| Protein ID: 229586344 |
 T4SS name [ID] | VirB [480] |
| Gene symbol | virB4-1 |
| Locus tag | RAF_ORF0129 |
| Strain | Rickettsia africae ESF-5 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_012633] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 132785..135202 [+] |
| Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | C3PME2 |
| KEGG ID | raf:RAF_ORF0129 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 8.4e-70, Aligned region: 194..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 9.8e-36, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 2.1e-05, Aligned region: 444..576 |
| Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
| >gi|229586344|ref|YP_002844845.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia africae ESF-5] MKLFRTRAAKELRSKQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKMNGFSFETADDEDLDIKKNIRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGARSFFNELYVSILY KPDTGGVAIVEYFLKKLRQKSNKTVWENDMKEMKENLQEMSTRVINTFRSYGARLLGVRQTQSGSYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEVRSPLGKKYAGMISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFVNRTVAIGKMQLQQNRMIQSGDKATSQIAEINTALDMATSGDIAFGEHHLSLLCS ANNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLQLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LAKQDRRLSNIIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQKVRVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSRISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGIDAVVAKVSLDGMDNIISVL SGRVETVILLDQIREKHGNDPDKWLPIFYAAVKTL |
| Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
| >gi|229586230|ref|NC_012633.1|:132785-135202 Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome ATGAAATTATTTAGAACTAGAGCCGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGAAAGACCCACTTCGCATTTTA TTCCTTATAAATGTCATTGGGATAGTAATACTATTTTAACGAAAGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAA AATGAATGGATTTTCTTTTGAAACTGCTGATGATGAAGATCTAGACATTAAAAAGAATATCAGAAATGCC TTACTTAAAAATATGGCCTCGGGAAATATCGTTATGTATTTCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAA TATTTGACGATACGGAATTTACTTATGATCCTACCGTAAAAGTCCCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG TGCAGAATGGCGTAAGAAACATGCTGGGGCTAGGTCGTTTTTTAATGAATTATATGTTAGTATTTTATAT AAGCCTGATACTGGCGGTGTTGCTATAGTTGAGTATTTTCTAAAGAAGCTTAGACAGAAATCTAATAAAA CCGTTTGGGAAAACGACATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACTAGAGTGATTAATAC ATTCAGAAGTTACGGAGCAAGATTACTTGGAGTTCGTCAAACGCAGTCAGGTAGTTATTGTGAAATTTTA GAATTCCTTTCATCTTTAATCAATTGTGGCGATTCACCGGGTCCTATAGCATTACCGCGTGGTACTATTG ACGAGTATTTACCGACTCATCGCTTATTTTTTGATTCTCGTACTATTGAAGTAAGAAGTCCGCTTGGCAA GAAATATGCTGGAATGATTAGTATACTTGAATACGGTCCTAATACTTCGGCAGGAATTTTTGACGGATTC CTGCAAATGCCTTTTGAATTTGTTATGACGCAAAGCTTTGTCTTTGTTAATAGAACAGTAGCGATCGGTA AAATGCAATTACAGCAAAATAGAATGATACAATCCGGTGATAAAGCTACTTCACAAATTGCTGAAATTAA TACGGCCCTTGATATGGCCACCAGCGGTGATATCGCTTTCGGTGAGCATCATTTATCGCTTTTATGTTCC GCAAATAATATTAAAGCTTTGGAAGATATATTGTCAATGGCAGCAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTC