| Protein ID: 148284156 |
 T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | TrbL/VirB6 |
| Locus tag | OTBS_0285 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 279441..281657 [+] |
| Product | conjugal transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CCE9 |
| KEGG ID | ots:OTBS_0285 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.7e-20, Aligned region: 325..510 |
| Protein Sequence: 738 a.a. [Download] |
| >gi|148284156|ref|YP_001248246.1| conjugal transfer protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MILHNFSEFNTRNLNIMNQQNTLFLKFLVGIILFCSVISYSIAECIDADDFGFPIIAISSRYDTKQLTGQ KDNQVAPWIDSKLLVNGKPLVVMVKHWNYHEYDNDISHLSAWSAWYGTNKNKHTLASITKRFPECRFRNN KTFSDSYDDNDDIPVINPPCLFKHGIGLYALIAKPGVDPNANVHSQSYGIPKKTINFHVGQNYLSSLNST ELDSGFLDTTPDGNIVKTGGYFHKYQDQEAEQYVGGRLYFKILDRFYDDNNGQYKIIIKSGVGDEKDSPE TFLINIVKEMLFGNKKNQNKNGIIQNLFINILKNPSYKIVVNLTLILFIAFSGLAFLIGNINMTAHELVL RTVKILVISVLLNSDTAWKFFYDYLFFIFVDGPQFIIKTINEATAIGPGSSSILGLMIAPHTLKKLFSIL FVDWGGFIYIICYLILLYYIFIISFKATVLYLNALILVGIGIIVGPVFLCFVLFQFTKPIFENWIKQLTI YALQPVILFAGIAFVGMFIRHEIYASLGFRVCEVPFPPIANTLIKIISGDSSKKQSLLNLWFPAQVLKKT LLFSQKCANIPVPEDHIVYRDQKPWQCSDGISGNSKQLITSTDPSNEKHCSAYECKANRYVELPFLDPNI NKDRYRIRNFFAGNFVQWDSLLLLAACVFLLSMFNDNAIALANYISSGGDRSSASEKSTTAIVSTVTPPS PTTFIPAAFSKIGQQRTKNSNSHSNSNSRSGINTGPKK |
| Nucleotide Sequence: 2217 bp [Download] |
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| Protein ID: 148285051 |
| T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-1 |
| Locus tag | OTBS_1951 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1879463..1881910 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB1 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1951 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 8.1e-17, Aligned region: 543..624 |
| Protein Sequence: 815 a.a. [Download] |
| >gi|148285051|ref|YP_001249141.