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| - | |
| RT0028 | |
| Rickettsia typhi str. Wilmington | |
| chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] | |
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| VirB6-like protein of the type IV secretion system | |
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| Protein ID: 51473242 |
| VirB [498] | |
| - | |
| RT0029 | |
| Rickettsia typhi str. Wilmington | |
| chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] | |
| 33268..35928 [-] | |
| VirB6-like protein of the type IV secretion system | |
| VirB6 | |
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| NA | |
| TrbL [PF04610], Evalue: 1.5e-20, Aligned region: 516..710 |
| Protein Sequence: 886 a.a. [Download] |
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| Protein ID: 51473243 |
| VirB [498] | |
| - | |
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| Rickettsia typhi str. Wilmington | |
| chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] | |
| 36090..39005 [-] | |
| VirB6-like protein of the type IV secretion system | |
| VirB6 | |
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| TrbL [PF04610], Evalue: 1.8e-31, Aligned region: 615..854 |
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| VirB [498] | |
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| chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] | |
| 39009..41033 [-] | |
| VirB6-like protein of the type IV secretion system | |
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| TrbL [PF04610], Evalue: 2e-14, Aligned region: 405..495 |
| Protein Sequence: 674 a.a. [Download] |
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| >gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c41033-39009 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGAAAACTCTTAAAGCTTTAAAGATATTTATTATAGTTTATATATCGTCTGTAAGCTTAGAAAGCTTTG CTGGATTTGGAGAATCATGCTCTAATTTACCGATTACTTCAGATGGGTATTTAGAAACATACACGGCATA TGGGTATATAATTCGTAGTATTGATATGAAAGATCCGAGAGGTAATTGTAACCCATATACGTCTAGTATA ACGTTTTGTTTTAAAAATGTAGAAGGTAGCACTAGTCCTTGTACCATATATACTTTAAATGAAGGTGATG CTAGGAAGATTAGTGATTTAAGTACTGATAATAATCCTAATCTTGGTGCAAATACTGTATTAAAGAATAT CGTTTTAACAGTTAAAAAATTTGGTAATGATCTATGTTTAGCTATGCCTACATCAAGGGGACCTATGCCA GTAGCATGTAAATCTTTGAATGCTACTCCTGCTCCCACTAATCCTAAGTATGAGAATTGTAATATAGGCA AAAGCTGTTATACAGGAGCAAATTATAGTCAATCATTAATTAATTTTTCTGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT AAGTGAAACCCTTAATAAAATATTTTTTACAGGAAATAGTTGTAGTTCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA ACTCATCTTGCCGCTTTTTCTACATTTCAAGGTTATTTAAAGAGAATTATAGGTGCGGCATTAATTCTTT ATACTATGTTTTTTGCCTTTAATATGGCTCTTAATAAGGAATATGCAACTACTGAAAAAATAACTCTTTT TATAATAAAATTCTTATTTGTTGTATATTTTTCGATCGGTCTTGAACCTTTAAATTTTAGTGGTGGTCAG ACAGTAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATATGGACTGCCTCTTTTGACTGGGGCAGCACCTGATTTTGCAG AAATGATCTTTAATGCGGCAGGTTCTAGAGGGTTATGTCAGTTTGATAATTCAAAGTATAAGGACGGTTA TAAATTTTATGGTTTATGGGATGCGATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGTTTGGATTTACTTTAT AATATTGATAAAAATGGAATTTTAGGGCATTCAGTCGGTAATGGTCCTGGCGGTAATAATAAACCTATAC CTAATTTTGATCCTGATAGCAAAAAAGATAGACCACACGATTTAAGTAAAGCAGGAGCACTGAGATTTTT TACTGTTATGTTTGGATTTTTGATGTCTGGACACATTATTATACTTGTGGCAGGTATAGCATTTTCTGTA ATATTTTTATCTATACTTTTGTATTTTATTACACATTATTTAGTTTGTATGATTACCATTTACGTTATGA