| Protein ID: 229586348 |
 T4SS name [ID] | VirB [480] |
| Gene symbol | virB6-5 |
| Locus tag | RAF_ORF0135 |
| Strain | Rickettsia africae ESF-5 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_012633] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 146321..149782 [+] |
| Product | VirB6 |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | C3PME6 |
| KEGG ID | raf:RAF_ORF0135 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.6e-24, Aligned region: 293..482 |
| Protein Sequence: 1153 a.a. [Download] |
| >gi|229586348|ref|YP_002844849.1| VirB6 [Rickettsia africae ESF-5] MNKNIFITLLISLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSARYDPEEITSRQEGNQVAPWRDSAYKVNGYPL TIMVRPWSYILGDKNTSGQLSAWCPWYGQKNNTTTLAAFCVKLQPCTFWDNTRLDMCTPNPANQNDAMIS NAPCIMTNGVGLYFLIAAKNTDPNISPDSQSKPQGITQHLGEELTSGYEFYSTSSTGQFLEAGGINYQYK GEDKSKYAQSPLYFKIIDKFYNDNSGQYRLVIKSGVTDTRPDPLQFLTDLIKGVLFGKDGIIKKTYQQII DTSGYRMSVSAILTLYIMFTGFSFLIGNINLTHVELIVRILKVSIVSILLSTDKAWTFFHDYLFVFFIDG VQQILQIINEASATGPGSQSLLGLLISPQTLSKLFSLLFVDWLGFIYIILYLIALYFIFFLIFKATIIYL TALITIGMIIIMGPIFICFMLFNITRSLFENWLRQLISYALQPIILFTGIAFISMIIRTEIYSTLGFAVC KHDFPNLGPINEIFGSFLEDIDPSLGHSIFYWWFPVPMKGGINNFHKANILVPKDHIIVDDSCKNDPDKC KHCAAYECIDERYIELPFLDLVKDAKRISNFINGKFVQLDGILLIFVSIYLLSKFNDTAMSTAQFIAGTS GNLTEIQKVNQQSYESAAQQMNRPLNYVAKTVSAPVTSRVSAGKEQVRMFFAEKFENMMMGRLEKQALGS SANKTVQNEVKRKYGIDSKDVKMNAITDYENGIAGLLKNLPKGNELKAKELSQMKFTQLRDKIAANKYGV KDYTALSKEQKAELDKSLKDANLRELASDANFTRDYQDAYKNAHQEMSGRGVGLFGKNIGVLRSWQEIKH RVDTKRKLKEEQRVGIGEKIYAGYTGIKRGALTAIVGKDLRDAYEGNLTSAEWHDFEYNDPRLRTYSEKL KDDEKAREHEELQMHINKEALAAQADILSPEYLARLEKAGRHSDVEYYQELAQRKLIHEVHGRLFEEGEP VMMGDRFMCEKATDSQMRDMIDNAHRKYAEFIDGDRYIRRQEHYDIMHEKAQENLEQTYKELKDHFKRDD IKIEEMPALIAQKVKDTAEGAEIDQKITEELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDKIN KYRENAKMQTYVKPIVNEGRKLRKLEDHLRNMK |
| Nucleotide Sequence: 3462 bp [Download] |
| >gi|229586230|ref|NC_012633.1|:146321-149782 Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome ATGAACAAAAATATTTTTATTACATTATTAATATCGCTATTGCTGCTTTCCGGTTGTACCGGCGATACTT GTATTGACCCTGATGATTTCGGTTTTATCAAATTCAATGTCTCTGCTAGATATGATCCGGAAGAAATTAC TTCAAGACAGGAAGGTAATCAGGTAGCACCATGGCGTGATAGTGCTTATAAAGTAAACGGCTATCCTTTA ACCATTATGGTAAGACCGTGGAGTTATATACTTGGCGATAAAAATACTTCAGGTCAGTTATCTGCATGGT GTCCATGGTATGGTCAAAAAAATAACACAACTACTTTGGCTGCTTTTTGTGTTAAGCTACAACCGTGTAC TTTTTGGGATAATACTAGACTTGATATGTGTACTCCTAATCCCGCAAATCAAAATGATGCAATGATTAGT AATGCTCCATGTATAATGACAAACGGTGTCGGGCTTTATTTTCTTATTGCCGCTAAAAATACCGATCCCA ATATTTCACCGGACTCACAGAGTAAACCGCAAGGTATAACTCAGCATTTAGGAGAGGAGCTTACTTCGGG CTATGAATTTTATAGTACTAGTAGTACAGGACAATTCTTGGAAGCCGGCGGTATAAATTATCAATATAAA GGTGAAGATAAGTCAAAATATGCTCAATCTCCTCTTTATTTTAAGATTATAGATAAATTTTATAATGATA ATAGCGGGCAATATAGATTAGTAATAAAGTCTGGAGTTACTGATACTAGACCCGATCCGCTACAATTTTT