Protein ID: 157804153 |
T4SS name [ID] | VirB [491] |
Gene symbol | - |
Locus tag | A1E_05005 |
Strain | Rickettsia canadensis str. McKiel |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 1020985..1023417 [+] |
Product | Type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family protein |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | A8EZY4 |
KEGG ID | rcm:A1E_05005 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 1.1e-50, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 7.7e-09, Aligned region: 436..604 |
Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
>gi|157804153|ref|YP_001492702.1| Type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family protein [Rickettsia canadensis str. McKiel] MFSDLRKCDKDIYNYNAHNFIPIACHYNENTLLTKDGKLLQIIKIYGINSEQISNNLQNLREMVRVSIKK NITNYDFAFWLHTIREKQNLDDSTPYKKLLPANIHALWQRKNHWHDKFVNTLYISIVHDSTKVNIKNFNS LINSLSNKLITDFENNYLDSAFQKLENITNNILKDLNEFGAEKLGIIFENDNVFSNPLFLYNRIANLNNN YCLVPIIDLSDALGRSTYTISGDKMVVTDNDKNNKFVSLLSIKEYQETPSNALDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQVISKLQGQDYILKITNDSTLLNHKGINKLDAANLDFQFCNQQISIAVIEEDENKLDADVAKAST ELFKLGIIHVKEDLNIEQIFWSQLPANFAFIRRMSPLPVEHIASLTALHNTTLGNQYNPWGRAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTEKTGKTVLLNFLISESTKYDPTIIYISNNNDSKIFIEAIEGKWLEPD KQIINPFLVDDTEKSQAFILEFLKLISGHYISPLSEIEIFFLEKLKNKILSIEKEKRIFSDILKLEDFKE AGGIQILDKFKVFTEGQLYYQLFDGPSLNIQEGEVIGFNLYKLSDEPFSKQFYPTERKFLEQFNNNLKKH QSISAAVIYAFTYHLSIVGTKPKIFVADNFDKLYKPEVYYDNINLIYNNLSKNNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLSEPEIRKLSQLILSARMFLISQDNESIASELSIAALIG IVRILSSRQEEMDIYKKILEQHQGPPDNWVHYLYNALNTD |
Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:1020985-1023417 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome GTGTTTAGTGATTTACGAAAGTGTGATAAGGATATATACAATTATAATGCTCATAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATGAAAATACTTTACTTACCAAAGACGGTAAGTTACTACAAATTATCAAAATATACGG CATTAATTCAGAACAAATTAGCAATAATTTACAGAATTTACGTGAAATGGTTAGAGTTTCTATAAAAAAG AATATAACCAATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACATACAATACGAGAAAAACAAAATTTAGACGATTCCA CTCCTTATAAAAAATTATTACCGGCAAATATTCATGCACTATGGCAAAGAAAAAATCATTGGCATGATAA ATTTGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCCACTAAAGTTAATATCAAAAATTTTAACTCT TTAATAAATTCATTATCTAATAAATTAATTACTGATTTTGAAAATAACTACTTAGATTCAGCTTTTCAAA AATTAGAAAATATCACTAATAATATTTTAAAAGATTTAAATGAATTCGGTGCTGAAAAACTTGGTATAAT ATTTGAAAATGATAATGTTTTTTCTAACCCTTTATTTTTATATAATCGTATAGCTAACCTTAATAATAAT TATTGTTTGGTACCTATAATAGATTTATCTGATGCACTAGGTAGAAGTACTTATACAATTAGTGGCGATA AAATGGTAGTTACAGATAATGATAAAAATAACAAATTCGTTTCTTTACTATCTATAAAAGAATATCAAGA AACTCCTTCTAACGCACTTGATAAATTTTTACAGTTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTAAGCAAAAAACAAGTAATATCCAAATTGCAAGGTCAAGATTATATTCTTAAGATTACCAACGACT CAACTTTACTTAATCACAAAGGGATTAATAAGCTTGATGCAGCTAACTTAGATTTTCAATTTTGTAATCA GCAAATTTCAATTGCTGTTATAGAAGAAGATGAAAATAAACTCGATGCAGATGTAGCTAAAGCATCAACC GAACTTTTTAAACTTGGCATTATTCATGTAAAAGAAGATCTTAATATTGAACAAATATTTTGGTCGCAAT TACCTGCTAACTTTGCCTTTATCCGTAGAATGTCACCATTACCCGTAGAACATATTGCTTCTCTTACCGC TCTTCATAATACTACACTCGGTAATCAATATAATCCTTGGGGTAGAGCTATCACTTTACTGCGAACTGAA AAAGGTACTCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGAATAAAGGTAATACTTGCATCTTTGGTACGG AAAAAACTGGCAAAACCGTATTATTGAACTTTCTAATATCAGAATCGACTAAATATGACCCAACAATAAT TTATATCTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATTGAAGCAATAGAAGGTAAATGGTTAGAACCGGAC AAACAAATTATCAATCCGTTTTTAGTAGATGATACAGAAAAATCACAAGCCTTCATTTTAGAATTTTTAA AATTAATCAGCGGTCATTATATTTCACCACTAAGTGAAATAGAGATATTTTTCCTAGAGAAGTTAAAAAA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCCGATATTTTAAAATTAGAAGATTTTAAAGAG GCAGGAGGAATACAAATACTTGATAAATTTAAAGTTTTTACCGAAGGACAATTATATTATCAATTATTTG ATGGACCGTCTCTTAACATTCAAGAAGGGGAAGTCATAGGGTTTAATTTATATAAACTTTCTGACGAACC ATTTTCTAAACAATTTTATCCAACGGAGAGAAAATTTTTAGAACAGTTTAATAATAATTTAAAGAAACAC CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTTACTTATCATTTAAGCATAGTCGGCACAAAACCTAAAA TATTTGTTGCCGATAATTTTGATAAACTTTATAAACCTGAGGTTTATTACGATAATATAAATTTGATTTA TAATAATTTATCTAAAAATAACGGTATTTTCGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAGTCATACCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCTACCGTCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGACAAAATTTTAGGTTTAAGCGAACCGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGC AAGGATGTTCTTAATTAGTCAGGATAATGAATCTATAGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGCTTTAATAGGA ATTGTCCGTATTTTATCAAGCAGACAAGAGGAAATGGACATTTATAAAAAAATACTTGAACAACACCAAG GTCCTCCGGATAATTGGGTCCATTACTTATATAATGCATTAAATACGGACTAA |