SecReT4
Protein ID: 157803287
T4SS name [ID]VirB [491]
Gene symbol-
Locus tagA1E_00505
StrainRickettsia canadensis str. McKiel
Repliconchromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]114838..118152 [+]
ProductTrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein
Component typeVirB6
UniProt IDA8EXG8
KEGG IDrcm:A1E_00505
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 7.4e-12, Aligned region: 509..585
Protein Sequence: 1104 a.a.     [Download]
>gi|157803287|ref|YP_001491836.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia canadensis str. McKiel]
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VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDNDLFSKNEHDDFGYFPGGQCTRENRIDPNKPELRFALCSNAKLIVARAE
AVAKSALAIAKAVLTGSDPWDDIKEAWKNNKKDYYVPYSGKPGDDGFAFDVGFPVIYWKVIQDKDRICVS
TKGFTGDVPVGCKYMKEPFPKSMYNSFMDVGDKDLIENTNKTPTDPLALVSCSSAGGGCYQKAYNASKTA
VVMTSPLIECIRQMIARLLISKDVCSFDNVSQVINLASRQDSALFQFQVRMYKIVAAFLTLYVMFFGFKL
LLAGEVPPKSEYINFILKMIFVTYFSIGINITPGSGSPYDRLDGMIQWAFPFLLDGINALASWVMNAAPS
NLCKFNGPGISYDGSVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENAYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLLI
PAIISGNMMLVSLALAYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFTYTRNYFDSWVKLMI
SFLLQPMVVVTFMITMFSVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIENLAQGSTSSRDVLIFYINNDWNDKSQYPTD
EDVESCQNSLGYMLNNPITTAFNFTKNSVSEIVGSKSGDTSTDKFLAKFQFLSGVILGPGMFFMSPKVVF
EKIKNILLALVTACFTLYLMYHVSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMALSATVAGAATKGLD
QVASRRGGVSDLAGGLGGGVRDNVAASGGVSAPKVMQTTLSSVATASPKTVSSEARSDVVTTTPASPEVV
SLPSSIRSAISISEPQSNIKSESAGKIISDNNQESKKEIDNTPPLQEKVDNASKGSGVSDLAGGLGGGVR
DNVAASGGVSAPKVMQTTLSSVATASPKTVSSEARSDVVTTTPASPEVVSLPSSIRSAISISEPQSNIKS
ESAGKIISDNNQESKKEIDNTPPLQEKVDNASKGSGVIDYSFNLKEHDNPTGVKQIRENAEIRDKRAEVE
KAWNELVASGGGRIRDQQGEEISERRANAEKVWDELVKNGVVTEKKDNSSNENS
 
Nucleotide Sequence: 3315 bp     [Download]
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:114838-118152 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome
ATGCAATTATTTCCTCGTAGTATAATTATAACATTAGTAATAAGCTTTGTCATAAATTTAGGACTAGTCA
CTAAAACTCATGCCAAAGATACTCTTGATAGCATTATAGATGTTTTAAGCGGCTTAACTTGTGAAACTCA
AGGAGTCGGTGATTTATTGCGTAGTGAATTCTCTCATACATGTATTGTTGCCCCGTTCTTTACTTTTGCA
GTAATGAATCTTGTTTCTCCCGTTTTATACATGAATACATTTTTAAAGCTTAAAATAAACGATAACGATT
TATTTAGTAAGAATGAGCATGATGATTTTGGGTATTTCCCTGGAGGTCAATGTACTCGTGAAAACAGAAT
TGATCCTAACAAGCCGGAATTACGTTTTGCTTTATGTAGTAATGCTAAATTAATTGTAGCTCGAGCAGAG
GCTGTAGCAAAATCAGCACTTGCTATTGCTAAAGCTGTATTAACAGGGAGCGATCCTTGGGACGATATAA
