| Protein ID: 229586346 |
 T4SS name [ID] | VirB [480] |
| Gene symbol | virB6-3 |
| Locus tag | RAF_ORF0133 |
| Strain | Rickettsia africae ESF-5 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_012633] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 140419..143319 [+] |
| Product | VirB6 |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | C3PME4 |
| KEGG ID | raf:RAF_ORF0133 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.9e-31, Aligned region: 605..844 |
| Protein Sequence: 966 a.a. [Download] |
| >gi|229586346|ref|YP_002844847.1| VirB6 [Rickettsia africae ESF-5] MQGNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKVGDSCYMRYASDGQGGADSITGTITLNANANYVNTTK MLSDGTTLLVPDPTRYGEWLNTQVLVENSQPVNLQVVGQVSLCLAYIPKDNLQRTGAGSNLDDNGQMIPI PRINDTNNPPVSLIMDAKNNEWRNIAELYANDRVLVSVSPNFANTDATVKDAFKGAEVTQDCSENKTTYN PICGKYSVYSGKYVNACELKEKYWNCQVTWRCPNWYEQAGCDWGALGCIASCQKIPECTTKCMAWVNIMR PAPENYLDDESFTFSWSDNTGKLFIDYSALQCSYNANIPPADQCPDRVHDRRTKDKDYIGGVHCTSGICS DGDFQKNRRFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDAGSVSQALPSKLEFAKFVADTDQPPDYKDKDGKYLYKVI YNIPFNSDIAKSYLQYRLWSPTSQDSSKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFDDRGRVQYIIVKPSEN PNTSGKTYSPQGISVDSEGKYSFNANEAGYIWMKILNDPGNNLRDYKDSEGSYKVHFSTSLKVGSFSIKV MNPLLQLFKTKVQGAATSIFKNMVCYKANDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFAKINQKELVI RIAKIGVVSGLMNGNTFEFFNNYLFDAITNFSDSIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAVMSKIFFSQT FIAQLLALLSLGLSGIIYFIITFIAVCIVIITALRAVAVYIMAFMATCILIGIAPLFISFLLFDFTRYLF DNWVRFTIRYMLEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFCIN WFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVVKLTSAVGPSATEIGGKMSHDAGQKALS SIGMDDKTRQGITGRAEARLKQRNKTLDQAEKNRKNTPKEGGEKTNEEPPKPETPK |
| Nucleotide Sequence: 2901 bp [Download] |
| >gi|229586230|ref|NC_012633.1|:140419-143319 Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome ATGCAGGGTAACTTATTAAAAGTTTTAGGAGTACTTGCTATAGTAGCAACGTTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAGTCGGTGACAGCTGCTACATGAGATATGCATCGGACGGTCA AGGAGGAGCGGATTCAATAACCGGTACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATGTAAACACTACTAAG ATGTTGTCCGACGGCACGACTCTGCTTGTTCCTGATCCTACTCGTTACGGTGAATGGCTAAATACTCAGG TGCTAGTAGAAAACAGCCAACCGGTGAATTTACAAGTGGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATAT ACCGAAAGATAATTTACAACGTACAGGGGCTGGATCTAATTTAGACGATAACGGTCAAATGATCCCGATT CCTCGTATTAACGATACAAATAATCCACCTGTCTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATAATGAATGGCGTA ATATTGCCGAATTATACGCCAATGATAGAGTTTTAGTTTCCGTATCTCCTAATTTTGCCAATACGGATGC