AACGGATTTAATAAAAGGAGTATTATTTGGTAAGGATGGGATTATAAAGAAAACTTATCAACAAATAATT GATACGTCGGGTTATAGGATGAGTGTCTCGGCTATTTTAACTCTATACATAATGTTTACAGGTTTTTCCT TTTTAATAGGTAATATAAACCTTACTCATGTCGAACTTATAGTTAGAATATTAAAAGTTAGTATAGTCTC AATATTATTAAGTACTGATAAAGCTTGGACATTTTTTCATGATTATTTATTCGTATTTTTTATTGATGGG GTTCAGCAAATACTGCAAATAATTAATGAAGCTTCGGCTACCGGTCCTGGTTCTCAAAGCTTGCTTGGGT TACTTATTTCTCCTCAAACTTTATCTAAATTATTTTCTTTACTATTTGTTGATTGGCTTGGTTTTATATA TATCATTCTATATTTAATAGCCTTATATTTTATTTTCTTTCTTATATTTAAAGCCACTATTATCTATCTA ACCGCTCTTATAACTATCGGGATGATTATAATTATGGGACCGATATTTATTTGTTTCATGTTGTTTAATA TAACTCGTTCGTTATTTGAGAATTGGTTAAGACAATTAATATCATATGCATTACAGCCTATAATTTTATT TACCGGTATCGCTTTTATTTCAATGATCATCAGAACCGAAATATATTCAACGCTTGGTTTTGCAGTATGT AAACATGATTTTCCTAATTTAGGTCCGATAAATGAAATATTCGGTAGCTTCCTTGAGGATATAGATCCAA GCCTGGGTCATTCAATATTTTATTGGTGGTTTCCAGTACCGATGAAAGGCGGTATAAATAATTTCCACAA AGCAAATATATTAGTTCCTAAAGATCATATAATAGTAGATGATTCTTGTAAGAATGACCCTGATAAATGT AAGCATTGTGCTGCGTATGAGTGTATAGATGAACGCTATATTGAATTACCGTTTTTAGATTTAGTTAAAG ATGCAAAAAGAATTAGTAATTTTATAAATGGGAAATTTGTCCAACTTGACGGGATATTACTAATTTTTGT GTCTATTTATTTGCTAAGTAAATTTAACGATACTGCTATGTCAACGGCACAATTTATTGCTGGTACTTCA GGTAATTTAACAGAAATACAAAAAGTTAATCAGCAATCTTATGAATCTGCAGCGCAACAAATGAATAGAC CGCTAAATTATGTGGCTAAGACGGTAAGTGCACCTGTAACTAGCCGTGTAAGTGCAGGGAAAGAGCAAGT TCGTATGTTTTTTGCCGAGAAATTTGAAAATATGATGATGGGAAGGCTTGAAAAGCAAGCTCTCGGTTCT TCAGCAAATAAAACCGTACAAAATGAGGTTAAGAGAAAATACGGTATAGATTCTAAAGATGTAAAAATGA ATGCTATTACGGATTATGAAAACGGTATTGCAGGATTATTAAAGAATTTACCTAAGGGGAATGAATTAAA AGCAAAAGAACTATCGCAAATGAAGTTTACTCAGCTTCGAGATAAAATTGCTGCAAATAAATATGGAGTG AAAGATTACACTGCTTTAAGTAAAGAACAAAAAGCTGAGCTTGATAAGTCATTAAAAGATGCTAACTTAC GTGAACTCGCTAGCGATGCAAACTTTACTAGAGATTATCAAGATGCTTATAAAAATGCTCACCAAGAAAT GTCCGGGCGAGGTGTTGGTCTGTTTGGTAAGAATATAGGAGTGCTTAGAAGTTGGCAAGAGATAAAGCAT CGTGTTGATACAAAACGTAAATTAAAAGAAGAACAGCGTGTAGGTATAGGCGAAAAAATATATGCAGGTT ATACAGGAATAAAAAGAGGAGCTTTAACTGCAATAGTCGGTAAAGATTTACGTGATGCTTATGAGGGTAA TCTAACCAGTGCCGAATGGCATGATTTTGAATATAACGATCCAAGGCTTAGAACTTATAGCGAAAAATTA AAAGATGATGAAAAAGCACGAGAACATGAAGAGCTCCAAATGCATATTAATAAGGAGGCGCTAGCTGCTC AAGCAGATATATTATCACCGGAATATCTAGCAAGACTAGAAAAAGCAGGTAGACATAGTGATGTGGAATA TTATCAAGAATTAGCTCAAAGAAAGCTTATTCATGAGGTGCATGGTAGGTTATTTGAGGAAGGTGAACCG GTAATGATGGGCGACAGATTTATGTGTGAGAAAGCTACTGATTCTCAGATGCGCGATATGATAGATAACG CTCATAGAAAATATGCAGAATTTATAGATGGAGATCGATATATTCGTCGCCAAGAGCATTATGATATTAT GCACGAGAAAGCCCAGGAAAATTTAGAGCAAACTTATAAAGAGCTTAAAGATCATTTCAAAAGAGATGAT ATCAAGATCGAAGAAATGCCGGCATTAATAGCACAAAAAGTTAAAGATACCGCCGAGGGAGCTGAAATAG ACCAAAAGATTACAGAAGAGCTTAATAACTTTAATGCTGATGTTAAAAATTATGAATATAGTACTGAAGT ATTAAATAAAATAGAGGATAGAAAGCAAGCCATTACCGATGAAGTCAATGCTCAGATCGATAAGATTAAT AAATATAGAGAAAATGCCAAAATGCAAACCTATGTAAAGCCTATAGTAAACGAGGGTAGAAAGCTAAGAA AATTAGAAGATCATTTAAGAAATATGAAGTAG |