CATATATTTCGCCTATATTCATTCCTATGGTTTTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGACGGGTGGGT AAAAGTATGTATTTCATGTGCATTACAACCTGCAGTAGTAGCAGGTTTTATAGCTCTATTAATAACTATG TATGATTCTGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCTTAAGATATGATTATGAAAAAGGTGATATTAGATTTA GTACTTTTGAGTTAAGGCTCCCTAGCATTGATGCAGATAAATGTCAAGAAAGCTTTGGGTATAAAATGTT AAAATATTATGCAGGTGAAGGTTGGGAAGAACATTTATTGATACTCTTTCCAATAAAATCAATTGTTCGA GATGTTGTATCTATTTTAGCAGAACTTTTGTGTGTATTAGTATTTTCGGTTATTTTTTATTACTTCTCTA AATCTATAGGACGCTTTGCTGCTGATTTAACTAATGGTCCTAATATGGATGCAGTAACGGCGAGTCCAAC TAAAATTGTTGATTTAGTAAAAAAAGGAGCAGCATTCCTGCAGGATGCTTCTTCAGTACATGCACAAGGT AAGTCACCTGTGGAAGATAAGCCAGATATTGGTAGTAAGCGTAAAGATGGAGTGCAACAAGGTGAAGATT CTGAAAACAGTTCTGGAGGAGAGTTAGCTGATTTAGCAAGCGGTTCTGGTGGAGGCAAATTATAG |
| Protein ID: 51473245 |
| VirB [498] | |
| - | |
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| Rickettsia typhi str. Wilmington | |
| chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] | |
| 41020..44427 [-] | |
| VirB6-like protein of the type IV secretion system | |
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| TrbL [PF04610], Evalue: 3.4e-11, Aligned region: 505..580 |
| Protein Sequence: 1135 a.a. [Download] |
| >gi|51473245|ref|YP_067002.1| VirB6-like protein of the type IV secretion system [Rickettsia typhi str. Wilmington] MALFPRGILIALVLSFVLNLGLVTKIHAKDTLDSIIDILSGLTCETQGVGDLMRTEFSHTCIVAPFFTFA VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCTRENRIDPKNPELHFALCSNAKLIVSRAKSVT ESALAIAKAVLTWSDPWDDIKQAWENKKKEYHIPYRGKPGDDGFAFDVGFPVIYWKVIQDRDRICVSTKG FTGDVPVGCKYMKEPFPKSIYNSFIDVEDKNFIKDSTNDTPSDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAIV MTSPLIECIRQMIARLLISKDVCSFDNVDQVVNLASRQDSALFQFQVGMHKIVTAFLTLYVMFFGFKLLL AGKVPPKSEYINFILKIIFVTYFSIGININPSNGSQYDRLDGMIQWVFPFLLNGISGLANWVMNAAPSGL CKFNNISYDKSVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENSYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLIIPAII SGNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFAYTRNYFDSWVKLMISFLL QPMVVVTFMITMFAVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKMQGGIKSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDSV ESCKNSLGYMLNNPINTAFNFAKDNISEIVNSKPGETTTDEFLSKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKI KNIFLALITACFTLYLMYNFSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAALANAGTATKGIDQIAS RGGGGGARDLIGAKGLVSDNIASSGGAVGDNIASSGGAVGDNIAVSGAASTPTVTTTTASSSIANSMTKT IGDDVRSDIVTPHASTTAVPQHSSINTTIPTSVSPNIKSTSLKEIIRDNQENEKEIDNTTRAQEKIKSSS KVSGLIDYSFNLKEHDNPTGIKQIRENAEIRDKRVEVEKAWNELVASGGGRIRDQQSEETSEQRTNAEKK WNEFVDSGVVTEIREIDNSVNNKLADKLDKSEKSKIEENKNIENNIKVYNTNTLPQEKVNNTDKSSGLID YSFNLKEHDNPTGVKQIRENAEIRDKRVKVEKAWNELVASGGGRVKEQAGGKITERRANAEKVWDDLVKS GVVKEKKDNSSNENS |
| Nucleotide Sequence: 3408 bp [Download] |
| >gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c44427-41020 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGGCATTATTCCCTCGTGGTATACTGATAGCATTAGTACTGAGCTTTGTCCTAAATTTAGGTCTAGTGA CTAAAATTCATGCTAAAGATACTCTTGATAGCATTATAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACACA AGGTGTAGGTGATTTAATGCGTACTGAATTTTCACATACATGTATTGTCGCTCCGTTTTTTACTTTTGCG GTAATGAATCTTGTATCTCCCGTTTTATACATGAATACATTTTTAAAGCTTAAAATAAATGACAGTGATT TATTTAACGATAGTAATTTTGGGAATTTTCCCGGAGGTCAATGTACTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA AAATCCAGAATTACATTTTGCTCTATGTAGTAATGCTAAATTAATTGTATCGCGTGCAAAATCAGTTACA GAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTCTTAACATGGAGTGATCCTTGGGATGATATAAAGCAAGCGT GGGAAAATAAAAAAAAGGAATATCATATTCCATATAGAGGTAAGCCTGGTGATGACGGTTTTGCATTTGA TGTAGGCTTCCCTGTAATATATTGGAAAGTTATTCAAGATAGAGATAGAATATGTGTCTCAACAAAAGGG TTTACAGGAGATGTGCCAGTCGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCAAAATCCATATATAATAGTT TTATTGATGTAGAAGATAAGAATTTTATTAAAGATTCAACAAATGACACACCTAGCGATCCTTTAGCTTT AGTTTCCTGTAGTGCTGCAGGAGATGGGTGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAATAGTC ATGACTTCTCCTCTTATAGAATGTATAAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGATGTTTGTA GTTTTGATAATGTAGATCAAGTTGTGAATTTGGCATCAAGACAAGATAGTGCATTATTTCAGTTCCAAGT AGGCATGCATAAAATAGTTACGGCTTTTTTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGTTTTAAGTTATTACTT GCAGGTAAAGTGCCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATAATATTTGTAACTTATTTTT CAATAGGAATTAATATAAATCCTTCTAATGGTTCTCAGTATGATCGGTTAGATGGAATGATTCAGTGGGT GTTTCCTTTCTTACTTAACGGTATAAGCGGTTTAGCAAATTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCTGGTTTA TGTAAATTTAATAATATTTCTTATGATAAAAGTGTTTCATATATTGCATTATGGGATGCATTAGATTGTA GAGTTGCTCATTATTTAGGACTTGATATATTATCTACTTTACTTGTAGAAAATTCGTATCGAAGCCATGA TTTTTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCCCCACCATATATTTATTTAATAATTCCAGCAATAATC TCTGGTAATATGATGTTGGTATCACTTGCACTTTCTTACCCGTTACTGGTGATTTCTGTCGCTGCATTTA TGGTTAATGCAACAATTATGTGTATGATATCTATAGTCATACTCGGTATTCTAGCTCCTCTTTTCGTGCC TATGTTCTTATTTGCGTATACACGAAATTATTTTGATAGCTGGGTTAAGCTGATGATTTCATTCTTGCTA CAGCCTATGGTAGTAGTCACGTTTATGATTACGATGTTTGCAGTATATGATTATGGCTTTTATGGTAAAT GTCAATATAAGAGCAAGTTAATTCATAATAGCATAGAAGATAAAATGCAAGGTGGTATAAAATCTAAGAG AGATGTTTTAATATTTTATATTAATAATGATTGGGATGACACATCACAATATCCTGATAAAGATTCAGTA GAGAGTTGTAAAAATAGTTTAGGGTATATGTTAAATAACCCTATTAATACAGCATTTAACTTTGCAAAAG ATAATATCAGTGAAATAGTTAATAGTAAACCTGGTGAGACCACTACTGATGAATTTCTTTCTAAATTTCA GTTTTTATCAGGAGTTGTTTTGGGTCCTGGTATGTTTTTTATGTCGCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATT AAAAATATTTTTCTTGCATTAATTACTGCATGTTTTACATTGTATTTAATGTATAATTTTAGTAGTCAAC TAGCTGAATTTGCTGCAGATATGACAGAAGGAGTTGCGCTTAATAATGTTGCTATCAAGCCACAAGCAAT ATTTAAGGCAGCTATGGCAGCGCTTGCTAATGCTGGTACTGCAACTAAGGGTATAGATCAGATAGCAAGC CGTGGAGGAGGTGGAGGTGCACGTGATTTAATTGGAGCTAAAGGATTGGTAAGTGATAATATAGCTTCAA GTGGAGGTGCTGTCGGTGATAATATAGCTTCAAGTGGAGGTGCTGTCGGTGATAATATTGCTGTGAGTGG AGCTGCGTCAACACCTACAGTAACAACAACTACAGCTTCGTCTTCAATAGCAAATTCTATGACAAAAACT ATAGGTGATGATGTAAGATCAGATATTGTCACTCCTCATGCTTCTACAACAGCTGTTCCACAGCATTCTA GCATTAATACTACTATTCCTACATCTGTATCACCTAATATTAAATCTACAAGTCTTAAGGAAATTATTAG AGATAATCAAGAAAATGAAAAAGAGATCGATAATACTACGCGTGCACAAGAAAAAATTAAAAGTTCAAGT AAAGTTTCAGGACTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGATAATCCAACAGGAATAAAACAGA TAAGGGAAAATGCAGAGATTCGTGATAAACGTGTAGAAGTAGAGAAAGCATGGAACGAATTAGTGGCAAG TGGTGGAGGCAGAATAAGAGATCAACAAAGTGAAGAAACATCGGAGCAACGTACTAATGCAGAAAAGAAA TGGAATGAATTTGTTGATAGCGGTGTAGTAACTGAAATAAGAGAAATTGATAATAGTGTCAATAATAAAT TAGCTGATAAACTTGATAAATCAGAAAAATCAAAGATAGAAGAAAATAAAAATATAGAAAATAACATTAA AGTCTATAATACTAATACGTTGCCACAAGAAAAAGTCAATAATACAGATAAAAGTTCAGGACTAATTGAT TATAGTTTTAACTTAAAAGAACATGATAATCCAACAGGAGTAAAACAGATAAGGGAAAATGCAGAAATTC GTGATAAACGTGTAAAAGTAGAAAAAGCATGGAATGAACTAGTCGCAAGTGGAGGTGGAAGAGTAAAAGA ACAAGCAGGAGGAAAAATAACAGAACGACGTGCAAATGCAGAAAAGGTATGGGATGATTTAGTTAAAAGT GGTGTAGTAAAAGAAAAAAAAGATAATAGTTCTAATGAAAACTCTTAA |