AAGAAGCATGGAAAAATAATAAAAAGGATTATTATGTTCCATATAGCGGTAAGCCAGGTGATGATGGTTT
TGCCTTTGATGTCGGTTTCCCTGTAATATATTGGAAAGTTATTCAAGATAAAGATAGAATATGTGTCTCA
ACAAAGGGGTTTACAGGAGATGTTCCTGTCGGTTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCGAAATCCATGT
ATAATAGTTTTATGGATGTAGGAGATAAGGATTTGATTGAGAATACAAATAAAACTCCTACAGATCCTTT
AGCCCTAGTTTCATGCAGTAGTGCAGGTGGAGGATGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCA
GTAGTCATGACCTCTCCTCTTATAGAATGTATAAGGCAAATGATTGCTAGGTTACTAATTAGTAAAGATG
TTTGTAGTTTTGATAATGTAAGTCAAGTGATTAATCTTGCTTCAAGGCAAGATAGTGCATTATTTCAGTT
TCAAGTAAGAATGTATAAAATAGTTGCAGCTTTCTTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGTTTTAAACTA
TTACTTGCAGGTGAAGTACCACCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATGATATTCGTGACTT
ATTTTTCAATAGGAATTAATATAACCCCTGGTAGTGGTTCTCCGTATGACCGGCTAGATGGTATGATTCA
GTGGGCGTTTCCTTTCTTACTTGACGGTATAAATGCTTTAGCAAGTTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCT
AATTTATGTAAATTTAACGGTCCTGGTATTTCCTATGATGGCAGTGTTTCCTATATTGCATTATGGGATG
CATTAGATTGTAGGGTAGCTCATTATTTAGGGCTTGATATATTATCTACGTTACTTGTCGAAAATGCTTA
TCGAAGCCATGATTTTTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCACCGCCATATATTTATTTGTTAATT
CCAGCGATAATCTCCGGTAATATGATGTTAGTGTCACTCGCTCTTGCTTATCCGTTACTTGTGATTTCGG
TTGCTGCATTTATGGTTAATGCAACGATTATGTGTATGATATCTATAGTAATACTCGGTATTTTAGCTCC
TCTTTTTGTACCAATGTTTTTATTCACGTATACAAGAAATTATTTTGATAGCTGGGTTAAACTAATGATT
TCGTTCTTGCTACAGCCTATGGTGGTAGTTACTTTTATGATCACGATGTTTTCGGTATATGATTATGGTT
TCTACGGTAAATGTCAATATAAGAGCAAGTTAATTCACAATAGTATAGAAAATCTTGCACAGGGCAGTAC
TTCAAGTCGTGATGTTTTGATATTTTATATTAATAATGATTGGAATGATAAGTCACAATATCCTACTGAT
GAGGATGTGGAAAGTTGTCAAAATAGTTTAGGTTATATGTTAAATAACCCTATTACCACAGCATTTAATT
TTACAAAAAATAGTGTAAGTGAAATTGTCGGTAGTAAATCGGGCGATACCTCTACCGATAAATTTCTTGC
CAAATTTCAATTTTTATCGGGAGTGATTTTAGGTCCAGGGATGTTTTTTATGTCACCAAAAGTCGTTTTT
GAGAAAATTAAAAATATTTTGCTTGCGTTAGTTACGGCATGTTTTACATTGTACTTGATGTATCATGTTA
GTAGTCAACTGGCTGAATTTGCTGCAGATATGACGGAAGGAGTAGCTCTGAATAATGTTGCTATAAAGCC
GCAAGCAATATTTAAGGCAGCTATGGCATTATCTGCTACTGTTGCGGGTGCTGCAACTAAGGGTCTAGAT
CAGGTAGCAAGTAGGAGAGGAGGTGTAAGTGATTTAGCAGGTGGTTTAGGTGGCGGAGTAAGGGATAATG
TTGCTGCAAGCGGAGGTGTGTCGGCACCTAAGGTAATGCAGACAACTTTGTCTTCTGTAGCCACTGCTAG
CCCAAAAACTGTAAGTAGTGAAGCAAGATCGGATGTTGTTACTACTACTCCTGCTTCTCCAGAAGTTGTA
TCACTTCCTTCTAGTATTAGAAGTGCTATTTCTATATCTGAACCACAAAGTAATATTAAATCTGAAAGTG
CTGGAAAAATCATAAGTGATAATAATCAAGAAAGTAAAAAAGAGATCGATAATACTCCGCCTTTACAAGA
AAAAGTTGATAATGCAAGTAAGGGTTCAGGAGTAAGTGATTTAGCAGGTGGTTTAGGTGGTGGAGTAAGG
GATAATGTTGCTGCAAGCGGAGGTGTGTCGGCACCTAAGGTAATGCAGACAACTTTGTCTTCTGTAGCCA
