Protein ID: 157803288 |
T4SS name [ID] | VirB [491] |
Gene symbol | - |
Locus tag | A1E_00510 |
Strain | Rickettsia canadensis str. McKiel |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 118139..120157 [+] |
Product | TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | A8EXG9 |
KEGG ID | rcm:A1E_00510 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 4.8e-17, Aligned region: 406..494 |
Protein Sequence: 672 a.a. [Download] |
>gi|157803288|ref|YP_001491837.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia canadensis str. McKiel] MKTLKTLKIFIMVCIASVSLASFAGFGESCSSLPATSDKYLETDTAYGYIIRNIDMKDPRGNCDSAVPGI TFCFKNIEGSSSPCTMYTLNEGDSKKISDLSTDNNPDLGANPVLQNIVLTVKKLDNDLCLIMPTSRGPMP VACKSLSANPPPNPSDYENCNIGKNCYTGASYSQSLINFSGLAVQCLSETLNKIFFVGNSCSSQDQNSRI TNLAAFSTFQGYLKRTIGAALILYIMFFAFNMALNKEYASTEKIALFIIKFLFVAYFSIGLGPLDFSSGQ PTKENGMLKYGLPLLTGAAPDFAQMIFNAAGARGLCQFDNSKYKDGYKFYGLWDAIDCRIGYYLGLDLLY NIDKNRVLGRSVGNGPSGNNEKIPNLGNPDKNSPNDLSKAGSLRFFTVMFGFFMAGNVIIFAAGLVFSVI FLSILLYFITHYLVCMVTIYVMTYVSPIFIPMALFTRTKAYFDGWLKVCISCTLQPSVIAGFIALLITMY DSAIFKNCEFLRHDYEKGDIRFSTFELRLPISAADKCQESFGYKMLQYYAGEGWEEHLLILFPIKSIVRD VVSILAELLYVLVFSVIFYYFSKSIGRFAADLTNGPNMDAVNARSTKIVDLVKKGAAFLKDAAIASQGKP LVGHKLSGGSRRKGRVQSDDTLGSHGRSSDNAKDALSTSRGK |
Nucleotide Sequence: 2019 bp [Download] |
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:118139-120157 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATGGTTTGTATAGCGTCTGTAAGCTTAGCTAGCTTTG CAGGTTTTGGGGAATCATGTTCTAGTTTACCGGCTACTTCAGACAAATATTTAGAAACAGATACAGCATA TGGCTATATAATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCGAGAGGTAATTGTGACTCAGCTGTGCCTGGTATA ACGTTTTGTTTTAAAAATATAGAAGGTAGTAGTAGTCCTTGTACCATGTATACTTTAAATGAAGGTGATT CTAAGAAGATTAGTGATTTAAGTACTGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTACAGAATAT CGTTTTAACGGTTAAAAAATTGGATAATGATTTATGTTTAATTATGCCTACATCAAGGGGTCCGATGCCG GTAGCATGTAAATCTTTAAGTGCTAATCCGCCGCCTAATCCGTCTGATTATGAAAATTGTAATATAGGTA AAAATTGTTATACGGGAGCAAGTTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT GAGTGAAACACTTAATAAAATATTTTTTGTTGGAAATAGCTGTAGTTCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA ACTAATCTTGCCGCTTTTTCTACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGAACTATAGGTGCAGCACTAATTCTCT ATATTATGTTTTTTGCCTTTAATATGGCTCTAAATAAAGAATATGCAAGTACTGAAAAAATAGCTCTTTT TATAATAAAATTCTTATTTGTTGCTTATTTTTCTATCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGCAGCGGTCAG CCGACAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATACGGACTACCTCTTTTGACGGGAGCAGCACCAGACTTTGCAC AGATGATCTTTAATGCAGCAGGTGCTAGAGGATTATGTCAGTTTGATAATTCAAAGTATAAGGACGGTTA TAAATTTTACGGTTTATGGGACGCTATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGTTTGGATTTACTTTAT AATATAGATAAGAATCGAGTTTTAGGGCGTTCGGTCGGCAATGGTCCCAGTGGTAATAATGAGAAGATAC CTAACCTTGGTAATCCGGATAAAAATAGTCCAAATGATTTAAGTAAAGCAGGATCACTGAGGTTTTTTAC AGTTATGTTTGGATTTTTTATGGCTGGCAACGTCATTATATTTGCAGCAGGTTTAGTATTTTCTGTAATA TTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATTTAGTTTGCATGGTTACTATTTACGTTATGACAT ATGTTTCTCCTATATTCATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGATGGGTGGTTAAA AGTATGTATTTCATGTACATTGCAGCCGTCAGTAATAGCAGGTTTTATAGCTTTATTAATAACTATGTAT GATTCCGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCCTTAGACATGATTATGAAAAAGGAGATATTAGATTTAGTA CTTTTGAATTAAGGCTCCCTATTAGTGCTGCAGACAAATGTCAGGAAAGTTTTGGATATAAAATGTTACA ATATTATGCAGGTGAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTGATACTTTTCCCAATAAAATCAATTGTTAGAGAT GTTGTGTCTATTTTAGCGGAACTTTTGTATGTATTAGTATTTTCAGTTATTTTTTATTATTTCTCTAAAT CTATAGGGCGTTTTGCTGCTGATTTAACTAACGGTCCTAATATGGACGCAGTAAATGCACGTTCAACTAA AATAGTTGATTTAGTAAAGAAAGGAGCTGCGTTCCTTAAGGATGCTGCTATAGCTTCACAAGGCAAGCCA CTGGTAGGACATAAGCTGAGTGGAGGAAGTAGACGTAAAGGTAGGGTGCAAAGTGATGATACACTTGGTT CACACGGAAGAAGTAGTGATAATGCCAAAGATGCTTTATCGACAAGTAGAGGTAAATGA |