| Protein ID: 350273158 |
 T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-1 |
| Locus tag | RJP_0109 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 140435..143437 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM24 |
| KEGG ID | rja:RJP_0109 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 3.1e-12, Aligned region: 504..579 |
| Protein Sequence: 1000 a.a. [Download] |
| >gi|350273158|ref|YP_004884471.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MKLFPRSILITLVLSFALNLGLVTKTHAKDTLDSIIDILSGLTCETQGVGDLLRSEFSHTCIVAPFFTFA VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCARENRIDPKNPELRFALCNNAKLIVSRAKSVA ESALAIAKAVLTGSDPWDDIKTAWANKKKEYHVPYSGKPGDDGFAFDLGFPVIYWKVIQDKDRICVSTKG FTGDVPVGCKYMKEPFPKSMYNNFMDVADKDFIEDPNKTPTDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAVVM TSPLIECMRQMIARLLISKDVCSFDNVSQVVNLVSRQDSAFFQFQVGMYKIVTAFLTLYVMFFGFKLLLA GEVPPKSEYINFILKMIFVTYFSIGINITPGNGSPYDRLDGMIQWAFPFLLDGINGLASWVMNAAPSGLC KFNNLSYDGTVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENAYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLLIPAIIS GNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFSYTRNYFDSWVKLMISFLLQ PMVVVTFMITMFSVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKIQGGITSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDAVE SCQNSLGYMLNNPITTAFNFAKDSVSEIVDSKPGNTPTDKFLAKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKIK NILLALVTACFTLYLMYNFSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAVLATAGAATKGGDQIASR GGVGDLKAGQGGGASDLEVGKGGLPNDNIAASGGTSAPTVTTPTASSSVATSSPKTVSSEARSDVVTPPA PTEAVSPPPASIRTSISTPAPQSNIAAESVGKIIRDNNQESKKEIDNTPPSQEKVDNAAPHEKVDSTSKG TGVIDYSFNLKEHDNPTGIKQIRENAEIRDKRVKVEKAWNELIASGGGRVREQEEGEISERCTNAEKVWD ELVKSGVVTEKKDNSSNENS |
| Nucleotide Sequence: 3003 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:140435-143437 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGAAATTATTTCCTCGTAGTATACTTATAACATTAGTATTAAGCTTTGCCCTAAATTTAGGGCTAGTTA CTAAAACTCATGCTAAAGATACTCTTGATAGCATTATAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACCCA AGGCGTAGGCGATTTGCTGCGTTCTGAATTTTCTCATACATGTATTGTTGCTCCGTTCTTTACTTTTGCG GTAATGAATCTTGTCTCTCCCGTTTTATACATGAATACGTTTTTAAAGCTTAAAATAAACGACAGTGATT TATTTAACGATAGTAACTTTGGGAATTTCCCCGGAGGTCAATGTGCTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA AAATCCAGAATTACGCTTTGCTTTATGTAATAATGCTAAATTAATTGTATCTCGGGCAAAATCTGTTGCA GAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTCTTAACAGGGAGCGACCCTTGGGATGATATAAAGACAGCGT GGGCAAATAAAAAAAAGGAATATCATGTTCCATATAGTGGTAAGCCCGGTGATGACGGTTTTGCATTTGA TTTAGGCTTTCCTGTAATATATTGGAAAGTTATTCAAGATAAAGATAGAATATGCGTATCGACAAAAGGA TTTACAGGAGACGTTCCCGTCGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCAAAATCCATGTATAATAACT TTATGGATGTAGCAGATAAGGATTTTATTGAGGATCCAAATAAAACTCCCACCGATCCTTTAGCTTTAGT TTCCTGTAGTGCAGCGGGTGATGGATGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAGTAGTCATG ACTTCTCCTCTTATAGAATGTATGAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGATGTTTGTAGTT TTGATAATGTAAGCCAAGTGGTTAATTTGGTTTCAAGGCAAGATAGTGCATTCTTTCAGTTTCAAGTAGG AATGTATAAAATAGTTACGGCTTTTCTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGCTTTAAACTATTACTTGCA GGTGAAGTGCCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATGATATTCGTAACTTATTTTTCAA TAGGAATTAATATAACCCCTGGTAATGGTTCTCCGTATGACCGGTTAGATGGCATGATTCAGTGGGCGTT TCCTTTCTTACTTGACGGTATAAACGGTTTAGCAAGTTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCCGGTTTATGT AAATTTAACAATCTTTCTTATGACGGTACCGTTTCTTATATTGCATTATGGGATGCATTAGATTGTAGGG TAGCTCATTATTTAGGGCTTGATATATTATCTACGTTACTTGTCGAAAATGCTTATCGCAGTCATGATTT TTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCTCCACCATATATTTATTTGCTAATTCCGGCGATAATCTCC GGTAATATGATGTTGGTGTCACTCGCTCTTTCTTATCCGTTACTTGTGATTTCGGTTGCTGCCTTTATGG TTAATGCAACGATTATGTGTATGATATCTATAGTAATACTCGGTATTTTGGCTCCTCTTTTTGTACCTAT GTTTTTATTCTCATATACAAGAAATTATTTTGATAGCTGGGTTAAACTAATGATCTCGTTCTTGCTACAA CCTATGGTGGTAGTTACTTTTATGATCACGATGTTTTCGGTATATGATTATGGTTTCTACGGTAAATGTC AATATAAGAGCAAATTAATTCACAATAGTATAGAAGACAAAATTCAAGGTGGCATTACTTCTAAGAGGGA TGTTTTAATATTTTACATTAATAATGATTGGGATGATACGTCACAATATCCTGATAAAGATGCCGTAGAA AGCTGTCAAAATAGTTTAGGTTATATGTTAAATAACCCTATTACCACGGCATTTAACTTTGCAAAAGATA GTGTAAGTGAAATTGTTGATAGTAAACCGGGTAATACCCCTACCGATAAATTTCTTGCTAAATTCCAGTT TTTATCAGGAGTAGTTTTGGGTCCCGGAATGTTTTTTATGTCTCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATTAAA AATATTTTGCTTGCGTTAGTTACGGCATGTTTTACATTGTATTTGATGTATAATTTTAGTAGTCAGTTAG CTGAATTTGCTGCAGATATGACGGAAGGAGTAGCTCTTAATAATGTTGCTATAAAACCGCAAGCAATATT TAAGGCAGCTATGGCAGTACTTGCTACTGCGGGTGCTGCAACTAAGGGGGGCGATCAGATAGCAAGTAGA GGAGGAGTTGGTGATTTAAAAGCTGGTCAAGGTGGAGGAGCAAGTGATTTAGAGGTAGGGAAAGGCGGAC TACCAAATGATAATATTGCTGCAAGCGGAGGTACGTCGGCACCTACGGTAACAACGCCGACAGCTTCGTC TTCTGTAGCAACTTCTAGCCCAAAAACTGTAAGTAGTGAAGCAAGATCAGATGTTGTTACTCCTCCTGCT CCTACAGAAGCTGTTTCACCACCGCCTGCTAGTATTAGAACTTCTATTTCTACACCTGCACCACAAAGTA ATATTGCAGCTGAAAGTGTTGGAAAAATCATAAGAGATAATAATCAAGAAAGTAAAAAAGAGATTGATAA TACTCCGCCTTCACAGGAAAAAGTTGATAATGCAGCTCCACACGAAAAAGTTGACAGCACAAGTAAAGGT ACAGGAGTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGATAATCCGACAGGCATAAAACAGATACGGG AAAATGCAGAGATTCGAGATAAACGTGTAAAAGTAGAAAAAGCATGGAATGAACTAATAGCAAGCGGAGG AGGAAGAGTAAGAGAACAAGAAGAAGGAGAAATATCAGAACGATGTACAAATGCTGAAAAGGTATGGGAT GAGTTAGTAAAAAGTGGCGTAGTAACAGAAAAAAAAGATAATAGTTCTAATGAAAACTCTTAA |
| Protein ID: 350273159 |
| T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-2 |