CTGCTAGCCCAAAAACTGTAAGTAGTGAAGCAAGATCGGATGTTGTTACTACTACTCCTGCTTCTCCAGA
AGTTGTATCACTTCCTTCTAGTATTAGAAGTGCTATTTCTATATCTGAACCACAAAGTAATATTAAATCT
GAAAGTGCTGGAAAAATCATAAGTGATAATAATCAAGAAAGTAAAAAAGAGATCGATAATACTCCGCCTT
TACAAGAAAAAGTTGATAATGCAAGTAAGGGTTCAGGAGTAATTGATTATAGTTTTAACTTGAAGGAACA
TGATAATCCGACAGGAGTAAAGCAGATACGGGAAAATGCAGAGATTCGGGATAAACGTGCAGAAGTAGAG
AAAGCATGGAATGAATTAGTAGCAAGTGGAGGAGGAAGAATAAGAGACCAGCAAGGTGAAGAAATATCAG
AACGACGTGCAAATGCCGAAAAAGTATGGGATGAGTTAGTAAAAAACGGTGTAGTAACAGAAAAAAAAGA
TAATAGTTCTAATGAAAACTCTTAA

Protein ID: 157803288
T4SS name [ID]VirB [491]
Gene symbol-
Locus tagA1E_00510
StrainRickettsia canadensis str. McKiel
Repliconchromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]118139..120157 [+]
ProductTrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein
Component typeVirB6
UniProt IDA8EXG9
KEGG IDrcm:A1E_00510
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 4.8e-17, Aligned region: 406..494
Protein Sequence: 672 a.a.     [Download]
>gi|157803288|ref|YP_001491837.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia canadensis str. McKiel]
MKTLKTLKIFIMVCIASVSLASFAGFGESCSSLPATSDKYLETDTAYGYIIRNIDMKDPRGNCDSAVPGI
TFCFKNIEGSSSPCTMYTLNEGDSKKISDLSTDNNPDLGANPVLQNIVLTVKKLDNDLCLIMPTSRGPMP
VACKSLSANPPPNPSDYENCNIGKNCYTGASYSQSLINFSGLAVQCLSETLNKIFFVGNSCSSQDQNSRI
TNLAAFSTFQGYLKRTIGAALILYIMFFAFNMALNKEYASTEKIALFIIKFLFVAYFSIGLGPLDFSSGQ
PTKENGMLKYGLPLLTGAAPDFAQMIFNAAGARGLCQFDNSKYKDGYKFYGLWDAIDCRIGYYLGLDLLY
NIDKNRVLGRSVGNGPSGNNEKIPNLGNPDKNSPNDLSKAGSLRFFTVMFGFFMAGNVIIFAAGLVFSVI
FLSILLYFITHYLVCMVTIYVMTYVSPIFIPMALFTRTKAYFDGWLKVCISCTLQPSVIAGFIALLITMY
DSAIFKNCEFLRHDYEKGDIRFSTFELRLPISAADKCQESFGYKMLQYYAGEGWEEHLLILFPIKSIVRD
VVSILAELLYVLVFSVIFYYFSKSIGRFAADLTNGPNMDAVNARSTKIVDLVKKGAAFLKDAAIASQGKP
LVGHKLSGGSRRKGRVQSDDTLGSHGRSSDNAKDALSTSRGK
 
Nucleotide Sequence: 2019 bp     [Download]
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:118139-120157 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome
ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATGGTTTGTATAGCGTCTGTAAGCTTAGCTAGCTTTG
CAGGTTTTGGGGAATCATGTTCTAGTTTACCGGCTACTTCAGACAAATATTTAGAAACAGATACAGCATA
TGGCTATATAATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCGAGAGGTAATTGTGACTCAGCTGTGCCTGGTATA
ACGTTTTGTTTTAAAAATATAGAAGGTAGTAGTAGTCCTTGTACCATGTATACTTTAAATGAAGGTGATT
CTAAGAAGATTAGTGATTTAAGTACTGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTACAGAATAT
CGTTTTAACGGTTAAAAAATTGGATAATGATTTATGTTTAATTATGCCTACATCAAGGGGTCCGATGCCG
GTAGCATGTAAATCTTTAAGTGCTAATCCGCCGCCTAATCCGTCTGATTATGAAAATTGTAATATAGGTA
AAAATTGTTATACGGGAGCAAGTTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT
GAGTGAAACACTTAATAAAATATTTTTTGTTGGAAATAGCTGTAGTTCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA
ACTAATCTTGCCGCTTTTTCTACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGAACTATAGGTGCAGCACTAATTCTCT
ATATTATGTTTTTTGCCTTTAATATGGCTCTAAATAAAGAATATGCAAGTACTGAAAAAATAGCTCTTTT
TATAATAAAATTCTTATTTGTTGCTTATTTTTCTATCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGCAGCGGTCAG
CCGACAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATACGGACTACCTCTTTTGACGGGAGCAGCACCAGACTTTGCAC
AGATGATCTTTAATGCAGCAGGTGCTAGAGGATTATGTCAGTTTGATAATTCAAAGTATAAGGACGGTTA
TAAATTTTACGGTTTATGGGACGCTATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGTTTGGATTTACTTTAT
AATATAGATAAGAATCGAGTTTTAGGGCGTTCGGTCGGCAATGGTCCCAGTGGTAATAATGAGAAGATAC
CTAACCTTGGTAATCCGGATAAAAATAGTCCAAATGATTTAAGTAAAGCAGGATCACTGAGGTTTTTTAC
AGTTATGTTTGGATTTTTTATGGCTGGCAACGTCATTATATTTGCAGCAGGTTTAGTATTTTCTGTAATA
TTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATTTAGTTTGCATGGTTACTATTTACGTTATGACAT
ATGTTTCTCCTATATTCATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGATGGGTGGTTAAA
AGTATGTATTTCATGTACATTGCAGCCGTCAGTAATAGCAGGTTTTATAGCTTTATTAATAACTATGTAT
GATTCCGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCCTTAGACATGATTATGAAAAAGGAGATATTAGATTTAGTA
CTTTTGAATTAAGGCTCCCTATTAGTGCTGCAGACAAATGTCAGGAAAGTTTTGGATATAAAATGTTACA
ATATTATGCAGGTGAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTGATACTTTTCCCAATAAAATCAATTGTTAGAGAT
GTTGTGTCTATTTTAGCGGAACTTTTGTATGTATTAGTATTTTCAGTTATTTTTTATTATTTCTCTAAAT
CTATAGGGCGTTTTGCTGCTGATTTAACTAACGGTCCTAATATGGACGCAGTAAATGCACGTTCAACTAA
AATAGTTGATTTAGTAAAGAAAGGAGCTGCGTTCCTTAAGGATGCTGCTATAGCTTCACAAGGCAAGCCA
CTGGTAGGACATAAGCTGAGTGGAGGAAGTAGACGTAAAGGTAGGGTGCAAAGTGATGATACACTTGGTT
CACACGGAAGAAGTAGTGATAATGCCAAAGATGCTTTATCGACAAGTAGAGGTAAATGA

Protein ID: 157803289
T4SS name [ID]VirB [491]
Gene symbol-
Locus tagA1E_00515
StrainRickettsia canadensis str. McKiel
Repliconchromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]120164..123070 [+]
ProductVirB6-like protein of the type IV secretion system
Component typeVirB6
UniProt IDA8EXH0
KEGG IDrcm:A1E_00515
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 9.8e-31, Aligned region: 607..846
Protein Sequence: 968 a.a.     [Download]
>gi|157803289|ref|YP_001491838.1| VirB6-like protein of the type IV secretion system [Rickettsia canadensis str. McKiel]
MQSNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKIGNGCYMRYDADGKGGRDSITDTITLNANANYVYTSK