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MQWLYQLAKIVILISVFALQIEAIKAIPAIDMINMGDIIPDEVKDVADDIKDGVKKVVDTLSNITCETRG VNNLLFKDEFSHTCTPAPFFSLATSSILGVGTYLPMVLKLNMTNAELFGEQFPGGQCLKKNRADPADPRI SFALCNNVKLMVAAATAIGGTVVNAAVAIASGDNVWEAVAKAWHIKAQDIFEVYKDKEVGYSHHFVDINL AGSPYIPYKIVRDKDKICVAAWTLLGGYLNVGCKYISEPCSSSIYSNFLNNSSSVSDISKPVCHTGNGNK ESKELSDKNRLVECGNMSGCYADAVENSKTLLPITGPIVKCFVQMARKILGESTVCKLNAKGDEVITNAS DVNMISKFSRHMRRAVAAFMCLYIIFWGYNILLSPNEISRKDVINTVLKIVLVTYFSIGISTGDDKKLIN GVQSWGMELLRGDVMAKVAAWVMTKSSNEEGKKVSGLCNFQPSDYDSSKHGADARQLLALWDSIDCRLTH YLGINAIKDYVRQKIQAVKGSGGDPLGNSIPPYYYLLVPALWSGNMTLLGLVLFYPLLVISIAAYMVNAY IVCIIGILILGLLAPIFVPMVLFEYTKSYFHSWLKLVISFVLQPMVVIVFMMMMFHVYEYGFYTDCAYDY RLVKDSSGNVSRMRKMFFINVNDKNLYDGDADQKIARCKKSLGWMLNNPLFAVINTAKTVAKDVISVDNV GSEDASENHQFSDTVEVDQGLFFKTTRSIFQLVKDLIMALLVACLTLYLIYHLSDSLSQFVSSLVSGINL SGMTVNPKQMHDTLGVLAKKGGGKASSAMKGGGDGGQSMRSGSLK |
| Nucleotide Sequence: 2448 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:1879463-1881910 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGCAGTGGTTGTATCAATTAGCTAAAATAGTTATATTAATATCAGTATTTGCACTACAAATTGAAGCTA TTAAGGCTATTCCCGCAATTGATATGATTAATATGGGTGATATTATACCTGATGAAGTAAAGGATGTAGC TGACGATATTAAAGATGGAGTTAAAAAAGTTGTAGATACATTATCAAATATAACTTGCGAAACTAGAGGA GTTAACAATTTATTGTTTAAAGATGAATTTTCTCATACTTGTACTCCTGCTCCATTTTTTAGTTTAGCAA CATCATCTATCTTAGGAGTAGGCACGTATCTTCCAATGGTATTAAAGTTAAATATGACTAATGCAGAGTT ATTTGGTGAACAATTTCCTGGAGGACAATGTCTTAAAAAAAATCGCGCTGATCCTGCTGATCCGCGAATT AGCTTTGCTTTATGTAATAATGTTAAGTTAATGGTAGCAGCAGCAACTGCTATAGGTGGAACTGTAGTCA ATGCTGCTGTTGCTATTGCATCTGGTGATAATGTTTGGGAGGCTGTTGCCAAAGCATGGCATATTAAGGC TCAAGATATCTTTGAAGTATATAAGGATAAAGAGGTAGGATATTCTCATCACTTTGTGGATATTAATCTT GCTGGATCTCCTTATATACCTTATAAAATAGTACGAGATAAAGATAAAATTTGTGTTGCTGCATGGACTT TATTGGGGGGATATTTAAATGTAGGGTGTAAGTATATTAGTGAACCTTGTAGTAGCTCTATATATAGTAA TTTTTTAAATAACTCTTCTAGTGTATCAGATATATCAAAGCCAGTATGCCATACCGGAAATGGTAATAAA GAATCAAAAGAATTGTCTGATAAAAATAGATTAGTTGAATGTGGAAATATGAGCGGGTGTTATGCAGATG CAGTAGAAAATTCTAAAACTCTGCTACCTATTACTGGTCCTATAGTTAAGTGTTTTGTACAGATGGCTCG TAAAATCCTTGGAGAATCAACTGTATGCAAGCTAAATGCTAAAGGGGATGAGGTTATAACAAATGCTAGT GATGTTAATATGATTAGTAAATTTAGCCGTCACATGCGCAGGGCAGTTGCTGCTTTTATGTGTTTATATA TCATTTTTTGGGGATACAATATTTTGTTATCGCCAAATGAAATAAGTCGTAAAGATGTTATTAATACTGT TTTAAAGATAGTGTTAGTAACATATTTTTCAATTGGAATTAGTACTGGTGATGATAAAAAATTAATTAAT GGAGTACAAAGTTGGGGTATGGAGTTGCTACGCGGAGATGTAATGGCAAAAGTAGCAGCTTGGGTAATGA CAAAATCTAGTAATGAAGAAGGTAAAAAAGTATCTGGTTTATGCAATTTTCAGCCTAGTGATTATGATTC