Protein ID: 308183678 |
T4SS name [ID] | VirB [610] |
Gene symbol | - |
Locus tag | HPPC_07755 |
Strain | Helicobacter pylori PeCan4 |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_014555] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 1552006..1553754 [+] |
Product | conjugal transfer protein (traG) |
Component type | VirD4 |
UniProt ID | E1Q5D2 |
KEGG ID | hpc:HPPC_07755 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | T4SS-DNA_transf [PF02534], Evalue: 6.1e-68, Aligned region: 83..564 TrwB_AAD_bind [PF10412], Evalue: 6.6e-30, Aligned region: 323..542 TraG-D_C [PF12696], Evalue: 2.2e-24, Aligned region: 411..531 AAA_10 [PF12846], Evalue: 2.1e-10, Aligned region: 82..188 AAA_10 [PF12846], Evalue: 2.1e-10, Aligned region: 386..487 |
Protein Sequence: 582 a.a. [Download] |
>gi|308183678|ref|YP_003927805.1| conjugal transfer protein (traG) [Helicobacter pylori PeCan4] MIEKFKTLRDKFKDKTSNLFHKLNSIQKDYYTKTLPKACKDVFTLGSSKSYPMTLNFNKGFCVGLYKGLN SLKPTYYDAPLSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLSVPSSCVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFDPL GNDNTLKFNPFDKRTVEKLDFNRKRRLVDEVGNTIFAEDGANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTST FFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQSSDNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNVNVELLWYKQVAE QVYTDPENPKNYDGSVNNLEKDDQGNVIMKEGMLDPVIRNEANKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSY QVKSATDSMSFEYEDLRVDNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNLLLKESKKFEERVYLFLDEFV RFGKLPFLLEMPALSRSYGVVLIFITQSNALIEKYYGREDARIVNSTVAYKVIFKMDDLEYAKQVSEEVG KMTRKTRSHSTEKGQLITGGTSSIGKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIILVSGHKAKPLKLKANYYFKNKEL LSRINWEVKPNEEVFDESKKDV |
Nucleotide Sequence: 1749 bp [Download] |
>gi|308182188|ref|NC_014555.1|:1552006-1553754 Helicobacter pylori PeCan4 chromosome, complete genome ATGATAGAAAAATTCAAAACATTAAGAGATAAATTTAAGGATAAAACCAGCAATTTATTCCATAAGCTTA ATAGCATTCAAAAAGATTATTACACTAAAACTCTCCCTAAGGCTTGCAAAGATGTCTTTACGCTAGGTTC TTCTAAGAGTTATCCTATGACCTTAAATTTTAACAAAGGTTTTTGTGTGGGGCTATATAAAGGTTTAAAT TCACTTAAGCCTACTTATTATGATGCTCCGCTTTCTACTTTAATTATCGCTCCTCCTGGAAGTGGTAAAA CCGCAGCTGTGGCTGTGCCTAATCTTTTAAGCGTGCCTAGCTCTTGTGTGGTGTTAGATATTAAAGGGGA GTTGTTTGATTTAACGGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAATTTTTGTATTTGATCCCTTA GGAAATGATAACACGCTTAAATTCAATCCGTTTGATAAACGCACTGTAGAAAAATTAGATTTTAACCGAA AGCGAAGGCTTGTAGATGAAGTGGGTAATACTATTTTTGCTGAAGATGGGGCAAATAAAGACCCTCATTG GACACAGCAAGCTAAAAATTTATTTGTCTTTTACGCTCTTTATGATTTGTGTGTGCATAACACTAGCACC TTTTTTGAAATTGCTAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCGATTTTATA CTGAATTATATGAATGTCAAAGTAGTGATAATGGTTTTGTTAAAGAGAATGGGCGTTATATGGCTAAAGT AGAAAATGGCGTTAAAAAAATGAAACCTAATGTCAATGTGGAATTGCTATGGTATAAACAAGTAGCCGAA CAAGTCTATACTGACCCAGAAAATCCTAAAAATTATGATGGATCTGTGAATAATTTAGAAAAAGACGATC AAGGCAATGTTATAATGAAAGAGGGCATGTTAGATCCTGTTATTAGAAACGAAGCGAACAAATGGGCTAA GGCGAATGATAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTTTACAAGCTAT CAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGAGGATTTAAGGGTTGACAATATTTCACTCT ATATTAAAATCGCTCAAACAGATATTGACACACTCGCACCGCTTATCCGTATCCTTTTGGAAAGTATTGC TAAAAATCTTTTATTGAAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGGGTTTATCTGTTTTTAGATGAATTTGTG CGTTTTGGTAAATTGCCTTTTTTATTAGAAATGCCCGCATTAAGTAGGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTT TTATCACGCAATCCAATGCTCTTATTGAAAAATATTATGGTAGAGAAGATGCAAGAATTGTTAATAGCAC CGTGGCTTACAAAGTAATTTTCAAAATGGATGATTTAGAATATGCTAAACAAGTGAGCGAAGAAGTCGGT AAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCACTCTACAGAAAAAGGACAACTCATTACCGGAGGAACTTCTAGTA TAGGTAAAGAGGCGTGGGACTTATTGAGCGCGCAAGATATTATGAATATTGATAAAGATGAAGTGATCAT TTTAGTAAGCGGTCATAAGGCTAAACCCTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTCAAAAACAAAGAATTA CTCTCTCGTATTAATTGGGAAGTCAAGCCCAATGAAGAAGTGTTTGATGAATCAAAAAAGGATGTATGA |