| Protein ID: 148285053 |
 T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-3 |
| Locus tag | OTBS_1953 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1885858..1889133 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB3 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1953 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.6e-22, Aligned region: 665..861 |
| Protein Sequence: 1091 a.a. [Download] |
| >gi|148285053|ref|YP_001249143.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MQSKIIKFAIIAVCIAVVSFILMLFGALRSGDDCWYRYNADGQDLDVIRLTQNVRASGQYDSLRLGGIVD PSKPCGLWIKSDFYVSVHEENGQLKPVNIDFLIDGTVSLCQAYLPKNALTCKLKYNDGKECNISDINKFF NGEKSDCIEDCEDNTDDSGNLIPIPRILDPGDGLPVILKANVGEWRNLAQVSAGDEIEVKIGRNQNFSHG GVENTEIGYAYSRPEFDWFNDTSLDWQKGTNDTFGIIKRTKQVRADCQEGKKNYSPLCGRYSPWGEGDNY IKQCDECKGCTCEDCGMKPKCPGSKPVCPAPECEMAGSHGWFSKHFAVFNSELGKDKCFYTGTVKDIFGG KDCPEKYLLDCKRAVLADGLPEEYRDDGTRTVPATLTEQDRNDIKSLGRIACSNRLDEQLVKNRQKVYSW RSATYATDLKYRFSSVQDKDSILGNKCKSDFPSGKDLATGCYGITKVNQDLIIYKDQISETLFSGPRYLQ YMIRPDINIESMKNSVGGYVLYLKQNSCVRKSGVAFDDSKFHGRGKILYAIVPAGVDVNKLKSHELDVYT TGSLDVKVEDLVGKAKISSSQSGYIWFKILNDEKDYKASVGEYKITMSTIVPRGKFISKVLNPIIRIFEN KIANASKTMFKNITCYQQNDKSRCTNFFNYIRAMLTLYIMGCGFAFMLGAVNFTAKELVIRIVKVIIVSG LINEGTFNFFNAYLYDLIMNFSKQLMVNVSGYEYDQNIGTFLFLDELMSKIFFNKTFYVQLLSLLSMGLM GVVYYIIIFVPIILIIISLLKTIMVYLVSTTAVALLVGLAPLFLSFMLFNRTWYLFDNWVRMLFRYLIEP VILMAGITILTQLFIVYLDFVLGYSVCWKCAIVFKLPKIDALGGVLGSYGGQELFCINWFGPWGYDNRAD NNIGLAMNYIIALVIIAYCMYSYIDFSSLMVDILTAGGAGGIAPSVGHVAPQVWDTAVQWTEKAVMKVAS IGKKGSFAVRKGIGKGISHAKSKYSSSQTEKSKDKDNVVNRRTNLENKSLNDKRGSAIRGKNSNVENVKP NQNTYLRVNNQEIDLNSPKPSHNESSVRRHDLNKKNFENND |
| Nucleotide Sequence: 3276 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:1885858-1889133 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGCAATCTAAAATTATCAAATTTGCAATTATAGCAGTTTGTATAGCTGTAGTAAGTTTTATCTTAATGC TTTTTGGCGCATTAAGATCAGGCGATGATTGTTGGTACCGTTATAATGCAGATGGGCAAGATTTAGATGT TATTCGATTAACTCAGAATGTTAGAGCTTCTGGACAATATGATAGCTTGCGCCTTGGAGGAATAGTTGAT CCAAGTAAGCCATGTGGTCTTTGGATAAAATCAGATTTTTATGTTTCAGTACATGAAGAAAATGGGCAAT TAAAACCTGTAAATATTGATTTTCTTATTGATGGAACAGTGAGCCTTTGTCAGGCATACTTACCAAAAAA TGCTTTAACTTGTAAGCTGAAATATAATGATGGTAAAGAATGTAATATTAGTGATATTAATAAATTTTTT AATGGAGAGAAGAGTGATTGTATAGAAGATTGTGAAGATAATACTGATGATAGTGGTAATCTTATTCCTA TTCCTAGAATTTTAGATCCAGGCGATGGTTTACCAGTAATATTAAAGGCGAATGTTGGAGAGTGGCGTAA TCTTGCTCAGGTATCTGCTGGTGATGAAATAGAAGTCAAAATTGGTAGAAATCAAAATTTTAGTCACGGA GGGGTTGAGAATACCGAAATAGGCTATGCTTATAGTAGACCAGAATTTGATTGGTTTAACGATACAAGTC TAGATTGGCAAAAGGGTACTAATGATACTTTTGGTATAATTAAAAGGACTAAGCAGGTTAGAGCTGATTG