Protein ID: 238650572 |
T4SS name [ID] | VirB [478] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RPR_02840 |
Strain | Rickettsia peacockii str. Rustic |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_012730] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 482463..485363 [+] |
Product | virB6c protein |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | C4K1C5 |
KEGG ID | rpk:RPR_02840 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.9e-31, Aligned region: 605..844 |
Protein Sequence: 966 a.a. [Download] |
>gi|238650572|ref|YP_002916424.1| virB6c protein [Rickettsia peacockii str. Rustic] MQGNLLKVLEVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKVGDSCYMRYASDGQGGADSITGTITLNANANYVNTAK MLSDGTTLLIPDPTRYGEWLNTQVLVENSQSVNLQVVGQVSLCLAYIPKDNLQRTGAGSNLDDNGQMIPI PRINDRNNPPVSLIMDAKNNEWRNIAELYANDRVLVSVSPNFANTDATVKDAFKGVEVTKDCSENKTTYN PICGKYSVYSGEYVNACELKEKYWNCQVTWRCPTWYEQPFCNWGALGCVRSCDKIPECTTKCMAWVNITR PAPENYLDDESFTFSWSDNTGKLFIDYSALQCSYNANIPPVDQCPDSVRDRSTKDKDYIGGVHCTSGICS DGDFQKNRRFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDAGSVSQALPSKLEFAKFVADTDQPPDYKDKDGKYLYKVI YNIPFNSNIAKSYLQYRLWSPTSQDSSKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFDDRGRVQYIIVKPSEN PNTSGKTYSPQGISVDSEGKYSFNANEAGYIWMKILNDPGNNLRDYKDSEGSYKVHFSTSLKVGSFTIKV MNPLLQLFKTKVQGAATSIFKNMVCYKANDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFAKINQKELVI RIAKIGVVSGLMNGNTFEFFNNYLFDAITNFSDSIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAVMSKIFFSQT FIAQLLALLSLGLSGIIYFIITFIAVGIVIITALRAVAVYIMAFMATCILIGIAPLFISFLLFDFTRYLF DNWVRFTIRYMIEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFCIN WFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVVKLTSAVGPSATEIGGKMSHDAGQKALS SIGMDDKTRQGITGRAEARLKQRNKTLDQAEKNRKNTPKEGGEKTNEEPPKPEIPK |
Nucleotide Sequence: 2901 bp [Download] |
>gi|238650213|ref|NC_012730.1|:482463-485363 Rickettsia peacockii str. Rustic, complete genome ATGCAGGGTAACTTATTAAAAGTTTTAGAAGTACTTGCTATAGTAGCAACGTTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAGTCGGTGACAGCTGCTACATGAGATATGCGTCAGACGGTCA AGGAGGAGCGGATTCAATAACCGGTACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATGTAAACACTGCTAAG ATGTTGTCCGACGGCACGACTCTGCTTATTCCTGATCCTACTCGTTACGGTGAATGGCTAAATACTCAGG TGCTAGTAGAAAACAGCCAATCAGTGAATTTACAAGTGGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATAT ACCGAAAGATAATTTACAACGTACAGGGGCTGGATCTAATTTAGACGATAACGGTCAAATGATCCCGATT CCTCGTATTAACGATAGAAATAATCCACCTGTCTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATAATGAATGGCGTA ATATTGCCGAATTATACGCCAATGATAGAGTTTTAGTTTCCGTATCTCCTAATTTTGCCAATACGGATGC