| Protein ID: 165932714 |
 T4SS name [ID] | VirB [486] |
| Gene symbol | virB6.1 |
| Locus tag | RrIowa_0179 |
| Strain | Rickettsia rickettsii str. Iowa |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010263] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 137157..140117 [+] |
| Product | channel protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | B0BW71 |
| KEGG ID | rrj:RrIowa_0179 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.1e-12, Aligned region: 504..579 |
| Protein Sequence: 986 a.a. [Download] |
| >gi|165932714|ref|YP_001649503.1| channel protein [Rickettsia rickettsii str. Iowa] MKLFPRSILITLVLSFALNLGIVTKTHAKDTLDSIVDILSGLTCETQGVGDLLRTEFSHTCIVAPFFTFA VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCTRENRIDPKNPELRFALCNNAKLIVSRAKSVA ESALAIAKAVLTGSDPWDDIKTAWANKKKEYHVPYSGKPGDDGFAFDLGFPVIYWKVIQDKDRICVSTKG FTGDVPVGCKYMKEPFPKSMYNSFMDVADKDFIEDPNKTPTDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAVVM TSPLIECMRQMIARLLISKDVCSFDNVSQVVNLVSRQDSAFFQFQVGMYKIVTAFLTLYVMFFGFKLLLA GEVPPKSEYINFILKMIFVTYFSIGINITPGNGSPYDRLDGMIQWAFPFLLDGINGLASWVMNAAPSGLC KFNNLSYDGTVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENAYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLLIPAIIS GNMMLVSLALAYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFAYTRNYFESWVKLMISFLLQ PMVVVTFMITMFSVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKIQGGITSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDAVE SCQNSLGYMLNNPITTVFNFTKDSVSEIVDSKPGNTPTDKFLAKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKIK NILLALVMACFTLYLMYNFSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAVLATAGAATQGGDQIASR GGVGDLKAGQGGGVSDLEVGKGGLPNDNIATSGGMSTPTASSSVATSSPKTVSSEARSDVVTPPAPTEAV SPPPASIRTSISTPAPRVGKIIRDNNQESKKEIDNTLPSQEKVDAPQEKVNSTSKGTGVIDYSFNLKEHD NPTGVKQIQENAEIRDKRVKVEKAWNELVASGGGRVREQEGGEISERRANAEKAWDELVKSGVVTEKKDN SSNENS |
| Nucleotide Sequence: 2961 bp [Download] |
| >gi|319717301|ref|NC_010263.2|:137157-140117 Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome ATGAAATTATTTCCTCGTAGTATACTTATAACATTAGTATTAAGCTTTGCCCTAAATTTAGGGATAGTTA CTAAAACTCATGCTAAAGATACTCTTGATAGCATTGTAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACCCA AGGCGTAGGCGATTTGCTGCGTACTGAATTTTCTCATACATGTATTGTTGCTCCGTTCTTTACTTTTGCG GTAATGAATCTTGTCTCTCCCGTTTTATACATGAATACGTTTTTAAAGCTTAAAATAAACGACAGTGATT TATTTAACGATAGTAACTTTGGGAATTTTCCCGGAGGTCAATGTACTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA AAATCCAGAATTACGCTTTGCTTTATGTAATAATGCTAAATTAATTGTATCTCGGGCAAAATCTGTTGCA GAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTCTTAACAGGGAGTGACCCTTGGGATGATATAAAGACAGCGT GGGCAAATAAAAAAAAGGAATATCATGTTCCATATAGTGGTAAGCCCGGTGATGACGGTTTTGCATTTGA TTTAGGCTTTCCTGTAATATATTGGAAAGTTATTCAAGATAAAGATAGAATATGCGTATCGACAAAAGGA TTTACAGGAGATGTTCCCGTTGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCAAAATCCATGTATAATAGCT TTATGGATGTAGCAGATAAGGATTTTATTGAGGATCCAAATAAAACTCCTACCGATCCTTTAGCTTTAGT TTCCTGTAGTGCAGCGGGTGATGGATGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAGTAGTAATG ACTTCTCCTCTTATAGAATGTATGAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGATGTTTGTAGTT