| Protein ID: 148285054 |
 T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-4 |
| Locus tag | OTBS_1954 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1889126..1891693 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB4 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1954 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9.7e-19, Aligned region: 555..750 |
| Protein Sequence: 855 a.a. [Download] |
| >gi|148285054|ref|YP_001249144.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MTKILKILITKNKSLMTYYINILILLSYIFVSTSIQASNELLQAGEQLPTSNSLQWMDKYPNDNNTGCTN VSPTWLSVADVKWIDIQANSNNNWIDSGIMTKAGKSISVEIPKISQNFRKLQKRYLVLHRVDPRFPVIGK TFIIELGTNNKPISRLHNFENGKLLNYQNENSSNFQNGSTNFTNAINLQKKFFNGADTKISVKAGDIIDI ALISSVDFFNKLQLKGGTEKSGFTGELYPRWDDYKYYKPYGIYTVSLKSNVGVVDNALLVTGQTSDKKAL SKLLVGVKSIDSISSFEKCNLNNLSKSQSCIMQSGIGMEIKLDQEVLKSKFDKFLVGYNVGNANSSAFLD KPIEGMYHIVAKSDGDLSFSTPLFNNNVKYRTNGLQDVEYSSILSSCSTLNEFEQKYLNSILSSKQEIIQ GIVVDKTLVGRYLMYITIDRHNIVSDEYDGDIEYIISNTTPNLSTKGTTLPRNGINIVTPESAKLWFRFV KTNNEQFNLKVTVPPDSEGKIKVAGFFYDNIYIPIKQKVEKFSKLFYFGLAKNAALKKVFSILAILYITL YGIYFLLGVVKVTAYDLLIRCSKIIVIAALFNESSQYIFYDTLFPMFDGGINSLISYAVKTTASDVDNPF KFFDLVVSRYIDVNFLKIILIEIVNIHNGLTILGILTLWSIMRFIIIMVKVCMELLMSMIAIAILVGLAP MFIIFILFDRTAEIFKRWLTALLLNTLMPVIMIIFILIINELMLVAVEAAFPEIRICWGTLFDIELNLDL SAIGLPTAFSIPLMAVPFYNVVFVGGNLFNAMDLGNSFAGSLAGVFLLYNLVLLAGTLVGSQVFTKGINR KGMSYVKSIMMQLLS |
| Nucleotide Sequence: 2568 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:1889126-1891693 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGACTAAAATACTTAAAATTCTAATAACAAAAAACAAATCATTGATGACTTATTACATAAATATATTGA TTTTGCTATCATATATTTTTGTGTCTACCAGTATTCAAGCTTCAAATGAATTACTTCAAGCTGGAGAGCA ACTACCTACTTCTAATTCTCTTCAATGGATGGATAAATATCCTAATGATAATAATACAGGATGTACAAAT GTATCACCTACATGGTTGAGTGTTGCAGATGTAAAATGGATAGATATACAAGCTAACTCCAATAATAATT GGATTGATTCTGGTATTATGACTAAAGCTGGCAAAAGTATTTCAGTTGAGATTCCAAAGATTAGTCAAAA TTTTAGAAAGTTACAGAAAAGATATCTAGTATTACATAGAGTTGATCCGCGATTTCCTGTAATTGGGAAA ACTTTTATTATTGAACTAGGCACAAACAATAAGCCTATTTCACGTCTTCATAATTTTGAGAATGGTAAAC TATTGAATTACCAAAATGAGAATAGTAGTAATTTTCAAAATGGTAGTACTAATTTTACGAATGCTATAAA