MGE detailed information
MGE type: Integrative_Conjugative_Elements MGE length: 88997 bp
Accession: NZ_CP078006 Location: 5835314..5924310 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain NDTH7329 Replicon: chromosome
Accession: NZ_CP078006 Location: 5835314..5924310 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain NDTH7329 Replicon: chromosome
Gene structure
The 5 kb flanking regions of this MGE are displayed.
| Locus tag | Coordinates | Strand | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
|---|---|---|---|---|---|---|
| KUU80_RS27240 (KUU80_27235) | 5830833..5835085 | + | 4253 | Protein_5408 | two-partner secretion system exoprotein TpsA4 | - |
| KUU80_RS27245 (KUU80_27240) | 5835452..5836312 | + | 861 | WP_023082029.1 | ParA family protein | - |
| KUU80_RS27250 (KUU80_27245) | 5836314..5837042 | + | 729 | WP_025298022.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27255 (KUU80_27250) | 5837039..5837536 | + | 498 | WP_196994394.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS33565 | 5837533..5838684 | + | 1152 | WP_023108755.1 | Lar family restriction alleviation protein | - |
| KUU80_RS27270 (KUU80_27265) | 5838684..5839385 | + | 702 | WP_023082648.1 | DUF2786 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS27275 (KUU80_27270) | 5839382..5840089 | + | 708 | WP_023082649.1 | HNH endonuclease signature motif containing protein | - |
| KUU80_RS27280 (KUU80_27275) | 5840073..5840297 | + | 225 | WP_009315888.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27285 (KUU80_27280) | 5840294..5841637 | + | 1344 | WP_023082650.1 | replicative DNA helicase | - |
| KUU80_RS27290 (KUU80_27285) | 5842076..5842522 | - | 447 | WP_003117028.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27295 (KUU80_27290) | 5842706..5843665 | + | 960 | WP_023082651.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27300 (KUU80_27295) | 5844072..5844257 | + | 186 | WP_003157042.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27305 (KUU80_27300) | 5844247..5844774 | + | 528 | WP_003448815.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27310 (KUU80_27305) | 5844771..5845028 | + | 258 | WP_003448812.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27315 (KUU80_27310) | 5845021..5845260 | + | 240 | WP_023082652.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27320 (KUU80_27315) | 5845253..5845486 | + | 234 | WP_003103841.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27325 (KUU80_27320) | 5845486..5846508 | + | 1023 | WP_010792224.1 | nucleoid-associated protein YejK | - |
| KUU80_RS27330 (KUU80_27325) | 5846505..5847395 | + | 891 | WP_025298026.1 | DNA adenine methylase | - |
| KUU80_RS27335 (KUU80_27330) | 5847416..5847685 | + | 270 | WP_012076847.1 | Arc family DNA-binding protein | - |
| KUU80_RS27340 (KUU80_27335) | 5847682..5849415 | + | 1734 | WP_031637209.1 | ParB family protein | - |
| KUU80_RS27345 (KUU80_27340) | 5849443..5850198 | + | 756 | WP_012076849.1 | DUF2857 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS27350 (KUU80_27345) | 5850201..5851526 | + | 1326 | WP_031637207.1 | STY4528 family pathogenicity island replication protein | - |
| KUU80_RS27355 (KUU80_27350) | 5852067..5852237 | + | 171 | WP_196752229.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27360 (KUU80_27355) | 5852394..5853122 | + | 729 | WP_023082037.1 | TIGR03761 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27365 (KUU80_27360) | 5853128..5853676 | + | 549 | WP_023082038.1 | DUF3158 family protein | - |
| KUU80_RS27370 (KUU80_27365) | 5853724..5854566 | + | 843 | WP_023082039.1 | Rha family transcriptional regulator | - |
| KUU80_RS27375 (KUU80_27370) | 5854596..5855084 | + | 489 | WP_023082040.1 | single-stranded DNA-binding protein | - |
| KUU80_RS27380 (KUU80_27375) | 5855192..5855545 | + | 354 | WP_003120979.1 | helix-turn-helix transcriptional regulator | - |
| KUU80_RS27385 (KUU80_27380) | 5855665..5855832 | + | 168 | WP_128729268.1 | CrpP family ICE-associated protein | - |
| KUU80_RS27390 (KUU80_27385) | 5855947..5857866 | + | 1920 | WP_023082041.1 | type I DNA topoisomerase | - |
| KUU80_RS27395 (KUU80_27390) | 5857880..5858626 | + | 747 | WP_223677422.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27400 (KUU80_27395) | 5858927..5860816 | + | 1890 | WP_196994395.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27405 (KUU80_27400) | 5860813..5862789 | + | 1977 | WP_016851611.1 | DEAD/DEAH box helicase | - |