TAGTAAACACGGAGCTGATGCTAGGCAGCTTTTAGCATTATGGGATTCTATTGATTGCAGGCTAACACAT TATTTAGGAATAAATGCTATTAAAGATTATGTTAGGCAAAAAATTCAAGCTGTAAAGGGTAGTGGTGGAG ATCCTTTAGGTAATTCCATACCTCCATATTATTATTTGTTAGTTCCTGCTTTATGGAGTGGCAATATGAC TTTATTGGGGCTAGTTTTGTTTTATCCATTGCTTGTAATATCAATAGCAGCATACATGGTTAATGCATAT ATAGTATGTATTATTGGAATATTAATCTTAGGATTATTGGCTCCTATATTTGTACCTATGGTGCTTTTTG AATATACTAAAAGTTATTTTCATAGTTGGTTAAAATTAGTAATATCATTTGTACTACAGCCTATGGTTGT TATTGTTTTTATGATGATGATGTTTCACGTTTATGAATATGGCTTTTATACTGATTGTGCATATGATTAT AGACTTGTAAAAGATAGTAGTGGCAATGTTTCAAGAATGAGAAAGATGTTTTTTATTAATGTCAATGATA AAAATTTATATGATGGTGATGCTGATCAAAAAATTGCTAGATGTAAAAAAAGTTTAGGATGGATGTTAAA TAATCCTCTGTTTGCAGTGATTAATACTGCTAAAACTGTAGCTAAGGATGTTATCTCAGTAGACAATGTA GGATCAGAAGATGCTTCAGAAAATCATCAGTTTAGTGATACAGTAGAAGTGGATCAGGGATTATTTTTTA AAACTACTCGCTCTATTTTTCAATTAGTTAAAGATTTAATAATGGCGCTACTAGTTGCTTGTTTAACTTT ATATTTGATTTATCACCTTAGTGATTCACTGTCACAGTTTGTATCATCATTAGTAAGCGGAATAAATCTT TCTGGTATGACTGTTAATCCTAAGCAAATGCATGATACTTTAGGCGTTTTGGCAAAAAAGGGAGGAGGAA AAGCGAGTTCAGCTATGAAAGGTGGAGGAGATGGTGGGCAATCTATGAGAAGCGGTTCTCTAAAATAA |
| Protein ID: 148285052 |
| T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-2 |
| Locus tag | OTBS_1952 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1881932..1885804 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB2 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1952 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.3e-18, Aligned region: 878..970 |
| Protein Sequence: 1290 a.a. [Download] |
| >gi|148285052|ref|YP_001249142.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MIKHLLYNFRIVINNHSILKAFKEAIYSILLLVIALPSMAYAEKNCCVRQNNKKRCCTYDQRFCYAYVQS KCIQKEELRYQNPDVLQEKVKLLESSAKQAWNNAQDHRFSSNLEKFNAVTNASAQTREIISLSEQLKKAL VNEGKARQAAFTESSKTGKDKINRKMSEDFQQLIEERKAALKLAQESGDKASSQYKIIKASARDLVVVAG MDFWNALLLYKKIDEELDSKVRNGADKKSILIAKKKVLYEIEKVLKAFVEGRDMYNKFVAWVIGYSDVTE EKENKAIEFLLQNLSYSTVRRSASFETTLKAVIEVYKNGDFINELKLQNESVKTDIAKIEHSIQVAEDEM KRKQEEEEAKKLLEFQNKVKKAKEEVDAAKDKFKEKQTQAREAHDQASASGDLEDKIEALNKKKKEYEAA KKYKEALDKAIDIGNNNPDLVRERDSLGNDIDNLSQSIDQMTDDVNRDKEIYKQQFEEDKNSSVSANCDF SQYRSISPESSVFTLASFVYQNINFKCGNVCNTADKGFNLCLKVKKSDLCRDCIPIYIGPQSEFKSISEL