MLSDGTTRLIPDPTRYGEWLNTKVLVENSQSVNLQVVGQVSLCLAYIPQDNVQRTGPGSNLDDNGKMIPI
PRVTDSNIPPISLIMDAKNSEWRNIAELYANDRVLVSISPNFIGTEATVNDAFKGTAVTTDCSQGKTSYE
PICGKYSFYSGQYVNACELKQNYWQGNQHREPCHCVFGCIYQEAVAKWVCDSANAASHCCLSLVCDSLPA
WINHYGTMPESYKDDGSFTFSWSDNLGNLFIDYSNLQCSNNANILPNGKCPDVVSNRSPKDKDYIGGVHC
TSGICNDGDFQKHRRFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDTGSVSQALPSNLEFAKFVADSDQLPEYKDKDGK
YIYKVIYNIPFNSNIEKSYLQYRLWSPTSQDASKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFNDRGRVQYII
VAGSENPNTSGKSYSPQGINVDSDGKANIIANGDGYIWMRILNDSNDYKDSDGNYKVHFSTFLKVGSFTV
KVMNPLLQLFKTKVQGAATSIFRNMVCYKASDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFTKINQKEL
VIRIAKIGVVSGLINGNTFEFFNSYLFDVITGFSDAIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAVMSKIFFS
QTFIAQLLALLSLGLSGIIYFIITFIALGIVIVTALRAMAVYIMAFMVTCILIGIAPLFISFLLFDFTRY
LFDNWVRFTIRYMIEPVIMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFC
INWFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVVKLTSAAGPSATGMGEAMYNVAEQKT
LSQVGMDAETRKGITGRAESRLKQRNKTLDQAEKNRKHTPQEGGEKTNEEPPKPETLK
 
Nucleotide Sequence: 2907 bp     [Download]
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:120164-123070 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome
ATGCAGAGTAACTTGTTAAAAGTTTTAGGAGTACTCGCTATAGTAGCAACGTTAGTTTGCTTTATTTTTG
CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAATCGGTAACGGCTGCTACATGAGATATGACGCAGACGGTAA
AGGTGGTAGAGATTCAATAACTGATACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATGTATACACTTCTAAG
ATGCTGTCCGACGGTACAACTCGGCTTATTCCTGATCCTACTCGTTACGGTGAATGGTTAAATACTAAGG
TGCTAGTAGAAAATAGCCAATCGGTGAATTTACAAGTCGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATAT
ACCACAAGATAATGTCCAACGTACTGGACCTGGATCTAATTTAGATGATAACGGTAAAATGATTCCGATC
CCTCGTGTCACCGATTCAAATATTCCTCCTATCTCTCTAATAATGGATGCCAAAAATAGTGAGTGGCGTA
ATATTGCCGAATTATACGCCAATGATAGAGTTTTAGTTTCCATATCTCCTAATTTTATCGGTACAGAGGC
AACAGTTAATGATGCCTTTAAAGGTACTGCGGTCACGACAGATTGTTCACAAGGCAAAACTTCTTATGAG
CCGATTTGTGGAAAATATTCTTTTTATTCTGGTCAATATGTTAATGCTTGTGAATTGAAACAAAATTATT
GGCAAGGTAATCAGCATAGGGAACCATGTCATTGTGTTTTTGGATGTATTTATCAAGAAGCAGTTGCTAA
GTGGGTATGTGATTCTGCTAATGCAGCTTCTCATTGTTGTCTTAGTTTGGTATGTGACTCCCTACCTGCT
TGGATAAATCACTATGGCACAATGCCAGAATCTTATAAAGACGATGGTAGTTTTACCTTTAGTTGGTCAG
ATAATTTGGGTAATTTATTTATTGATTATTCAAATCTTCAATGTTCCAATAATGCTAATATTTTACCGAA
TGGTAAATGTCCTGATGTTGTCTCTAATCGTAGTCCTAAAGATAAAGATTATATTGGAGGTGTACATTGT
ACTTCAGGAATATGTAACGATGGAGATTTTCAAAAGCATCGGAGATTTTGGTATACAGCGGATGGTAAAG
GAGGTAAAGGACCAACTGGATTAATATATCAAATGAATGATACGGGTTCTGTAAGTCAAGCTTTGCCTTC
