| Protein ID: 350273158 |
 T4SS name [ID] | VirB [426] |
| Gene symbol | virB6-1 |
| Locus tag | RJP_0109 |
| Strain | Rickettsia japonica YH |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_016050] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 140435..143437 [+] |
| Product | trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | G4KM24 |
| KEGG ID | rja:RJP_0109 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 3.1e-12, Aligned region: 504..579 |
| Protein Sequence: 1000 a.a. [Download] |
| >gi|350273158|ref|YP_004884471.1| trbL/virB6 plasmid Conjugative transfer protein [Rickettsia japonica YH] MKLFPRSILITLVLSFALNLGLVTKTHAKDTLDSIIDILSGLTCETQGVGDLLRSEFSHTCIVAPFFTFA VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCARENRIDPKNPELRFALCNNAKLIVSRAKSVA ESALAIAKAVLTGSDPWDDIKTAWANKKKEYHVPYSGKPGDDGFAFDLGFPVIYWKVIQDKDRICVSTKG FTGDVPVGCKYMKEPFPKSMYNNFMDVADKDFIEDPNKTPTDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAVVM TSPLIECMRQMIARLLISKDVCSFDNVSQVVNLVSRQDSAFFQFQVGMYKIVTAFLTLYVMFFGFKLLLA GEVPPKSEYINFILKMIFVTYFSIGINITPGNGSPYDRLDGMIQWAFPFLLDGINGLASWVMNAAPSGLC KFNNLSYDGTVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENAYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLLIPAIIS GNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFSYTRNYFDSWVKLMISFLLQ PMVVVTFMITMFSVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKIQGGITSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDAVE SCQNSLGYMLNNPITTAFNFAKDSVSEIVDSKPGNTPTDKFLAKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKIK NILLALVTACFTLYLMYNFSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAVLATAGAATKGGDQIASR GGVGDLKAGQGGGASDLEVGKGGLPNDNIAASGGTSAPTVTTPTASSSVATSSPKTVSSEARSDVVTPPA PTEAVSPPPASIRTSISTPAPQSNIAAESVGKIIRDNNQESKKEIDNTPPSQEKVDNAAPHEKVDSTSKG TGVIDYSFNLKEHDNPTGIKQIRENAEIRDKRVKVEKAWNELIASGGGRVREQEEGEISERCTNAEKVWD ELVKSGVVTEKKDNSSNENS |
| Nucleotide Sequence: 3003 bp [Download] |
| >gi|350273053|ref|NC_016050.1|:140435-143437 Rickettsia japonica YH, complete genome ATGAAATTATTTCCTCGTAGTATACTTATAACATTAGTATTAAGCTTTGCCCTAAATTTAGGGCTAGTTA CTAAAACTCATGCTAAAGATACTCTTGATAGCATTATAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACCCA AGGCGTAGGCGATTTGCTGCGTTCTGAATTTTCTCATACATGTATTGTTGCTCCGTTCTTTACTTTTGCG GTAATGAATCTTGTCTCTCCCGTTTTATACATGAATACGTTTTTAAAGCTTAAAATAAACGACAGTGATT TATTTAACGATAGTAACTTTGGGAATTTCCCCGGAGGTCAATGTGCTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA AAATCCAGAATTACGCTTTGCTTTATGTAATAATGCTAAATTAATTGTATCTCGGGCAAAATCTGTTGCA GAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTCTTAACAGGGAGCGACCCTTGGGATGATATAAAGACAGCGT GGGCAAATAAAAAAAAGGAATATCATGTTCCATATAGTGGTAAGCCCGGTGATGACGGTTTTGCATTTGA