Protein ID: 238650573 |
T4SS name [ID] | VirB [478] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RPR_02845 |
Strain | Rickettsia peacockii str. Rustic |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_012730] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 485537..488212 [+] |
Product | virB6d protein |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | C4K1C6 |
KEGG ID | rpk:RPR_02845 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 6.8e-21, Aligned region: 521..715 |
Protein Sequence: 891 a.a. [Download] |
>gi|238650573|ref|YP_002916425.1| virB6d protein [Rickettsia peacockii str. Rustic] MKILKSLVLLVLFMAMPAKADDVFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPEFTSFQEGNIGISLSTAGIWQSTGNT VQKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFGMPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTDNNSETPGTI PPDKDLDALSFTKMSDFVKYFNYSNGNSRIEVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNTLKLPNTVDNILTQELDS SIFAASALYTQSNLGDLDNRIIYSSAEQVCNMIDEERKSVCSGTGTATKYKNTDNGVIVGKPMITGAVQY FMGLIKACPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVNSGSTQSSFIYYQATSGGTMDFTSD WQVSNMFSNSVLMSDWSRNFSNYASFVDYINKNDWSANFLYFGCYSMIVEIGNGANSINPDDQQNIKLEY LITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFATDAPQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIK PITDQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNLAKTALTLYVTIFGLMFVTGALKLTAVEVITRICKIAIVAFLIRE ESWSFFNTYFFSVFTDGIDFFVTNVLGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIA IITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLI FFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLGIPIHFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISSSNILT NNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYSLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMQDIDSVTKPI KKAAMAPARVFKDKIIDQNYKARKLEVGGEFTNKFLAERNDVKKEEGEKKE |
Nucleotide Sequence: 2676 bp [Download] |
>gi|238650213|ref|NC_012730.1|:485537-488212 Rickettsia peacockii str. Rustic, complete genome ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATGGCGATGCCAGCTAAAGCCGATGATGTTT TTTCATGGATGTCAACCAGTTTTGGTGGGTTAAAAAGCTTATTCGGTTGTTTAGAAGTGCCTGAATTTAC AAGTTTTCAAGAGGGTAATATAGGAATTAGTTTATCTACAGCCGGAATTTGGCAATCAACAGGTAATACT GTTCAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAATTGGTCTACTTCAGGTATTACTCCTGAACCTAGAAAATATC TAGTATTATATAGAATTGATCCAAGGTTTGGTATGCCGCAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAA ATTACAATTTGAAGCTTTAGGATTTCCTCGTTTTGTTACGGACAATAACAGTGAAACACCGGGGACTATA CCGCCTGACAAAGACCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATTTTGTTAAATATTTTAACTATT CTAACGGTAATTCGAGAATTGAAGTTAAGGCCGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTGGTAAAGATAA TTTTTTTAGCCCTAATACTCTAAAACTTCCTAATACCGTAGATAATATTTTAACACAGGAACTTGATAGC TCGATATTCGCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGAGATTTGGATAATAGAATAATTTACT CTTCTGCAGAGCAGGTGTGTAATATGATAGATGAGGAAAGAAAAAGTGTATGTAGCGGCACGGGTACTGC TACAAAGTATAAAAATACCGATAATGGAGTAATAGTCGGTAAGCCTATGATAACGGGAGCGGTACAGTAT TTCATGGGCTTAATTAAGGCTTGTCCTGCTAATGCCGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTATTACGATC AAGGTAGAGGGATGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAAGGGACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTC AGGCAGTACTCAAAGTAGCTTTATATATTATCAAGCCACTAGCGGTGGTACTATGGATTTTACTAGCGAT TGGCAAGTTAGTAACATGTTTAGTAATTCAGTTTTAATGAGTGATTGGAGCCGAAATTTTTCAAATTATG CTAGTTTTGTAGATTATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTTGGTTGTTATTCGAT GATTGTTGAAATAGGTAATGGGGCAAATTCAATTAATCCTGATGATCAACAAAATATAAAGTTAGAATAT TTAATAACGTCTGATGGTACATTACCTGATCCATCTGTTCGTGGTACGCCGGTAGATTATAACTTTGCGA CTGATGCCCCGCAAGATGGATATTTATGGTTAAGGGTGGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTAGT TAGTGTAAATTATGCTAATTATACCGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATATATAACGGTGCTATTAAA CCTATTACCGATCAGTTTAGAACTTTTAGTCAAAACTTTTATATTAAGTTAGTTAAAAATTCTGCAGTGC AGAATTTAGCTAAAACTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGGCTAATGTTCGTTACAGGAGCATT AAAATTAACTGCCGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATAGCTATAGTAGCTTTTTTAATTAGAGAA GAAAGTTGGAGCTTCTTTAATACATACTTCTTTAGTGTATTTACTGACGGTATTGATTTCTTTGTAACTA ACGTATTAGGTGCTACAAGCTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATAC TAACGGTAGGATTTGGGGATTACTATTTATTGAATTATTACAAATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCT ATTATAACCATTTATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGTTATGTTATTG CATTCATAGGGGTAACTGTTATGATTTCATTGGCACCGTTTTTTATAATATTAATGTTATTTGAAAAAAC TAAAAGTTTATTTGATAATTGGATATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTGCAGCCGACAATATTATTGATT TTCTTTTTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTGGTAGTTAGAGCCTGTTGGGATA CTCTTATACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAACAAATCTTGGTATTCCGATTCATTTCTCTTTTACATT ACCGTTCTTACCCGGAATACCTTTCTATGTACCGGATGTTCCAGAAATTAGTAGCTCGAATATTCTAACG AACAATGCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTATTATTTTATTCATATTGCTTGATGTCAT ATAGTTTAGTAACTTTTGTAAATATAGTAGTTGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGAATATCAGG AAATTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCGTTATGCAGGATATAGATTCAGTAACAAAACCGATT AAAAAGGCTGCAATGGCTCCGGCTAGAGTTTTCAAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAGAA AACTGGAAGTAGGTGGTGAATTTACAAATAAATTTCTTGCTGAGCGTAATGATGTGAAGAAAGAGGAAGG AGAGAAGAAAGAATAA |