| Locus tag | RJP_0110 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 143424..145439 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM25 |
| KEGG ID | rja:RJP_0110 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.3e-14, Aligned region: 409..495 |
| Protein Sequence: 671 a.a. [Download] |
| >gi|350273159|ref|YP_004884472.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MKTLKTLKIFIIVCIASVSLASFAGFGESCSSLPTTLDGYLETDTAYGYIIRNIDMKDPRGNCNSVASSI TFCFKNVEGSSSPCTMYTLNEGDSKKISDLSTDNNPDLGANPVLKNIVLTVKKWDNDLCLVMPTSRGPMP VACKSLSATPTSPPSEDENCNIGKNCYTGANYSQSLINFSGLAVQCLSETLNKIFFAGKSCSAQDQNSRI TNLAAFSTFQGYLKRIIGAALILYTMFFAFNMALNTEYASTEKIALFVIKFLFVAYFSLGLGPLDFSGGQ PTKENGMLKYGLPLLTGAAPDFAQMIFNAAGSRGLCQFDNSKYKDGYKFYGLWDAIDCRIGYYLGLDLLY NIDKNGVLGNVVGNGPRGNNIPIPNFDPDGKNDRPKDLSKAGALRFFTVMFGFFMAGNVIILAAGLVFSV IFLSILLYFITHYLVCMITIYVMTYISPIFIPMALFTRTKAYFDGWLKVCISCALQPAIVAGFIALLITM YDSAIFKNCEFLRYDYEKGDIRFSTFELRLPVSGADQCQESFGYKMLEYYAGKGWEEHLLILFPIKSIVR DVVSILAELLCVLVFSVIFYYFSKSIGRFASDLTNGPNMDAVTASPTKIVGLVKKGAAFLKDAAMASQGK PLVGDKPGVGGKRKEGKQQGGDLASGTGEGADLASGSGGGK |
| Nucleotide Sequence: 2016 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:143424-145439 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATAGTTTGTATAGCGTCTGTAAGCTTAGCTAGCTTTG CCGGCTTTGGAGAATCATGTTCTAGTTTACCGACTACTTTAGATGGGTATTTAGAAACGGACACGGCATA TGGCTATATAATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCAAGAGGTAATTGTAACTCAGTTGCGTCTAGTATA ACGTTTTGTTTTAAAAATGTAGAAGGTAGTAGTAGCCCTTGCACCATGTATACTTTAAATGAAGGTGACT CTAAAAAGATTAGTGATTTAAGTACCGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTAAAGAATAT CGTTTTAACGGTTAAAAAATGGGATAATGATCTATGTTTAGTTATGCCTACGTCAAGGGGACCGATGCCG GTAGCATGTAAATCTTTGAGTGCTACACCGACTTCACCTCCTTCTGAGGATGAGAATTGTAATATAGGAA AAAATTGCTATACGGGAGCAAATTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT GAGCGAAACGCTTAATAAAATATTTTTTGCTGGAAAGAGTTGTAGTGCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA ACTAATCTTGCTGCTTTTTCTACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGAATTATAGGTGCGGCATTAATTCTTT ATACTATGTTTTTTGCCTTTAATATGGCTCTAAATACAGAATATGCAAGTACTGAAAAAATAGCTCTTTT TGTAATAAAATTCTTATTTGTTGCTTATTTTTCTCTCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGCGGTGGTCAG CCGACAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATATGGATTACCTCTTTTGACAGGAGCAGCACCGGACTTTGCGC AGATGATCTTTAATGCAGCAGGTTCTAGAGGATTATGTCAATTTGATAATTCAAAGTATAAGGACGGTTA TAAATTTTACGGTTTATGGGACGCGATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGCTTGGATTTACTTTAT AATATAGATAAGAATGGAGTGTTAGGGAATGTGGTAGGTAATGGTCCCCGTGGTAATAATATACCTATAC CTAATTTTGATCCTGATGGCAAAAATGACAGACCGAAGGATTTAAGTAAAGCAGGAGCACTTAGATTTTT TACCGTTATGTTTGGATTCTTTATGGCCGGAAACGTTATTATACTTGCAGCAGGTTTAGTATTTTCTGTA ATATTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATTTAGTTTGCATGATTACTATTTACGTTATGA CATATATTTCTCCTATATTCATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGACGGGTGGCT AAAAGTATGTATTTCATGTGCATTGCAGCCGGCAATAGTAGCAGGTTTTATAGCTTTATTAATAACTATG TATGATTCCGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCCTTAGATATGATTATGAAAAAGGGGATATTAGATTTA GTACTTTTGAGTTAAGGCTTCCTGTTAGCGGGGCAGATCAATGTCAGGAAAGTTTTGGATATAAAATGTT AGAATATTATGCAGGTAAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTGATACTTTTTCCAATAAAATCAATTGTTAGA GATGTTGTATCTATTTTAGCGGAACTTTTATGCGTATTAGTATTTTCGGTTATTTTTTATTACTTCTCTA AATCTATAGGACGATTTGCTTCTGATTTAACTAATGGTCCTAATATGGATGCAGTAACGGCAAGTCCCAC TAAAATCGTTGGTTTAGTAAAGAAAGGAGCAGCCTTCCTTAAGGATGCTGCTATGGCTTCGCAAGGTAAG CCGCTGGTAGGAGATAAGCCGGGTGTTGGAGGTAAGCGTAAAGAGGGAAAGCAGCAAGGCGGGGATTTAG CAAGCGGCACAGGCGAAGGAGCTGATTTAGCAAGCGGTTCGGGTGGAGGTAAATGA |
| Protein ID: 350273160 |
| T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-3 |
| Locus tag | RJP_0111 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 145446..148346 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM26 |
| KEGG ID | rja:RJP_0111 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.5e-31, Aligned region: 605..844 |
| Protein Sequence: 966 a.a. [Download] |
| >gi|350273160|ref|YP_004884473.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MQGNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKVGDSCYMRYTSDGKGGADSITGTITLNANANYVNTSK MLPDGTTLLIPDPTRYGEWLNTQVLVENSQPVNLQVVGQVSLCLAYIPKDNLQRTGAGSNLDDNGQMIPI PRINDTNNPPVSLIMDAKNNEWRNIAELYANDRVLVSVSPNFANTDATVKDAFKGVEVTKDCSENKTTYN PICGKYSVYSGEYVNACELKENYWNCQVTWRCPAWWEQVGCDWGALGCNYYCDKIRECTEKCMAWVNITR PAPENYLDDESFTFSWSDNTGKLFIDYSALQCSYNANIPPDDKCPDSVRDRSPKDKDYIGGVNCTSGICS DGDFQKNRRFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDAGSVSQALPSKLEFAKFVADTDQPPDYKDKDGKYLYKVI YNIPFNSNIAKSYLQYRLWSPTSQDSSKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFDDRGRVQYIIVKPSEN PNTSGKTYSPQGISVDSEGKYSFNANEAGYIWMKILNDPGNNLRDYKDSEGSYKVHFSTSLKVGSFTIKV MNPLLQLFKTKVQGAATSIFKNMVCYKANDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFAKINQKELVI RIAKIGVVSGLMNGSTFEFFNNYLFDTITNFSDSIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAVMSKIFFSQT FIAQLLALLSLGLSGIIYFIITFIAVGIVIITALRAVAVYIMAFMATCILIGIAPLFISFLLFDFTRYLF DNWVRFTIRYMIEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFCIN WFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVVKLTSAVGPSATEIGGKMSHDAGQKALS SIGMDYKTRQGITGRAEARLKQRNKTLDQAEKNRKNTPKEGGEKTNEEPPKPETPK |