FDTSGVKKGRRDPILVTENAVKNIGFKVEHTDKISCLKIKTSYGDIPIVCKNISADIDLIPQARSNNRIC SLSTTKSRVPFNFSGRAIGCLKEALDKMFYADSITHDQVSSASILKPLSSFQRGMTVTVKAALMLYIIFF GIKMIFVERFFSLERLVTGVLQILIVMYFSVGLGPMTNKDGKISYNNGMQDHFLPFLSSVTSELAHMVFS SVGSDSAVGGTKLCYFDPNKDYTPDARYYALWDAIDCRIGYYLGFRLLHNYTVDRSKPSLGGKLVGSSIG TSANDDITKHLSNIKDDHALKKDDTFLVFPTLWGLLLSGEIIFFLVMLLFVIIFLTLFWRFMAVFITSLV NLYVMCYISPIFIPMVLFEKTKSMFNNWLHLTLSFALQPAIVAAFIALFVTLMDSITYKTCQFARYDYQQ GNKILSTFELRVPDRYIQDHSLFDDAYNSDAAKICRESAGYRLVEYFNGKNWHQRIFLFFKAFVVYPEPD FLPTMIVVLLFCGIFYYFFQEAHRFAAVITSGITAVNMELPSLRIPSFRNKSTRTKGGKDDKEEESSDKF SSRGGIDKTATDKISSRSNIESSAQDKISTGLKSNGISGIEHGLKKDHDAIRAAKKFDISNNDEVIGADK FCTSGNKQTDKLSSENIKPRDTSVVSAEDKFSTSFKLKDHKDIVQSEIDKKLESNVSDKISNNQTIETRK SNIESDALSKKIDANDLNEIKKGSDDKKNI |
| Nucleotide Sequence: 3873 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:1881932-1885804 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGATAAAGCATTTGCTATATAACTTTAGGATAGTAATTAACAATCATTCAATTCTTAAAGCTTTTAAAG AAGCAATTTATAGTATATTGTTGCTAGTTATTGCACTGCCATCAATGGCTTATGCTGAAAAGAATTGCTG TGTTAGGCAGAATAATAAGAAGAGGTGTTGTACTTACGATCAACGATTTTGTTATGCATATGTACAGTCT AAATGTATCCAAAAAGAGGAATTACGTTATCAGAATCCTGATGTATTACAAGAAAAGGTAAAGTTACTTG AATCTTCAGCTAAGCAAGCATGGAATAATGCTCAAGATCATCGATTTTCATCTAATTTAGAAAAATTTAA TGCTGTAACTAATGCTAGTGCTCAAACTAGAGAAATCATTAGTTTATCTGAACAATTGAAAAAAGCTTTA GTAAATGAAGGTAAGGCTAGGCAGGCTGCGTTTACGGAAAGCAGTAAAACTGGTAAAGATAAAATTAATC GTAAGATGAGTGAAGATTTTCAGCAATTAATAGAAGAGCGAAAAGCTGCATTAAAATTAGCTCAAGAATC TGGTGACAAAGCTTCAAGTCAATATAAGATAATTAAAGCTAGCGCTAGAGATTTAGTAGTAGTTGCTGGA ATGGACTTTTGGAATGCGTTGTTACTATACAAAAAAATTGATGAGGAATTAGATTCGAAAGTGAGAAATG GTGCTGATAAGAAAAGTATATTAATTGCAAAAAAGAAAGTGCTTTATGAAATAGAAAAAGTTTTGAAAGC TTTTGTAGAGGGAAGAGATATGTACAATAAATTTGTGGCATGGGTTATAGGTTATTCTGATGTAACAGAA GAAAAAGAAAACAAGGCTATTGAGTTTTTATTACAAAATTTGAGCTATAGTACAGTAAGGAGATCAGCCT CATTTGAGACCACTTTGAAAGCAGTAATAGAGGTATATAAAAATGGTGATTTTATCAATGAATTAAAACT TCAAAATGAAAGTGTAAAAACTGATATTGCTAAAATAGAGCATAGCATACAAGTTGCTGAAGATGAGATG AAGAGAAAACAGGAAGAGGAAGAAGCTAAAAAATTATTAGAGTTTCAAAATAAAGTTAAAAAAGCTAAAG AAGAAGTTGATGCTGCCAAAGATAAATTTAAAGAAAAACAGACTCAAGCTCGTGAAGCTCATGATCAAGC TAGTGCTAGTGGAGATTTAGAAGATAAAATTGAAGCTCTAAACAAAAAGAAAAAGGAGTATGAAGCTGCT