| Protein ID: 32469831 |
 T4SS name [ID] | Cjp [603] |
| Gene symbol | virD4 |
| Locus tag | pVir_p06 |
| Strain | Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir (NC_005012) |
| Replicon | plasmid pVir [GenBank: NC_005012] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 4452..6338 [+] |
| Product | VirD4 |
| Component type | Cjp06 |
| UniProt ID | Q8GJE7 |
| KEGG ID | cjj:CJJ81176_pVir0007 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | T4SS-DNA_transf [PF02534], Evalue: 1.4e-72, Aligned region: 137..568 TrwB_AAD_bind [PF10412], Evalue: 8.7e-28, Aligned region: 315..516 TraG-D_C [PF12696], Evalue: 1.6e-25, Aligned region: 420..536 |
| Protein Sequence: 628 a.a. [Download] |
| >gi|32469831|ref|NP_863303.1| VirD4 [Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176] MNDKKITPAKWVLMFITSIILGIILYLLMVKIIFKPDLLVTHQVGLQIIHNLGNPALKLKAYVAVFALIL PFIVCLIWFFMPQMNLKENYGNARFAKEKDFEEMNICNDRGLILGCNIKKGIKGDEIEYIRAKMPLSALV VAPPGTGKTSGIILPNLFTVPNSTLALDIKGELYAKSAGYRKKYFNNEILLFEPFSDNNTLFFNPFDNSI VKDMNFIQMMKLADQIAGTIFVAEKGKEGDHWVTSAKTLFTFFALYNMQKHKHTSLGDLTQAPKKDYFNE LNEEFGKECLIEDEDTGEVSRDYNVDTFKVFLKQVANDENLDEIVRNQARAYQTAAEQEFASIKSTYDTY MKVFTNPQVANATSKMNFRFEDLREKRITMYVVIQTEDMDILAPLVRIFIESLFKKLMSGQENSNPDKFI YCLLDEFVRFGKMPFLLEAPALCRSYGLIPVFVTQSYEQIRKYYGEDDLGIIRANAGYQTIFRMNTEKDA KEISDLIGDFTREKTSSSKGTFDFFKSNNTVSKEGYKLITSQDIKNQSSEDILILVTGFLSRPIKAKVPY WFKNPKLKGADKISLEDNNTNTEGESKNDEINNDDSQNVNQEQNFTQENSSSKQIFELEELGIKVKKE |
| Nucleotide Sequence: 1887 bp [Download] |
| >gi|32469825|ref|NC_005012.1|:4452-6338 Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir, complete sequence ATGAATGATAAGAAAATAACCCCTGCAAAATGGGTATTAATGTTTATAACTAGCATTATTTTAGGAATAA TTCTTTATTTATTAATGGTAAAAATTATTTTCAAACCTGATTTATTAGTAACACATCAAGTTGGGTTACA AATAATTCATAATTTAGGAAACCCTGCATTAAAACTTAAAGCTTATGTAGCAGTTTTTGCTCTCATTTTG CCTTTTATAGTCTGTTTGATTTGGTTTTTTATGCCACAAATGAATTTAAAAGAAAATTACGGAAATGCAA GATTTGCTAAAGAAAAAGATTTTGAAGAAATGAATATTTGCAATGATAGGGGTTTAATTTTAGGTTGTAA TATTAAAAAAGGTATAAAAGGCGATGAAATAGAATACATCAGAGCTAAAATGCCCCTAAGTGCGTTGGTG GTTGCACCACCAGGCACAGGTAAGACTTCAGGTATCATTTTACCTAATTTATTTACAGTTCCTAATTCTA CTTTAGCACTTGATATTAAAGGCGAACTTTATGCAAAAAGTGCAGGTTATAGAAAAAAATATTTTAATAA TGAAATTTTATTATTTGAACCTTTTTCAGATAATAATACTTTATTTTTCAACCCTTTTGATAATTCTATA GTTAAAGATATGAATTTTATCCAAATGATGAAATTAGCAGATCAAATCGCAGGAACTATATTTGTAGCTG AAAAAGGGAAAGAAGGCGATCATTGGGTTACAAGTGCGAAAACTCTTTTCACTTTTTTTGCATTATACAA TATGCAAAAACACAAACATACGAGTTTAGGAGATTTAACTCAAGCTCCAAAAAAAGATTATTTTAATGAG TTAAATGAAGAATTCGGAAAAGAGTGTTTAATTGAAGATGAAGACACAGGAGAAGTTTCAAGAGATTATA ATGTAGATACTTTCAAAGTATTTTTAAAACAAGTGGCTAATGATGAAAATCTTGATGAGATCGTTAGAAA TCAAGCAAGGGCTTATCAAACGGCTGCCGAGCAAGAATTTGCAAGTATTAAATCAACTTATGATACTTAT ATGAAAGTTTTCACTAATCCACAAGTGGCTAATGCAACTTCAAAAATGAATTTTAGATTTGAAGATTTAA GAGAAAAAAGAATTACTATGTATGTAGTAATACAAACCGAAGATATGGATATATTAGCTCCTTTGGTGCG TATTTTTATCGAAAGTTTATTTAAAAAACTAATGAGCGGACAAGAAAATTCTAATCCTGACAAATTCATT TATTGCTTATTAGATGAATTTGTGAGATTTGGAAAAATGCCTTTTTTACTTGAAGCACCTGCATTATGTA GATCTTATGGACTTATTCCTGTATTTGTTACTCAATCATACGAGCAAATTAGAAAATATTATGGCGAAGA TGATTTAGGAATTATTAGAGCAAATGCAGGTTATCAAACTATTTTTAGAATGAATACAGAAAAAGACGCT AAAGAAATTAGCGATCTAATCGGCGATTTTACCAGAGAAAAAACATCATCATCAAAAGGAACTTTTGATT TCTTTAAAAGTAATAACACTGTATCCAAAGAAGGTTATAAATTGATAACTTCACAAGATATTAAAAATCA ATCCAGTGAAGATATTTTGATTTTAGTAACAGGATTTTTATCAAGACCTATTAAAGCTAAAGTGCCTTAT TGGTTTAAAAATCCAAAACTTAAAGGAGCGGATAAGATTTCTTTAGAAGATAATAATACTAATACGGAAG GAGAAAGCAAAAATGATGAGATTAATAATGATGATAGCCAAAATGTTAATCAAGAACAAAACTTTACTCA AGAAAATTCAAGCTCTAAACAAATTTTCGAACTTGAAGAACTAGGAATAAAGGTAAAAAAAGAATAA |