TTTAGGCTTTCCTGTAATATATTGGAAAGTTATTCAAGATAAAGATAGAATATGCGTATCGACAAAAGGA TTTACAGGAGACGTTCCCGTCGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCAAAATCCATGTATAATAACT TTATGGATGTAGCAGATAAGGATTTTATTGAGGATCCAAATAAAACTCCCACCGATCCTTTAGCTTTAGT TTCCTGTAGTGCAGCGGGTGATGGATGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAGTAGTCATG ACTTCTCCTCTTATAGAATGTATGAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGATGTTTGTAGTT TTGATAATGTAAGCCAAGTGGTTAATTTGGTTTCAAGGCAAGATAGTGCATTCTTTCAGTTTCAAGTAGG AATGTATAAAATAGTTACGGCTTTTCTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGCTTTAAACTATTACTTGCA GGTGAAGTGCCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATGATATTCGTAACTTATTTTTCAA TAGGAATTAATATAACCCCTGGTAATGGTTCTCCGTATGACCGGTTAGATGGCATGATTCAGTGGGCGTT TCCTTTCTTACTTGACGGTATAAACGGTTTAGCAAGTTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCCGGTTTATGT AAATTTAACAATCTTTCTTATGACGGTACCGTTTCTTATATTGCATTATGGGATGCATTAGATTGTAGGG TAGCTCATTATTTAGGGCTTGATATATTATCTACGTTACTTGTCGAAAATGCTTATCGCAGTCATGATTT TTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCTCCACCATATATTTATTTGCTAATTCCGGCGATAATCTCC GGTAATATGATGTTGGTGTCACTCGCTCTTTCTTATCCGTTACTTGTGATTTCGGTTGCTGCCTTTATGG TTAATGCAACGATTATGTGTATGATATCTATAGTAATACTCGGTATTTTGGCTCCTCTTTTTGTACCTAT GTTTTTATTCTCATATACAAGAAATTATTTTGATAGCTGGGTTAAACTAATGATCTCGTTCTTGCTACAA CCTATGGTGGTAGTTACTTTTATGATCACGATGTTTTCGGTATATGATTATGGTTTCTACGGTAAATGTC AATATAAGAGCAAATTAATTCACAATAGTATAGAAGACAAAATTCAAGGTGGCATTACTTCTAAGAGGGA TGTTTTAATATTTTACATTAATAATGATTGGGATGATACGTCACAATATCCTGATAAAGATGCCGTAGAA AGCTGTCAAAATAGTTTAGGTTATATGTTAAATAACCCTATTACCACGGCATTTAACTTTGCAAAAGATA GTGTAAGTGAAATTGTTGATAGTAAACCGGGTAATACCCCTACCGATAAATTTCTTGCTAAATTCCAGTT TTTATCAGGAGTAGTTTTGGGTCCCGGAATGTTTTTTATGTCTCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATTAAA AATATTTTGCTTGCGTTAGTTACGGCATGTTTTACATTGTATTTGATGTATAATTTTAGTAGTCAGTTAG CTGAATTTGCTGCAGATATGACGGAAGGAGTAGCTCTTAATAATGTTGCTATAAAACCGCAAGCAATATT TAAGGCAGCTATGGCAGTACTTGCTACTGCGGGTGCTGCAACTAAGGGGGGCGATCAGATAGCAAGTAGA GGAGGAGTTGGTGATTTAAAAGCTGGTCAAGGTGGAGGAGCAAGTGATTTAGAGGTAGGGAAAGGCGGAC TACCAAATGATAATATTGCTGCAAGCGGAGGTACGTCGGCACCTACGGTAACAACGCCGACAGCTTCGTC TTCTGTAGCAACTTCTAGCCCAAAAACTGTAAGTAGTGAAGCAAGATCAGATGTTGTTACTCCTCCTGCT CCTACAGAAGCTGTTTCACCACCGCCTGCTAGTATTAGAACTTCTATTTCTACACCTGCACCACAAAGTA ATATTGCAGCTGAAAGTGTTGGAAAAATCATAAGAGATAATAATCAAGAAAGTAAAAAAGAGATTGATAA TACTCCGCCTTCACAGGAAAAAGTTGATAATGCAGCTCCACACGAAAAAGTTGACAGCACAAGTAAAGGT ACAGGAGTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGATAATCCGACAGGCATAAAACAGATACGGG AAAATGCAGAGATTCGAGATAAACGTGTAAAAGTAGAAAAAGCATGGAATGAACTAATAGCAAGCGGAGG AGGAAGAGTAAGAGAACAAGAAGAAGGAGAAATATCAGAACGATGTACAAATGCTGAAAAGGTATGGGAT GAGTTAGTAAAAAGTGGCGTAGTAACAGAAAAAAAAGATAATAGTTCTAATGAAAACTCTTAA |