AAAAAATATAAGGAGGCTTTGGACAAAGCAATTGATATTGGTAACAACAATCCTGATTTAGTTAGAGAGC GTGATAGTTTAGGAAATGATATAGATAATTTATCTCAAAGTATTGATCAGATGACAGATGATGTTAATAG AGATAAAGAGATATATAAGCAACAATTTGAAGAAGATAAAAATTCATCAGTTAGTGCAAACTGTGATTTT AGCCAGTATAGAAGCATCTCTCCTGAAAGCAGCGTTTTTACTTTAGCTTCTTTTGTATATCAAAATATTA ATTTTAAGTGTGGAAATGTATGTAATACTGCAGATAAGGGATTTAATCTTTGTTTAAAGGTTAAAAAGTC AGATCTGTGTAGAGATTGTATTCCAATATATATTGGTCCGCAATCTGAATTTAAGTCTATTAGTGAGTTA TTTGATACTAGTGGAGTAAAGAAAGGTAGAAGAGATCCTATACTAGTAACTGAAAATGCAGTAAAAAATA TTGGATTTAAGGTTGAACATACTGATAAAATTTCTTGTTTAAAAATCAAAACATCTTATGGAGATATTCC TATAGTCTGTAAAAATATTAGTGCTGATATTGATTTAATACCTCAAGCTAGGAGTAATAATAGAATTTGT AGTTTAAGTACTACAAAAAGTAGAGTGCCTTTTAATTTTTCTGGTAGAGCTATAGGTTGTTTAAAAGAAG CATTGGATAAGATGTTTTATGCTGATTCAATTACTCATGATCAGGTATCTTCTGCTAGTATATTGAAGCC TCTTTCAAGCTTTCAGCGTGGTATGACAGTAACTGTTAAAGCGGCTTTAATGTTATACATAATATTTTTT GGCATCAAAATGATATTTGTTGAGCGTTTTTTTAGCCTAGAGAGATTAGTTACTGGAGTATTACAGATAC TAATTGTAATGTATTTTTCTGTTGGGCTAGGTCCAATGACTAATAAAGATGGAAAAATAAGTTATAATAA CGGTATGCAAGATCATTTTTTGCCATTTTTAAGTTCAGTTACCTCAGAATTAGCTCATATGGTATTTTCA TCAGTTGGTAGTGATTCTGCTGTTGGTGGTACTAAATTATGTTATTTTGATCCTAACAAGGATTATACAC CGGATGCTCGTTATTATGCATTATGGGATGCAATAGATTGTAGAATAGGATATTACTTAGGTTTTAGATT ATTACATAATTATACTGTAGATAGGTCAAAGCCATCACTTGGTGGTAAGTTAGTTGGATCATCTATTGGG ACTAGCGCTAATGATGATATTACCAAGCATTTGAGTAATATTAAGGATGATCACGCACTTAAGAAAGATG ATACTTTCTTAGTATTTCCTACTTTGTGGGGATTGTTATTAAGTGGTGAAATTATCTTTTTCTTAGTAAT GCTACTATTTGTTATAATCTTTTTAACGTTATTTTGGAGGTTTATGGCTGTATTTATTACTAGTTTGGTA AATTTATATGTCATGTGCTATATATCTCCTATTTTTATTCCTATGGTATTGTTTGAAAAGACAAAATCAA TGTTTAATAATTGGTTGCATTTGACATTATCTTTTGCATTGCAGCCTGCAATTGTTGCAGCATTTATTGC GTTATTTGTGACTTTAATGGATTCAATAACGTATAAAACATGTCAATTTGCAAGGTATGATTATCAGCAG GGGAATAAAATTTTGAGTACTTTTGAGCTTCGTGTACCTGATCGTTATATTCAAGACCATAGTCTCTTTG ATGATGCATATAATAGTGATGCTGCTAAAATATGTAGAGAGAGTGCTGGATATAGGTTAGTAGAATATTT TAATGGAAAAAATTGGCATCAAAGAATATTTCTTTTCTTTAAAGCATTTGTAGTATATCCTGAACCAGAT TTTTTACCTACTATGATTGTTGTATTACTATTTTGTGGAATTTTTTATTACTTCTTTCAGGAAGCACATA GGTTTGCGGCAGTTATTACTAGTGGTATTACTGCTGTAAATATGGAGTTACCAAGCTTAAGAATTCCTAG CTTTAGGAATAAGAGCACTAGAACCAAAGGTGGTAAAGATGATAAAGAAGAAGAGTCAAGTGATAAGTTT