVADTDQPPDYKDKDGKYLYKVI YNIPFNSNIAKSYLQYRLWSPTSQDSSKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFDDRGRVQYIIVKPSEN PNTSGKTYSPQGISVDSEGKYSFNANEAGYIWMKILNDPGNNLRDYKDSEGSYKVHFSTSLKVGSFTIKV MNPLLQLFKTKVQGAATSIFKNMVCYKANDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFAKINQKELVI RIAKIGVVSGLMNGSTFEFFNNYLFDTITNFSDSIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAVMSKIFFSQT FIAQLLALLSLGLSGIIYFIITFIAVGIVIITALRAVAVYIMAFMATCILIGIAPLFISFLLFDFTRYLF DNWVRFTIRYMIEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFCIN WFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVVKLTSAVGPSATEIGGKMSHDAGQKALS SIGMDYKTRQGITGRAEARLKQRNKTLDQAEKNRKNTPKEGGEKTNEEPPKPETPK |
| Nucleotide Sequence: 2901 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:145446-148346 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGCAGGGTAACTTATTAAAAGTTTTAGGAGTACTTGCTATAGTAGCAACGTTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAGTCGGTGACAGCTGCTACATGAGATATACGTCAGATGGTAA AGGAGGGGCGGATTCAATAACCGGTACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATGTAAACACTTCTAAG ATGTTGCCCGACGGCACGACTCTGCTTATTCCTGATCCTACTCGTTACGGTGAATGGCTAAATACTCAGG TGCTAGTAGAAAACAGCCAACCGGTGAATTTACAAGTGGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATAT ACCGAAAGATAATTTACAACGTACAGGGGCTGGATCTAATTTAGACGATAACGGTCAAATGATTCCGATT CCTCGTATTAACGATACAAATAATCCACCTGTCTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATAATGAATGGCGTA ATATTGCCGAATTATACGCCAATGATAGAGTTTTAGTGTCCGTATCTCCTAATTTTGCTAATACGGATGC GACAGTTAAGGATGCTTTTAAAGGTGTTGAAGTTACGAAAGATTGTTCAGAGAATAAAACTACTTATAAT CCAATTTGTGGAAAATATTCTGTTTATTCAGGTGAGTATGTCAATGCTTGCGAGTTAAAAGAGAATTATT GGAATTGTCAAGTCACATGGAGGTGCCCTGCCTGGTGGGAGCAAGTAGGTTGCGACTGGGGAGCATTAGG CTGTAATTATTATTGTGATAAGATACGAGAATGTACAGAGAAATGTATGGCTTGGGTTAATATAACTAGA CCAGCACCAGAAAACTACCTAGATGATGAGAGTTTTACATTTTCGTGGTCTGACAACACAGGTAAATTAT TTATCGACTATTCAGCCCTTCAATGTTCTTATAATGCTAATATTCCTCCAGATGATAAATGTCCTGATAG TGTTCGCGATCGTAGTCCAAAAGATAAAGATTATATTGGAGGTGTAAATTGTACTTCGGGCATATGTAGT GATGGAGATTTTCAAAAGAATCGGAGATTTTGGTATACGGCGGACGGTAAAGGAGGCAAAGGACCAACTG GATTAATATATCAAATGAATGATGCGGGTTCTGTAAGTCAAGCTCTGCCTTCTAAGCTAGAATTTGCTAA ATTTGTTGCAGATACAGATCAACCGCCTGACTATAAAGATAAAGACGGTAAATATTTATATAAAGTTATA TATAATATACCTTTTAACAGTAATATTGCAAAAAGTTATTTACAATATAGGCTGTGGTCTCCTACCTCAC AAGATAGTAGTAAGAATACGGGAGGATACGTTTTAAATATTAAACAGACTAAATGCTATAGAGAAAACGG TAATAGTTTTAATGATACTTTTGATGATCGAGGACGAGTGCAATACATAATAGTAAAGCCTTCGGAAAAC CCGAATACTAGCGGTAAAACCTATTCACCTCAAGGAATTAGCGTTGATAGTGAAGGTAAATATAGCTTTA ACGCAAATGAGGCGGGTTATATATGGATGAAAATTCTAAATGATCCTGGTAATAATTTAAGGGACTATAA AGATAGTGAAGGTAGCTATAAAGTACATTTCTCAACATCCTTAAAAGTAGGAAGTTTTACTATTAAAGTA ATGAATCCGTTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTGCAAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAAAAATATGG TATGTTATAAAGCTAATGATAGCTCATCCTGTACTAACTTTTTTACCTATATTAAAGCAATTTTAATTCT GTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTTTTGCTTGGTTTTGCTAAGATAAACCAAAAAGAGCTAGTAATT AGAATAGCAAAAATCGGGGTAGTTAGCGGACTTATGAACGGTAGTACCTTTGAATTTTTCAATAACTATC TTTTTGATACAATTACCAATTTTTCAGACTCAATTATTGCTAATATGAGTGGATATAGTTTGTTTACTTC TACTAATACTATTTCTAATCCTTTCATGTTTTTAGATGCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACC TTTATCGCTCAATTACTTGCACTTCTTTCTCTTGGGCTTAGCGGTATTATATATTTTATAATTACTTTTA TTGCGGTTGGTATAGTAATTATTACGGCGCTTAGAGCTGTTGCCGTTTATATTATGGCATTTATGGCAAC TTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTATTTATTT GATAATTGGGTGAGGTTTACGATCCGCTATATGATAGAACCGGTAGTTATGATGGCAGGTATTATAGTGC TAACACAACTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTTAGGTTATAGCGTGTGTTGGAAATGTGCTTTACC GATAAAAATTCCGTTTATCGGTACTATTTTACCTATTGCCTTGCTGAATGTACCTATCTTCTGTATTAAT TGGTTTGCCCCTTGGGGAATGGATTATATGTCGGGTATGATGGGAGTAAATATGCAAAATATCGTAGCTC TAGTTATTATTGCTTACGGTATGTACGGTTATGTCGAATTTTCAGGACGTATGGTAGTAAAATTAACTAG TGCTGTTGGGCCTTCGGCTACTGAAATTGGTGGTAAAATGTCTCATGATGCAGGACAAAAAGCATTAAGT TCAATAGGAATGGATTATAAAACAAGACAAGGTATTACCGGCAGAGCGGAAGCACGATTAAAACAACGCA ATAAGACATTAGATCAGGCTGAGAAAAATAGGAAAAATACGCCAAAAGAAGGGGGCGAAAAGACAAATGA AGAACCACCTAAACCTGAAACACCGAAATAG |