| Protein ID: 157803286 |
 T4SS name [ID] | VirB [491] |
| Gene symbol | - |
| Locus tag | A1E_00500 |
| Strain | Rickettsia canadensis str. McKiel |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 112279..114696 [+] |
| Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | A8EXG7 |
| KEGG ID | rcm:A1E_00500 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 1.6e-68, Aligned region: 195..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 4.2e-37, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 1.1e-05, Aligned region: 444..559 |
| Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
| >gi|157803286|ref|YP_001491835.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia canadensis str. McKiel] MKLFRTRAAKEFRSKQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDLDIKKNIRNA LLKNMSSGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGVEWRKKHAGSKSFFNELYISILY KPDTGGAAIVEYFLKKLRQKSNKIAWENDMKEMKENLQEMSTRVINTFRSYGARLLGVRQTPSGNYCEIL EFLSSLVNCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEARSPLGKKYAGIISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFANRTVAIGKMQLQQNRMIQAGDKATSQIVEISTALDMATSGDIGFGEHHLSLLCS ANSIKALEDILSMASVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMEYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIKDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLQLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LERKDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQKARVFGFDMTELLKDPISLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSRISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGVDAVVAKVNLDGMNNIISVL SGRVETVILLDQIREKYGNDPDKWLPIFYEAVKTL |
| Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
| >gi|157803189|ref|NC_009879.1|:112279-114696 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome ATGAAGTTATTTAGAACTAGAGCAGCTAAAGAATTCAGGTCTAAACAAGAAAGACCCACTTCACACTTTA TCCCTTATAAATGTCATTGGGATAGTAATACCATTTTAACTAAAGATAATTCGTTATTGCAAGTTATTAA AATAAACGGCTTTTCTTTTGAAACTGCAGATGATGAAGATTTGGACATTAAGAAGAATATAAGAAATGCC TTACTTAAAAATATGTCTTCGGGAAATATCGTTATGTATTTCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAA TATTTGATGATACTGAATTTACTTATGATCCTACTGTAAAAGTACCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG TGTAGAATGGCGTAAAAAACATGCTGGTAGCAAGTCGTTTTTTAATGAATTATATATTAGTATTTTGTAT AAGCCTGATACCGGTGGTGCTGCTATAGTTGAGTATTTTCTAAAGAAGCTTAGACAAAAATCTAATAAAA TCGCTTGGGAAAACGACATGAAAGAAATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACTAGAGTGATTAATAC ATTCAGAAGTTACGGAGCAAGATTACTTGGAGTGCGTCAAACGCCGTCAGGTAATTATTGTGAAATTTTA GAATTCCTTTCATCTTTAGTTAATTGCGGTGATTCACCCGGTCCTATAGCATTACCGCGCGGTACTATTG ACGAATATTTACCGACACATCGCTTATTTTTTGATTCACGTACTATTGAAGCAAGAAGTCCGCTTGGCAA AAAATATGCGGGAATAATTAGTATACTTGAGTATGGTCCTAATACTTCAGCAGGAATTTTTGATGGATTC CTGCAAATGCCTTTTGAATTTGTCATGACTCAAAGTTTTGTTTTTGCTAACCGAACTGTAGCAATAGGTA AAATGCAATTACAACAAAACCGAATGATACAAGCAGGTGATAAGGCTACTTCACAAATTGTTGAAATTTC AACGGCACTTGATATGGCCACTAGTGGTGATATCGGTTTTGGTGAGCACCACTTATCCCTTTTATGTTCT GCAAATAGTATTAAAGCTTTGGAAGATATATTGTCAATGGCATCAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTC AACCGGTCAGAGAAAAAGTTAATATGGAACCTAGTTATTGGGGGCAGTTACCTGGAAATATGGAATATAT AGTACGTAAATCTACTATAAACACCTTGAATATGGCTAGTTTTGCATCGCAGCATAATTACCCGCTTGGT AAAATTAAAGATAATCATTGGGGCGAGTATGTCACAGTACTTGATACTACTTCAGGTACGCCGTTTTATT TTAATTTTCATGTAAGGGATGTTGGACATACTCTAATTATCGGTCCAACAGGTGCCGGTAAAACAGTTCT TATGAATTTTTTATGTGCTGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGAGGA GCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAACGGAGTTTATACAGTAATTGACCCAGGTTTAAAATGCAACTTTA ACCCTTTGCAGCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGGACATTTATTTTAGAGTGGCTTCGTGTGCTTGTAAC TTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTATCTCAAGCGGTAAGTGGTAATTTTAGA TTAGAAAGAAAAGATAGAAGGCTTAGTAATGTTATAGCATTTCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTGG CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTCGGTAAAGGTTCACACGCTAAGATATTTGACAATGAAATTGATGATAT CGATTTACAAAAAGCAAGAGTATTCGGTTTTGATATGACTGAATTACTTAAAGATCCTATAAGTCTTGCA CCGGTATTGTTATATATTTTCCATCGTATTAATATCTCTTTAGATGGTCAGAAAACGATGATAGTGCTTG ATGAAGCATGGGCTTTAATCGATAATCCAGTATTTGCACCTAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAG AAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTTGAAGATGCCGCAAAAAGTAGAATTAGCGAT ACGTTGATTCAACAAACAGCCACGCAGATTTTTTTACCTAATTTGAAAGCTACAGATATTTATCGTAGTG CATTTATGTTAAGTCAGCGAGAATATATTTTAATTAAAACTACCGATCCTACTACACGTTATTTTTTAAT AAAACAAGGAGTAGATGCTGTAGTTGCCAAAGTTAATTTAGACGGTATGAATAATATAATTAGTGTTTTA TCTGGCAGAGTTGAGACTGTAATATTGCTCGATCAAATTAGAGAGAAATACGGCAATGATCCGGATAAGT GGTTACCTATATTTTATGAAGCAGTTAAAACATTATAG |
| Protein ID: 157804153 |
| T4SS name [ID] | VirB [491] |
| Gene symbol | - |
| Locus tag | A1E_05005 |
| Strain | Rickettsia canadensis str. McKiel |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1020985..1023417 [+] |
| Product | Type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family protein |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | A8EZY4 |
| KEGG ID | rcm:A1E_05005 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 1.1e-50, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 7.7e-09, Aligned region: 436..604 |
| Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
| >gi|157804153|ref|YP_001492702.1| Type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family protein [Rickettsia canadensis str. McKiel] MFSDLRKCDKDIYNYNAHNFIPIACHYNENTLLTKDGKLLQIIKIYGINSEQISNNLQNLREMVRVSIKK NITNYDFAFWLHTIREKQNLDDSTPYKKLLPANIHALWQRKNHWHDKFVNTLYISIVHDSTKVNIKNFNS LINSLSNKLITDFENNYLDSAFQKLENITNNILKDLNEFGAEKLGIIFENDNVFSNPLFLYNRIANLNNN YCLVPIIDLSDALGRSTYTISGDKMVVTDNDKNNKFVSLLSIKEYQETPSNALDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQVISKLQGQDYILKITNDSTLLNHKGINKLDAANLDFQFCNQQISIAVIEEDENKLDADVAKAST ELFKLGIIHVKEDLNIEQIFWSQLPANFAFIRRMSPLPVEHIASLTALHNTTLGNQYNPWGRAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTEKTGKTVLLNFLISESTKYDPTIIYISNNNDSKIFIEAIEGKWLEPD KQIINPFLVDDTEKSQAFILEFLKLISGHYISPLSEIEIFFLEKLKNKILSIEKEKRIFSDILKLEDFKE AGGIQILDKFKVFTEGQLYYQLFDGPSLNIQEGEVIGFNLYKLSDEPFSKQFYPTERKFLEQFNNNLKKH QSISAAVIYAFTYHLSIVGTKPKIFVADNFDKLYKPEVYYDNINLIYNNLSKNNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLSEPEIRKLSQLILSARMFLISQDNESIASELSIAALIG IVRILSSRQEEMDIYKKILEQHQGPPDNWVHYLYNALNTD |
| Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
| >gi|157803189|ref|NC_009879.1|:1020985-1023417 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome GTGTTTAGTGATTTACGAAAGTGTGATAAGGATATATACAATTATAATGCTCATAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATGAAAATACTTTACTTACCAAAGACGGTAAGTTACTACAAATTATCAAAATATACGG CATTAATTCAGAACAAATTAGCAATAATTTACAGAATTTACGTGAAATGGTTAGAGTTTCTATAAAAAAG AATATAACCAATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACATACAATACGAGAAAAACAAAATTTAGACGATTCCA CTCCTTATAAAAAATTATTACCGGCAAATATTCATGCACTATGGCAAAGAAAAAATCATTGGCATGATAA ATTTGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCCACTAAAGTTAATATCAAAAATTTTAACTCT TTAATAAATTCATTATCTAATAAATTAATTACTGATTTTGAAAATAACTACTTAGATTCAGCTTTTCAAA AATTAGAAAATATCACTAATAATATTTTAAAAGATTTAAATGAATTCGGTGCTGAAAAACTTGGTATAAT ATTTGAAAATGATAATGTTTTTTCTAACCCTTTATTTTTATATAATCGTATAGCTAACCTTAATAATAAT TATTGTTTGGTACCTATAATAGATTTATCTGATGCACTAGGTAGAAGTACTTATACAATTAGTGGCGATA AAATGGTAGTTACAGATAATGATAAAAATAACAAATTCGTTTCTTTACTATCTATAAAAGAATATCAAGA AACTCCTTCTAACGCACTTGATAAATTTTTACAGTTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTAAGCAAAAAACAAGTAATATCCAAATTGCAAGGTCAAGATTATATTCTTAAGATTACCAACGACT CAACTTTACTTAATCACAAAGGGATTAATAAGCTTGATGCAGCTAACTTAGATTTTCAATTTTGTAATCA GCAAATTTCAATTGCTGTTATAGAAGAAGATGAAAATAAACTCGATGCAGATGTAGCTAAAGCATCAACC GAACTTTTTAAACTTGGCATTATTCATGTAAAAGAAGATCTTAATATTGAACAAATATTTTGGTCGCAAT TACCTGCTAACTTTGCCTTTATCCGTAGAATGTCACCATTACCCGTAGAACATATTGCTTCTCTTACCGC TCTTCATAATACTACACTCGGTAATCAATATAATCCTTGGGGTAGAGCTATCACTTTACTGCGAACTGAA AAAGGTACTCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGAATAAAGGTAATACTTGCATCTTTGGTACGG AAAAAACTGGCAAAACCGTATTATTGAACTTTCTAATATCAGAATCGACTAAATATGACCCAACAATAAT TTATATCTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATTGAAGCAATAGAAGGTAAATGGTTAGAACCGGAC AAACAAATTATCAATCCGTTTTTAGTAGATGATACAGAAAAATCACAAGCCTTCATTTTAGAATTTTTAA AATTAATCAGCGGTCATTATATTTCACCACTAAGTGAAATAGAGATATTTTTCCTAGAGAAGTTAAAAAA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCCGATATTTTAAAATTAGAAGATTTTAAAGAG GCAGGAGGAATACAAATACTTGATAAATTTAAAGTTTTTACCGAAGGACAATTATATTATCAATTATTTG ATGGACCGTCTCTTAACATTCAAGAAGGGGAAGTCATAGGGTTTAATTTATATAAACTTTCTGACGAACC ATTTTCTAAACAATTTTATCCAACGGAGAGAAAATTTTTAGAACAGTTTAATAATAATTTAAAGAAACAC CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTTACTTATCATTTAAGCATAGTCGGCACAAAACCTAAAA TATTTGTTGCCGATAATTTTGATAAACTTTATAAACCTGAGGTTTATTACGATAATATAAATTTGATTTA TAATAATTTATCTAAAAATAACGGTATTTTCGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAGTCATACCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCTACCGTCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGACAAAATTTTAGGTTTAAGCGAACCGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGC AAGGATGTTCTTAATTAGTCAGGATAATGAATCTATAGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGCTTTAATAGGA ATTGTCCGTATTTTATCAAGCAGACAAGAGGAAATGGACATTTATAAAAAAATACTTGAACAACACCAAG GTCCTCCGGATAATTGGGTCCATTACTTATATAATGCATTAAATACGGACTAA |