TAATCTAGAATTTGCTAAGTTTGTTGCAGATTCAGATCAACTGCCTGAATATAAAGATAAAGACGGTAAA
TATATATATAAAGTTATATATAATATACCTTTTAACAGCAATATTGAAAAAAGTTATTTACAATATAGAC
TTTGGTCTCCCACCTCACAAGATGCTAGTAAGAATACGGGTGGATATGTTCTAAATATTAAACAGACTAA
ATGTTATAGAGAGAACGGTAATAGTTTTAATGATACTTTTAATGATCGGGGACGAGTGCAATACATAATA
GTAGCTGGTTCAGAAAACCCGAATACTAGCGGTAAATCTTATTCACCTCAAGGAATTAACGTTGATAGTG
ATGGTAAAGCTAACATTATTGCAAATGGAGATGGTTATATATGGATGAGAATTCTAAACGATTCTAATGA
TTATAAAGATAGTGATGGTAACTATAAAGTACATTTCTCAACATTCTTAAAAGTAGGAAGTTTTACTGTT
AAAGTAATGAATCCATTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTGCAAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAGAA
ATATGGTATGTTATAAAGCTAGTGATAGCTCGTCCTGTACTAATTTTTTTACTTATATTAAAGCGATTTT
AATTCTGTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTCTTGCTCGGCTTTACTAAGATAAACCAAAAAGAGCTA
GTAATTAGAATAGCAAAAATTGGAGTAGTTAGCGGACTTATAAACGGTAATACTTTTGAGTTTTTTAATA
GCTATCTTTTTGATGTAATTACCGGTTTTTCAGATGCAATTATTGCTAATATGAGTGGGTATAGTTTGTT
TACTTCTACTAATACTATTTCTAATCCTTTTATGTTTTTAGATGCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGT
CAAACATTTATTGCTCAATTACTTGCACTTCTTTCTCTTGGGCTGAGCGGTATTATATATTTTATAATTA
CTTTTATTGCGCTTGGTATAGTAATTGTTACAGCACTTAGAGCTATGGCCGTTTATATTATGGCATTTAT
GGTAACTTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTAT
TTATTTGATAATTGGGTAAGGTTTACAATCCGCTATATGATAGAACCGGTAATTATGATGGCGGGTATTA
TAGTACTAACACAGCTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTTAGGTTATAGTGTTTGTTGGAAATGTGC
TTTACCGATAAAAATTCCATTTATCGGGACTATTTTACCTATTGCATTATTGAATGTACCGATCTTCTGT
ATTAATTGGTTTGCCCCTTGGGGGATGGATTATATGTCAGGTATGATGGGAGTGAATATGCAAAATATCG
TAGCTTTAGTTATTATTGCTTATGGTATGTACGGTTACGTCGAATTTTCAGGACGTATGGTAGTAAAATT
AACTAGTGCTGCCGGACCTTCAGCTACTGGTATGGGCGAAGCAATGTATAATGTTGCAGAACAGAAAACG
TTGAGTCAAGTAGGAATGGATGCCGAGACAAGAAAAGGTATTACTGGCAGAGCGGAATCACGATTGAAAC
AACGCAATAAAACATTAGATCAAGCTGAGAAAAACAGAAAACATACGCCGCAAGAAGGAGGTGAAAAGAC
AAATGAAGAACCGCCTAAACCTGAAACACTGAAATAA

Protein ID: 157803290
T4SS name [ID]VirB [491]
Gene symbol-
Locus tagA1E_00520
StrainRickettsia canadensis str. McKiel
Repliconchromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]123077..125743 [+]
Producthypothetical protein
Component typeVirB6
UniProt IDA8EXH1
KEGG IDrcm:A1E_00520
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 2.3e-20, Aligned region: 519..713
Protein Sequence: 888 a.a.     [Download]
>gi|157803290|ref|YP_001491839.1| hypothetical protein A1E_00520 [Rickettsia canadensis str. McKiel]
MMKILKSLVVLVLFMTVPAKAVDTFSWMSTSFSGLKSLFGCLEVPEFTSFQEGNIGISLSTAGTWQSTGN
AVKKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYTKLQFEALGFPRFVTGNNGAIPPD