TTGATAATGTAAGCCAAGTGGTTAATTTGGTTTCAAGGCAAGATAGTGCATTCTTTCAGTTTCAAGTAGG AATGTATAAAATAGTTACGGCTTTTCTCACTTTATATGTTATGTTTTTTGGCTTTAAACTATTACTTGCA GGTGAAGTGCCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATGATATTCGTAACTTATTTTTCAA TAGGAATTAATATAACCCCTGGTAATGGTTCTCCGTATGACCGGTTAGACGGCATGATTCAGTGGGCGTT TCCTTTCTTACTTGACGGTATAAACGGTTTAGCAAGTTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCCGGTTTATGT AAATTTAACAATCTTTCTTATGACGGTACCGTTTCTTATATTGCATTATGGGATGCATTAGATTGTAGGG TAGCTCATTATTTAGGGCTTGATATATTATCTACGTTACTTGTCGAAAATGCTTATCGCAGTCATGATTT TTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCTCCACCATATATTTATTTGCTAATTCCGGCGATAATCTCC GGTAATATGATGTTGGTGTCACTCGCTCTTGCTTATCCATTACTTGTGATTTCGGTTGCTGCCTTTATGG TTAATGCAACGATTATGTGTATGATATCTATAGTAATACTCGGTATTTTGGCTCCTCTTTTTGTACCTAT GTTTTTATTCGCATATACAAGAAATTATTTTGAGAGCTGGGTTAAACTAATGATCTCGTTCTTGCTACAA CCTATGGTGGTAGTTACTTTTATGATCACGATGTTTTCGGTATATGATTATGGTTTCTATGGTAAATGTC AATATAAGAGCAAGTTAATTCACAATAGTATAGAAGACAAAATTCAAGGTGGCATTACTTCTAAGAGGGA TGTTTTAATATTTTACATTAATAATGATTGGGATGATACGTCACAGTATCCTGATAAAGATGCCGTAGAA AGCTGTCAAAATAGTTTAGGTTATATGTTAAATAACCCTATTACCACGGTATTTAACTTTACAAAAGATA GTGTAAGTGAAATTGTCGATAGTAAACCGGGTAATACCCCTACCGATAAATTTCTTGCTAAATTCCAGTT TTTATCAGGAGTAGTTTTAGGGCCCGGAATGTTTTTCATGTCTCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATTAAA AATATTTTGCTTGCGTTAGTTATGGCATGTTTTACATTGTATTTGATGTATAATTTTAGTAGTCAGCTAG CTGAATTTGCTGCAGATATGACGGAAGGAGTAGCTCTTAATAATGTTGCTATAAAACCGCAAGCAATATT TAAGGCAGCTATGGCAGTACTTGCTACTGCGGGTGCTGCAACTCAGGGGGGCGATCAGATAGCAAGTAGA GGAGGAGTTGGTGATTTAAAAGCTGGTCAAGGTGGAGGAGTAAGTGATTTAGAGGTAGGGAAAGGCGGAC TACCAAATGATAATATTGCTACAAGCGGAGGTATGTCGACGCCGACAGCTTCGTCTTCTGTAGCAACTTC TAGCCCAAAAACTGTAAGTAGTGAAGCAAGATCAGATGTTGTGACTCCTCCTGCTCCTACAGAAGCTGTT TCACCACCGCCTGCTAGTATTAGAACTTCTATTTCTACACCTGCACCACGTGTTGGAAAAATCATAAGAG ATAATAATCAAGAAAGTAAAAAAGAGATTGATAATACTCTGCCTTCACAAGAAAAAGTTGATGCTCCACA AGAAAAAGTTAACAGCACAAGTAAAGGTACAGGAGTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGAT AATCCGACAGGCGTAAAACAGATACAGGAAAATGCAGAGATTCGAGATAAACGTGTAAAAGTAGAAAAAG CATGGAATGAACTAGTAGCAAGCGGAGGAGGAAGAGTAAGAGAACAAGAAGGAGGAGAAATATCAGAACG ACGTGCAAATGCTGAAAAGGCATGGGATGAGTTAGTAAAAAGCGGCGTAGTAACAGAAAAAAAAGATAAT AGTTCTAATGAAAACTCTTAA |
| Protein ID: 165932715 |
| T4SS name [ID] | VirB [486] |
| Gene symbol | virB6.2 |
| Locus tag | RrIowa_0180 |
| Strain | Rickettsia rickettsii str. Iowa |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010263] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 140104..142089 [+] |
| Product | channel protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | B0BW72 |
| KEGG ID | rrj:RrIowa_0180 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9e-15, Aligned region: 407..495 |
| Protein Sequence: 661 a.a. [Download] |
