Protein ID: 165932715 |
T4SS name [ID] | VirB [486] |
Gene symbol | virB6.2 |
Locus tag | RrIowa_0180 |
Strain | Rickettsia rickettsii str. Iowa |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_010263] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 140104..142089 [+] |
Product | channel protein |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | B0BW72 |
KEGG ID | rrj:RrIowa_0180 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9e-15, Aligned region: 407..495 |
Protein Sequence: 661 a.a. [Download] |
>gi|165932715|ref|YP_001649504.1| channel protein [Rickettsia rickettsii str. Iowa] MKTLKTLKIFIIVCITSVSLASFADFGESCSSLPITSDWYLEMNTAYGYIIRNIDMKDPRGNCNSVASSI TFCFKNVEGSSSPCTMYTLNEGDSKKISDLSTDNNPDLGANPVLKNIVLTVKKWDNDLCLVMPTSRGPMP VACKSLSATPTPPPPEDENCNIGKSCYTGANYSQSLINFSGLAVQCLSATLNKIFFAGKSCSAQDQNSRI TNLAAFSTFQGYLKRIIGAALILYTMFFAFNMALNTEYASTEKIALFVIKFLFVAYFSIGLGPLDFSGGQ PTKENGMLKYGLPLLTGAAPDFAQMIFNAAGSRGLCQFDNSKYKDGYKFYGLWDAIDCRIGYYLGLDLLY NIDKNGVLGNVVGNGPRGNNTPIPNFDPEGKNDRPKDLSKAGALRFFTVMFGFFMAGNVIIFAAGLIFSV IFLSILLYFITHYLVCMITIYVMTYISPIFIPMALFTRTKAYFDGWLKVCMSCALQPAVLAGFIALLITM YDSAIFKNCEFLRYDYEKGDIRFSTFELRLPVGGADQCQESFGYKMLEYYAGKGWEEHLLILFPIKSIVR DVVSILAELLCVLVFSVIFYYFSKSIGRFASDLTNGPNMDAVTASPTKIIGLVKKGAAFLKDAAMASQGK PLVGDKPGVGGKRKEGQQQGRDLASGSGGGK |
Nucleotide Sequence: 1986 bp [Download] |
>gi|319717301|ref|NC_010263.2|:140104-142089 Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATAGTTTGTATAACGTCTGTAAGCTTAGCTAGCTTTG CCGACTTTGGAGAATCATGTTCTAGTTTACCGATTACTTCAGATTGGTATTTAGAAATGAACACGGCATA TGGCTATATAATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCAAGAGGTAATTGTAACTCAGTTGCGTCTAGTATA ACGTTTTGTTTTAAAAATGTAGAAGGTAGTAGTAGCCCTTGCACCATGTATACTTTAAATGAAGGTGACT CTAAAAAGATTAGTGATTTAAGCACCGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTAAAGAATAT CGTTTTAACGGTTAAAAAATGGGATAATGATCTATGTTTAGTTATGCCTACGTCAAGGGGACCGATGCCG GTAGCATGTAAATCTTTGAGTGCTACACCGACTCCACCTCCTCCTGAGGATGAGAATTGTAATATAGGAA AAAGTTGCTATACGGGAGCAAATTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT GAGTGCAACGCTTAATAAAATATTTTTTGCTGGAAAGAGTTGTAGTGCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA ACTAATCTTGCTGCTTTTTCTACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGAATTATAGGTGCGGCATTAATTCTTT ATACTATGTTTTTTGCTTTTAATATGGCTCTAAATACAGAATATGCAAGTACTGAAAAAATAGCTCTTTT TGTAATAAAATTCTTATTTGTTGCTTATTTTTCTATCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGTGGTGGTCAG CCGACAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATATGGATTACCTCTTTTGACAGGAGCAGCACCGGACTTTGCAC AGATGATCTTTAATGCAGCAGGTTCTAGAGGATTATGTCAATTTGATAATTCAAAGTATAAGGACGGTTA TAAATTTTACGGTTTATGGGACGCGATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGCTTGGATTTACTTTAT AATATAGATAAGAATGGAGTGTTAGGGAATGTGGTCGGCAATGGTCCCCGTGGTAATAATACACCTATAC CTAATTTTGATCCTGAAGGCAAAAATGACAGACCGAAGGATTTAAGTAAAGCAGGAGCACTTAGATTTTT TACCGTTATGTTTGGATTCTTTATGGCCGGAAATGTTATTATATTTGCAGCAGGTTTAATATTTTCTGTA ATATTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATTTAGTGTGCATGATTACTATTTATGTTATGA CATATATTTCTCCTATATTCATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGACGGGTGGCT AAAAGTATGTATGTCATGTGCATTGCAGCCGGCAGTATTAGCAGGTTTTATAGCTTTATTAATAACTATG TATGATTCCGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCCTTAGATATGATTATGAAAAAGGGGATATTAGATTTA GTACTTTTGAGTTAAGGCTTCCTGTTGGCGGGGCAGATCAATGTCAGGAAAGTTTTGGATATAAAATGTT AGAATATTATGCAGGTAAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTGATACTTTTCCCAATAAAATCAATTGTTAGA GATGTTGTATCTATTTTAGCAGAACTTTTATGCGTATTAGTATTTTCGGTTATTTTTTATTACTTCTCTA AATCTATAGGGCGATTTGCTTCTGATTTAACTAATGGTCCTAATATGGATGCAGTAACGGCAAGTCCCAC TAAAATTATTGGTTTAGTAAAGAAAGGAGCAGCTTTCCTTAAGGATGCTGCTATGGCTTCGCAAGGTAAG CCGCTGGTAGGAGATAAGCCGGGTGTTGGAGGTAAGCGTAAAGAGGGGCAGCAGCAAGGCAGGGATTTAG CAAGCGGTTCGGGTGGAGGTAAATGA |