| Protein ID: 148285051 |
 T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-1 |
| Locus tag | OTBS_1951 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1879463..1881910 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB1 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1951 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 8.1e-17, Aligned region: 543..624 |
| Protein Sequence: 815 a.a. [Download] |
| >gi|148285051|ref|YP_001249141.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MQWLYQLAKIVILISVFALQIEAIKAIPAIDMINMGDIIPDEVKDVADDIKDGVKKVVDTLSNITCETRG VNNLLFKDEFSHTCTPAPFFSLATSSILGVGTYLPMVLKLNMTNAELFGEQFPGGQCLKKNRADPADPRI SFALCNNVKLMVAAATAIGGTVVNAAVAIASGDNVWEAVAKAWHIKAQDIFEVYKDKEVGYSHHFVDINL AGSPYIPYKIVRDKDKICVAAWTLLGGYLNVGCKYISEPCSSSIYSNFLNNSSSVSDISKPVCHTGNGNK ESKELSDKNRLVECGNMSGCYADAVENSKTLLPITGPIVKCFVQMARKILGESTVCKLNAKGDEVITNAS DVNMISKFSRHMRRAVAAFMCLYIIFWGYNILLSPNEISRKDVINTVLKIVLVTYFSIGISTGDDKKLIN GVQSWGMELLRGDVMAKVAAWVMTKSSNEEGKKVSGLCNFQPSDYDSSKHGADARQLLALWDSIDCRLTH YLGINAIKDYVRQKIQAVKGSGGDPLGNSIPPYYYLLVPALWSGNMTLLGLVLFYPLLVISIAAYMVNAY IVCIIGILILGLLAPIFVPMVLFEYTKSYFHSWLKLVISFVLQPMVVIVFMMMMFHVYEYGFYTDCAYDY RLVKDSSGNVSRMRKMFFINVNDKNLYDGDADQKIARCKKSLGWMLNNPLFAVINTAKTVAKDVISVDNV GSEDASENHQFSDTVEVDQGLFFKTTRSIFQLVKDLIMALLVACLTLYLIYHLSDSLSQFVSSLVSGINL SGMTVNPKQMHDTLGVLAKKGGGKASSAMKGGGDGGQSMRSGSLK |
| Nucleotide Sequence: 2448 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:1879463-1881910 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGCAGTGGTTGTATCAATTAGCTAAAATAGTTATATTAATATCAGTATTTGCACTACAAATTGAAGCTA TTAAGGCTATTCCCGCAATTGATATGATTAATATGGGTGATATTATACCTGATGAAGTAAAGGATGTAGC TGACGATATTAAAGATGGAGTTAAAAAAGTTGTAGATACATTATCAAATATAACTTGCGAAACTAGAGGA GTTAACAATTTATTGTTTAAAGATGAATTTTCTCATACTTGTACTCCTGCTCCATTTTTTAGTTTAGCAA CATCATCTATCTTAGGAGTAGGCACGTATCTTCCAATGGTATTAAAGTTAAATATGACTAATGCAGAGTT ATTTGGTGAACAATTTCCTGGAGGACAATGTCTTAAAAAAAATCGCGCTGATCCTGCTGATCCGCGAATT AGCTTTGCTTTATGTAATAATGTTAAGTTAATGGTAGCAGCAGCAACTGCTATAGGTGGAACTGTAGTCA ATGCTGCTGTTGCTATTGCATCTGGTGATAATGTTTGGGAGGCTGTTGCCAAAGCATGGCATATTAAGGC TCAAGATATCTTTGAAGTATATAAGGATAAAGAGGTAGGATATTCTCATCACTTTGTGGATATTAATCTT GCTGGATCTCCTTATATACCTTATAAAATAGTACGAGATAAAGATAAAATTTGTGTTGCTGCATGGACTT TATTGGGGGGATATTTAAATGTAGGGTGTAAGTATATTAGTGAACCTTGTAGTAGCTCTATATATAGTAA TTTTTTAAATAACTCTTCTAGTGTATCAGATATATCAAAGCCAGTATGCCATACCGGAAATGGTAATAAA GAATCAAAAGAATTGTCTGATAAAAATAGATTAGTTGAATGTGGAAATATGAGCGGGTGTTATGCAGATG CAGTAGAAAATTCTAAAACTCTGCTACCTATTACTGGTCCTATAGTTAAGTGTTTTGTACAGATGGCTCG TAAAATCCTTGGAGAATCAACTGTATGCAAGCTAAATGCTAAAGGGGATGAGGTTATAACAAATGCTAGT GATGTTAATATGATTAGTAAATTTAGCCGTCACATGCGCAGGGCAGTTGCTGCTTTTATGTGTTTATATA TCATTTTTTGGGGATACAATATTTTGTTATCGCCAAATGAAATAAGTCGTAAAGATGTTATTAATACTGT TTTAAAGATAGTGTTAGTAACATATTTTTCAATTGGAATTAGTACTGGTGATGATAAAAAATTAATTAAT GGAGTACAAAGTTGGGGTATGGAGTTGCTACGCGGAGATGTAATGGCAAAAGTAGCAGCTTGGGTAATGA CAAAATCTAGTAATGAAGAAGGTAAAAAAGTATCTGGTTTATGCAATTTTCAGCCTAGTGATTATGATTC TAGTAAACACGGAGCTGATGCTAGGCAGCTTTTAGCATTATGGGATTCTATTGATTGCAGGCTAACACAT TATTTAGGAATAAATGCTATTAAAGATTATGTTAGGCAAAAAATTCAAGCTGTAAAGGGTAGTGGTGGAG ATCCTTTAGGTAATTCCATACCTCCATATTATTATTTGTTAGTTCCTGCTTTATGGAGTGGCAATATGAC TTTATTGGGGCTAGTTTTGTTTTATCCATTGCTTGTAATATCAATAGCAGCATACATGGTTAATGCATAT ATAGTATGTATTATTGGAATATTAATCTTAGGATTATTGGCTCCTATATTTGTACCTATGGTGCTTTTTG AATATACTAAAAGTTATTTTCATAGTTGGTTAAAATTAGTAATATCATTTGTACTACAGCCTATGGTTGT TATTGTTTTTATGATGATGATGTTTCACGTTTATGAATATGGCTTTTATACTGATTGTGCATATGATTAT AGACTTGTAAAAGATAGTAGTGGCAATGTTTCAAGAATGAGAAAGATGTTTTTTATTAATGTCAATGATA AAAATTTATATGATGGTGATGCTGATCAAAAAATTGCTAGATGTAAAAAAAGTTTAGGATGGATGTTAAA TAATCCTCTGTTTGCAGTGATTAATACTGCTAAAACTGTAGCTAAGGATGTTATCTCAGTAGACAATGTA GGATCAGAAGATGCTTCAGAAAATCATCAGTTTAGTGATACAGTAGAAGTGGATCAGGGATTATTTTTTA AAACTACTCGCTCTATTTTTCAATTAGTTAAAGATTTAATAATGGCGCTACTAGTTGCTTGTTTAACTTT ATATTTGATTTATCACCTTAGTGATTCACTGTCACAGTTTGTATCATCATTAGTAAGCGGAATAAATCTT TCTGGTATGACTGTTAATCCTAAGCAAATGCATGATACTTTAGGCGTTTTGGCAAAAAAGGGAGGAGGAA AAGCGAGTTCAGCTATGAAAGGTGGAGGAGATGGTGGGCAATCTATGAGAAGCGGTTCTCTAAAATAA |