KDLDALSFTKMSDSVKYFNYSNGHSRIQVNAGDVVNISLVSKDKFFSPNTPKLPNTVDNILTQELDSSVF
AASALYTQSNLGNFDNRIIYLSAEQVCNMIDASRTSVCRGTGTATKYKNTDNGVIVGKPMRTGAVEHFMG
LINSCPANAGIDTSPACYYDQGRGMIIKVGRQVIKGRDQRFVNSGSTHSSFIYYQATSGGTMDFTSDWSS
TGMFDKSVLMSDWSRNYSGDYNRFVNDINKNDWSANFLYFGRYVMIVEIGNGTNSISPGDHQNIKLEYLI
TPNGTLPDSSVRGMPVDYNFATDALQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIVYYGVIKPI
TDQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNIAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAVEVITRICKIAIVAFLLREES
WDFFNTYFFSVFTNAIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFISVI
TIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFVGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISILLSYVVQPTILLIFF
LLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTHLGIPINFSFTLPFLPGIPFFVPDVPEISSSNILTNN
ANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYGLVTFVNVVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAIMHDIDSVTKPIKK
TTIVPARVFKDKIIDQNYKARKPEGGGEYTNKFLAERNDRKKEEEVRK
 
Nucleotide Sequence: 2667 bp     [Download]
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:123077-125743 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome
ATGATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTGTATTAGTTTTATTTATGACCGTACCAGCTAAAGCTGTTGATA
CTTTTTCATGGATGTCAACCAGTTTTAGTGGGTTAAAAAGCTTATTCGGTTGTTTAGAAGTGCCTGAATT
TACAAGTTTTCAAGAGGGTAATATAGGCATTAGTTTATCTACAGCTGGAACGTGGCAGTCAACAGGTAAT
GCTGTTAAGAAAGGTAAATTATTAAAAATAAATTGGTCTACTTCAGGTATTACTCCTGAGCCTAGAAAAT
ATCTAGTATTATATAGAATTGATCCAAGGTTTAGTACGCCGCAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATAC
TAAATTACAATTTGAAGCTTTAGGATTTCCTCGTTTTGTTACAGGAAATAACGGTGCTATACCGCCTGAT
AAAGATCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATTCTGTTAAGTATTTTAACTATTCTAACGGTC
ATTCGAGAATTCAAGTTAATGCTGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTAGTAAAGATAAATTTTTTAG
CCCTAATACTCCAAAACTTCCTAATACTGTAGATAATATTTTAACACAGGAACTTGATAGTTCAGTATTC
GCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGCAACTTTGATAATAGAATAATTTACTTATCTGCAG
AGCAGGTGTGTAATATGATAGATGCGTCAAGAACAAGTGTATGTAGAGGCACAGGCACTGCTACAAAATA
TAAAAATACCGATAACGGAGTAATAGTTGGTAAGCCTATGAGAACAGGAGCAGTAGAGCATTTTATGGGC
TTAATTAATTCTTGTCCTGCTAATGCTGGTATAGATACTAGTCCCGCTTGCTATTACGATCAAGGTAGAG
GGATGATAATTAAAGTAGGCCGGCAGGTTATTAAGGGACGAGATCAGCGTTTTGTAAATTCAGGCAGTAC
TCACAGTAGTTTTATATATTATCAAGCAACTAGCGGCGGTACTATGGATTTTACTAGTGATTGGTCGTCT
ACTGGAATGTTTGATAAGTCAGTTTTAATGAGTGATTGGAGCCGAAATTATTCTGGTGATTATAATAGGT
TTGTAAATGATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTCGGTCGTTATGTGATGATTGT
GGAAATAGGTAACGGGACAAATTCAATTAGTCCGGGTGATCACCAAAATATAAAGTTAGAATATTTAATT
ACACCAAATGGTACGTTACCTGATTCATCTGTTCGCGGTATGCCGGTAGATTATAACTTTGCGACTGATG
CACTGCAAGATGGATATTTATGGTTAAGGGTGGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTAGTTAGTGT
AAATTATGCTAATTATACTGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAGTATATTACGGTGTTATTAAACCTATT
ACCGATCAGTTTAGAACTTTTAGTCAAAACTTTTATATTAAGTTAGTGAAAAATTCTGCAGTGCAGAATA
TAGCTAAAGCTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGCCTAATGTTTGTTGCTGGAGCATTAAAATT
AACTGCTGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATAGCTATAGTAGCTTTTTTACTTAGAGAAGAAAGT
TGGGATTTCTTTAATACATATTTTTTTAGTGTATTTACTAACGCTATTGATTTTTTTGTAACTAACGTAG
TAGGTGCTACAAGCTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATACTAACGG
TAGGATTTGGGGACTACTATTTATTGAATTATTGCAAATACATAATGGTTTAGCATTTATCTCTGTTATA
ACCATTTATTCTCTTATCACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGCTATGTTATTGCATTCG
TAGGGGTAACTGTTATGATTTCATTAGCACCGTTTTTCATAATATTAATGTTATTTGAAAAAACTAAGAG
TTTATTTGATAACTGGATATCAATATTGCTTAGCTATGTAGTGCAGCCGACAATATTATTAATTTTCTTT
TTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAACAGCTTTTAAAAGTAGTAGTTAGAGCCTGTTGGGATACTCTTA
TACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAACACATCTCGGTATTCCGATCAATTTCTCTTTTACATTGCCGTT
CTTACCCGGAATACCTTTCTTTGTACCAGATGTTCCGGAAATTAGTAGCTCGAATATTTTAACGAACAAT
GCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTATTATTTTATTCATATTGTCTGATGTCATATGGTT
TAGTAACTTTTGTAAATGTAGTAGTCGGAATGCTTACAAATGTTACACCAGCACGAATATCAGGAAATTA
TCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCATTATGCATGATATAGATTCGGTAACAAAACCAATTAAAAAG
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AAAGTAA

Protein ID: 157803291
T4SS name [ID]VirB [491]
Gene symbol-
Locus tagA1E_00525
StrainRickettsia canadensis str. McKiel
Repliconchromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon]
Location [Strand]125852..129292 [+]
Producthypothetical protein
Component typeVirB6
UniProt IDA8EXH2
KEGG IDrcm:A1E_00525
PDB IDNA
Domain hit(s) vs Pfam TrbL [PF04610], Evalue: 1.7e-25, Aligned region: 295..484
Protein Sequence: 1146 a.a.     [Download]
>gi|157803291|ref|YP_001491840.1| hypothetical protein A1E_00525 [Rickettsia canadensis str. McKiel]
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Nucleotide Sequence: 3441 bp     [Download]
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:125852-129292 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome
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