AGCTCTAGAGGTGGTATAGATAAAACTGCTACAGATAAAATTAGCAGTCGGTCTAACATCGAATCATCAG CTCAGGATAAAATTAGTACTGGATTAAAAAGTAATGGTATTAGTGGCATTGAACATGGCTTAAAAAAAGA TCATGATGCTATTAGAGCTGCTAAGAAGTTTGACATTAGTAATAATGATGAAGTTATTGGTGCTGATAAG TTTTGTACTAGTGGAAATAAGCAGACTGATAAGTTAAGTTCTGAAAATATTAAGCCAAGAGATACTAGTG TAGTTTCTGCAGAAGATAAATTTAGTACTTCTTTCAAACTTAAAGATCATAAAGATATTGTTCAGTCTGA GATTGATAAGAAACTAGAATCTAATGTTAGCGATAAAATTAGCAATAATCAAACAATCGAAACAAGAAAG AGTAATATTGAATCAGATGCCTTATCAAAAAAGATAGATGCTAATGATTTAAATGAGATTAAAAAAGGTA GTGATGATAAGAAAAACATCTAA |
| Protein ID: 148285053 |
| T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-3 |
| Locus tag | OTBS_1953 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1885858..1889133 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB3 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1953 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.6e-22, Aligned region: 665..861 |
| Protein Sequence: 1091 a.a. [Download] |
| >gi|148285053|ref|YP_001249143.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MQSKIIKFAIIAVCIAVVSFILMLFGALRSGDDCWYRYNADGQDLDVIRLTQNVRASGQYDSLRLGGIVD PSKPCGLWIKSDFYVSVHEENGQLKPVNIDFLIDGTVSLCQAYLPKNALTCKLKYNDGKECNISDINKFF NGEKSDCIEDCEDNTDDSGNLIPIPRILDPGDGLPVILKANVGEWRNLAQVSAGDEIEVKIGRNQNFSHG GVENTEIGYAYSRPEFDWFNDTSLDWQKGTNDTFGIIKRTKQVRADCQEGKKNYSPLCGRYSPWGEGDNY IKQCDECKGCTCEDCGMKPKCPGSKPVCPAPECEMAGSHGWFSKHFAVFNSELGKDKCFYTGTVKDIFGG KDCPEKYLLDCKRAVLADGLPEEYRDDGTRTVPATLTEQDRNDIKSLGRIACSNRLDEQLVKNRQKVYSW RSATYATDLKYRFSSVQDKDSILGNKCKSDFPSGKDLATGCYGITKVNQDLIIYKDQISETLFSGPRYLQ YMIRPDINIESMKNSVGGYVLYLKQNSCVRKSGVAFDDSKFHGRGKILYAIVPAGVDVNKLKSHELDVYT TGSLDVKVEDLVGKAKISSSQSGYIWFKILNDEKDYKASVGEYKITMSTIVPRGKFISKVLNPIIRIFEN KIANASKTMFKNITCYQQNDKSRCTNFFNYIRAMLTLYIMGCGFAFMLGAVNFTAKELVIRIVKVIIVSG LINEGTFNFFNAYLYDLIMNFSKQLMVNVSGYEYDQNIGTFLFLDELMSKIFFNKTFYVQLLSLLSMGLM GVVYYIIIFVPIILIIISLLKTIMVYLVSTTAVALLVGLAPLFLSFMLFNRTWYLFDNWVRMLFRYLIEP VILMAGITILTQLFIVYLDFVLGYSVCWKCAIVFKLPKIDALGGVLGSYGGQELFCINWFGPWGYDNRAD NNIGLAMNYIIALVIIAYCMYSYIDFSSLMVDILTAGGAGGIAPSVGHVAPQVWDTAVQWTEKAVMKVAS IGKKGSFAVRKGIGKGISHAKSKYSSSQTEKSKDKDNVVNRRTNLENKSLNDKRGSAIRGKNSNVENVKP NQNTYLRVNNQEIDLNSPKPSHNESSVRRHDLNKKNFENND |