| >gi|165932715|ref|YP_001649504.1| channel protein [Rickettsia rickettsii str. Iowa] MKTLKTLKIFIIVCITSVSLASFADFGESCSSLPITSDWYLEMNTAYGYIIRNIDMKDPRGNCNSVASSI TFCFKNVEGSSSPCTMYTLNEGDSKKISDLSTDNNPDLGANPVLKNIVLTVKKWDNDLCLVMPTSRGPMP VACKSLSATPTPPPPEDENCNIGKSCYTGANYSQSLINFSGLAVQCLSATLNKIFFAGKSCSAQDQNSRI TNLAAFSTFQGYLKRIIGAALILYTMFFAFNMALNTEYASTEKIALFVIKFLFVAYFSIGLGPLDFSGGQ PTKENGMLKYGLPLLTGAAPDFAQMIFNAAGSRGLCQFDNSKYKDGYKFYGLWDAIDCRIGYYLGLDLLY NIDKNGVLGNVVGNGPRGNNTPIPNFDPEGKNDRPKDLSKAGALRFFTVMFGFFMAGNVIIFAAGLIFSV IFLSILLYFITHYLVCMITIYVMTYISPIFIPMALFTRTKAYFDGWLKVCMSCALQPAVLAGFIALLITM YDSAIFKNCEFLRYDYEKGDIRFSTFELRLPVGGADQCQESFGYKMLEYYAGKGWEEHLLILFPIKSIVR DVVSILAELLCVLVFSVIFYYFSKSIGRFASDLTNGPNMDAVTASPTKIIGLVKKGAAFLKDAAMASQGK PLVGDKPGVGGKRKEGQQQGRDLASGSGGGK |
| Nucleotide Sequence: 1986 bp [Download] |
| >gi|319717301|ref|NC_010263.2|:140104-142089 Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATAGTTTGTATAACGTCTGTAAGCTTAGCTAGCTTTG CCGACTTTGGAGAATCATGTTCTAGTTTACCGATTACTTCAGATTGGTATTTAGAAATGAACACGGCATA TGGCTATATAATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCAAGAGGTAATTGTAACTCAGTTGCGTCTAGTATA ACGTTTTGTTTTAAAAATGTAGAAGGTAGTAGTAGCCCTTGCACCATGTATACTTTAAATGAAGGTGACT CTAAAAAGATTAGTGATTTAAGCACCGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTAAAGAATAT CGTTTTAACGGTTAAAAAATGGGATAATGATCTATGTTTAGTTATGCCTACGTCAAGGGGACCGATGCCG GTAGCATGTAAATCTTTGAGTGCTACACCGACTCCACCTCCTCCTGAGGATGAGAATTGTAATATAGGAA AAAGTTGCTATACGGGAGCAAATTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT GAGTGCAACGCTTAATAAAATATTTTTTGCTGGAAAGAGTTGTAGTGCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA ACTAATCTTGCTGCTTTTTCTACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGAATTATAGGTGCGGCATTAATTCTTT ATACTATGTTTTTTGCTTTTAATATGGCTCTAAATACAGAATATGCAAGTACTGAAAAAATAGCTCTTTT TGTAATAAAATTCTTATTTGTTGCTTATTTTTCTATCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGTGGTGGTCAG CCGACAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATATGGATTACCTCTTTTGACAGGAGCAGCACCGGACTTTGCAC AGATGATCTTTAATGCAGCAGGTTCTAGAGGATTATGTCAATTTGATAATTCAAAGTATAAGGACGGTTA TAAATTTTACGGTTTATGGGACGCGATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGCTTGGATTTACTTTAT AATATAGATAAGAATGGAGTGTTAGGGAATGTGGTCGGCAATGGTCCCCGTGGTAATAATACACCTATAC CTAATTTTGATCCTGAAGGCAAAAATGACAGACCGAAGGATTTAAGTAAAGCAGGAGCACTTAGATTTTT TACCGTTATGTTTGGATTCTTTATGGCCGGAAATGTTATTATATTTGCAGCAGGTTTAATATTTTCTGTA ATATTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATTTAGTGTGCATGATTACTATTTATGTTATGA CATATATTTCTCCTATATTCATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGACGGGTGGCT AAAAGTATGTATGTCATGTGCATTGCAGCCGGCAGTATTAGCAGGTTTTATAGCTTTATTAATAACTATG TATGATTCCGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCCTTAGATATGATTATGAAAAAGGGGATATTAGATTTA GTACTTTTGAGTTAAGGCTTCCTGTTGGCGGGGCAGATCAATGTCAGGAAAGTTTTGGATATAAAATGTT AGAATATTATGCAGGTAAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTGATACTTTTCCCAATAAAATCAATTGTTAGA GATGTTGTATCTATTTTAGCAGAACTTTTATGCGTATTAGTATTTTCGGTTATTTTTTATTACTTCTCTA AATCTATAGGGCGATTTGCTTCTGATTTAACTAATGGTCCTAATATGGATGCAGTAACGGCAAGTCCCAC TAAAATTATTGGTTTAGTAAAGAAAGGAGCAGCTTTCCTTAAGGATGCTGCTATGGCTTCGCAAGGTAAG CCGCTGGTAGGAGATAAGCCGGGTGTTGGAGGTAAGCGTAAAGAGGGGCAGCAGCAAGGCAGGGATTTAG CAAGCGGTTCGGGTGGAGGTAAATGA |
| Protein ID: 165932716 |
| T4SS name [ID] | VirB [486] |
| Gene symbol | virB6.3 |
| Locus tag | RrIowa_0181 |
| Strain | Rickettsia rickettsii str. Iowa |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010263] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 142096..144996 [+] |
