MGE detailed information
MGE type: Non-Mobilizable plasmid MGE length: 53491 bp
Accession: NZ_CP077989 Location: 1..53491 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain ZPPH1 Replicon: plasmid p1
Accession: NZ_CP077989 Location: 1..53491 Organism: Pseudomonas aeruginosa strain ZPPH1 Replicon: plasmid p1
Gene structure
The 5 kb flanking regions of this MGE are displayed.
Locus tag | Coordinates | Strand | Size (bp) | Protein ID | Product | Description |
---|---|---|---|---|---|---|
KUU79_RS30975 (KUU79_30960) | 1..816 | + | 816 | WP_196994190.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS30980 (KUU79_30965) | 1847..2641 | + | 795 | WP_031655076.1 | DUF3560 domain-containing protein | - |
KUU79_RS30985 (KUU79_30970) | 2913..3983 | + | 1071 | WP_196994191.1 | DNA-binding protein | - |
KUU79_RS30990 (KUU79_30975) | 4022..4288 | + | 267 | WP_196994192.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS30995 (KUU79_30980) | 4364..4555 | + | 192 | WP_196994193.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31000 (KUU79_30985) | 4584..4883 | + | 300 | WP_196994194.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31005 (KUU79_30990) | 4996..5202 | + | 207 | WP_152996423.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31010 (KUU79_30995) | 5229..5483 | + | 255 | WP_196994195.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31015 (KUU79_31000) | 6069..6746 | + | 678 | WP_034018017.1 | SOS response-associated peptidase | - |
KUU79_RS31020 (KUU79_31005) | 6855..7157 | + | 303 | WP_023131919.1 | anti-CRISPR protein AcrE1 | - |
KUU79_RS31025 (KUU79_31010) | 7180..7602 | + | 423 | WP_196994196.1 | anti-CRISPR protein AcrF3 | - |
KUU79_RS31030 (KUU79_31015) | 7615..7854 | + | 240 | WP_196994197.1 | anti-CRISPR protein | - |
KUU79_RS32370 | 7851..8054 | + | 204 | WP_031757130.1 | helix-turn-helix transcriptional regulator | - |
KUU79_RS31035 (KUU79_31020) | 8150..8470 | + | 321 | WP_196994198.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31040 (KUU79_31025) | 8952..9368 | + | 417 | WP_196994199.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31045 (KUU79_31030) | 9459..9734 | - | 276 | WP_019727125.1 | type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin | Toxin Detail |
KUU79_RS31050 (KUU79_31035) | 9734..10009 | - | 276 | WP_019727126.1 | ribbon-helix-helix domain-containing protein | Antitoxin Detail |
KUU79_RS31055 (KUU79_31040) | 10284..10670 | + | 387 | WP_019727127.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31060 (KUU79_31045) | 10731..11024 | + | 294 | WP_019727128.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31065 (KUU79_31050) | 11348..11656 | + | 309 | WP_019727129.1 | TrfB-related DNA-binding protein | - |
KUU79_RS31070 (KUU79_31055) | 12306..12758 | + | 453 | WP_019727132.1 | DNA repair protein RadC | - |
KUU79_RS31075 (KUU79_31060) | 13196..13444 | + | 249 | WP_058130600.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31080 (KUU79_31065) | 13494..13745 | - | 252 | WP_058130599.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31085 (KUU79_31070) | 13804..14088 | + | 285 | WP_019727136.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31090 (KUU79_31075) | 14131..14508 | + | 378 | WP_019727137.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31095 (KUU79_31080) | 14957..16930 | + | 1974 | WP_196994200.1 | ParB/RepB/Spo0J family partition protein | - |
KUU79_RS31100 (KUU79_31085) | 16961..17284 | + | 324 | WP_025982297.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31105 (KUU79_31090) | 17497..18012 | - | 516 | WP_128570131.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31110 (KUU79_31095) | 18022..18399 | - | 378 | WP_128652626.1 | helix-turn-helix domain-containing protein | - |
KUU79_RS31115 (KUU79_31100) | 18420..18707 | - | 288 | WP_196994201.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31120 (KUU79_31105) | 18720..18926 | - | 207 | WP_196994202.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31125 (KUU79_31110) | 18946..19293 | - | 348 | WP_079263052.1 | helix-turn-helix transcriptional regulator | - |
KUU79_RS31130 (KUU79_31115) | 19308..19532 | - | 225 | WP_019727142.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31135 (KUU79_31120) | 20174..20485 | + | 312 | WP_126620957.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31140 (KUU79_31125) | 20543..20743 | - | 201 | WP_023123722.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31145 (KUU79_31130) | 20757..21377 | - | 621 | WP_196994203.1 | Tn3 family transposase TnpR_TnEc1 | Transposase |