| Nucleotide Sequence: 3276 bp [Download] |
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| Protein ID: 148285054 |
| T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virB6-4 |
| Locus tag | OTBS_1954 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1889126..1891693 [+] |
| Product | type IV secretion system protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | A5CFB4 |
| KEGG ID | ots:OTBS_1954 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9.7e-19, Aligned region: 555..750 |
| Protein Sequence: 855 a.a. [Download] |
| >gi|148285054|ref|YP_001249144.1| type IV secretion system protein [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MTKILKILITKNKSLMTYYINILILLSYIFVSTSIQASNELLQAGEQLPTSNSLQWMDKYPNDNNTGCTN VSPTWLSVADVKWIDIQANSNNNWIDSGIMTKAGKSISVEIPKISQNFRKLQKRYLVLHRVDPRFPVIGK TFIIELGTNNKPISRLHNFENGKLLNYQNENSSNFQNGSTNFTNAINLQKKFFNGADTKISVKAGDIIDI ALISSVDFFNKLQLKGGTEKSGFTGELYPRWDDYKYYKPYGIYTVSLKSNVGVVDNALLVTGQTSDKKAL SKLLVGVKSIDSISSFEKCNLNNLSKSQSCIMQSGIGMEIKLDQEVLKSKFDKFLVGYNVGNANSSAFLD KPIEGMYHIVAKSDGDLSFSTPLFNNNVKYRTNGLQDVEYSSILSSCSTLNEFEQKYLNSILSSKQEIIQ GIVVDKTLVGRYLMYITIDRHNIVSDEYDGDIEYIISNTTPNLSTKGTTLPRNGINIVTPESAKLWFRFV KTNNEQFNLKVTVPPDSEGKIKVAGFFYDNIYIPIKQKVEKFSKLFYFGLAKNAALKKVFSILAILYITL YGIYFLLGVVKVTAYDLLIRCSKIIVIAALFNESSQYIFYDTLFPMFDGGINSLISYAVKTTASDVDNPF KFFDLVVSRYIDVNFLKIILIEIVNIHNGLTILGILTLWSIMRFIIIMVKVCMELLMSMIAIAILVGLAP MFIIFILFDRTAEIFKRWLTALLLNTLMPVIMIIFILIINELMLVAVEAAFPEIRICWGTLFDIELNLDL SAIGLPTAFSIPLMAVPFYNVVFVGGNLFNAMDLGNSFAGSLAGVFLLYNLVLLAGTLVGSQVFTKGINR KGMSYVKSIMMQLLS |
| Nucleotide Sequence: 2568 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:1889126-1891693 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGACTAAAATACTTAAAATTCTAATAACAAAAAACAAATCATTGATGACTTATTACATAAATATATTGA TTTTGCTATCATATATTTTTGTGTCTACCAGTATTCAAGCTTCAAATGAATTACTTCAAGCTGGAGAGCA ACTACCTACTTCTAATTCTCTTCAATGGATGGATAAATATCCTAATGATAATAATACAGGATGTACAAAT GTATCACCTACATGGTTGAGTGTTGCAGATGTAAAATGGATAGATATACAAGCTAACTCCAATAATAATT GGATTGATTCTGGTATTATGACTAAAGCTGGCAAAAGTATTTCAGTTGAGATTCCAAAGATTAGTCAAAA TTTTAGAAAGTTACAGAAAAGATATCTAGTATTACATAGAGTTGATCCGCGATTTCCTGTAATTGGGAAA