| Product | channel protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | B0BW73 |
| KEGG ID | rrj:RrIowa_0181 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 8.4e-31, Aligned region: 605..844 |
| Protein Sequence: 966 a.a. [Download] |
| >gi|165932716|ref|YP_001649505.1| channel protein [Rickettsia rickettsii str. Iowa] MQGNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKVGDSCYMRYESDGKGGADSIIGTITLNANANYVNTAK MLSDGTIRLIPDPTRYGEWLNTQVLVENGQPVNLQVVGQVSLCLAYIPKDNLQRTGAGSNLDDNGQMIPI PRINDTNNPPVSLIMDAKNNEWRNIAELYANDRVLVSVSPNFANTDATIKDAFKGVEVTKDCSENKTTYN PICGKYSVYSGEYVNACELKEQYWNCQVTWRCPTWHEKIGCDWGELGCVSSCDKVPECTTKCMAWVNRTR PAPENYLDDESFTFSWSDNTGKLFIDYSALQCSYNANIPPVDQCPDSVRDRSPKDKDYIGGVHCTSGICS DGDFQKNRRFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDAGSVSQALPSKLEFAKFVADTDQPPDYKDKDGKYLYKVI YNIPFNSNIAKSYLQYRLWSPTSQDSSKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFDDRGRVQYIIVKPSEN PNTSGKTYSPQGISVDSEGKYSFNANEAGYIWMKILNDPGNNLRDYKDSEGSYKVHFSTSLKVGSFTIKV MNPLLQLFKTKVQGAATSIFKNMVCYKANDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFAKINQKELVI RIAKIGVVSGLMNGNTFEFFNNYLFDAITNFSDSIIANMSGYSLFTSTNTIANPFMFLDAVMSKIFFSQT FIAQLLALLSLGLSGIIYFIIIFIAVGIVIITALRAVAVYIMAFMATCILIGIAPLFISFLLFDFTRYLF DNWVRFTIRYMIEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFCIN WFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVVKLTSAVGPSATEIGGKMSHDAGQKALS SIGMDDKTRQGITGRAEVRLKQRNKTLDQAEKNRKNTPQEGGEKTNEEPPKPETPK |
| Nucleotide Sequence: 2901 bp [Download] |
| >gi|319717301|ref|NC_010263.2|:142096-144996 Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome ATGCAGGGTAACTTATTAAAAGTTTTAGGAGTACTTGCTATAGTAGCAACGTTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAGTCGGTGACAGCTGCTACATGAGGTATGAGTCGGACGGTAA AGGAGGAGCGGATTCAATAATCGGTACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATGTAAACACTGCTAAG ATGTTGTCCGACGGCACGATTCGGCTTATTCCTGATCCTACTCGTTACGGTGAATGGCTAAATACTCAGG TGCTAGTAGAAAACGGCCAACCGGTGAATTTACAAGTGGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATAT ACCGAAAGATAATTTACAACGTACAGGGGCTGGATCTAATTTAGACGATAACGGTCAAATGATCCCGATT CCTCGTATTAACGATACAAATAATCCACCTGTCTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATAATGAATGGCGTA ATATTGCCGAATTATACGCCAATGATAGAGTTTTAGTTTCCGTATCTCCTAATTTTGCCAATACGGATGC GACAATTAAAGATGCTTTTAAAGGTGTTGAAGTTACGAAAGATTGTTCAGAGAATAAAACTACTTATAAT CCAATTTGTGGAAAATATTCTGTTTATTCAGGTGAATATGTCAATGCTTGCGAGTTAAAAGAGCAGTATT GGAATTGTCAAGTCACATGGAGGTGCCCTACCTGGCATGAGAAAATAGGTTGCGACTGGGGAGAATTGGG CTGTGTTTCTTCTTGTGATAAGGTACCAGAATGTACAACGAAATGTATGGCTTGGGTTAATAGAACGAGA CCAGCACCAGAAAACTACCTAGATGATGAGAGTTTTACATTTTCGTGGTCTGACAACACAGGTAAATTAT TTATCGACTATTCAGCCCTTCAATGTTCTTATAATGCTAATATTCCTCCAGTTGATCAATGTCCTGATAG TGTGCGCGATCGTAGTCCAAAAGATAAAGATTATATTGGAGGTGTACATTGTACTTCGGGCATATGTAGC GATGGAGATTTTCAAAAGAATCGGAGATTTTGGTATACGGCGGACGGTAAAGGAGGCAAAGGACCAACTG GATTAATATATCAAATGAATGATGCGGGTTCTGTAAGTCAAGCTCTGCCTTCTAAGCTAGAATTTGCTAA ATTTGTTGCAGATACAGATCAACCGCCTGACTATAAAGATAAAGACGGTAAATATTTATATAAAGTTATA TATAATATACCTTTTAACAGTAATATTGCAAAAAGTTATTTACAATATAGGCTGTGGTCTCCTACCTCAC AAGATAGTAGTAAGAATACTGGAGGATACGTTTTAAATATTAAACAGACTAAATGCTATAGAGAAAACGG