Protein ID: 15603980 |
T4SS name [ID] | VirB [399] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RP103 |
Strain | Rickettsia prowazekii str. Madrid E |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_000963] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 114023..116440 [+] |
Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | Q9ZE45 |
KEGG ID | rpr:RP103 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 2.6e-68, Aligned region: 194..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 6.7e-37, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 1e-05, Aligned region: 444..576 |
Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
>gi|15603980|ref|NP_220495.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia prowazekii str. Madrid E] MKLFRTRAAKELRSKQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDLDIKKNIRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGARSFFNELYISILY KPDTGGAAIVEYFLKKLRQKSNKTAWENDMKEMKENLQEMSTRVVNTFRSYGAKLLGVRQTQSGIYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEVRSPLGKKYAGIISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFANRTVAIGKMKLQQNRMIQSGDKATSQIVEINTALDMATSGDIGFGDHHLSLLCS AKNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLHLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVNGNFR LEKKDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQRARVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSSISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGIDAVVAKVNLEGMNNIISVL SGRVETVMLLDQIRDKYGNDPDKWLPIFYEAVKTL |
Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
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Protein ID: 15604616 |
T4SS name [ID] | VirB [399] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RP784 |
Strain | Rickettsia prowazekii str. Madrid E |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_000963] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 983022..985454 [+] |
Product | VIRB4 protein precursor (virB4) |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | Q9ZCG4 |
KEGG ID | rpr:RP784 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 3.6e-53, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 6.2e-08, Aligned region: 436..518 DUF4116 [PF13475], Evalue: 1.4e-05, Aligned region: 40..78 |
Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
>gi|15604616|ref|NP_221134.1| VIRB4 protein precursor (virB4) [Rickettsia prowazekii str. Madrid E] MFSDLRKFDKDIYNYNAPNFIPIACHYNENTLLTKDGKLLQIVKIHGINSEKISDNIQNLREMVRLAIKK HVTDYDFAFWLHTIREKQNLDDITPYKKLLPANIHTLWQRKNHWNDKFVNTLYISIVHDSAKIQIKNFSS LINSLSYKLIANFEKNYLDSAFKKLENITNNILNDLNEFGAEKLGIIFENDNVFSNTLFLYNRIANLNDN DCLVPIIDLSDALGRSIYTISGDKIIVTDHAKNNKFVSLLSIKEYQETPSNTLDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQIISKLHGQDHILKITNDSILLNYKGINKLDETNLDFQFCNQQISIAVIEEDESKLAKAVAKAST ELFKLGIIHVKEDINIEQIFWSQLPANFSFIRRISPLSVEHIASFTALHNTTLGNQYNPWGRAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTEKTGKTVLLNFLISESTKYDPTIIYISNNNDSQIFIEAIEGKWLEPE KQIINPFLVDDTEQSQAFILEFLKLISGHYISQLSEIEISFLEKFKDKILSIEKEKRIFSNILKLENFKE EGGIQIFDKLKVFTEGQLYYGLFDGPSLSIKEGEVIGFNLYTLSDEPFSKQFYPMERKFLEQFNHNLKKH QSISAAVIYALSYHLSLLGTKPKIFAADNFDQLYRPESYYDNINLIYNNLSENNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLNELEIRKLSQLMLAARMFLINKDNESIASELSIAALIG IVRILSSRQEEMDIYKKILQEHAGPPDNWINYLYNALNIY |
Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
>gi|15603881|ref|NC_000963.1|:983022-985454 Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome, complete genome GTGTTTAGTGATTTACGGAAATTTGATAAAGATATATATAATTATAATGCTCCTAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATGAAAATACTTTACTTACCAAAGATGGTAAATTACTACAAATTGTAAAAATACACGG TATTAACTCAGAGAAAATAAGCGACAATATACAAAATTTACGTGAAATGGTTAGACTTGCTATAAAAAAG CATGTAACTGATTATGATTTCGCTTTTTGGCTGCACACAATACGAGAAAAACAAAACTTAGACGATATCA CTCCTTATAAAAAATTATTACCCGCCAATATACATACCTTATGGCAAAGAAAAAACCATTGGAATGATAA ATTCGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCTGCTAAAATTCAGATCAAAAATTTTAGTTCT TTAATAAATTCATTATCTTATAAATTAATTGCTAATTTTGAAAAAAACTATTTAGATTCAGCTTTTAAAA AACTAGAAAATATCACCAATAATATTTTAAACGATTTAAATGAATTTGGGGCTGAAAAACTCGGAATAAT ATTTGAAAATGATAATGTTTTTTCTAATACTTTATTTCTATATAATCGAATAGCTAATCTTAACGATAAT GATTGTTTGGTGCCTATAATAGATTTATCCGATGCATTAGGTAGAAGTATTTATACAATTAGCGGAGATA AAATAATAGTGACAGATCATGCAAAAAATAACAAATTCGTTTCTTTATTATCTATAAAAGAATATCAAGA AACTCCTTCTAATACACTTGATAAATTTTTACAATTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTTAGCAAAAAACAAATAATATCTAAATTGCATGGTCAAGATCATATTTTAAAAATTACTAACGACT CAATTTTACTTAATTACAAAGGAATTAATAAACTTGATGAAACTAATTTAGATTTTCAATTTTGTAACCA GCAAATTTCGATTGCCGTTATAGAAGAAGATGAAAGTAAACTAGCTAAAGCTGTAGCTAAAGCATCAACA GAGCTCTTTAAGCTTGGTATTATTCATGTAAAGGAAGATATTAATATCGAGCAAATATTTTGGTCACAAT TACCGGCTAACTTTTCGTTTATACGCAGAATATCACCATTATCTGTTGAACATATTGCGTCTTTTACTGC TCTGCATAATACTACACTCGGTAATCAATATAACCCCTGGGGCAGGGCTATAACTTTGCTACGAACTGAA AAAGGTACGCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGAATAAAGGTAATACTTGTATCTTTGGTACAG AAAAAACTGGCAAAACTGTATTATTGAACTTTTTAATATCAGAATCAACCAAATATGATCCAACAATAAT TTATATTTCTAATAATAATGATTCTCAAATTTTTATTGAAGCAATAGAAGGTAAATGGTTAGAACCGGAA AAACAAATTATTAATCCATTTTTAGTAGATGATACAGAACAATCACAAGCTTTCATTTTAGAATTTTTAA AATTAATAAGTGGTCATTATATTTCACAGCTTAGTGAAATCGAGATATCTTTTCTAGAAAAATTTAAAGA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAGCGTATTTTTTCTAACATTTTAAAATTAGAAAATTTTAAAGAG GAAGGAGGAATACAAATATTTGATAAACTTAAAGTTTTCACTGAAGGACAATTATATTACGGGTTATTTG ACGGGCCATCTCTTAGCATTAAAGAAGGCGAAGTGATAGGATTTAACTTATATACACTTTCTGACGAACC GTTTTCTAAACAATTTTATCCAATGGAGAGAAAATTTTTAGAACAATTTAATCATAATTTAAAGAAACAC CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTAAGTTATCATTTAAGCCTACTTGGCACAAAACCTAAAA TATTTGCTGCTGATAATTTTGATCAACTTTACAGGCCTGAATCTTATTATGATAATATAAATTTAATCTA TAATAATTTATCAGAAAATAACGGTATTTTTGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAATCATATCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCTACCCTCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAATGAATTGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATGCTTGCTGC AAGAATGTTCTTAATTAATAAGGATAATGAATCAATTGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGCTTTAATAGGC ATTGTACGTATTTTATCAAGCAGACAAGAGGAAATGGATATTTATAAAAAAATACTTCAAGAACATGCAG GTCCTCCAGATAATTGGATTAATTATCTATATAATGCGTTAAATATATACTAA |