Detailed information of TA system    

insolicoBioinformatically predicted

Overview


TA module


Type III Classification (family/domain) toxIN/ToxN(toxin)
Location 1..83528 Replicon plasmid pCh38_83
Accession NZ_CP024100
Organism Bacillus cytotoxicus strain CH_38

Toxin (Protein)


Gene name toxN Uniprot ID -
Locus tag CG483_RS22390 Protein ID WP_094374045.1
Coordinates 1..83528 (-) Length 27842.666666667 a.a.

Antitoxin (RNA)


Gene name toxI
Locus tag -
Coordinates 294..390 (-)

Genomic Context


Locus tag Coordinates Strand Size (bp) Protein ID Product Description
CG483_RS22390 1..83528 - 83528 WP_094374045.1 type III toxin-antitoxin system ToxN/AbiQ family toxin Toxin
- 294..390 - 97 NuclAT_0 - Antitoxin
- 294..390 - 97 NuclAT_0 - Antitoxin
- 294..390 - 97 NuclAT_0 - Antitoxin
- 294..390 - 97 NuclAT_0 - Antitoxin
- 294..390 - 97 NuclAT_0 - Antitoxin
CG483_RS22395 494..1515 - 1022 Protein_1 DUF3991 domain-containing protein -
CG483_RS22400 1643..2194 - 552 WP_094374049.1 metal-dependent hydrolase -
CG483_RS22405 2219..3199 - 981 WP_094374051.1 hypothetical protein -
CG483_RS22410 3306..5075 - 1770 WP_162533114.1 hypothetical protein -
CG483_RS22415 5072..5281 - 210 WP_094374055.1 DUF5511 family protein -
CG483_RS22420 5304..5732 - 429 WP_094374057.1 DUF5514 family protein -
CG483_RS22425 5752..6228 - 477 WP_094374059.1 hypothetical protein -
CG483_RS22430 6297..7862 - 1566 WP_094374061.1 hypothetical protein -
CG483_RS22435 7882..8490 - 609 WP_094374063.1 hypothetical protein -
CG483_RS22440 8508..8795 - 288 WP_094374065.1 hypothetical protein -
CG483_RS22445 9059..9916 - 858 WP_094374067.1 hypothetical protein -
CG483_RS22450 9907..10185 - 279 WP_094374069.1 DUF5513 family protein -
CG483_RS22455 10293..10901 - 609 WP_094374071.1 hypothetical protein -
CG483_RS22460 10926..12053 - 1128 WP_094374073.1 bifunctional lysozyme/C40 family peptidase -
CG483_RS22465 12055..13992 - 1938 WP_094374075.1 ATP-binding protein -
CG483_RS22470 14007..14669 - 663 WP_162533115.1 hypothetical protein -
CG483_RS22475 14733..15047 - 315 WP_094374077.1 hypothetical protein -
CG483_RS22480 15031..15864 - 834 WP_094374078.1 hypothetical protein -
CG483_RS22485 15833..16042 - 210 WP_094374080.1 hypothetical protein -
CG483_RS22490 16047..16307 - 261 WP_094374082.1 hypothetical protein -
CG483_RS22495 16325..19282 - 2958 WP_094374084.1 hypothetical protein -
CG483_RS22500 19317..21944 - 2628 WP_094374086.1 type IV secretory system conjugative DNA transfer family protein -
CG483_RS22505 21980..23950 - 1971 WP_094374087.1 hypothetical protein -
CG483_RS22510 24046..24324 - 279 WP_094374089.1 TrbC/VirB2 family protein -
CG483_RS22515 24342..24593 - 252 WP_094374091.1 hypothetical protein -
CG483_RS22520 24777..25139 - 363 WP_094374093.1 hypothetical protein -
CG483_RS22525 25193..25942 - 750 WP_094374095.1 hypothetical protein -
CG483_RS22530 25939..26772 - 834 WP_094374097.1 hypothetical protein -
CG483_RS22535 26807..28153 - 1347 WP_094374099.1 Flp pilus assembly complex ATPase component TadA -
CG483_RS22540 28170..28553 - 384 WP_094374101.1 hypothetical protein -
CG483_RS23360 28645..28797 - 153 WP_204082018.1 hypothetical protein -
CG483_RS22545 28886..29260 - 375 WP_094374103.1 hypothetical protein -
CG483_RS22550 29280..33527 - 4248 WP_162533177.1 fusion protein (includes pXO2-28-29-30) -
CG483_RS22555 33677..34252 - 576 WP_094374107.1 hypothetical protein -
CG483_RS22560 34320..34541 - 222 WP_094374109.1 hypothetical protein -
CG483_RS23035 34618..34779 - 162 WP_162533112.1 hypothetical protein -
CG483_RS22565 34919..35668 - 750 WP_094374111.1 hypothetical protein -
CG483_RS22570 35731..35967 - 237 WP_094374113.1 hypothetical protein -
CG483_RS22575 36303..36782 - 480 WP_094374115.1 DUF5512 family protein -
CG483_RS22585 37089..37622 - 534 WP_094374118.1 hypothetical protein -
CG483_RS22590 38343..38642 - 300 WP_162533116.1 hypothetical protein -
CG483_RS23365 39558..39713 - 156 WP_204082014.1 hypothetical protein -
CG483_RS22595 39710..40933 - 1224 WP_094374122.1 AimR family lysis-lysogeny pheromone receptor -
CG483_RS22600 41082..41840 - 759 WP_162533117.1 hypothetical protein -
CG483_RS22605 42042..43598 - 1557 WP_094374126.1 primase C-terminal domain-containing protein -
CG483_RS22610 44272..45087 + 816 WP_094374128.1 AAA family ATPase -
CG483_RS22615 45092..45454 + 363 WP_094374130.1 hypothetical protein -
CG483_RS22620 45543..45764 + 222 WP_094374131.1 hypothetical protein -
CG483_RS22625 45786..46013 + 228 WP_094374133.1 hypothetical protein -