GACAGTTAAAGATGCTTTTAAAGGTGCTGAAGTTACGCAAGATTGTTCAGAGAATAAAACTACTTATAAT CCAATTTGTGGAAAATATTCTGTTTATTCAGGTAAGTATGTCAATGCTTGCGAGTTAAAAGAGAAATATT GGAATTGTCAAGTCACATGGAGGTGCCCTAACTGGTATGAGCAAGCAGGTTGCGACTGGGGAGCATTGGG CTGTATTGCGTCTTGTCAAAAGATACCAGAATGTACAACGAAATGTATGGCTTGGGTTAATATAATGAGA CCAGCACCAGAAAACTACCTAGATGATGAGAGTTTTACATTTTCGTGGTCTGACAACACAGGTAAATTAT TTATCGACTATTCAGCCCTTCAATGTTCTTATAATGCTAATATTCCTCCAGCTGATCAATGTCCTGATCG TGTTCACGATCGTCGTACAAAAGATAAAGATTATATTGGAGGTGTACATTGTACTTCGGGCATATGTAGC GATGGAGATTTTCAAAAGAATCGGAGATTTTGGTATACGGCGGACGGTAAAGGAGGCAAAGGACCAACTG GATTAATATATCAAATGAATGATGCGGGTTCTGTAAGTCAAGCTCTGCCTTCTAAGCTAGAATTTGCTAA ATTTGTTGCAGATACAGATCAACCGCCTGACTATAAAGATAAAGACGGTAAATATTTATATAAAGTTATA TATAATATACCTTTTAACAGTGATATTGCAAAAAGTTATTTACAATATAGGCTGTGGTCGCCTACCTCAC AAGATAGTAGTAAGAATACGGGAGGATACGTTTTAAATATTAAACAGACTAAATGCTATAGAGAAAACGG TAATAGTTTTAACGATACTTTTGATGATCGAGGACGAGTGCAATACATCATAGTAAAGCCTTCGGAAAAC CCGAATACTAGCGGTAAAACCTATTCACCTCAAGGAATTAGCGTTGATAGTGAAGGTAAATATAGCTTTA ACGCAAATGAGGCGGGTTATATATGGATGAAAATTCTAAATGATCCTGGTAATAATTTAAGGGACTATAA AGATAGTGAAGGTAGCTATAAAGTACATTTCTCAACATCCTTAAAAGTAGGAAGTTTTTCTATTAAAGTA ATGAATCCGTTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTGCAAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAAAAATATGG TATGTTATAAAGCTAATGATAGTTCGTCCTGTACTAACTTTTTTACCTATATTAAAGCAATTTTAATTCT GTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTTTTACTTGGTTTTGCTAAGATAAACCAAAAAGAGCTAGTAATT AGAATAGCAAAAATCGGGGTAGTTAGCGGACTGATGAACGGTAATACCTTTGAATTTTTCAATAACTATC TTTTTGATGCAATTACCAATTTTTCAGACTCAATTATTGCTAATATGAGTGGATATAGTTTGTTTACTTC TACTAATACTATTTCTAATCCTTTCATGTTTTTAGATGCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACC TTTATCGCTCAATTACTTGCACTTCTTTCTCTTGGGCTTAGCGGTATTATATATTTTATAATTACTTTTA TTGCGGTTTGTATAGTAATTATTACGGCGCTTAGAGCTGTTGCCGTTTATATTATGGCATTTATGGCAAC TTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTATTTATTT GATAATTGGGTGAGGTTTACGATCCGCTATATGCTGGAACCGGTAGTTATGATGGCAGGTATTATAGTGC TAACACAACTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTTAGGTTATAGCGTGTGTTGGAAATGTGCTTTACC GATAAAAATTCCGTTTATCGGTACTATTTTACCTATTGCCTTGCTGAATGTACCTATCTTCTGTATTAAT TGGTTTGCCCCTTGGGGAATGGATTATATGTCGGGTATGATGGGAGTAAATATGCAAAATATCGTAGCTC TAGTTATTATTGCTTACGGTATGTACGGTTATGTCGAATTTTCAGGACGTATGGTAGTAAAATTAACTAG TGCTGTTGGGCCTTCGGCTACTGAAATTGGTGGTAAAATGTCTCATGATGCAGGACAAAAAGCATTAAGT TCAATAGGAATGGATGATAAAACAAGACAAGGTATTACCGGCAGAGCGGAAGCACGATTAAAACAACGCA ATAAGACATTAGATCAGGCTGAGAAAAATAGGAAAAATACGCCAAAAGAAGGGGGCGAGAAGACAAATGA AGAACCACCTAAACCTGAAACACCGAAATAG |