Protein ID: 51209555 |
T4SS name [ID] | VirB [423] |
Gene symbol | - |
Locus tag | pTet_p42 |
Strain | Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet (NC_006135) |
Replicon | plasmid pTet [GenBank: NC_006135] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 36169..37980 [+] |
Product | cmgD4 |
Component type | VirD4 |
UniProt ID | Q69B94, A1WZY0 |
KEGG ID | cjj:CJJ81176_pTet0040 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | T4SS-DNA_transf [PF02534], Evalue: 7.8e-105, Aligned region: 93..565 TraG-D_C [PF12696], Evalue: 3.9e-26, Aligned region: 406..528 TrwB_AAD_bind [PF10412], Evalue: 2.3e-17, Aligned region: 345..542 |
Protein Sequence: 603 a.a. [Download] |
>gi|51209555|ref|YP_063487.1| cmgD4 [Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176] MQNNKSIQMIFLAIASFILTYLITPIVFFFLNKVKIMKAIEIYNINFTLQAISNGYPKIWLSLGITFGIC FVVFSVLVLSLKAKKSQFGEARFANFNEIKKMNLFSDNGIIIGKYKGKILRFSGQQFVALGAPTRSGKGV GIVIPNLLEWRESAVVQDIKQECFDYTSKYRKEILGQEVYLFNPFSRQTHRYNPLTYIDMSDKEHCDSQL MDLGNILYPQDGDSTSKFFNGLAQNLFIGLCYLWRDLQLTDYGKEFQSAFDINVGEFNFYNILQLSKGFS LKNEGKTLKGFDDTYNFLSYCEVLDEATIRRLETYFNINSDATKSGVMSSFNAPLVPFESETLRLSTETS DFDLRDLRKKKMTIYIGITPDQLANAQFILNIFWSQLILLNTKELPQSNKDLKYTCLMVMDEFTAPGRIP IYQSAISFMAGYWLRSLMIYQSNSQLETQPPLGYGKEGAKTLLTNHACQIFYAPREQEDAEAISRILGNT TFKTKSRSINTGNNGGGSHSISEASRALMLPQELREMPFENELITIDSGKPILCNKAFYYSDSYFMDKFK AVSKSLSTIRKIPSRKQLEDAILKGECKVKIQIIGENNDKKIA |
Nucleotide Sequence: 1812 bp [Download] |
>gi|51209513|ref|NC_006135.1|:36169-37980 Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet, complete sequence ATGCAAAATAATAAAAGCATTCAAATGATTTTTCTTGCTATAGCGAGTTTTATTCTCACTTACTTAATAA CGCCCATTGTTTTTTTCTTTTTAAATAAAGTAAAAATAATGAAAGCGATTGAAATTTATAACATAAATTT TACGCTACAAGCAATCTCTAATGGTTATCCAAAAATATGGCTTTCTTTAGGTATTACTTTTGGCATTTGT TTTGTTGTTTTTTCTGTTTTGGTGTTATCTTTAAAAGCCAAAAAATCTCAATTTGGCGAAGCTAGATTTG CAAATTTTAATGAAATTAAAAAAATGAATTTATTTTCAGATAATGGAATAATTATCGGAAAATACAAGGG AAAGATTTTAAGATTTAGCGGTCAGCAATTTGTAGCCTTAGGAGCACCCACAAGAAGTGGTAAAGGCGTA GGTATAGTAATACCAAACTTGTTAGAGTGGCGAGAAAGTGCTGTTGTTCAAGATATTAAACAAGAATGTT TTGACTACACAAGCAAATATAGAAAAGAGATTTTAGGACAAGAAGTTTATTTATTCAATCCATTTTCAAG ACAGACACATCGCTATAATCCTTTAACTTATATTGATATGAGTGATAAAGAGCATTGCGATAGTCAATTA ATGGATTTAGGTAACATACTCTACCCACAAGATGGGGATTCTACCTCAAAATTTTTCAATGGCTTAGCAC AAAACTTATTTATTGGGCTTTGTTATTTATGGCGTGATTTACAATTAACCGATTATGGAAAAGAATTTCA AAGTGCGTTTGATATTAATGTAGGAGAATTTAACTTTTACAATATTTTGCAACTCTCAAAAGGTTTCTCA CTTAAAAATGAAGGAAAAACTTTAAAAGGATTTGATGATACATACAATTTCTTATCTTATTGTGAAGTTT TAGATGAAGCAACCATAAGGCGTTTAGAAACTTATTTTAATATTAACTCAGATGCTACTAAATCAGGTGT AATGAGCTCTTTTAATGCTCCGCTTGTGCCATTTGAAAGTGAAACATTAAGATTAAGCACAGAAACAAGC GATTTTGATTTGCGAGATTTGCGTAAAAAGAAAATGACAATTTATATAGGAATTACGCCTGATCAATTAG CAAATGCACAATTTATTTTAAATATTTTTTGGTCGCAACTTATTTTATTAAACACCAAAGAATTGCCACA AAGCAATAAAGATTTAAAATATACTTGTTTAATGGTTATGGATGAATTTACTGCACCTGGTAGAATTCCT ATCTATCAATCAGCAATCAGTTTTATGGCTGGTTATTGGTTAAGATCTTTGATGATTTATCAATCAAATT CACAACTTGAAACACAACCACCTTTGGGCTATGGAAAAGAAGGAGCTAAAACACTCTTAACAAATCATGC TTGTCAGATTTTCTATGCGCCAAGAGAGCAAGAAGACGCAGAAGCTATCTCTAGGATTTTAGGAAATACT ACTTTTAAAACAAAATCAAGAAGTATTAATACAGGCAATAATGGAGGTGGATCACATAGTATTAGCGAAG CAAGTAGGGCTTTAATGTTGCCACAAGAACTTAGAGAAATGCCTTTTGAAAATGAACTAATTACTATTGA TAGTGGAAAACCTATTTTATGCAATAAAGCATTTTATTATTCAGATTCTTATTTTATGGATAAATTTAAA GCTGTTTCGAAAAGTTTATCAACAATAAGAAAAATCCCTTCACGCAAACAATTAGAAGATGCGATCTTAA AGGGAGAATGTAAAGTAAAAATTCAAATTATAGGAGAAAACAATGATAAAAAAATCGCTTGA |