Protein ID: 229586344 |
T4SS name [ID] | VirB [480] |
Gene symbol | virB4-1 |
Locus tag | RAF_ORF0129 |
Strain | Rickettsia africae ESF-5 |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_012633] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 132785..135202 [+] |
Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | C3PME2 |
KEGG ID | raf:RAF_ORF0129 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 8.4e-70, Aligned region: 194..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 9.8e-36, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 2.1e-05, Aligned region: 444..576 |
Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
>gi|229586344|ref|YP_002844845.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia africae ESF-5] MKLFRTRAAKELRSKQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKMNGFSFETADDEDLDIKKNIRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGARSFFNELYVSILY KPDTGGVAIVEYFLKKLRQKSNKTVWENDMKEMKENLQEMSTRVINTFRSYGARLLGVRQTQSGSYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEVRSPLGKKYAGMISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFVNRTVAIGKMQLQQNRMIQSGDKATSQIAEINTALDMATSGDIAFGEHHLSLLCS ANNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLQLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LAKQDRRLSNIIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQKVRVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSRISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGIDAVVAKVSLDGMDNIISVL SGRVETVILLDQIREKHGNDPDKWLPIFYAAVKTL |
Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
>gi|229586230|ref|NC_012633.1|:132785-135202 Rickettsia africae ESF-5 chromosome, complete genome ATGAAATTATTTAGAACTAGAGCCGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGAAAGACCCACTTCGCATTTTA TTCCTTATAAATGTCATTGGGATAGTAATACTATTTTAACGAAAGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAA AATGAATGGATTTTCTTTTGAAACTGCTGATGATGAAGATCTAGACATTAAAAAGAATATCAGAAATGCC TTACTTAAAAATATGGCCTCGGGAAATATCGTTATGTATTTCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAA TATTTGACGATACGGAATTTACTTATGATCCTACCGTAAAAGTCCCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG TGCAGAATGGCGTAAGAAACATGCTGGGGCTAGGTCGTTTTTTAATGAATTATATGTTAGTATTTTATAT AAGCCTGATACTGGCGGTGTTGCTATAGTTGAGTATTTTCTAAAGAAGCTTAGACAGAAATCTAATAAAA CCGTTTGGGAAAACGACATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACTAGAGTGATTAATAC ATTCAGAAGTTACGGAGCAAGATTACTTGGAGTTCGTCAAACGCAGTCAGGTAGTTATTGTGAAATTTTA GAATTCCTTTCATCTTTAATCAATTGTGGCGATTCACCGGGTCCTATAGCATTACCGCGTGGTACTATTG ACGAGTATTTACCGACTCATCGCTTATTTTTTGATTCTCGTACTATTGAAGTAAGAAGTCCGCTTGGCAA GAAATATGCTGGAATGATTAGTATACTTGAATACGGTCCTAATACTTCGGCAGGAATTTTTGACGGATTC CTGCAAATGCCTTTTGAATTTGTTATGACGCAAAGCTTTGTCTTTGTTAATAGAACAGTAGCGATCGGTA AAATGCAATTACAGCAAAATAGAATGATACAATCCGGTGATAAAGCTACTTCACAAATTGCTGAAATTAA TACGGCCCTTGATATGGCCACCAGCGGTGATATCGCTTTCGGTGAGCATCATTTATCGCTTTTATGTTCC GCAAATAATATTAAAGCTTTGGAAGATATATTGTCAATGGCAGCAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTC AGCCGGTTAGAGAAAAAGTTAACATGGAACCTAGCTATTGGGGACAGTTGCCGGGAAATATGGATTATAT AGTGCGTAAATCCACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTTGCCTCACAACATAATTATCCGCTCGGT AAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTACTTGATACTACTTCAGGTACACCGTTTTATT TTAATTTCCATGTAAGGGATGTTGGACATACTCTCATTATCGGTCCAACCGGTGCTGGTAAAACAGTTCT TATGAATTTCTTATGTGCTGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGAGGA GCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAACGGAGTTTATACAGTAATTGATCCGGGTTTAAAATGCAACTTTA ACCCTTTACAGCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACGTTTATTTTAGAGTGGCTTCGTGTGCTTGTAAC TTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTATCTCAAGCGGTAAGCGGTAATTTTAGA TTAGCAAAACAAGATAGAAGGCTTAGTAATATTATAGCATTTCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTGG CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTTGGTAAAGGTTCACACGCTAAGATATTTGACAATGAAATAGATGATAT TGATTTACAAAAAGTAAGAGTATTCGGTTTTGATATGACTGAATTACTTAAAGATCCTGTAAGTCTTGCA CCGGTATTACTATATATTTTCCATCGTATTAATATCTCTTTAGATGGGCAGAAAACTATGATAGTACTTG ATGAAGCATGGGCTTTAATCGATAATCCGGTATTTGCACCTAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAG AAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTTGAAGATGCTGCAAAAAGTAGAATTAGTGAT ACGTTGATTCAACAAACAGCTACGCAGATTTTTTTACCTAATTTGAAAGCTACGGATATTTATCGTAGTG CATTTATGTTAAGTCAACGAGAATATATTTTAATTAAAACTACCGACCCTACTACACGTTATTTTTTAAT AAAACAAGGAATAGATGCCGTAGTGGCAAAAGTTAGCTTAGATGGTATGGATAACATAATCAGTGTTTTA TCCGGTAGAGTTGAGACTGTAATATTGCTCGATCAAATTAGAGAGAAACATGGCAATGATCCGGATAAAT GGTTACCTATATTTTATGCAGCAGTTAAAACATTATAA |