KUU79_RS31150 (KUU79_31135) | 21685..21831 | - | 147 | WP_203327834.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31155 (KUU79_31140) | 21893..22039 | - | 147 | WP_203327834.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31160 (KUU79_31145) | 22101..22247 | - | 147 | WP_222821527.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31165 (KUU79_31150) | 22433..22708 | - | 276 | WP_031655097.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31170 (KUU79_31155) | 22708..22989 | - | 282 | WP_023123759.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31175 (KUU79_31160) | 24158..25978 | - | 1821 | WP_222821528.1 | type IA DNA topoisomerase | - |
KUU79_RS31180 (KUU79_31165) | 25987..26595 | - | 609 | WP_078458668.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31185 (KUU79_31170) | 26595..27026 | - | 432 | WP_196994205.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31190 (KUU79_31175) | 27037..28059 | - | 1023 | WP_196994206.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31195 (KUU79_31180) | 28056..28865 | - | 810 | WP_023123756.1 | ParA family protein | - |
KUU79_RS31200 (KUU79_31185) | 28868..30988 | - | 2121 | WP_128570136.1 | TraM recognition domain-containing protein | - |
KUU79_RS31205 (KUU79_31190) | 32791..33549 | + | 759 | WP_126620954.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31210 (KUU79_31195) | 33546..34583 | + | 1038 | WP_044069758.1 | Putative conjugal transfer protein | VF |
KUU79_RS31220 (KUU79_31205) | 35250..35396 | - | 147 | WP_196994186.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31225 (KUU79_31210) | 35683..36252 | - | 570 | WP_023123752.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31230 (KUU79_31215) | 36709..36900 | - | 192 | WP_124176250.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31235 (KUU79_31220) | 37160..37483 | + | 324 | WP_175454325.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31240 (KUU79_31225) | 37455..37865 | + | 411 | WP_023123751.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31245 (KUU79_31230) | 37870..38205 | + | 336 | WP_019727098.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31250 (KUU79_31235) | 38208..40760 | + | 2553 | WP_058350743.1 | VirB4 family type IV secretion system protein | - |
KUU79_RS31255 (KUU79_31240) | 40779..41630 | + | 852 | WP_023123749.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31260 (KUU79_31245) | 41641..42171 | + | 531 | WP_126620960.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31265 (KUU79_31250) | 42173..43348 | + | 1176 | WP_058350742.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31270 (KUU79_31255) | 43361..44149 | + | 789 | WP_222821525.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31275 (KUU79_31260) | 44146..44991 | + | 846 | WP_031757119.1 | TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein | - |
KUU79_RS31280 (KUU79_31265) | 44997..46400 | + | 1404 | WP_203327840.1 | TrbI/VirB10 family protein | - |
KUU79_RS31285 (KUU79_31270) | 46378..46752 | + | 375 | WP_203327839.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31290 (KUU79_31275) | 46752..46949 | + | 198 | WP_033992705.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31295 (KUU79_31280) | 46960..47682 | + | 723 | WP_203327838.1 | lytic transglycosylase domain-containing protein | - |
KUU79_RS31300 (KUU79_31285) | 47679..48002 | + | 324 | WP_196994187.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31305 (KUU79_31290) | 47999..48403 | + | 405 | WP_196994188.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS31310 (KUU79_31295) | 48428..48772 | + | 345 | Protein_67 | single-stranded DNA-binding protein | - |
KUU79_RS31315 (KUU79_31300) | 48871..49461 | + | 591 | WP_152989013.1 | hypothetical protein | - |
KUU79_RS32375 | 51573..51746 | + | 174 | Protein_69 | Autotransporter adhesin UpaG | VF |
KUU79_RS32380 | 51990..52196 | + | 207 | WP_223699785.1 | Autotransporter adhesin UpaG | VF |
KUU79_RS31325 (KUU79_31310) | 52208..52834 | + | 627 | WP_019727114.1 | DUF6012 family protein | - |
Similar MGE(s)
Similar MGE(s) is defined as other TA-related MGE(s) with Mash distance < 0.01 to this MGE.
Detail | Organism | MGE type | Related TA | Genome accession | Coordinates | Mash distance |
---|