TAATAGTTTTAACGATACTTTTGATGATCGAGGACGAGTGCAATACATCATAGTAAAGCCTTCGGAAAAC CCGAATACTAGCGGTAAAACCTATTCACCTCAAGGAATTAGCGTTGATAGTGAAGGTAAATATAGCTTTA ACGCAAATGAGGCGGGTTATATATGGATGAAAATTCTAAATGATCCTGGTAATAATTTAAGGGACTATAA AGATAGTGAAGGTAGCTATAAAGTACATTTCTCAACATCCTTAAAAGTAGGAAGTTTTACTATTAAAGTA ATGAATCCGTTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTGCAAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAAAAATATGG TATGTTATAAAGCTAATGATAGTTCGTCCTGTACTAACTTTTTTACCTATATTAAAGCAATTTTAATTCT GTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTTTTGCTTGGTTTTGCTAAGATAAACCAAAAAGAGCTAGTAATT AGAATAGCAAAAATCGGGGTAGTTAGCGGACTTATGAACGGTAATACCTTTGAATTTTTCAATAACTATC TTTTTGATGCAATTACCAATTTTTCAGACTCAATTATTGCTAATATGAGTGGATATAGTTTGTTTACTTC TACTAATACTATTGCTAATCCTTTCATGTTTTTAGATGCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACC TTTATCGCTCAATTACTTGCACTTCTTTCTCTTGGGCTTAGCGGTATTATATATTTTATAATTATTTTTA TTGCGGTTGGTATAGTAATTATTACGGCGCTTAGAGCTGTTGCAGTTTATATTATGGCATTTATGGCAAC TTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTATTTATTT GATAATTGGGTGAGGTTTACGATCCGCTATATGATAGAGCCGGTAGTTATGATGGCAGGTATTATAGTAC TAACACAACTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTTAGGTTATAGCGTGTGTTGGAAATGTGCTTTACC GATAAAAATTCCGTTTATCGGTACTATTTTACCTATTGCCTTGCTGAATGTACCTATCTTCTGTATTAAT TGGTTTGCCCCTTGGGGAATGGATTATATGTCGGGTATGATGGGAGTAAATATGCAAAATATCGTAGCTC TAGTTATTATTGCTTACGGTATGTACGGTTATGTCGAATTTTCAGGACGTATGGTAGTAAAATTAACTAG TGCTGTTGGGCCTTCGGCTACTGAAATTGGTGGTAAAATGTCTCATGATGCAGGACAAAAAGCATTAAGT TCAATAGGAATGGATGATAAAACAAGACAAGGTATTACCGGCAGAGCGGAAGTACGATTAAAACAACGCA ATAAGACATTAGATCAGGCTGAGAAAAATAGGAAAAATACGCCACAAGAAGGGGGCGAGAAGACAAATGA AGAACCACCTAAACCTGAAACACCGAAATAG |
| Protein ID: 165932717 |
| T4SS name [ID] | VirB [486] |
| Gene symbol | virB6.4 |
| Locus tag | RrIowa_0182 |
| Strain | Rickettsia rickettsii str. Iowa |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010263] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 145160..147835 [+] |
| Product | channel protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | B0BW74 |
| KEGG ID | rrj:RrIowa_0182 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9.6e-21, Aligned region: 521..715 |
| Protein Sequence: 891 a.a. [Download] |
| >gi|165932717|ref|YP_001649506.1| channel protein [Rickettsia rickettsii str. Iowa] MKILKSLVLLVLFMAMPAKADDAFSWMSTSFSGLKSLFGCLEVPEFTSFQEGNIGINLSTAGIWQSTGNT VQKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFSMPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTNNNSETPGTI PPDKDLDALSFTKMSDFVKYFNYSNGNSRIEVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNTLKLPNTVDNILTQELDS SIFAASALYTQSNLGDFDNRIIYSSAEQVCNMIDEERKSVCSGTGTATKYKNTDNGVIVGKPMITGAVQY FMGLIKACPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVNSGNTQSSFIYYQATSGGTMDFTSD WQVSNMFSNSVLMSDWSRNFSNYASFVDYINKNDWSANFLYFGCYSMIVEIGNGANSINPDDQQNIKLEY LITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFATDAPQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIK PITDQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNLAKTALTLYVTIFGLMFVTGALKLTAVEVITRICKIAIVAFLIRE ESWSFFNTYFFSVFTDGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIA IITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLI FFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLGIPIHFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISSSNILT NNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYSLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMQDIDSVTKPI KKAAMAPARVFKDKIIDQNYKARKPEVGGEFTNKFLAERNDVKKEEGEQKE |