TCTGCAGAAAAAATTTTTTAATGGCGCAGACACTAAAATTAGTGTTAAAGCTGGTGATATTATCGATATA GCTTTAATTTCGTCTGTCGATTTTTTTAATAAGTTGCAGTTAAAAGGTGGTACTGAAAAATCTGGATTTA CTGGAGAGTTATATCCTAGGTGGGATGATTATAAATATTATAAACCTTATGGCATATATACTGTATCACT AAAGTCTAATGTTGGTGTTGTTGATAATGCTTTATTGGTTACTGGTCAAACTTCTGATAAGAAGGCATTA AGTAAGTTATTAGTTGGTGTTAAGAGTATTGATAGTATAAGCAGTTTTGAAAAATGTAATTTGAATAACT TGTCTAAGTCTCAATCCTGTATAATGCAATCTGGAATAGGAATGGAAATTAAATTGGATCAAGAAGTTCT AAAGTCTAAGTTTGATAAATTTTTAGTTGGTTATAATGTGGGGAATGCGAATAGCAGCGCTTTTCTCGAT AAGCCAATAGAGGGAATGTATCATATAGTAGCAAAAAGTGATGGTGACTTGAGTTTTTCTACGCCATTGT TTAATAATAATGTAAAATACCGTACTAATGGACTGCAAGATGTGGAATATAGCAGTATATTAAGTAGCTG TAGTACATTGAATGAATTTGAACAAAAATATTTAAATTCTATTCTTAGTTCTAAGCAAGAAATAATTCAA GGAATAGTTGTTGATAAAACATTAGTAGGGCGGTACTTGATGTACATAACTATTGATAGACATAATATAG TTAGTGATGAATATGATGGTGATATAGAGTATATTATTTCAAATACAACTCCAAACTTATCTACTAAAGG TACTACTTTACCTCGAAATGGAATAAATATAGTTACTCCTGAATCAGCAAAGCTATGGTTTCGTTTTGTA AAAACAAATAATGAACAATTTAATTTGAAGGTAACAGTTCCACCTGATAGTGAAGGTAAAATAAAGGTTG CTGGATTTTTTTATGATAATATTTATATACCAATCAAGCAAAAAGTTGAAAAGTTTTCTAAATTGTTTTA TTTTGGCTTAGCTAAGAATGCAGCCTTAAAAAAGGTATTCAGTATTTTAGCAATTCTATACATTACACTA TATGGTATTTATTTTTTATTAGGAGTAGTAAAAGTTACTGCTTACGACTTACTTATACGATGTAGTAAAA TTATAGTTATAGCAGCACTGTTTAACGAAAGTAGCCAATATATTTTTTATGATACTCTATTTCCAATGTT TGATGGTGGTATAAATAGTTTAATTAGCTATGCTGTTAAAACTACTGCCAGTGATGTTGACAATCCGTTT AAGTTCTTTGATTTAGTTGTTAGTAGATATATTGATGTTAACTTTCTAAAGATAATATTAATTGAAATAG TTAACATACATAATGGTTTGACGATATTAGGAATATTAACTTTATGGTCAATTATGAGGTTTATAATCAT TATGGTTAAAGTATGTATGGAACTTTTGATGTCTATGATTGCCATTGCAATATTAGTTGGGTTGGCTCCG ATGTTTATAATTTTTATATTATTTGATAGGACAGCTGAGATTTTTAAAAGATGGCTTACTGCTCTTTTAT TAAATACATTAATGCCAGTGATAATGATTATCTTTATATTAATTATTAATGAATTGATGTTAGTTGCAGT GGAAGCTGCTTTTCCTGAAATTAGAATTTGTTGGGGCACATTGTTTGATATAGAATTAAATCTTGACTTA TCTGCAATTGGATTACCAACAGCATTTAGTATTCCTCTGATGGCTGTACCTTTCTACAACGTTGTTTTCG TTGGTGGAAATTTATTTAATGCTATGGATTTAGGTAACAGTTTTGCAGGTTCGTTAGCAGGAGTTTTTTT ACTATATAACTTAGTTTTACTAGCTGGAACACTAGTTGGTTCTCAAGTATTTACTAAGGGAATAAATAGA AAGGGAATGAGCTATGTAAAAAGTATCATGATGCAACTTTTAAGTTAG |