| Protein ID: 350273159 |
 T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-2 |
| Locus tag | RJP_0110 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 143424..145439 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM25 |
| KEGG ID | rja:RJP_0110 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.3e-14, Aligned region: 409..495 |
| Protein Sequence: 671 a.a. [Download] |
| >gi|350273159|ref|YP_004884472.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MKTLKTLKIFIIVCIASVSLASFAGFGESCSSLPTTLDGYLETDTAYGYIIRNIDMKDPRGNCNSVASSI TFCFKNVEGSSSPCTMYTLNEGDSKKISDLSTDNNPDLGANPVLKNIVLTVKKWDNDLCLVMPTSRGPMP VACKSLSATPTSPPSEDENCNIGKNCYTGANYSQSLINFSGLAVQCLSETLNKIFFAGKSCSAQDQNSRI TNLAAFSTFQGYLKRIIGAALILYTMFFAFNMALNTEYASTEKIALFVIKFLFVAYFSLGLGPLDFSGGQ PTKENGMLKYGLPLLTGAAPDFAQMIFNAAGSRGLCQFDNSKYKDGYKFYGLWDAIDCRIGYYLGLDLLY NIDKNGVLGNVVGNGPRGNNIPIPNFDPDGKNDRPKDLSKAGALRFFTVMFGFFMAGNVIILAAGLVFSV IFLSILLYFITHYLVCMITIYVMTYISPIFIPMALFTRTKAYFDGWLKVCISCALQPAIVAGFIALLITM YDSAIFKNCEFLRYDYEKGDIRFSTFELRLPVSGADQCQESFGYKMLEYYAGKGWEEHLLILFPIKSIVR DVVSILAELLCVLVFSVIFYYFSKSIGRFASDLTNGPNMDAVTASPTKIVGLVKKGAAFLKDAAMASQGK PLVGDKPGVGGKRKEGKQQGGDLASGTGEGADLASGSGGGK |
| Nucleotide Sequence: 2016 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:143424-145439 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATAGTTTGTATAGCGTCTGTAAGCTTAGCTAGCTTTG CCGGCTTTGGAGAATCATGTTCTAGTTTACCGACTACTTTAGATGGGTATTTAGAAACGGACACGGCATA TGGCTATATAATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCAAGAGGTAATTGTAACTCAGTTGCGTCTAGTATA ACGTTTTGTTTTAAAAATGTAGAAGGTAGTAGTAGCCCTTGCACCATGTATACTTTAAATGAAGGTGACT CTAAAAAGATTAGTGATTTAAGTACCGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTAAAGAATAT CGTTTTAACGGTTAAAAAATGGGATAATGATCTATGTTTAGTTATGCCTACGTCAAGGGGACCGATGCCG GTAGCATGTAAATCTTTGAGTGCTACACCGACTTCACCTCCTTCTGAGGATGAGAATTGTAATATAGGAA AAAATTGCTATACGGGAGCAAATTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT GAGCGAAACGCTTAATAAAATATTTTTTGCTGGAAAGAGTTGTAGTGCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA ACTAATCTTGCTGCTTTTTCTACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGAATTATAGGTGCGGCATTAATTCTTT ATACTATGTTTTTTGCCTTTAATATGGCTCTAAATACAGAATATGCAAGTACTGAAAAAATAGCTCTTTT TGTAATAAAATTCTTATTTGTTGCTTATTTTTCTCTCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGCGGTGGTCAG CCGACAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATATGGATTACCTCTTTTGACAGGAGCAGCACCGGACTTTGCGC AGATGATCTTTAATGCAGCAGGTTCTAGAGGATTATGTCAATTTGATAATTCAAAGTATAAGGACGGTTA TAAATTTTACGGTTTATGGGACGCGATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGCTTGGATTTACTTTAT AATATAGATAAGAATGGAGTGTTAGGGAATGTGGTAGGTAATGGTCCCCGTGGTAATAATATACCTATAC CTAATTTTGATCCTGATGGCAAAAATGACAGACCGAAGGATTTAAGTAAAGCAGGAGCACTTAGATTTTT TACCGTTATGTTTGGATTCTTTATGGCCGGAAACGTTATTATACTTGCAGCAGGTTTAGTATTTTCTGTA ATATTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATTTAGTTTGCATGATTACTATTTACGTTATGA CATATATTTCTCCTATATTCATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGACGGGTGGCT AAAAGTATGTATTTCATGTGCATTGCAGCCGGCAATAGTAGCAGGTTTTATAGCTTTATTAATAACTATG TATGATTCCGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCCTTAGATATGATTATGAAAAAGGGGATATTAGATTTA GTACTTTTGAGTTAAGGCTTCCTGTTAGCGGGGCAGATCAATGTCAGGAAAGTTTTGGATATAAAATGTT AGAATATTATGCAGGTAAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTGATACTTTTTCCAATAAAATCAATTGTTAGA GATGTTGTATCTATTTTAGCGGAACTTTTATGCGTATTAGTATTTTCGGTTATTTTTTATTACTTCTCTA AATCTATAGGACGATTTGCTTCTGATTTAACTAATGGTCCTAATATGGATGCAGTAACGGCAAGTCCCAC TAAAATCGTTGGTTTAGTAAAGAAAGGAGCAGCCTTCCTTAAGGATGCTGCTATGGCTTCGCAAGGTAAG CCGCTGGTAGGAGATAAGCCGGGTGTTGGAGGTAAGCGTAAAGAGGGAAAGCAGCAAGGCGGGGATTTAG CAAGCGGCACAGGCGAAGGAGCTGATTTAGCAAGCGGTTCGGGTGGAGGTAAATGA |