Protein ID: 225685392 |
T4SS name [ID] | Tra_F [803] |
Gene symbol | - |
Locus tag | PERMA_A0031 |
Strain | Persephonella marina EX-H1 |
Replicon | plasmid unnamed [GenBank: NC_012439] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 20265..23756 [-] |
Product | hypothetical protein |
Component type | TraG_F |
UniProt ID | C0QUW0 |
KEGG ID | pmx:PERMA_A0031 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TraG_N [PF07916], Evalue: 5.5e-48, Aligned region: 7..468 |
Protein Sequence: 1163 a.a. [Download] |
>gi|225685392|ref|YP_002729759.1| hypothetical protein PERMA_A0031 [Persephonella marina EX-H1] MAIDLDLYTVGNIETLSQVYKYLVLILGDSFIGTVIKITAVWGLIFAILASAFKGRFSIWIYHFLMTYVL FQIFFMPVVRLTIIDTKLDRTYVVDNVPFGVGFIASMASGFSYKLTNLIDNAFHTGTVVVWGPGTGSYVA GVDYSRMGFAGMFDYLKMGLKIDPRLVQTKFNAVYEMQAYIEQCFFPYVSTLSATEIDNLRKSNNLLADL RVDNSFLMSYNGTTWTCDDFYDNKLVPDWNDFVNTGATTPQLFGFADYMTVRMVDSINAMTNASMSFNQI ITQSGIINMIKESYFTSGLADDMNNRLLAGYAVGRAEEQAKLMGKAMFLWAKKVIPFMQGFLEAFFVILF PFLIILLFIPLVSFGGVQPAIGYLKVIVWVYLFIPILAIIDGMIKLQAINKTIAWLNSVGLQGITLGDYG FLLEQADFYPAIAGFAAMSTPLWAWMLLKGFEAGVHGISALVGSMGSQFVGQEAGAANITRNMTRDSREL MANMGAGQSPVEALSNAGTWMYKENTNLGGLYSSLGAYNAHSILESQLGIGGAVQTTTAQALYGLTHSGG RGMAAWNASGGNVMNMLNTGAMTSPAQIIERDYGTLGLKYDAQGNLVAAEFNTGIKSDMMQANLQTTFSQ SRNDVISTAWNAVWGNSQTYQKAYQSTSAITEQFLKDYTSGTGIEDRASFDNRAEVKEAFTDAKELRDTL TEEYGLSKDKANQFVAEFTTGLSAAAAKNGGKLDINTVKDVFKSVLSKFKADGSVGAKGIENFEETEAWK EATQYADNKSYQIVQDTALSYTTSHNAYFNRVKQEKGAELQDVSYQDLQQFHENWQKAEQITAQINRAFN QTQTELGSLNTNNLIGFIRWMNGGHIDKQKETMMMDRILTAVANNDKPFLDNLSKAYTAYVMEMQGMTDV SPGVSKFFTQKQAFLNMVQGQVDNAAVNIATHFNQHYEGINTLRNMAGVSPYQNLQAEAGDRFAYVGSNQ ASIENGVYAGKGNIKPISKPQWTGEVEQYTKDPTNPIELGKNIVNYGKEHGAWGTAMAVGTGSVILGTAM EYAPWAKQAFDTMKSGASKVWTTIRTAEPIAEMGTGRWAQFAAGGRLLTIPVGTTAGVAMAATTVPLAAV GGWAIGTAINNKWGDDIYNNFTEPVLDWIGEKTGWWKPVGGNK |
Nucleotide Sequence: 3492 bp [Download] |
>gi|225685337|ref|NC_012439.1|:c23756-20265 Persephonella marina EX-H1 plasmid unnamed, complete sequence ATGGCTATTGATTTAGACCTTTATACAGTTGGGAACATAGAAACCTTATCACAGGTATATAAGTATCTGG TTTTAATACTGGGTGATAGTTTTATAGGAACTGTTATAAAAATCACAGCTGTATGGGGGCTGATTTTTGC CATTCTTGCTTCTGCTTTCAAGGGTCGGTTTTCCATCTGGATATATCATTTCTTGATGACCTATGTTCTT TTCCAGATATTCTTTATGCCTGTTGTTCGGCTTACCATCATAGATACAAAGCTTGATAGAACTTATGTTG TGGATAATGTGCCTTTTGGAGTGGGTTTTATTGCTTCAATGGCAAGTGGATTTTCTTATAAACTTACAAA CCTAATAGATAATGCTTTTCATACTGGAACTGTTGTTGTCTGGGGACCGGGAACTGGTAGTTATGTGGCA GGCGTTGATTATTCCAGAATGGGCTTTGCTGGAATGTTTGACTATTTAAAGATGGGGCTAAAAATAGACC CACGGCTTGTTCAAACAAAATTTAATGCTGTTTATGAAATGCAAGCTTATATAGAACAGTGTTTCTTTCC TTATGTGTCAACCTTAAGTGCAACGGAAATAGATAATCTTAGAAAAAGCAATAACCTGTTAGCAGATTTA AGAGTAGATAATTCTTTCCTTATGAGTTATAACGGCACTACTTGGACTTGTGATGATTTTTATGACAATA AACTCGTTCCTGATTGGAATGATTTTGTAAATACTGGAGCTACTACACCACAACTCTTTGGCTTTGCAGA