CG483_RS22630 46044..46235 + 192 WP_094374135.1 hypothetical protein -
CG483_RS22635 46248..46532 + 285 WP_094374137.1 metalloregulator ArsR/SmtB family transcription factor -
CG483_RS22640 46559..46894 + 336 WP_094374139.1 hypothetical protein -
CG483_RS22650 47327..48421 + 1095 WP_094374143.1 RapH N-terminal domain-containing protein -
CG483_RS22655 48421..48579 + 159 WP_094374145.1 general stress protein -
CG483_RS22660 48669..50312 - 1644 WP_094374147.1 peptide ABC transporter substrate-binding protein -
CG483_RS22665 50687..51451 - 765 WP_094374149.1 site-specific DNA-methyltransferase -
CG483_RS22670 51644..51999 - 356 Protein_57 DNA cytosine methyltransferase -
CG483_RS22675 52015..52734 - 720 WP_094374152.1 DNA (cytosine-5-)-methyltransferase -
CG483_RS23370 52814..52990 - 177 WP_204082015.1 hypothetical protein -
CG483_RS22680 53288..53887 - 600 WP_094374154.1 DUF3967 domain-containing protein -
CG483_RS22685 54117..54323 - 207 WP_094374156.1 hypothetical protein -
CG483_RS23375 54858..55013 + 156 WP_204082016.1 hypothetical protein -
CG483_RS22690 55526..56140 + 615 WP_094374158.1 recombinase family protein -
CG483_RS22695 56257..57213 + 957 WP_094374160.1 site-specific integrase -
CG483_RS22700 57657..57995 + 339 WP_094374162.1 hypothetical protein -
CG483_RS22705 58034..58219 + 186 WP_094374164.1 helix-turn-helix domain-containing protein -
CG483_RS22710 58696..59268 - 573 WP_094374166.1 hypothetical protein -
CG483_RS22715 59282..59749 - 468 WP_094374168.1 hypothetical protein -
CG483_RS22720 59999..60253 - 255 WP_094374170.1 hypothetical protein -
CG483_RS22725 60320..61042 - 723 WP_094374172.1 hypothetical protein -
CG483_RS22730 61193..61612 - 420 WP_094374173.1 hypothetical protein -
CG483_RS22735 61676..62005 - 330 WP_094374175.1 hypothetical protein -
CG483_RS22740 62082..62339 - 258 WP_094374183.1 hypothetical protein -
CG483_RS22755 62974..63519 - 546 WP_094396517.1 hypothetical protein -
CG483_RS23040 63779..63949 - 171 WP_162533121.1 hypothetical protein -
CG483_RS22760 64001..64390 - 390 WP_094396516.1 hypothetical protein -
CG483_RS22765 64428..64838 - 411 WP_204082017.1 hypothetical protein -
CG483_RS22770 65001..65450 - 450 WP_162533120.1 CPBP family intramembrane metalloprotease -
CG483_RS22775 65482..67635 - 2154 WP_094396515.1 type IA DNA topoisomerase -
CG483_RS22780 67728..68663 - 936 WP_094396514.1 hypothetical protein -
CG483_RS22785 69180..69494 - 315 WP_063262619.1 hypothetical protein -
CG483_RS22790 69558..70433 - 876 WP_094398205.1 LysR family transcriptional regulator -
CG483_RS22795 70570..71589 + 1020 WP_063262617.1 YeiH family protein -
CG483_RS22800 71615..72037 + 423 WP_063262616.1 universal stress protein -
CG483_RS22805 72155..72292 + 138 Protein_85 SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase -
CG483_RS23045 72288..72470 + 183 WP_140419743.1 hypothetical protein -
CG483_RS22810 72496..73230 + 735 WP_063262614.1 SDR family oxidoreductase -
CG483_RS22815 73468..73713 + 246 WP_170869127.1 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein -
CG483_RS22820 74258..75790 - 1533 WP_063262612.1 hypothetical protein -
CG483_RS22825 75771..77640 - 1870 Protein_90 TnsD family transposase -
CG483_RS22830 77652..79313 - 1662 WP_094374179.1 ATP-binding protein -
CG483_RS22835 79315..81471 - 2157 WP_063262610.1 DDE-type integrase/transposase/recombinase -
CG483_RS22840 81468..82307 - 840 WP_063262609.1 heteromeric transposase endonuclease subunit TnsA -
CG483_RS22845 82659..83039 - 381 WP_094374043.1 hypothetical protein -

Associated MGEs


MGE
detail
Similar
MGEs
Relative
position
MGE Type Cargo ARG Virulence gene Coordinates Length (bp)
- inside Non-Mobilizable plasmid - - 1..83528 83528


Relative position:
(1) inside: TA loci is completely located inside the MGE;
(2) overlap: TA loci is partially overlapped with the MGE;
(3) flank: The TA loci is located in the 5 kb flanking regions of MGE.


Domains


Predicted by InterproScan

Toxin

(4249-4451)


Sequences


Toxin        


Download         Length: 27842.666666667 a.a.        Molecular weight: 3073693.60 Da        Isoelectric Point: 10.1504

>T86720 WP_094374045.1 NZ_CP024100:c83528-1 [Bacillus cytotoxicus]
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Antitoxin


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GTAGTAGGCACAAAAAA

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Protein Organism Identities (%) Coverage (%) Ha-value

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