| Protein ID: 148285052 |
 T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-2 |
| Locus tag | OTBS_1952 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1881932..1885804 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB2 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1952 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.3e-18, Aligned region: 878..970 |
| Protein Sequence: 1290 a.a. [Download] |
| >gi|148285052|ref|YP_001249142.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MIKHLLYNFRIVINNHSILKAFKEAIYSILLLVIALPSMAYAEKNCCVRQNNKKRCCTYDQRFCYAYVQS KCIQKEELRYQNPDVLQEKVKLLESSAKQAWNNAQDHRFSSNLEKFNAVTNASAQTREIISLSEQLKKAL VNEGKARQAAFTESSKTGKDKINRKMSEDFQQLIEERKAALKLAQESGDKASSQYKIIKASARDLVVVAG MDFWNALLLYKKIDEELDSKVRNGADKKSILIAKKKVLYEIEKVLKAFVEGRDMYNKFVAWVIGYSDVTE EKENKAIEFLLQNLSYSTVRRSASFETTLKAVIEVYKNGDFINELKLQNESVKTDIAKIEHSIQVAEDEM KRKQEEEEAKKLLEFQNKVKKAKEEVDAAKDKFKEKQTQAREAHDQASASGDLEDKIEALNKKKKEYEAA KKYKEALDKAIDIGNNNPDLVRERDSLGNDIDNLSQSIDQMTDDVNRDKEIYKQQFEEDKNSSVSANCDF SQYRSISPESSVFTLASFVYQNINFKCGNVCNTADKGFNLCLKVKKSDLCRDCIPIYIGPQSEFKSISEL FDTSGVKKGRRDPILVTENAVKNIGFKVEHTDKISCLKIKTSYGDIPIVCKNISADIDLIPQARSNNRIC SLSTTKSRVPFNFSGRAIGCLKEALDKMFYADSITHDQVSSASILKPLSSFQRGMTVTVKAALMLYIIFF GIKMIFVERFFSLERLVTGVLQILIVMYFSVGLGPMTNKDGKISYNNGMQDHFLPFLSSVTSELAHMVFS SVGSDSAVGGTKLCYFDPNKDYTPDARYYALWDAIDCRIGYYLGFRLLHNYTVDRSKPSLGGKLVGSSIG TSANDDITKHLSNIKDDHALKKDDTFLVFPTLWGLLLSGEIIFFLVMLLFVIIFLTLFWRFMAVFITSLV NLYVMCYISPIFIPMVLFEKTKSMFNNWLHLTLSFALQPAIVAAFIALFVTLMDSITYKTCQFARYDYQQ GNKILSTFELRVPDRYIQDHSLFDDAYNSDAAKICRESAGYRLVEYFNGKNWHQRIFLFFKAFVVYPEPD FLPTMIVVLLFCGIFYYFFQEAHRFAAVITSGITAVNMELPSLRIPSFRNKSTRTKGGKDDKEEESSDKF SSRGGIDKTATDKISSRSNIESSAQDKISTGLKSNGISGIEHGLKKDHDAIRAAKKFDISNNDEVIGADK FCTSGNKQTDKLSSENIKPRDTSVVSAEDKFSTSFKLKDHKDIVQSEIDKKLESNVSDKISNNQTIETRK SNIESDALSKKIDANDLNEIKKGSDDKKNI |