CTATATGACTGTTCGTATGGTTGATAGTATCAATGCAATGACTAATGCAAGCATGTCATTTAACCAGATA ATTACCCAGTCAGGAATTATCAATATGATAAAGGAAAGCTATTTTACTTCTGGTCTTGCCGATGACATGA ATAATAGACTACTTGCTGGATATGCTGTCGGTAGGGCTGAAGAACAGGCAAAGCTTATGGGTAAAGCAAT GTTCTTATGGGCTAAAAAGGTTATTCCATTTATGCAAGGCTTCCTTGAGGCATTCTTTGTAATTCTGTTT CCGTTTTTAATAATCTTATTGTTTATACCACTTGTTTCTTTCGGGGGTGTCCAGCCAGCTATTGGATACC TTAAGGTGATAGTATGGGTTTATCTTTTTATTCCGATTTTAGCAATAATAGATGGAATGATAAAACTACA AGCTATAAATAAAACAATAGCTTGGCTTAATTCTGTTGGACTTCAGGGTATTACACTTGGAGACTATGGG TTCTTGTTGGAACAGGCAGATTTTTATCCTGCAATTGCTGGATTTGCCGCAATGTCAACTCCACTTTGGG CTTGGATGCTATTAAAGGGTTTTGAGGCAGGAGTTCATGGAATTAGTGCATTAGTAGGTTCTATGGGAAG TCAATTTGTAGGACAGGAAGCTGGAGCTGCAAACATAACAAGAAATATGACAAGAGACAGCAGAGAGCTT ATGGCAAATATGGGTGCTGGTCAATCTCCAGTAGAGGCGTTATCCAATGCAGGAACTTGGATGTATAAAG AAAATACAAATTTAGGCGGGTTATATAGCAGTTTAGGTGCTTATAATGCACATTCTATTTTAGAAAGTCA ACTTGGCATTGGAGGGGCTGTTCAGACAACAACAGCACAAGCTTTATATGGACTTACACACTCAGGTGGT AGAGGTATGGCTGCTTGGAATGCCTCTGGTGGAAATGTAATGAATATGCTAAATACTGGAGCTATGACTT CACCAGCACAAATCATAGAAAGAGACTATGGAACTCTTGGTCTTAAATATGATGCACAAGGAAACTTGGT AGCCGCTGAATTTAATACGGGAATAAAATCAGATATGATGCAAGCAAACCTGCAAACAACATTTTCTCAA TCCAGAAACGATGTTATATCAACTGCTTGGAACGCAGTCTGGGGTAATAGCCAGACATATCAAAAAGCTT ATCAATCTACATCTGCTATAACAGAGCAGTTTTTAAAAGACTACACATCTGGAACGGGTATAGAGGATAG AGCTTCATTTGATAATAGGGCAGAAGTAAAAGAAGCCTTTACAGATGCAAAAGAGTTAAGAGATACACTA ACGGAAGAATATGGACTATCAAAAGATAAAGCTAATCAGTTTGTTGCAGAATTTACGACAGGGTTAAGTG CAGCAGCTGCTAAAAACGGCGGTAAGTTGGATATTAATACCGTTAAAGATGTATTTAAAAGTGTTCTATC TAAATTTAAAGCAGATGGTTCTGTTGGTGCTAAAGGAATTGAAAATTTTGAGGAAACAGAGGCTTGGAAA GAAGCTACTCAATATGCAGATAATAAGTCCTATCAAATTGTTCAAGATACAGCTTTATCATATACAACAA GTCATAATGCATATTTCAACAGGGTAAAACAAGAAAAAGGAGCGGAACTTCAGGATGTTTCTTATCAAGA CTTACAACAGTTCCATGAGAATTGGCAAAAAGCAGAACAGATTACAGCACAAATTAATAGGGCATTTAAT CAAACACAAACGGAGCTTGGAAGTTTAAATACAAATAACCTAATAGGATTTATTAGATGGATGAATGGAG GACATATAGATAAGCAGAAAGAAACTATGATGATGGATAGAATTCTTACAGCTGTGGCTAATAATGACAA GCCATTTTTAGATAATTTGTCAAAAGCCTATACTGCTTATGTTATGGAAATGCAAGGGATGACAGATGTA TCTCCAGGGGTATCAAAATTTTTCACTCAAAAGCAGGCTTTCCTAAATATGGTTCAGGGTCAGGTAGATA ATGCCGCAGTTAACATAGCTACTCATTTTAATCAGCACTACGAAGGGATAAATACACTAAGAAATATGGC AGGTGTTAGTCCATACCAGAACCTTCAAGCTGAAGCTGGAGACAGATTTGCTTATGTTGGTTCAAATCAA GCAAGTATTGAAAATGGTGTTTATGCTGGAAAAGGGAATATAAAGCCTATCAGTAAGCCTCAATGGACTG GAGAAGTGGAGCAATATACAAAAGACCCCACAAATCCGATAGAGCTTGGAAAAAACATAGTTAACTATGG AAAGGAGCATGGGGCTTGGGGAACTGCAATGGCTGTGGGAACTGGAAGTGTTATTTTGGGAACTGCTATG GAATATGCACCTTGGGCTAAACAAGCATTTGATACAATGAAAAGTGGAGCTTCAAAAGTATGGACAACTA TTAGAACTGCTGAACCAATAGCAGAAATGGGAACGGGTAGATGGGCACAGTTTGCAGCTGGAGGCAGGTT ATTAACTATTCCTGTTGGAACTACTGCTGGTGTAGCAATGGCGGCAACGACAGTTCCTCTTGCGGCAGTG GGAGGCTGGGCAATAGGAACAGCTATAAACAATAAATGGGGAGATGACATTTATAACAACTTTACTGAAC CAGTCTTGGACTGGATTGGTGAAAAAACAGGATGGTGGAAACCAGTAGGAGGGAACAAGTGA |