ACTTTTATTATTGAACTAGGCACAAACAATAAGCCTATTTCACGTCTTCATAATTTTGAGAATGGTAAAC TATTGAATTACCAAAATGAGAATAGTAGTAATTTTCAAAATGGTAGTACTAATTTTACGAATGCTATAAA TCTGCAGAAAAAATTTTTTAATGGCGCAGACACTAAAATTAGTGTTAAAGCTGGTGATATTATCGATATA GCTTTAATTTCGTCTGTCGATTTTTTTAATAAGTTGCAGTTAAAAGGTGGTACTGAAAAATCTGGATTTA CTGGAGAGTTATATCCTAGGTGGGATGATTATAAATATTATAAACCTTATGGCATATATACTGTATCACT AAAGTCTAATGTTGGTGTTGTTGATAATGCTTTATTGGTTACTGGTCAAACTTCTGATAAGAAGGCATTA AGTAAGTTATTAGTTGGTGTTAAGAGTATTGATAGTATAAGCAGTTTTGAAAAATGTAATTTGAATAACT TGTCTAAGTCTCAATCCTGTATAATGCAATCTGGAATAGGAATGGAAATTAAATTGGATCAAGAAGTTCT AAAGTCTAAGTTTGATAAATTTTTAGTTGGTTATAATGTGGGGAATGCGAATAGCAGCGCTTTTCTCGAT AAGCCAATAGAGGGAATGTATCATATAGTAGCAAAAAGTGATGGTGACTTGAGTTTTTCTACGCCATTGT TTAATAATAATGTAAAATACCGTACTAATGGACTGCAAGATGTGGAATATAGCAGTATATTAAGTAGCTG TAGTACATTGAATGAATTTGAACAAAAATATTTAAATTCTATTCTTAGTTCTAAGCAAGAAATAATTCAA GGAATAGTTGTTGATAAAACATTAGTAGGGCGGTACTTGATGTACATAACTATTGATAGACATAATATAG TTAGTGATGAATATGATGGTGATATAGAGTATATTATTTCAAATACAACTCCAAACTTATCTACTAAAGG TACTACTTTACCTCGAAATGGAATAAATATAGTTACTCCTGAATCAGCAAAGCTATGGTTTCGTTTTGTA AAAACAAATAATGAACAATTTAATTTGAAGGTAACAGTTCCACCTGATAGTGAAGGTAAAATAAAGGTTG CTGGATTTTTTTATGATAATATTTATATACCAATCAAGCAAAAAGTTGAAAAGTTTTCTAAATTGTTTTA TTTTGGCTTAGCTAAGAATGCAGCCTTAAAAAAGGTATTCAGTATTTTAGCAATTCTATACATTACACTA TATGGTATTTATTTTTTATTAGGAGTAGTAAAAGTTACTGCTTACGACTTACTTATACGATGTAGTAAAA TTATAGTTATAGCAGCACTGTTTAACGAAAGTAGCCAATATATTTTTTATGATACTCTATTTCCAATGTT TGATGGTGGTATAAATAGTTTAATTAGCTATGCTGTTAAAACTACTGCCAGTGATGTTGACAATCCGTTT AAGTTCTTTGATTTAGTTGTTAGTAGATATATTGATGTTAACTTTCTAAAGATAATATTAATTGAAATAG TTAACATACATAATGGTTTGACGATATTAGGAATATTAACTTTATGGTCAATTATGAGGTTTATAATCAT TATGGTTAAAGTATGTATGGAACTTTTGATGTCTATGATTGCCATTGCAATATTAGTTGGGTTGGCTCCG ATGTTTATAATTTTTATATTATTTGATAGGACAGCTGAGATTTTTAAAAGATGGCTTACTGCTCTTTTAT TAAATACATTAATGCCAGTGATAATGATTATCTTTATATTAATTATTAATGAATTGATGTTAGTTGCAGT GGAAGCTGCTTTTCCTGAAATTAGAATTTGTTGGGGCACATTGTTTGATATAGAATTAAATCTTGACTTA TCTGCAATTGGATTACCAACAGCATTTAGTATTCCTCTGATGGCTGTACCTTTCTACAACGTTGTTTTCG TTGGTGGAAATTTATTTAATGCTATGGATTTAGGTAACAGTTTTGCAGGTTCGTTAGCAGGAGTTTTTTT ACTATATAACTTAGTTTTACTAGCTGGAACACTAGTTGGTTCTCAAGTATTTACTAAGGGAATAAATAGA AAGGGAATGAGCTATGTAAAAAGTATCATGATGCAACTTTTAAGTTAG |