| Protein ID: 157828015 |
 T4SS name [ID] | VirB [489] |
| Gene symbol | - |
| Locus tag | A1G_00815 |
| Strain | Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith' |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009882] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 134523..136940 [+] |
| Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | A8GQS4 |
| KEGG ID | rri:A1G_00815 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 3.2e-69, Aligned region: 195..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 1.4e-36, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 1.6e-05, Aligned region: 444..555 |
| Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
| >gi|157828015|ref|YP_001494257.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith'] MKLFRTRAAKELRSKQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDLEIKKNIRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGARSFFNELYVSILY KPDTGGVAIVEYFLKKLRQKSNKTAWENDMKEMKENLQEMSTRVINTFRSYGARLLGVCQTQSGSYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEARSPLGKKYAGMISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFVNRTVAIGKMQLQQNRMIQAGDKATSQIAEINTALDMATSGDIAFGEHHLSLLCS ANNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALKGVYTVIDPGLKCNFNPLQLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LAKQDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQKARVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSRISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGVDAVVAKVSLDGMDNIISVL SGRIETVILLDQIREKHGNDPDKWLPIFYAAVKTL |
| Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
| >gi|157827862|ref|NC_009882.1|:134523-136940 Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith' chromosome, complete genome ATGAAATTATTTAGAACTAGAGCCGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGAAAGACCCACTTCGCATTTTA TTCCTTATAAATGTCATTGGGATAGTAATACTATTTTAACAAAAGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAA AATAAATGGATTTTCTTTTGAAACTGCTGATGATGAAGATCTAGAAATTAAAAAGAATATCAGAAATGCC TTACTTAAAAATATGGCTTCGGGAAATATCGTTATGTATTTCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAA TATTTGACGATACGGAATTTACTTATGATCCTACCGTAAAAGTCCCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG TGCAGAATGGCGTAAGAAACATGCTGGGGCTAGGTCGTTTTTTAATGAATTATATGTTAGTATTTTATAT AAGCCTGATACTGGCGGTGTTGCTATAGTTGAGTATTTTCTAAAGAAGCTTAGACAGAAATCTAATAAAA CCGCTTGGGAAAACGACATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACTAGAGTGATTAATAC ATTCAGAAGTTACGGAGCAAGATTACTTGGAGTTTGTCAAACGCAGTCAGGTAGTTATTGTGAAATTTTA GAATTCCTTTCATCTTTAATCAATTGCGGCGATTCACCGGGTCCTATAGCATTACCGCGTGGTACTATTG ACGAATATTTACCGACTCATCGCTTATTTTTTGATTCTCGTACTATTGAAGCAAGAAGTCCGCTTGGCAA GAAATATGCTGGAATGATCAGTATACTTGAATACGGTCCTAATACTTCGGCAGGAATTTTTGACGGATTC CTGCAAATGCCTTTTGAATTTGTTATGACTCAAAGCTTTGTCTTTGTTAATAGAACAGTAGCGATCGGTA AAATGCAATTACAGCAAAATAGAATGATACAAGCCGGTGATAAAGCTACTTCACAAATTGCTGAAATTAA TACGGCCCTTGATATGGCCACTAGCGGTGATATCGCTTTCGGTGAGCATCATTTATCGCTTTTATGTTCC GCAAATAATATTAAAGCTTTGGAAGATATATTGTCAATGGCAGCAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTC AGCCGGTTAGAGAAAAAGTTAACATGGAACCTAGCTATTGGGGACAGTTGCCGGGAAATATGGATTATAT AGTGCGTAAATCCACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTTGCCTCACAACATAATTATCCGCTCGGT AAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTACTTGATACTACTTCAGGTACACCGTTTTATT TTAATTTCCATGTAAGGGATGTTGGACATACTCTCATTATCGGTCCAACCGGTGCCGGTAAAACAGTTCT TATGAATTTCTTATGTGCTGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGAGGA GCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAAGGGAGTTTATACAGTAATTGATCCGGGTTTAAAATGCAACTTTA ACCCTTTACAGCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACGTTTATTTTAGAGTGGCTTCGTGTGCTTGTAAC TTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTATCTCAAGCGGTAAGCGGTAATTTTAGA TTAGCAAAACAAGATAGAAGGCTTAGTAATGTTATAGCATTTCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTGG CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTTGGTAAAGGTTCACACGCTAAGATATTTGACAATGAAATAGATGATAT TGATTTACAAAAAGCAAGAGTATTCGGTTTTGATATGACTGAATTACTTAAAGATCCTGTAAGCCTTGCA CCGGTATTACTATATATTTTCCATCGTATTAATATCTCTTTAGATGGGCAGAAAACTATGATAGTACTTG ATGAAGCATGGGCTTTAATCGATAATCCGGTATTTGCACCTAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAG AAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTCGAAGATGCTGCAAAAAGTAGAATTAGTGAT ACGTTGATTCAACAAACAGCTACACAGATTTTTTTACCTAATTTGAAAGCTACGGATATTTATCGTAGTG CATTTATGTTAAGTCAGCGAGAATATATTTTAATTAAAACTACCGACCCTACTACACGTTATTTTTTAAT AAAACAAGGAGTAGATGCTGTAGTGGCAAAAGTTAGCTTAGATGGTATGGATAACATAATCAGTGTTTTA TCCGGTAGAATTGAGACTGTAATATTGCTCGATCAAATTAGAGAGAAACACGGCAATGATCCGGATAAAT GGTTACCTATATTTTATGCAGCAGTTAAAACATTATAA |
| Protein ID: 157829049 |
| T4SS name [ID] | VirB [489] |
| Gene symbol | - |
| Locus tag | A1G_06670 |
| Strain | Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith' |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009882] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1107497..1109929 [+] |
| Product | virB4 protein |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | A8GTQ8 |
| KEGG ID | rri:A1G_06670 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 1.2e-50, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 5.9e-10, Aligned region: 436..605 |
| Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
| >gi|157829049|ref|YP_001495291.1| virB4 protein [Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith'] MFSGLRKFDKDIYNYNAPNFIPIACHYNENTLLTKDGKLLQIIKIHGITSEKISDNIQNLREMVRVSIKK NITDYDFAFWLHTIREKQNLDDSTPYKKLLPANIHTLWQRKNHWNDKFVNTLYISIVHDSAKVNITNFNS LINSLSNKLITDFENNYLDSAFQKLDNITNNILNDLNEFGAEKLGIIFENDNVFSNPLFLYNRIANLNNN DCLVPIIDLSDAIGRSIYTISSDKMVVTDHEKNNKFVSLLSIKEYHETPSNTLDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQVISKLRGQDYILKITNDSTLLNHKGINKLKAANLDFQFCNQQISIAVIEEDENKLDAAVAKAST ELFKLGIIHVKEDINIEPIFWSQLPANFAFIRRMSPLSVEHIASLTALHNTTLGNQYNPWGKAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTGKTGKTVLLNFLISESTKYDPTIIYISNNNDSKIFIEAIEGKWLEPD KQIINPFLVDDTEKSQAFILEFLKLISGHYISPLSEIEISFLEKLKNKILSIEKEKRIFSDILKLEDFKE EGGIQILDKLKVFTEEQLYSGLFDGSSLNIEEGKVIGFNLYKLSDEPFSKQFYPTERKFLEQFNNNLKKH QSISAAVIYAFTYHLSLVGTKPKIFAADNFDQLYRPEIYYDNINLIYNNLSQNNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLSKPEIRKLSQLMLSARMFLISKDNESIASELSIAALIG VVRILSSRQEEMDIYKKILEQHQGPPDNWVNYLYNELNTD |
| Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
| >gi|157827862|ref|NC_009882.1|:1107497-1109929 Rickettsia rickettsii str. 'Sheila Smith' chromosome, complete genome GTGTTTAGTGGTTTACGAAAATTTGACAAAGATATATATAATTATAATGCTCCTAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATGAAAATACTTTACTTACCAAAGACGGTAAATTACTACAAATTATCAAAATACATGG CATTACCTCAGAGAAAATAAGCGATAATATACAAAATTTACGTGAAATGGTTAGAGTTTCTATAAAAAAG AATATAACCGATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACATACAATAAGAGAAAAACAAAACTTAGACGATTCAA CTCCTTACAAAAAATTATTACCGGCAAATATTCATACCTTATGGCAAAGAAAAAACCATTGGAATGATAA ATTCGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCTGCTAAAGTTAACATCACAAATTTTAACTCT TTAATAAATTCTTTATCTAATAAATTAATTACTGATTTTGAAAATAACTACTTAGATTCAGCTTTTCAAA AATTAGACAATATCACTAATAATATTTTAAATGATTTAAACGAATTCGGTGCTGAAAAACTCGGTATAAT ATTTGAAAATGATAATGTTTTTTCTAATCCTTTATTTTTATATAATCGCATAGCTAACCTTAATAATAAT GATTGTTTGGTACCTATAATAGATTTATCCGATGCAATAGGTAGAAGTATTTATACAATTAGCAGCGATA AAATGGTAGTTACGGATCATGAGAAAAATAATAAATTCGTTTCTTTACTATCTATAAAAGAATATCATGA AACTCCTTCTAATACACTGGATAAATTTTTACAGTTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTGAGCAAAAAACAAGTAATATCCAAATTGCGTGGTCAAGATTATATTCTAAAAATTACTAACGACT CAACTTTACTTAATCACAAAGGGATTAATAAGCTTAAGGCAGCTAATTTAGATTTTCAATTTTGTAATCA GCAAATTTCAATTGCCGTTATAGAAGAAGATGAAAATAAACTAGATGCAGCCGTAGCTAAAGCATCAACT GAACTTTTTAAACTTGGTATTATTCATGTAAAAGAAGATATTAATATTGAGCCAATATTTTGGTCGCAAT TACCTGCTAACTTTGCCTTTATACGTAGAATGTCGCCATTATCCGTAGAGCATATTGCTTCTCTTACCGC TCTTCATAATACTACACTCGGTAATCAATATAATCCTTGGGGTAAGGCTATAACTTTACTGCGAACCGAG AAAGGTACTCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGAATAAAGGTAATACTTGCATCTTTGGTACGG GGAAAACCGGCAAAACCGTATTATTGAACTTTTTAATATCAGAATCGACTAAATACGATCCAACAATAAT TTATATCTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATCGAGGCAATAGAAGGCAAATGGTTAGAACCGGAC AAACAAATTATCAATCCATTTTTAGTAGATGATACAGAAAAATCACAAGCATTTATTTTAGAATTTTTAA AATTAATCAGTGGTCATTATATTTCACCTCTTAGCGAAATAGAGATATCCTTTCTAGAAAAATTAAAAAA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCCGATATTTTAAAATTAGAAGATTTTAAGGAG GAAGGAGGAATACAAATACTTGATAAACTTAAAGTTTTTACCGAAGAACAATTATATTCCGGATTATTTG ACGGATCGTCTCTTAACATTGAAGAAGGGAAAGTTATAGGGTTTAATTTATATAAACTTTCTGATGAGCC GTTTTCTAAACAATTTTACCCGACGGAGAGAAAATTTTTAGAACAATTTAATAACAATTTAAAGAAACAC CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTTACTTATCATTTAAGTCTAGTTGGCACAAAACCTAAAA TATTTGCTGCCGATAATTTTGATCAACTTTACAGACCTGAGATTTATTATGATAATATAAATTTAATCTA TAATAATTTGTCTCAAAATAACGGTATTTTCGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAGTCATATCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCTACCGTCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAGCAAGCCGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATGCTTTCTGC AAGAATGTTCTTAATTAGTAAGGATAATGAATCGATAGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGCTTTAATAGGA GTTGTCCGTATTTTATCAAGCAGACAGGAGGAAATGGATATTTATAAAAAAATACTTGAACAACACCAAG GTCCTCCGGATAATTGGGTTAATTACCTATATAATGAGTTAAATACGGACTAA |