Protein ID: 165932717 |
T4SS name [ID] | VirB [486] |
Gene symbol | virB6.4 |
Locus tag | RrIowa_0182 |
Strain | Rickettsia rickettsii str. Iowa |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_010263] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 145160..147835 [+] |
Product | channel protein |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | B0BW74 |
KEGG ID | rrj:RrIowa_0182 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9.6e-21, Aligned region: 521..715 |
Protein Sequence: 891 a.a. [Download] |
>gi|165932717|ref|YP_001649506.1| channel protein [Rickettsia rickettsii str. Iowa] MKILKSLVLLVLFMAMPAKADDAFSWMSTSFSGLKSLFGCLEVPEFTSFQEGNIGINLSTAGIWQSTGNT VQKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFSMPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTNNNSETPGTI PPDKDLDALSFTKMSDFVKYFNYSNGNSRIEVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNTLKLPNTVDNILTQELDS SIFAASALYTQSNLGDFDNRIIYSSAEQVCNMIDEERKSVCSGTGTATKYKNTDNGVIVGKPMITGAVQY FMGLIKACPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVNSGNTQSSFIYYQATSGGTMDFTSD WQVSNMFSNSVLMSDWSRNFSNYASFVDYINKNDWSANFLYFGCYSMIVEIGNGANSINPDDQQNIKLEY LITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFATDAPQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIK PITDQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNLAKTALTLYVTIFGLMFVTGALKLTAVEVITRICKIAIVAFLIRE ESWSFFNTYFFSVFTDGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIA IITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLI FFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLGIPIHFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISSSNILT NNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYSLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMQDIDSVTKPI KKAAMAPARVFKDKIIDQNYKARKPEVGGEFTNKFLAERNDVKKEEGEQKE |
Nucleotide Sequence: 2676 bp [Download] |
>gi|319717301|ref|NC_010263.2|:145160-147835 Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATGGCGATGCCAGCTAAAGCCGATGATGCTT TTTCATGGATGTCAACCAGTTTTAGTGGGTTAAAAAGCTTATTCGGTTGTTTAGAAGTGCCTGAATTTAC AAGTTTTCAAGAGGGTAATATAGGAATTAATTTATCTACAGCCGGAATTTGGCAATCAACAGGTAATACT GTTCAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAATTGGTCTACTTCAGGTATTACTCCTGAACCTAGAAAATATC TAGTATTATATAGAATTGATCCAAGGTTTAGTATGCCGCAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAA ATTACAATTTGAAGCTTTAGGGTTTCCTCGTTTTGTTACAAACAATAACAGTGAAACACCGGGAACTATA CCGCCTGATAAAGACCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATTTTGTTAAATATTTTAACTATT CTAACGGTAATTCGAGAATTGAAGTTAAGGCCGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTGGTAAAGATAA TTTTTTTAGCCCTAATACTCTAAAACTTCCTAATACCGTAGATAATATTTTAACACAGGAACTTGATAGC TCGATATTCGCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGAGATTTTGATAATAGAATAATTTACT CTTCTGCAGAGCAGGTGTGTAATATGATAGATGAGGAAAGAAAAAGTGTATGTAGCGGCACGGGTACTGC TACAAAGTATAAAAATACCGATAATGGAGTAATAGTCGGTAAGCCTATGATAACGGGAGCGGTACAGTAT TTCATGGGCTTAATTAAGGCTTGTCCTGCTAATGCCGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTATTACGATC AAGGTAGAGGGATGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAAGGGACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTC AGGCAATACTCAAAGTAGCTTTATATATTATCAAGCCACTAGCGGTGGTACTATGGATTTTACTAGCGAT TGGCAAGTTAGTAACATGTTTAGTAATTCAGTTTTAATGAGTGATTGGAGCCGAAATTTTTCAAATTATG CTAGTTTTGTAGATTATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTTGGTTGTTATTCGAT GATTGTTGAAATAGGTAATGGGGCAAATTCAATTAATCCTGATGATCAACAAAATATAAAGTTAGAATAT TTAATAACGTCTGATGGTACATTACCTGATCCATCTGTTCGTGGTACGCCGGTAGATTATAACTTTGCGA CTGATGCCCCGCAAGATGGATATTTATGGTTAAGGGTGGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTAGT TAGTGTAAATTATGCTAATTATACCGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATATATAACGGTGCTATTAAA CCTATTACCGATCAGTTTAGAACTTTTAGTCAAAACTTTTATATTAAGTTAGTTAAAAATTCTGCAGTGC AGAATTTAGCTAAAACTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGGCTAATGTTCGTTACAGGAGCATT AAAATTAACTGCTGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATAGCTATAGTAGCTTTTTTAATTAGAGAA GAAAGTTGGAGCTTCTTTAATACATACTTCTTTAGTGTATTTACTGACGGTATTGATTTCTTTGTAACTA ATGTAGTAGGTGCTACAAGCTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATAC TAACGGTAGGATTTGGGGATTACTATTTATTGAATTATTACAAATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCT ATTATAACCATTTATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGTTATGTTATTG CATTCATAGGGGTAACTGTTATGATTTCATTGGCACCATTTTTTATAATATTAATGTTATTTGAAAAAAC TAAAAGTTTATTTGATAATTGGATATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTGCAGCCGACAATATTATTGATT TTCTTTTTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTGGTAGTTAGAGCCTGTTGGGATA CTCTTATACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAACAAATCTTGGTATTCCGATTCATTTCTCTTTTACATT ACCGTTCTTACCCGGAATACCTTTCTATGTACCGGATGTTCCAGAAATTAGTAGCTCGAATATTCTAACG AACAATGCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTATTATTTTATTCATATTGCTTGATGTCAT ATAGTTTAGTAACTTTTGTAAATATAGTAGTTGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGAATATCAGG AAATTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCGTTATGCAGGATATAGATTCAGTAACAAAACCGATT AAAAAGGCTGCAATGGCTCCGGCTAGAGTTTTCAAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAGAA AACCGGAAGTAGGTGGTGAATTTACAAATAAATTTCTTGCTGAGCGTAATGATGTGAAGAAAGAGGAAGG AGAGCAGAAAGAATAA |