| Nucleotide Sequence: 3873 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:1881932-1885804 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGATAAAGCATTTGCTATATAACTTTAGGATAGTAATTAACAATCATTCAATTCTTAAAGCTTTTAAAG AAGCAATTTATAGTATATTGTTGCTAGTTATTGCACTGCCATCAATGGCTTATGCTGAAAAGAATTGCTG TGTTAGGCAGAATAATAAGAAGAGGTGTTGTACTTACGATCAACGATTTTGTTATGCATATGTACAGTCT AAATGTATCCAAAAAGAGGAATTACGTTATCAGAATCCTGATGTATTACAAGAAAAGGTAAAGTTACTTG AATCTTCAGCTAAGCAAGCATGGAATAATGCTCAAGATCATCGATTTTCATCTAATTTAGAAAAATTTAA TGCTGTAACTAATGCTAGTGCTCAAACTAGAGAAATCATTAGTTTATCTGAACAATTGAAAAAAGCTTTA GTAAATGAAGGTAAGGCTAGGCAGGCTGCGTTTACGGAAAGCAGTAAAACTGGTAAAGATAAAATTAATC GTAAGATGAGTGAAGATTTTCAGCAATTAATAGAAGAGCGAAAAGCTGCATTAAAATTAGCTCAAGAATC TGGTGACAAAGCTTCAAGTCAATATAAGATAATTAAAGCTAGCGCTAGAGATTTAGTAGTAGTTGCTGGA ATGGACTTTTGGAATGCGTTGTTACTATACAAAAAAATTGATGAGGAATTAGATTCGAAAGTGAGAAATG GTGCTGATAAGAAAAGTATATTAATTGCAAAAAAGAAAGTGCTTTATGAAATAGAAAAAGTTTTGAAAGC TTTTGTAGAGGGAAGAGATATGTACAATAAATTTGTGGCATGGGTTATAGGTTATTCTGATGTAACAGAA GAAAAAGAAAACAAGGCTATTGAGTTTTTATTACAAAATTTGAGCTATAGTACAGTAAGGAGATCAGCCT CATTTGAGACCACTTTGAAAGCAGTAATAGAGGTATATAAAAATGGTGATTTTATCAATGAATTAAAACT TCAAAATGAAAGTGTAAAAACTGATATTGCTAAAATAGAGCATAGCATACAAGTTGCTGAAGATGAGATG AAGAGAAAACAGGAAGAGGAAGAAGCTAAAAAATTATTAGAGTTTCAAAATAAAGTTAAAAAAGCTAAAG AAGAAGTTGATGCTGCCAAAGATAAATTTAAAGAAAAACAGACTCAAGCTCGTGAAGCTCATGATCAAGC TAGTGCTAGTGGAGATTTAGAAGATAAAATTGAAGCTCTAAACAAAAAGAAAAAGGAGTATGAAGCTGCT AAAAAATATAAGGAGGCTTTGGACAAAGCAATTGATATTGGTAACAACAATCCTGATTTAGTTAGAGAGC GTGATAGTTTAGGAAATGATATAGATAATTTATCTCAAAGTATTGATCAGATGACAGATGATGTTAATAG AGATAAAGAGATATATAAGCAACAATTTGAAGAAGATAAAAATTCATCAGTTAGTGCAAACTGTGATTTT AGCCAGTATAGAAGCATCTCTCCTGAAAGCAGCGTTTTTACTTTAGCTTCTTTTGTATATCAAAATATTA ATTTTAAGTGTGGAAATGTATGTAATACTGCAGATAAGGGATTTAATCTTTGTTTAAAGGTTAAAAAGTC AGATCTGTGTAGAGATTGTATTCCAATATATATTGGTCCGCAATCTGAATTTAAGTCTATTAGTGAGTTA TTTGATACTAGTGGAGTAAAGAAAGGTAGAAGAGATCCTATACTAGTAACTGAAAATGCAGTAAAAAATA TTGGATTTAAGGTTGAACATACTGATAAAATTTCTTGTTTAAAAATCAAAACATCTTATGGAGATATTCC TATAGTCTGTAAAAATATTAGTGCTGATATTGATTTAATACCTCAAGCTAGGAGTAATAATAGAATTTGT AGTTTAAGTACTACAAAAAGTAGAGTGCCTTTTAATTTTTCTGGTAGAGCTATAGGTTGTTTAAAAGAAG