| KUU80_RS27410 (KUU80_27405) | 5862930..5863274 | + | 345 | WP_016851612.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27415 (KUU80_27410) | 5863345..5863635 | - | 291 | WP_003448662.1 | putative addiction module antidote protein | Antitoxin Detail |
| KUU80_RS27420 (KUU80_27415) | 5863632..5863931 | - | 300 | WP_003120987.1 | type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin | Toxin Detail |
| KUU80_RS27425 (KUU80_27420) | 5864133..5865257 | + | 1125 | WP_012076859.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS27430 (KUU80_27425) | 5865257..5866966 | + | 1710 | WP_003099757.1 | Outer membrane lipoprotein BfpB | VF |
| KUU80_RS27435 (KUU80_27430) | 5866970..5868295 | + | 1326 | WP_003099758.1 | type 4b pilus protein PilO2 | - |
| KUU80_RS27440 (KUU80_27435) | 5868285..5868818 | + | 534 | WP_003099760.1 | type IV pilus biogenesis protein PilP | - |
| KUU80_RS27445 (KUU80_27440) | 5868827..5870407 | + | 1581 | WP_003099761.1 | Toxin coregulated pilus biosynthesis protein T | VF |
| KUU80_RS27450 (KUU80_27445) | 5870407..5871486 | + | 1080 | WP_023093858.1 | Toxin coregulated pilus biosynthesis protein E | VF |
| KUU80_RS27455 (KUU80_27450) | 5871508..5872038 | + | 531 | WP_023093859.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS27460 (KUU80_27455) | 5872035..5872991 | + | 957 | WP_023093675.1 | ATPase, T2SS/T4P/T4SS family | - |
| KUU80_RS27465 (KUU80_27460) | 5872984..5874363 | + | 1380 | WP_023093860.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS27470 (KUU80_27465) | 5874381..5874818 | + | 438 | WP_023093861.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS27475 (KUU80_27470) | 5875817..5876803 | + | 987 | WP_003099775.1 | Rpn family recombination-promoting nuclease/putative transposase | - |
| KUU80_RS27480 (KUU80_27475) | 5877116..5877682 | + | 567 | WP_003099777.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27485 (KUU80_27480) | 5877759..5877899 | + | 141 | WP_003099780.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS33570 | 5877937..5878071 | + | 135 | WP_003099783.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27490 (KUU80_27485) | 5878397..5878885 | + | 489 | WP_003099785.1 | STY4534 family ICE replication protein | - |
| KUU80_RS27495 (KUU80_27490) | 5879023..5879181 | + | 159 | WP_003099787.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27500 (KUU80_27495) | 5879255..5879452 | + | 198 | WP_003099789.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27505 (KUU80_27500) | 5879572..5879940 | + | 369 | WP_003099790.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27510 (KUU80_27505) | 5880183..5880533 | + | 351 | WP_004347949.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27515 (KUU80_27510) | 5880590..5881222 | + | 633 | WP_196994077.1 | DUF3275 family protein | - |
| KUU80_RS27520 (KUU80_27515) | 5881219..5881494 | + | 276 | WP_003099794.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27525 (KUU80_27520) | 5881564..5881926 | + | 363 | WP_003099795.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27530 (KUU80_27525) | 5881994..5882254 | + | 261 | WP_003099797.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27535 (KUU80_27530) | 5882347..5882952 | + | 606 | WP_003099799.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27540 (KUU80_27535) | 5882982..5884427 | + | 1446 | WP_003099801.1 | DUF6094 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS27545 (KUU80_27540) | 5884532..5886781 | + | 2250 | WP_042166055.1 | DEAD/DEAH box helicase | - |
| KUU80_RS27550 (KUU80_27545) | 5886876..5887332 | + | 457 | Protein_5470 | IS3 family transposase | - |
| KUU80_RS27555 (KUU80_27550) | 5887511..5888722 | + | 1212 | WP_223697283.1 | three-Cys-motif partner protein TcmP | - |
| KUU80_RS27560 (KUU80_27555) | 5888955..5889698 | + | 744 | WP_003117069.1 | phage Gp37/Gp68 family protein | - |
| KUU80_RS27565 (KUU80_27560) | 5889716..5891050 | + | 1335 | WP_003117070.1 | three-Cys-motif partner protein TcmP | - |
| KUU80_RS27570 (KUU80_27565) | 5891502..5892200 | + | 699 | WP_023094353.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27575 (KUU80_27570) | 5892211..5892966 | + | 756 | WP_003099814.1 | TIGR03759 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27580 (KUU80_27575) | 5892951..5893532 | + | 582 | WP_003117072.1 | hypothetical protein | VF |