GACAGTTAAAGATGCTTTTAAAGGTGTTGAAGTTACGAAAGATTGTTCAGAGAATAAAACTACTTATAAT CCAATTTGTGGAAAATATTCTGTTTATTCAGGTGAGTATGTCAATGCTTGCGAGTTAAAAGAGAAGTATT GGAATTGTCAAGTCACATGGAGGTGCCCTACCTGGTATGAGCAACCATTTTGCAACTGGGGAGCATTGGG CTGTGTTCGTTCTTGTGATAAGATACCAGAATGTACAACGAAATGTATGGCTTGGGTTAATATAACGAGA CCAGCACCAGAAAACTACCTAGATGATGAGAGTTTTACATTTTCGTGGTCTGACAACACAGGTAAATTAT TTATCGACTATTCAGCCCTTCAATGTTCTTATAATGCTAATATTCCTCCAGTTGATCAATGTCCTGATAG TGTTCGCGATCGTAGTACAAAAGATAAAGATTATATTGGAGGTGTACATTGTACTTCGGGCATATGTAGC GATGGAGATTTTCAAAAGAATCGGAGATTTTGGTATACGGCGGACGGTAAAGGAGGCAAAGGACCAACTG GATTAATATATCAAATGAATGATGCGGGTTCTGTAAGTCAAGCTCTGCCTTCTAAGCTAGAATTTGCTAA ATTTGTTGCAGATACAGATCAACCGCCTGACTATAAAGATAAAGACGGTAAATATTTATATAAAGTTATA TATAATATACCTTTTAACAGTAATATTGCAAAAAGTTATTTACAATATAGGCTGTGGTCTCCTACCTCAC AAGATAGTAGTAAGAATACGGGAGGATACGTTTTAAATATTAAACAGACTAAATGCTATAGAGAAAACGG TAATAGTTTTAACGATACTTTTGATGATCGAGGACGAGTGCAATACATCATAGTAAAGCCTTCGGAAAAC CCGAATACTAGCGGTAAAACCTATTCACCTCAAGGAATTAGCGTTGATAGTGAAGGTAAATATAGCTTTA ACGCAAATGAGGCGGGTTATATATGGATGAAAATCCTAAATGATCCTGGTAATAATTTAAGGGACTATAA AGATAGTGAAGGTAGCTATAAAGTACATTTCTCAACATCCTTAAAAGTAGGAAGTTTTACTATTAAAGTA ATGAATCCGTTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTGCAAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAAAAATATGG TATGTTATAAAGCTAATGATAGTTCGTCCTGTACTAACTTTTTTACCTATATTAAAGCAATTTTAATTCT GTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTTTTGCTTGGTTTTGCTAAGATAAACCAAAAAGAGCTAGTAATT AGAATAGCAAAAATCGGGGTAGTTAGCGGACTTATGAACGGTAATACCTTTGAATTTTTCAATAACTATC TTTTTGATGCAATTACCAATTTTTCAGACTCAATTATTGCTAATATGAGTGGATATAGTTTGTTTACTTC TACTAATACTATTTCTAATCCTTTCATGTTTTTAGATGCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACC TTTATCGCTCAATTACTTGCACTTCTTTCTCTTGGGCTTAGCGGTATTATATATTTTATAATTACTTTTA TTGCGGTTGGTATAGTAATTATTACGGCGCTTAGAGCTGTTGCCGTTTATATTATGGCATTTATGGCAAC TTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTATTTATTT GATAATTGGGTGAGGTTTACGATCCGCTATATGATAGAACCGGTAGTTATGATGGCAGGTATTATAGTAC TAACACAACTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTTAGGTTATAGCGTGTGTTGGAAATGTGCTTTACC GATAAAAATTCCGTTTATCGGTACTATTTTACCTATTGCCTTGCTGAATGTACCTATCTTCTGTATTAAT TGGTTTGCCCCTTGGGGAATGGATTATATGTCGGGTATGATGGGAGTAAATATGCAAAATATCGTAGCTC TAGTTATTATTGCTTACGGTATGTACGGTTATGTCGAATTTTCAGGACGTATGGTAGTAAAATTAACTAG TGCTGTTGGGCCTTCGGCTACTGAAATTGGTGGTAAAATGTCTCATGATGCAGGACAAAAAGCATTAAGT TCAATAGGAATGGATGATAAAACAAGACAAGGTATTACCGGCAGAGCGGAAGCACGATTAAAACAACGCA ATAAGACATTAGATCAGGCTGAGAAAAATAGGAAAAATACGCCAAAAGAAGGGGGCGAGAAGACAAATGA AGAACCACCTAAACCTGAAATACCGAAATAG |