| Nucleotide Sequence: 2676 bp [Download] |
| >gi|319717301|ref|NC_010263.2|:145160-147835 Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATGGCGATGCCAGCTAAAGCCGATGATGCTT TTTCATGGATGTCAACCAGTTTTAGTGGGTTAAAAAGCTTATTCGGTTGTTTAGAAGTGCCTGAATTTAC AAGTTTTCAAGAGGGTAATATAGGAATTAATTTATCTACAGCCGGAATTTGGCAATCAACAGGTAATACT GTTCAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAATTGGTCTACTTCAGGTATTACTCCTGAACCTAGAAAATATC TAGTATTATATAGAATTGATCCAAGGTTTAGTATGCCGCAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAA ATTACAATTTGAAGCTTTAGGGTTTCCTCGTTTTGTTACAAACAATAACAGTGAAACACCGGGAACTATA CCGCCTGATAAAGACCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATTTTGTTAAATATTTTAACTATT CTAACGGTAATTCGAGAATTGAAGTTAAGGCCGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTGGTAAAGATAA TTTTTTTAGCCCTAATACTCTAAAACTTCCTAATACCGTAGATAATATTTTAACACAGGAACTTGATAGC TCGATATTCGCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGAGATTTTGATAATAGAATAATTTACT CTTCTGCAGAGCAGGTGTGTAATATGATAGATGAGGAAAGAAAAAGTGTATGTAGCGGCACGGGTACTGC TACAAAGTATAAAAATACCGATAATGGAGTAATAGTCGGTAAGCCTATGATAACGGGAGCGGTACAGTAT TTCATGGGCTTAATTAAGGCTTGTCCTGCTAATGCCGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTATTACGATC AAGGTAGAGGGATGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAAGGGACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTC AGGCAATACTCAAAGTAGCTTTATATATTATCAAGCCACTAGCGGTGGTACTATGGATTTTACTAGCGAT TGGCAAGTTAGTAACATGTTTAGTAATTCAGTTTTAATGAGTGATTGGAGCCGAAATTTTTCAAATTATG CTAGTTTTGTAGATTATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTTGGTTGTTATTCGAT GATTGTTGAAATAGGTAATGGGGCAAATTCAATTAATCCTGATGATCAACAAAATATAAAGTTAGAATAT TTAATAACGTCTGATGGTACATTACCTGATCCATCTGTTCGTGGTACGCCGGTAGATTATAACTTTGCGA CTGATGCCCCGCAAGATGGATATTTATGGTTAAGGGTGGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTAGT TAGTGTAAATTATGCTAATTATACCGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATATATAACGGTGCTATTAAA CCTATTACCGATCAGTTTAGAACTTTTAGTCAAAACTTTTATATTAAGTTAGTTAAAAATTCTGCAGTGC AGAATTTAGCTAAAACTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGGCTAATGTTCGTTACAGGAGCATT AAAATTAACTGCTGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATAGCTATAGTAGCTTTTTTAATTAGAGAA GAAAGTTGGAGCTTCTTTAATACATACTTCTTTAGTGTATTTACTGACGGTATTGATTTCTTTGTAACTA ATGTAGTAGGTGCTACAAGCTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATAC TAACGGTAGGATTTGGGGATTACTATTTATTGAATTATTACAAATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCT ATTATAACCATTTATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGTTATGTTATTG CATTCATAGGGGTAACTGTTATGATTTCATTGGCACCATTTTTTATAATATTAATGTTATTTGAAAAAAC TAAAAGTTTATTTGATAATTGGATATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTGCAGCCGACAATATTATTGATT TTCTTTTTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTGGTAGTTAGAGCCTGTTGGGATA CTCTTATACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAACAAATCTTGGTATTCCGATTCATTTCTCTTTTACATT ACCGTTCTTACCCGGAATACCTTTCTATGTACCGGATGTTCCAGAAATTAGTAGCTCGAATATTCTAACG AACAATGCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTATTATTTTATTCATATTGCTTGATGTCAT ATAGTTTAGTAACTTTTGTAAATATAGTAGTTGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGAATATCAGG AAATTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCGTTATGCAGGATATAGATTCAGTAACAAAACCGATT AAAAAGGCTGCAATGGCTCCGGCTAGAGTTTTCAAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAGAA AACCGGAAGTAGGTGGTGAATTTACAAATAAATTTCTTGCTGAGCGTAATGATGTGAAGAAAGAGGAAGG AGAGCAGAAAGAATAA |
| Protein ID: 165932718 |
| T4SS name [ID] | VirB [486] |
| Gene symbol | virB6.5 |
| Locus tag | RrIowa_0183 |
| Strain | Rickettsia rickettsii str. Iowa |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010263] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 147988..151449 [+] |
| Product | channel protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | B0BW75 |
| KEGG ID | rrj:RrIowa_0183 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.2e-24, Aligned region: 293..482 |
| Protein Sequence: 1153 a.a. [Download] |
| >gi|165932718|ref|YP_001649507.1| channel protein [Rickettsia rickettsii str. Iowa] MNKNIFITLLISLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSARYDPEEITSRQEGNQVAPWRDSAYKVNGYPL TIMVRPWSYILGDKNTSGQLSAWCPWYGQKNNTTTLAAFCVKLQPCTFWDNSRLDMCTPNPANKNDAMIS NAPCIMTNGVGLYFLIAAKNTDPNISPDSQSKPQGITQHLGEELTSGYEFYSTSSIGQFLEAGGINYQYK GEDKSKYAQSPLYFKIIDKFYNDNSGQYRLVIKSGVTDTRPDPLQFLTDLIKGVLFGKDGIIKKTYQQII DTSGYRMSVSAILTLYIMFTGFSFLIGNINLTHVELIVRILKVSIVSILLSTDKAWTFFHDYLFVFFIDG VQQILQIINEASATGPGSQSLLGLLIAPQTLSKLFSLLFVDWLGFIYIILYLIALYFIFFLIFKATIIYL TALITIGMIIIMGPIFICFMLFNITRSLFENWLRQLISYALQPIILFTGIAFISMIIRTEIYSTLGFAVC KHDFPNLGPINEIFGSFLEDIDPSLGHSIFYWWFPVPMKGGINNFHKANILVPKDHIIVDDSCKNDPDKC KHCAAYECIDERYIELPFLDLVKDAKRISNFINGKFVQLDGILLIFVSIYLLSKFNDTAISTAQFIAGTS GNLTEIQKVNQQSYESAAQQMNRPLNYVAKTVSAPVTSRVSAGKEQVRMFFAEKFENMMMGRLEKQALGS SANKTVQNEVKRKYGIDSKDVKMNAITDYENGIAGLLKNLPKGNELKAKELSHMKFTQLRDKIAANKYEV KDYAALSKEQKAELDKSLKDANLRELASDANFTRDYQDAYKNAHQEMSGRGVGLFGKNIGVLRSWQEIEH RVDTKRKLKEEKRVGIGEKIYAGYTGIKRGALTAIVGKDLRDAYEGNLTSAEWHDFEYNDPRLRTYSEKL KDDEKAREHEELQMHINKEALAAQADILSPEYLARLEKAGRHSDVEYYQELAQRKLIHEVHGRLFEEGEP VMMGDRFMREKATDSQMRDMIDNAHRKHAEFIDGDRYIRRQEHYDIMYEKAQENLEQTYKELKDHFKRDD IKIEEMPALIAQKVKDTAEEAEIDQKITEELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDKIN KYRENAKMQTYVKPIVNEGRKLRKLEDHLRNMK |
| Nucleotide Sequence: 3462 bp [Download] |
| >gi|319717301|ref|NC_010263.2|:147988-151449 Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome ATGAACAAAAATATTTTTATTACATTATTAATATCGCTATTGCTGCTTTCTGGTTGTACCGGTGATACTT GTATTGACCCTGATGATTTCGGTTTTATCAAATTCAATGTCTCTGCTAGATATGATCCGGAAGAAATTAC TTCAAGACAGGAAGGTAATCAGGTAGCACCATGGCGTGATAGTGCTTATAAAGTAAACGGCTATCCTTTA ACCATTATGGTAAGACCGTGGAGTTATATACTTGGCGATAAAAATACTTCAGGTCAGTTATCTGCATGGT GTCCATGGTATGGTCAAAAAAATAACACAACTACTTTGGCTGCTTTTTGCGTTAAGCTACAACCGTGTAC TTTTTGGGATAATAGTAGACTTGATATGTGTACTCCTAATCCTGCAAATAAAAATGATGCAATGATTAGT