TCAAGAAGGAAAAAAGAATTATAGTCCACTATGCGGAAGGTATTCTCCATGGGGAGAAGGTGATAATTAT ATCAAACAGTGTGATGAATGTAAAGGATGTACTTGTGAAGATTGTGGTATGAAACCAAAATGTCCAGGAT CAAAGCCGGTATGCCCAGCACCTGAGTGTGAAATGGCAGGTTCACATGGATGGTTTTCTAAGCACTTTGC AGTATTTAACTCAGAACTTGGTAAAGACAAATGTTTTTATACAGGTACTGTTAAAGATATTTTTGGAGGA AAAGATTGTCCAGAGAAATATTTGCTAGATTGCAAGCGTGCTGTTTTAGCCGATGGACTGCCTGAAGAAT ATCGTGATGATGGTACTAGGACAGTACCTGCAACTTTAACTGAGCAAGATAGAAATGATATTAAGAGTTT AGGTAGAATAGCTTGCTCTAATCGACTAGATGAACAATTAGTAAAAAATAGACAAAAAGTTTACTCTTGG AGGTCTGCTACTTATGCTACTGATTTAAAGTATCGCTTTAGTAGTGTACAGGACAAAGATTCTATATTAG GCAATAAATGTAAAAGTGATTTTCCTTCAGGTAAGGATTTAGCTACTGGTTGTTATGGAATAACTAAAGT AAATCAGGATTTAATAATATATAAAGATCAGATTTCAGAAACGTTATTTAGTGGACCAAGATACTTACAA TATATGATTCGACCTGATATTAATATTGAAAGTATGAAAAATAGTGTTGGAGGATATGTATTATATTTAA AACAAAATTCATGTGTTAGAAAGTCTGGAGTTGCTTTTGATGATAGTAAATTTCATGGTCGAGGAAAAAT ATTATACGCGATAGTACCTGCAGGAGTAGATGTAAATAAACTAAAATCACATGAGCTTGATGTATATACT ACAGGATCACTTGATGTAAAGGTTGAAGATTTAGTAGGTAAAGCTAAAATCAGTTCTTCGCAGTCAGGGT ACATTTGGTTTAAAATTCTAAATGATGAAAAAGATTATAAAGCTAGTGTTGGTGAATATAAAATTACTAT GAGTACCATAGTACCTAGAGGAAAGTTTATAAGTAAAGTGTTAAATCCAATAATAAGGATATTTGAGAAT AAAATTGCTAATGCTTCAAAGACAATGTTTAAAAATATAACTTGTTATCAACAGAATGATAAGTCTAGAT GTACAAATTTCTTTAATTACATTAGGGCAATGTTAACTCTTTATATTATGGGTTGTGGGTTTGCATTTAT GCTAGGAGCAGTTAATTTTACTGCTAAAGAATTAGTTATTAGAATTGTCAAGGTAATAATTGTTAGTGGG CTGATAAATGAGGGGACTTTTAATTTTTTTAATGCTTATCTATATGATTTGATTATGAATTTTAGCAAAC AGTTAATGGTTAATGTATCAGGGTATGAGTATGATCAAAATATAGGAACATTTCTATTTTTAGATGAATT GATGAGTAAAATATTTTTTAATAAAACATTTTATGTTCAGTTATTATCTCTTTTAAGTATGGGGCTAATG GGAGTAGTTTATTATATTATAATATTTGTTCCTATAATTTTGATAATTATATCTTTGTTAAAGACTATTA TGGTATATTTGGTATCAACTACTGCTGTTGCTTTATTGGTAGGACTTGCGCCATTATTTCTTTCTTTTAT GCTTTTTAATAGAACTTGGTATTTATTTGATAATTGGGTTAGAATGCTATTTCGGTATTTAATAGAGCCA GTTATATTAATGGCAGGAATAACAATTTTAACTCAGCTTTTTATTGTTTACTTAGATTTTGTGCTCGGAT ATAGCGTTTGCTGGAAATGTGCTATAGTATTTAAGCTTCCAAAAATAGATGCATTAGGAGGTGTACTAGG TAGCTATGGTGGGCAAGAGTTATTTTGTATAAATTGGTTTGGTCCATGGGGGTATGATAATAGAGCTGAT AATAACATAGGATTAGCAATGAATTATATTATTGCTTTAGTAATTATTGCTTACTGTATGTATAGTTACA TTGACTTTTCAAGTTTAATGGTGGATATTCTTACAGCTGGAGGCGCTGGAGGGATTGCGCCTTCTGTAGG CCATGTTGCACCTCAAGTTTGGGATACTGCAGTACAATGGACTGAAAAGGCTGTTATGAAGGTGGCATCG ATAGGTAAAAAAGGTAGCTTTGCGGTACGGAAAGGAATAGGTAAGGGGATATCTCATGCAAAAAGTAAGT ATTCAAGTTCACAAACTGAAAAGTCTAAAGATAAAGATAATGTGGTTAATAGAAGAACCAATCTTGAAAA TAAAAGCCTAAATGACAAAAGAGGCTCTGCTATTAGAGGAAAAAATAGCAATGTTGAGAATGTAAAGCCT AACCAGAATACTTACCTAAGGGTGAATAATCAAGAAATTGATTTGAATAGCCCAAAACCATCGCATAATG AATCTTCTGTTAGAAGGCATGATTTGAATAAGAAAAATTTTGAGAATAATGACTAA |