| Nucleotide Sequence: 2901 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:145446-148346 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGCAGGGTAACTTATTAAAAGTTTTAGGAGTACTTGCTATAGTAGCAACGTTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAGTCGGTGACAGCTGCTACATGAGATATACGTCAGATGGTAA AGGAGGGGCGGATTCAATAACCGGTACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATGTAAACACTTCTAAG ATGTTGCCCGACGGCACGACTCTGCTTATTCCTGATCCTACTCGTTACGGTGAATGGCTAAATACTCAGG TGCTAGTAGAAAACAGCCAACCGGTGAATTTACAAGTGGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATAT ACCGAAAGATAATTTACAACGTACAGGGGCTGGATCTAATTTAGACGATAACGGTCAAATGATTCCGATT CCTCGTATTAACGATACAAATAATCCACCTGTCTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATAATGAATGGCGTA ATATTGCCGAATTATACGCCAATGATAGAGTTTTAGTGTCCGTATCTCCTAATTTTGCTAATACGGATGC GACAGTTAAGGATGCTTTTAAAGGTGTTGAAGTTACGAAAGATTGTTCAGAGAATAAAACTACTTATAAT CCAATTTGTGGAAAATATTCTGTTTATTCAGGTGAGTATGTCAATGCTTGCGAGTTAAAAGAGAATTATT GGAATTGTCAAGTCACATGGAGGTGCCCTGCCTGGTGGGAGCAAGTAGGTTGCGACTGGGGAGCATTAGG CTGTAATTATTATTGTGATAAGATACGAGAATGTACAGAGAAATGTATGGCTTGGGTTAATATAACTAGA CCAGCACCAGAAAACTACCTAGATGATGAGAGTTTTACATTTTCGTGGTCTGACAACACAGGTAAATTAT TTATCGACTATTCAGCCCTTCAATGTTCTTATAATGCTAATATTCCTCCAGATGATAAATGTCCTGATAG TGTTCGCGATCGTAGTCCAAAAGATAAAGATTATATTGGAGGTGTAAATTGTACTTCGGGCATATGTAGT GATGGAGATTTTCAAAAGAATCGGAGATTTTGGTATACGGCGGACGGTAAAGGAGGCAAAGGACCAACTG GATTAATATATCAAATGAATGATGCGGGTTCTGTAAGTCAAGCTCTGCCTTCTAAGCTAGAATTTGCTAA ATTTGTTGCAGATACAGATCAACCGCCTGACTATAAAGATAAAGACGGTAAATATTTATATAAAGTTATA TATAATATACCTTTTAACAGTAATATTGCAAAAAGTTATTTACAATATAGGCTGTGGTCTCCTACCTCAC AAGATAGTAGTAAGAATACGGGAGGATACGTTTTAAATATTAAACAGACTAAATGCTATAGAGAAAACGG TAATAGTTTTAATGATACTTTTGATGATCGAGGACGAGTGCAATACATAATAGTAAAGCCTTCGGAAAAC CCGAATACTAGCGGTAAAACCTATTCACCTCAAGGAATTAGCGTTGATAGTGAAGGTAAATATAGCTTTA ACGCAAATGAGGCGGGTTATATATGGATGAAAATTCTAAATGATCCTGGTAATAATTTAAGGGACTATAA AGATAGTGAAGGTAGCTATAAAGTACATTTCTCAACATCCTTAAAAGTAGGAAGTTTTACTATTAAAGTA ATGAATCCGTTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTGCAAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAAAAATATGG TATGTTATAAAGCTAATGATAGCTCATCCTGTACTAACTTTTTTACCTATATTAAAGCAATTTTAATTCT GTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTTTTGCTTGGTTTTGCTAAGATAAACCAAAAAGAGCTAGTAATT AGAATAGCAAAAATCGGGGTAGTTAGCGGACTTATGAACGGTAGTACCTTTGAATTTTTCAATAACTATC TTTTTGATACAATTACCAATTTTTCAGACTCAATTATTGCTAATATGAGTGGATATAGTTTGTTTACTTC TACTAATACTATTTCTAATCCTTTCATGTTTTTAGATGCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACC TTTATCGCTCAATTACTTGCACTTCTTTCTCTTGGGCTTAGCGGTATTATATATTTTATAATTACTTTTA TTGCGGTTGGTATAGTAATTATTACGGCGCTTAGAGCTGTTGCCGTTTATATTATGGCATTTATGGCAAC TTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTATTTATTT GATAATTGGGTGAGGTTTACGATCCGCTATATGATAGAACCGGTAGTTATGATGGCAGGTATTATAGTGC TAACACAACTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTTAGGTTATAGCGTGTGTTGGAAATGTGCTTTACC GATAAAAATTCCGTTTATCGGTACTATTTTACCTATTGCCTTGCTGAATGTACCTATCTTCTGTATTAAT TGGTTTGCCCCTTGGGGAATGGATTATATGTCGGGTATGATGGGAGTAAATATGCAAAATATCGTAGCTC TAGTTATTATTGCTTACGGTATGTACGGTTATGTCGAATTTTCAGGACGTATGGTAGTAAAATTAACTAG TGCTGTTGGGCCTTCGGCTACTGAAATTGGTGGTAAAATGTCTCATGATGCAGGACAAAAAGCATTAAGT TCAATAGGAATGGATTATAAAACAAGACAAGGTATTACCGGCAGAGCGGAAGCACGATTAAAACAACGCA ATAAGACATTAGATCAGGCTGAGAAAAATAGGAAAAATACGCCAAAAGAAGGGGGCGAAAAGACAAATGA AGAACCACCTAAACCTGAAACACCGAAATAG |