AATGCTCCATGTATAATGACAAACGGTGTCGGGCTTTATTTTCTTATTGCTGCTAAAAATACCGATCCCA ATATTTCACCGGACTCACAGAGTAAACCGCAAGGTATAACTCAGCATTTAGGAGAGGAGCTTACTTCGGG CTATGAATTTTATAGTACTAGTAGTATAGGACAATTCTTGGAAGCCGGAGGTATAAATTATCAATATAAA GGTGAAGATAAGTCAAAATATGCTCAATCTCCTCTTTATTTTAAGATTATAGATAAATTTTATAATGATA ATAGCGGGCAATATAGATTAGTAATAAAGTCCGGAGTTACTGATACTAGACCCGATCCGCTACAATTTTT AACGGATTTAATAAAAGGAGTATTATTTGGTAAGGATGGGATTATAAAGAAAACTTATCAACAAATAATT GATACGTCGGGTTATAGGATGAGTGTCTCGGCTATTTTAACTCTATATATAATGTTTACAGGCTTTTCCT TTTTAATAGGTAATATAAACCTTACTCATGTCGAACTTATAGTTAGAATATTAAAAGTTAGTATAGTCTC AATATTATTAAGTACTGATAAAGCTTGGACATTTTTTCATGATTATTTATTCGTATTTTTTATTGATGGG GTTCAGCAAATACTGCAAATAATTAATGAAGCTTCGGCTACCGGTCCCGGTTCTCAAAGCTTGCTTGGGT TACTTATTGCTCCTCAAACTTTATCTAAATTATTTTCTTTACTATTTGTTGATTGGCTTGGTTTTATATA TATCATTCTATATTTAATAGCCTTATATTTTATTTTCTTTCTTATATTTAAAGCCACTATTATCTATCTA ACCGCTCTTATAACTATCGGTATGATTATAATTATGGGACCGATATTTATTTGTTTCATGTTGTTTAATA TAACTCGTTCGTTATTTGAGAATTGGTTAAGACAATTAATATCATATGCATTACAGCCTATAATTTTATT TACCGGTATCGCTTTTATTTCAATGATCATCAGAACTGAAATATATTCAACGCTTGGTTTTGCAGTATGT AAACATGATTTTCCTAATTTAGGTCCGATAAATGAAATATTCGGTAGCTTCCTTGAGGATATAGATCCAA GCCTGGGTCATTCAATATTTTATTGGTGGTTCCCAGTACCGATGAAAGGCGGTATAAATAATTTCCACAA AGCAAATATATTAGTTCCTAAAGATCATATAATAGTAGATGATTCTTGTAAGAATGACCCTGATAAATGT AAGCATTGTGCTGCGTATGAGTGTATAGATGAACGCTATATTGAATTACCGTTTTTAGATTTAGTTAAAG ATGCAAAAAGAATTAGTAATTTTATAAATGGGAAATTTGTCCAACTTGACGGGATATTACTAATTTTTGT GTCTATTTATTTGCTAAGTAAATTTAACGATACTGCTATATCGACGGCACAATTTATTGCCGGTACTTCA GGTAATTTAACAGAAATACAAAAAGTTAATCAGCAATCTTATGAATCTGCAGCGCAACAAATGAATAGAC CGCTAAATTATGTGGCTAAGACGGTAAGTGCACCTGTAACTAGCCGTGTAAGTGCAGGGAAAGAGCAAGT TCGTATGTTTTTTGCCGAGAAATTTGAAAATATGATGATGGGAAGGCTTGAAAAGCAAGCTCTCGGTTCT TCAGCAAATAAAACCGTACAAAATGAGGTTAAGCGAAAATACGGTATAGATTCTAAAGATGTAAAAATGA ATGCTATTACGGATTATGAAAACGGTATTGCAGGATTATTAAAGAATTTACCTAAGGGGAATGAATTAAA AGCAAAAGAACTATCGCACATGAAGTTTACTCAGCTTCGAGATAAAATTGCTGCAAATAAATATGAAGTG AAAGATTACGCTGCTTTAAGTAAAGAACAAAAAGCTGAGCTTGATAAGTCATTAAAAGATGCTAACTTAC GTGAACTCGCTAGCGATGCAAACTTTACTAGAGATTATCAAGATGCTTATAAAAATGCTCACCAAGAAAT GTCCGGGCGAGGTGTTGGTCTGTTCGGTAAGAATATAGGAGTGCTTAGAAGTTGGCAAGAGATAGAGCAT CGTGTTGATACAAAACGTAAATTAAAAGAAGAAAAGCGTGTAGGTATAGGCGAAAAAATATATGCAGGTT ATACAGGAATAAAAAGAGGAGCTTTAACTGCAATAGTCGGTAAAGATTTACGTGATGCTTATGAGGGTAA TCTAACCAGTGCCGAATGGCATGATTTTGAATATAACGATCCAAGGCTTAGAACTTATAGCGAAAAATTA AAAGATGATGAAAAAGCACGAGAACATGAAGAGCTCCAAATGCATATTAATAAGGAGGCGCTAGCTGCTC AAGCAGATATATTATCACCGGAATATCTAGCAAGACTAGAAAAAGCAGGTAGACATAGTGATGTGGAATA TTATCAAGAATTAGCTCAAAGAAAGCTTATTCATGAGGTGCATGGTAGGTTATTTGAGGAAGGTGAACCG GTAATGATGGGCGACAGATTTATGCGTGAGAAAGCTACTGATTCTCAGATGCGCGATATGATAGATAACG CTCATAGAAAACATGCAGAATTTATAGATGGAGATCGATATATTCGTCGCCAAGAGCATTATGATATTAT GTACGAGAAAGCCCAGGAAAATTTAGAGCAAACTTATAAAGAGCTTAAAGATCATTTCAAAAGAGATGAT ATCAAGATCGAAGAAATGCCGGCATTAATAGCACAAAAAGTTAAAGATACCGCCGAGGAAGCTGAAATAG ACCAAAAGATTACGGAAGAGCTTAATAACTTTAATGCTGATGTTAAAAATTATGAATATAGTACTGAAGT ATTAAATAAAATAGAGGATAGAAAGCAAGCCATTACCGATGAAGTCAATGCTCAGATCGATAAGATTAAT AAATATAGAGAAAATGCCAAAATGCAAACCTATGTAAAGCCTATAGTAAACGAGGGTAGAAAGCTAAGAA AATTAGAAGATCATTTAAGAAATATGAAGTAG |