CATTGGATAAGATGTTTTATGCTGATTCAATTACTCATGATCAGGTATCTTCTGCTAGTATATTGAAGCC TCTTTCAAGCTTTCAGCGTGGTATGACAGTAACTGTTAAAGCGGCTTTAATGTTATACATAATATTTTTT GGCATCAAAATGATATTTGTTGAGCGTTTTTTTAGCCTAGAGAGATTAGTTACTGGAGTATTACAGATAC TAATTGTAATGTATTTTTCTGTTGGGCTAGGTCCAATGACTAATAAAGATGGAAAAATAAGTTATAATAA CGGTATGCAAGATCATTTTTTGCCATTTTTAAGTTCAGTTACCTCAGAATTAGCTCATATGGTATTTTCA TCAGTTGGTAGTGATTCTGCTGTTGGTGGTACTAAATTATGTTATTTTGATCCTAACAAGGATTATACAC CGGATGCTCGTTATTATGCATTATGGGATGCAATAGATTGTAGAATAGGATATTACTTAGGTTTTAGATT ATTACATAATTATACTGTAGATAGGTCAAAGCCATCACTTGGTGGTAAGTTAGTTGGATCATCTATTGGG ACTAGCGCTAATGATGATATTACCAAGCATTTGAGTAATATTAAGGATGATCACGCACTTAAGAAAGATG ATACTTTCTTAGTATTTCCTACTTTGTGGGGATTGTTATTAAGTGGTGAAATTATCTTTTTCTTAGTAAT GCTACTATTTGTTATAATCTTTTTAACGTTATTTTGGAGGTTTATGGCTGTATTTATTACTAGTTTGGTA AATTTATATGTCATGTGCTATATATCTCCTATTTTTATTCCTATGGTATTGTTTGAAAAGACAAAATCAA TGTTTAATAATTGGTTGCATTTGACATTATCTTTTGCATTGCAGCCTGCAATTGTTGCAGCATTTATTGC GTTATTTGTGACTTTAATGGATTCAATAACGTATAAAACATGTCAATTTGCAAGGTATGATTATCAGCAG GGGAATAAAATTTTGAGTACTTTTGAGCTTCGTGTACCTGATCGTTATATTCAAGACCATAGTCTCTTTG ATGATGCATATAATAGTGATGCTGCTAAAATATGTAGAGAGAGTGCTGGATATAGGTTAGTAGAATATTT TAATGGAAAAAATTGGCATCAAAGAATATTTCTTTTCTTTAAAGCATTTGTAGTATATCCTGAACCAGAT TTTTTACCTACTATGATTGTTGTATTACTATTTTGTGGAATTTTTTATTACTTCTTTCAGGAAGCACATA GGTTTGCGGCAGTTATTACTAGTGGTATTACTGCTGTAAATATGGAGTTACCAAGCTTAAGAATTCCTAG CTTTAGGAATAAGAGCACTAGAACCAAAGGTGGTAAAGATGATAAAGAAGAAGAGTCAAGTGATAAGTTT AGCTCTAGAGGTGGTATAGATAAAACTGCTACAGATAAAATTAGCAGTCGGTCTAACATCGAATCATCAG CTCAGGATAAAATTAGTACTGGATTAAAAAGTAATGGTATTAGTGGCATTGAACATGGCTTAAAAAAAGA TCATGATGCTATTAGAGCTGCTAAGAAGTTTGACATTAGTAATAATGATGAAGTTATTGGTGCTGATAAG TTTTGTACTAGTGGAAATAAGCAGACTGATAAGTTAAGTTCTGAAAATATTAAGCCAAGAGATACTAGTG TAGTTTCTGCAGAAGATAAATTTAGTACTTCTTTCAAACTTAAAGATCATAAAGATATTGTTCAGTCTGA GATTGATAAGAAACTAGAATCTAATGTTAGCGATAAAATTAGCAATAATCAAACAATCGAAACAAGAAAG AGTAATATTGAATCAGATGCCTTATCAAAAAAGATAGATGCTAATGATTTAAATGAGATTAAAAAAGGTA GTGATGATAAGAAAAACATCTAA |