| Protein ID: 148284004 |
 T4SS name [ID] | VirB [506] |
| Gene symbol | virD4 |
| Locus tag | OTBS_0007 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Boryong |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_009488] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 6617..8389 [+] |
| Product | type IV secretion system component VirD4 |
| Component type | VirD4 |
| UniProt ID | A5CBW9 |
| KEGG ID | ots:OTBS_0007 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | T4SS-DNA_transf [PF02534], Evalue: 8.8e-160, Aligned region: 122..568 TraG-D_C [PF12696], Evalue: 3.7e-28, Aligned region: 406..528 TrwB_AAD_bind [PF10412], Evalue: 4.8e-20, Aligned region: 238..536 |
| Protein Sequence: 590 a.a. [Download] |
| >gi|148284004|ref|YP_001248094.1| type IV secretion system component VirD4 [Orientia tsutsugamushi str. Boryong] MNENAFLTKIRNLVIKIMVHCIGVILVVFIIKFFILLFTVKHQNLIDVLLTFNVSIVYQYLIWIINSWSL IDFSSYDYLKLKLVFSFIVPPVITIVLYIKNFEKIKSWQPYKLKEKVYGDARWGDQDDIKRAGLRSKHGT LLGVDKGGYYVADGFQHALLFAPTGSGKGVGFVIPNLLFWEHSVIVHDIKLENYELTSGWRAQQGQNVYV WEPANPDGITHCYNPIDWVSSKPGQMVDDVQKIANLIMPEKDFWNNEARSLFLGVVLYLIADNTKAKTFG EVVRTMRSNDVVYNLAVVLDTMGAVIHPVAYMNIAAFLQKADKERSGVISTMNSGLELWANPLIDAATAS SDFNILEIKRKKTTIYVGLTPDNINRLQKLMQVFYQQSTEFLSRKIPDVKEEPYGVMFLLDEFPTLGKME QFKTGIAYFRGYRVRLFLIIQDTQQLKGTYEEAGMNSFLSNSTYRITFAANNYETANLISQLCGNKTVKQ ASHSQPRFFDLNPATRTMNISEVQRALLLPQEVILLPRDEQIILIESFPPIRSKKVKYYEDKFFTTRLLP PSFVPTQTPYVPPDYNATADDSNNVDNNQK |
| Nucleotide Sequence: 1773 bp [Download] |
| >gi|148283997|ref|NC_009488.1|:6617-8389 Orientia tsutsugamushi str. Boryong, complete genome ATGAATGAGAATGCATTTTTAACTAAGATTAGAAATCTAGTTATAAAGATAATGGTTCATTGTATTGGAG TAATATTAGTAGTTTTCATTATTAAATTTTTTATACTCTTATTTACTGTTAAACATCAAAATTTAATAGA TGTATTACTAACTTTTAATGTATCCATTGTATATCAATATCTAATCTGGATTATAAATTCTTGGAGTTTA ATTGATTTTAGTAGTTATGATTACTTAAAACTTAAATTAGTATTTTCATTTATAGTTCCACCTGTTATAA CTATAGTGTTATATATCAAAAATTTCGAGAAAATTAAGAGTTGGCAACCATATAAATTGAAAGAAAAAGT ATACGGTGATGCACGTTGGGGAGATCAAGATGATATAAAAAGAGCTGGTCTTAGATCAAAGCATGGTACA TTGTTAGGTGTGGATAAGGGAGGATACTATGTTGCAGATGGATTTCAACATGCTTTATTATTTGCTCCTA CTGGTTCAGGTAAAGGGGTAGGTTTTGTAATTCCAAATTTATTGTTTTGGGAACATTCGGTAATAGTTCA CGATATTAAGCTTGAAAATTATGAATTAACTAGTGGCTGGCGAGCTCAGCAAGGACAAAATGTTTATGTA TGGGAGCCAGCTAATCCAGATGGTATTACTCATTGTTATAATCCAATAGATTGGGTTAGTAGTAAACCTG GGCAGATGGTTGATGATGTGCAGAAAATTGCTAACCTAATTATGCCAGAAAAAGACTTTTGGAATAATGA GGCTAGAAGTCTGTTTTTAGGAGTTGTATTATATTTAATTGCTGACAATACAAAAGCTAAAACATTTGGT GAAGTGGTCCGTACTATGCGCAGTAATGATGTAGTATATAATTTAGCAGTAGTATTGGATACTATGGGAG CAGTTATTCATCCAGTTGCTTATATGAATATTGCTGCTTTTCTTCAAAAAGCTGATAAAGAACGCTCTGG AGTAATATCAACTATGAATTCTGGGCTTGAATTATGGGCAAATCCATTAATTGATGCTGCAACTGCTTCA TCAGATTTCAATATCTTAGAAATAAAAAGAAAAAAAACAACAATATATGTTGGCTTAACACCTGATAATA TCAATAGATTGCAAAAATTAATGCAAGTATTTTATCAACAGTCTACTGAATTTTTAAGCAGAAAAATTCC TGATGTTAAGGAAGAACCTTATGGGGTAATGTTTCTATTGGATGAGTTTCCAACTTTAGGTAAAATGGAA CAATTTAAAACCGGAATTGCTTATTTTCGAGGTTATAGAGTAAGGTTATTTTTGATTATTCAAGATACGC AACAGTTAAAAGGAACATATGAAGAAGCAGGAATGAATTCATTTTTATCTAATTCTACTTATAGAATTAC CTTTGCTGCTAACAATTATGAGACTGCTAACTTGATATCACAGCTATGTGGTAATAAAACAGTAAAACAA GCATCTCATAGTCAACCTCGCTTTTTTGATCTTAATCCAGCTACTAGAACTATGAATATTTCTGAAGTAC AAAGAGCATTATTATTACCACAAGAAGTTATTTTACTGCCACGAGATGAGCAAATTATTTTAATTGAATC GTTTCCACCAATACGATCTAAAAAGGTTAAATATTATGAGGACAAGTTTTTTACTACTAGATTACTACCA CCTTCATTTGTTCCAACTCAAACACCTTATGTTCCTCCAGATTATAATGCTACAGCTGATGATAGTAATA ACGTAGATAATAATCAAAAATAA |