| Protein ID: 350273161 |
| T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-4 |
| Locus tag | RJP_0112 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 148518..151193 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM27 |
| KEGG ID | rja:RJP_0112 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 7.9e-21, Aligned region: 521..715 |
| Protein Sequence: 891 a.a. [Download] |
| >gi|350273161|ref|YP_004884474.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MKILKSLVLLVLFMAMPAKADDAFSWMSTSFVGLKSLFGCLEVPKFTSFQEGNIGISLSKAGIWQSTGNT VQKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFSMPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTDNNSETLGTI PPDKDLDALSFTKMSDAVKYFNYSNGNSRIEVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNTLKLPNTVDNILTQELDS SIFAASALYTQSNLGDFDNRIIYSSAEQVCNMIDEERKSVCSGTGTATKYKNTDNGVIVGKPMITGAVQY FMGLINACPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVNSGSTQSSFIYYQATSGGTMDFTSD WQVSNMFSNSALMSDWSRNFSNYASFVDYINKNDWSANFLYFGRYAMIVEIGNGANSINPGDQQNIKLEY LITSDGTLPDPSVRGMPVDYNFATDAPQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIK PITYQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNLAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAVEVITRICKIAIVAFLIRE ESWSFFNTYFFSAFTDGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIA IITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLI FFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISSSNILT NNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYSLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMQDIDSVTKPI KKAAMAPARVFKDKIIDQNYKARKPEGGGEFTNKFLAERNDVKKEEGEKKE |
| Nucleotide Sequence: 2676 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:148518-151193 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATGGCGATGCCAGCTAAAGCCGATGATGCTT TTTCATGGATGTCAACCAGTTTTGTCGGGTTAAAAAGCTTATTCGGTTGTTTAGAAGTGCCTAAATTTAC AAGTTTTCAAGAGGGTAATATAGGAATTAGTTTATCTAAAGCCGGAATTTGGCAATCAACAGGTAATACT GTTCAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAATTGGTCTACTTCAGGTATTACTCCTGAACCTAGAAAATATC TAGTATTATATAGAATTGATCCAAGGTTTAGTATGCCGCAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAA ATTACAATTTGAAGCTTTAGGATTTCCTCGTTTTGTTACGGACAATAATAGTGAAACACTGGGGACTATA CCGCCTGATAAAGACCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATGCTGTTAAATATTTTAACTATT CTAACGGTAATTCGAGAATTGAAGTTAAGGCCGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTGGTAAAGATAA TTTTTTTAGCCCTAATACTCTAAAACTTCCTAATACCGTAGATAATATTTTAACACAGGAACTTGATAGC TCGATATTCGCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGAGATTTTGATAATAGAATAATTTATT CTTCTGCAGAGCAGGTGTGTAATATGATAGATGAGGAAAGAAAAAGTGTATGTAGCGGCACGGGTACTGC TACAAAGTATAAAAATACCGATAATGGAGTAATAGTCGGTAAGCCTATGATAACGGGAGCGGTACAGTAT TTCATGGGCTTAATTAATGCTTGTCCTGCTAATGCTGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTATTACGATC AAGGTAGAGGGATGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAAGGGACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTC AGGCAGTACTCAAAGTAGCTTTATATATTATCAAGCCACTAGCGGTGGTACTATGGATTTTACTAGCGAT TGGCAAGTTAGTAACATGTTTAGTAATTCAGCTTTAATGAGTGATTGGAGCCGAAATTTTTCAAATTATG CTAGTTTTGTAGATTATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTTGGTCGTTATGCGAT GATTGTTGAAATAGGTAATGGGGCAAATTCAATTAATCCTGGTGATCAACAAAATATAAAGTTAGAATAT TTAATAACGTCTGATGGTACATTACCTGATCCATCTGTTCGTGGTATGCCGGTAGATTATAACTTTGCGA CTGATGCCCCGCAAGATGGATATTTATGGTTAAGGGTTGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTAGT TAGTGTAAATTATGCTAATTATACCGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATATATAACGGTGCTATTAAA CCTATTACCTATCAGTTTAGAACTTTCAGTCAAAACTTTTATATTAAGTTAGTTAAAAATTCTGCAGTGC AGAATTTAGCTAAAGCTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGGCTAATGTTCGTTGCAGGAGCATT AAAATTAACTGCCGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATAGCTATAGTAGCTTTTTTAATTAGAGAA GAAAGTTGGAGCTTCTTTAATACATACTTCTTTAGTGCATTTACTGACGGTATTGATTTCTTTGTAACTA ACGTAGTAGGTGCTACAAGCTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATAC TAACGGTAGGATTTGGGGATTACTATTTATTGAATTATTACAGATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCT ATTATAACCATTTATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGTTATGTTATTG CATTCATAGGGGTAACTGTTATGATTTCATTGGCACCGTTTTTTATAATATTAATGTTATTTGAAAAAAC TAAAAGTTTATTTGATAATTGGATATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTACAGCCGACAATATTATTGATT TTCTTTTTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTGGTAGTTAGAGCCTGTTGGGATA CTCTTATACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAACAAATCTTGGTATTCCGATTAATTTCTCTTTTACATT ACCGTTCCTACCCGGAATACCTTTCTATGTGCCGGATGTTCCAGAAATTAGTAGCTCGAATATTCTAACG AACAATGCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTATTATTTTATTCATATTGCTTGATGTCAT ATAGTTTAGTAACTTTTGTAAATATAGTAGTTGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGAATATCAGG CAATTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCGTTATGCAGGATATAGATTCAGTAACAAAACCGATT AAAAAGGCTGCAATGGCTCCGGCTAGAGTTTTCAAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAGAA AACCGGAAGGAGGTGGTGAATTTACAAATAAATTTCTTGCTGAGCGTAATGATGTGAAGAAAGAGGAAGG AGAGAAGAAAGAATAA |