AGCCGGTTAGAGAAAAAGTTAACATGGAACCTAGCTATTGGGGACAGTTGCCGGGAAATATGGATTATAT AGTGCGTAAATCCACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTTGCCTCACAACATAATTATCCGCTCGGT AAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTACTTGATACTACTTCAGGTACACCGTTTTATT TTAATTTCCATGTAAGGGATGTTGGACATACTCTCATTATCGGTCCAACCGGTGCTGGTAAAACAGTTCT TATGAATTTCTTATGTGCTGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGAGGA GCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAACGGAGTTTATACAGTAATTGATCCGGGTTTAAAATGCAACTTTA ACCCTTTACAGCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACGTTTATTTTAGAGTGGCTTCGTGTGCTTGTAAC TTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTATCTCAAGCGGTAAGCGGTAATTTTAGA TTAGCAAAACAAGATAGAAGGCTTAGTAATATTATAGCATTTCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTGG CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTTGGTAAAGGTTCACACGCTAAGATATTTGACAATGAAATAGATGATAT TGATTTACAAAAAGTAAGAGTATTCGGTTTTGATATGACTGAATTACTTAAAGATCCTGTAAGTCTTGCA CCGGTATTACTATATATTTTCCATCGTATTAATATCTCTTTAGATGGGCAGAAAACTATGATAGTACTTG ATGAAGCATGGGCTTTAATCGATAATCCGGTATTTGCACCTAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAG AAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTTGAAGATGCTGCAAAAAGTAGAATTAGTGAT ACGTTGATTCAACAAACAGCTACGCAGATTTTTTTACCTAATTTGAAAGCTACGGATATTTATCGTAGTG CATTTATGTTAAGTCAACGAGAATATATTTTAATTAAAACTACCGACCCTACTACACGTTATTTTTTAAT AAAACAAGGAATAGATGCCGTAGTGGCAAAAGTTAGCTTAGATGGTATGGATAACATAATCAGTGTTTTA TCCGGTAGAGTTGAGACTGTAATATTGCTCGATCAAATTAGAGAGAAACATGGCAATGATCCGGATAAAT GGTTACCTATATTTTATGCAGCAGTTAAAACATTATAA |
| Protein ID: 229587146 |
| T4SS name [ID] | VirB [480] |
| Gene symbol | virB4-2 |
| Locus tag | RAF_ORF1109 |
| Strain | Rickettsia africae ESF-5 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_012633] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1127518..1129950 [+] |
| Product | VirB4 |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | C3PLR4 |
| KEGG ID | raf:RAF_ORF1109 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 4.4e-51, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 4.4e-11, Aligned region: 436..605 |
| Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
| >gi|229587146|ref|YP_002845647.1| VirB4 [Rickettsia africae ESF-5] MFSGLRKFDKDLYNYKAPNFIPIACHYNENTLLTKDGKLLQIIKIHGITSEKISDNIQNLREMVRVSITK NITDYDFAFWLHTIREKQNLDDSTPYKKLLPANIHTLWQRKNHWNNKFVNTLYISIVHDSTKVNITNFNS LINSLSHKLITDFENNYLDSAFQKLDNITNNILNDLNEFSAEKLGIIFENDNVFSNPLFLYNRIANLNNN DCLIPIIDLSDAIGRSIYTISSDKMVVTDHEKNNKFVSLLSIKEYHETPSNTLDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQVISKLHGQDYILKITNDSTLLNHKGINKLDAANLDFQFCNQQISIAVIEEDENKLDAAVAKAST ELFKLGIIHVKEDINIEQIFWSQLPANFAFIRRMSPLSVEHIASLTALHNTTLGNQYNPWGKAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTGKTGKTVLLNFLISEATKYDPTIIYISNNNDSKIFIEAIEGKWLEPD KQIINPFLVDDTEKSQAFILEFLKLISGHYISPLSEIEISFLEKLKNKILSIEKEKRIFSDILKLEDFKE EGGIQILDKLKVFTEEQLYSGLFDGSSLNIEEGKVIGFNLYKLSDEPFSKQFYPTERKFLEQFNNNLKKH QSISAAVIYAFTYHLSLVGTKPKIFAADNFDKLYRPEIYYDNINLIYNNLSQNNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLSKPEIRKLSQLILSARMFLISKDNESIASELSIAALIG VVRILSSRQEEMDIYKKILEQHQGPPDNWVNYLYNELNTD |
| Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
| >gi|229586230|ref|NC_012633.1|:1127518-1129950 Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome GTGTTTAGTGGTTTACGAAAATTTGATAAAGATCTATATAATTATAAGGCTCCTAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATGAAAATACTTTACTTACCAAAGACGGTAAATTACTACAAATTATTAAAATACACGG CATTACCTCAGAGAAAATAAGCGATAACATACAAAATTTACGTGAAATGGTTAGAGTTTCTATAACAAAG AATATAACCGATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACATACAATACGAGAAAAACAAAACTTAGACGATTCAA CTCCTTACAAAAAATTATTACCGGCAAATATTCATACCTTATGGCAAAGAAAAAACCATTGGAATAATAA ATTCGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCTACTAAAGTTAACATCACAAATTTTAACTCT TTAATAAATTCTTTATCTCATAAATTAATTACTGATTTTGAAAATAACTACTTAGATTCAGCTTTTCAAA AATTAGACAATATCACTAATAATATTTTAAATGATTTAAACGAATTCAGTGCTGAAAAACTCGGTATAAT ATTTGAAAATGATAATGTTTTTTCTAATCCTTTATTTTTATATAATCGCATAGCTAACCTTAATAATAAT GATTGTTTGATACCTATAATAGATTTATCCGATGCAATAGGTAGAAGTATTTATACAATTAGCAGCGATA AAATGGTAGTTACGGATCATGAGAAAAATAATAAATTCGTTTCTTTACTATCTATAAAAGAATATCATGA AACTCCTTCTAATACACTGGATAAATTTTTACAGTTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTTAGCAAAAAACAAGTAATATCCAAATTGCATGGTCAAGATTATATTCTAAAAATTACTAACGACT CAACTTTACTTAATCACAAAGGGATTAATAAGCTTGATGCAGCTAATTTAGATTTTCAATTTTGTAATCA GCAAATTTCAATTGCCGTTATAGAAGAAGATGAAAATAAACTAGATGCAGCCGTAGCTAAAGCATCAACC GAACTTTTTAAACTTGGTATTATTCATGTAAAAGAAGATATTAATATTGAGCAAATATTTTGGTCGCAAT TACCTGCTAACTTTGCCTTTATACGTAGAATGTCGCCATTATCCGTAGAGCATATTGCTTCTCTTACCGC TCTTCATAATACTACACTCGGTAATCAATATAATCCTTGGGGTAAGGCTATAACTTTACTGCGAACCGAG AAAGGTACTCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGAATAAAGGCAATACTTGCATCTTTGGTACGG GGAAAACCGGCAAAACCGTATTATTGAACTTTTTAATATCAGAAGCGACTAAATACGATCCAACAATAAT TTATATCTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATCGAGGCAATAGAAGGCAAATGGTTAGAACCGGAC AAACAAATTATCAATCCATTTTTAGTAGATGATACAGAAAAATCACAAGCATTCATTTTAGAATTTTTAA AATTAATCAGTGGTCATTATATTTCACCTCTTAGCGAAATAGAGATATCCTTTCTAGAGAAATTAAAAAA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCCGATATTTTAAAATTAGAAGATTTTAAGGAG GAAGGAGGAATACAAATACTTGATAAACTTAAAGTTTTTACCGAAGAACAATTATATTCCGGATTATTTG ACGGATCGTCTCTTAACATTGAAGAAGGGAAAGTTATAGGGTTTAATTTATATAAACTTTCTGATGAGCC GTTTTCTAAACAATTTTACCCGACGGAGAGAAAATTTTTAGAACAATTTAATAATAATTTAAAGAAACAC CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTTACTTATCATTTAAGTCTAGTTGGCACAAAACCTAAAA TATTTGCTGCCGATAATTTTGATAAACTTTACAGACCTGAGATTTATTATGATAATATAAATTTAATCTA TAATAATTTGTCTCAAAATAACGGTATTTTCGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAGTCATATCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCTACCATCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAGCAAACCGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGC AAGAATGTTCTTAATTAGTAAGGATAATGAATCGATAGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGCTTTAATAGGA GTTGTCCGTATTTTATCAAGCAGACAGGAGGAAATGGATATTTATAAAAAAATACTTGAACAACACCAAG GTCCTCCAGATAATTGGGTTAATTACCTATATAATGAGTTAAATACGGACTAA |