| KUU80_RS27585 (KUU80_27580) | 5893529..5894029 | + | 501 | WP_003099819.1 | integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27590 (KUU80_27585) | 5894038..5894307 | + | 270 | WP_003099820.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27595 (KUU80_27590) | 5894311..5896542 | + | 2232 | WP_196994078.1 | type IV conjugative transfer system coupling protein TraD | - |
| KUU80_RS27600 (KUU80_27595) | 5896542..5897288 | + | 747 | WP_003086173.1 | TIGR03747 family integrating conjugative element membrane protein | - |
| KUU80_RS27605 (KUU80_27600) | 5897306..5897797 | + | 492 | WP_003109389.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27610 (KUU80_27605) | 5898037..5899518 | + | 1482 | WP_042166176.1 | UvrD-helicase domain-containing protein | - |
| KUU80_RS27615 (KUU80_27610) | 5899627..5899932 | + | 306 | WP_058016274.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27620 (KUU80_27615) | 5900026..5900364 | + | 339 | WP_003158157.1 | RAQPRD family integrative conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27625 (KUU80_27620) | 5900361..5900600 | + | 240 | WP_003121019.1 | TIGR03758 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27630 (KUU80_27625) | 5900618..5900974 | + | 357 | WP_003117077.1 | TIGR03745 family integrating conjugative element membrane protein | - |
| KUU80_RS27635 (KUU80_27630) | 5900985..5901371 | + | 387 | WP_003117078.1 | TIGR03750 family conjugal transfer protein | - |
| KUU80_RS27640 (KUU80_27635) | 5901368..5902026 | + | 659 | Protein_5488 | TIGR03746 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27645 (KUU80_27640) | 5902023..5902907 | + | 885 | WP_003121020.1 | TIGR03749 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27650 (KUU80_27645) | 5902891..5904396 | + | 1506 | WP_003121021.1 | TIGR03752 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27655 (KUU80_27650) | 5904374..5904817 | + | 444 | WP_003121022.1 | TIGR03751 family conjugal transfer lipoprotein | - |
| KUU80_RS27660 (KUU80_27655) | 5904817..5907759 | + | 2943 | WP_179063012.1 | conjugative transfer ATPase | - |
| KUU80_RS27665 (KUU80_27660) | 5907756..5908040 | + | 285 | WP_003086159.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27670 (KUU80_27665) | 5908037..5908708 | + | 672 | WP_023092929.1 | DsbA family protein | - |
| KUU80_RS27675 (KUU80_27670) | 5908864..5910117 | + | 1254 | WP_003151440.1 | DNA cytosine methyltransferase | - |
| KUU80_RS27680 (KUU80_27675) | 5910104..5912206 | - | 2103 | WP_023092930.1 | ATP-binding protein | - |
| KUU80_RS27685 (KUU80_27680) | 5912472..5912903 | + | 432 | WP_023518409.1 | TIGR03757 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27690 (KUU80_27685) | 5912903..5913841 | + | 939 | WP_012076879.1 | TIGR03756 family integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27695 (KUU80_27690) | 5913859..5915241 | + | 1383 | WP_050413521.1 | integrating conjugative element protein | - |
| KUU80_RS27700 (KUU80_27695) | 5915241..5915588 | + | 348 | WP_003099870.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27705 (KUU80_27700) | 5915585..5917096 | + | 1512 | WP_211852000.1 | conjugal transfer protein TraG N-terminal domain-containing protein | - |
| KUU80_RS27710 (KUU80_27705) | 5917134..5917484 | - | 351 | WP_071537104.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27715 (KUU80_27710) | 5917603..5917875 | + | 273 | WP_003086148.1 | type II toxin-antitoxin system ParD family antitoxin | - |
| KUU80_RS27720 (KUU80_27715) | 5917879..5918229 | + | 351 | WP_003117088.1 | type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin | - |
| KUU80_RS27725 (KUU80_27720) | 5918402..5918632 | + | 231 | WP_021264354.1 | hypothetical protein | - |
| KUU80_RS27730 (KUU80_27725) | 5918853..5920202 | + | 1350 | WP_023082061.1 | SH3 domain-containing protein | - |
| KUU80_RS27735 (KUU80_27730) | 5920700..5922619 | + | 1920 | WP_211852002.1 | MobH family relaxase | - |
| KUU80_RS27740 (KUU80_27735) | 5922616..5923896 | + | 1281 | WP_211852004.1 | Tyrosine recombinase XerC ; Integrase | Integrase |
| KUU80_RS27760 (KUU80_27755) | 5924748..5927312 | - | 2565 | WP_003145976.1 | ATP-dependent chaperone ClpB | - |
| KUU80_RS27765 (KUU80_27760) | 5927468..5928196 | - | 729 | WP_003116257.1 | peptidoglycan editing factor PgeF | - |
| KUU80_RS27770 (KUU80_27765) | 5928193..5929155 | - | 963 | WP_003094686.1 | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase RluD | - |
Similar MGE(s)
Similar MGE(s) is defined as other TA-related MGE(s) with Mash distance < 0.01 to this MGE.
| Detail | Organism | MGE type | Related TA | Genome accession | Coordinates | Mash distance |
|---|