| Protein ID: 189184311 |
 T4SS name [ID] | VirB [507] |
| Gene symbol | virB6 |
| Locus tag | OTT_1404 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 1437129..1439345 [+] |
| Product | type IV secretion system protein VirB6 |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | B3CU15 |
| KEGG ID | ott:OTT_1404 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 3.8e-20, Aligned region: 325..510 |
| Protein Sequence: 738 a.a. [Download] |
| >gi|189184311|ref|YP_001938096.1| type IV secretion system protein VirB6 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda] MIQHNFSEFNTRNLNIMNQQNTLFLKFIVSIILFCSVISYSIAECIDADDFGFPIIAISSRYDAKQLTGQ KDNQVAPWVDSKLLVNGKPLVIMVKHWNYHEYDNDISHLSAWSAWYGTNKNKHTLSNITKRFPECRFSNN KTFSDSYDDNDDVPVINPPCLFKHGIGLYALIAKPGVDPNANVHSQSYGISKKTINFHVGQNYLSSLNST ELDSGFLDTTPDGNIVKTGGYFHKYQDQEDEQYVGGRLYFKILDRFYDDNNGQYKIIIKSGVGDEKDSPE TFLINIVKEMLFGNKKNQNKNGVIQNLFINILKNPSYKIVVNLTLILFVAFSGLAFLIGNINMTAHELVL RTVKILVISVLLNSDTAWKFFYNYLFFIFVDGPQFIIKTINQATAIGPGSSSILGLMIAPHTLKKLFSIL FVDWGGFIYIICYLILLYYIFIISFKATVLYLNALILVGIGIIVGPVFLCFVLFQFTKPIFENWIKQLTI YALQPVILFAGIAFVGMFIRHEIYASLGFRVCEVPFPPIANTLIKIISGDSSKKQSLLNLWFPAQVLKKT LLFSQKCANIPVPEDHIVYLDQNAWKCSDGISGNSKQLITSTNSSKEKHCSAYECKANRYVELPFLDPNI NKDRSRIRNFFAGNFVQWDSLLLLAACVFLLSMFNDNAIALANYISSGGDRSSASEKSTTAIVSTVTPPS PTTFIPAAFSKIGQQRTKNSNSHSNSNSRSGINTGPKK |
| Nucleotide Sequence: 2217 bp [Download] |
| >gi|189182907|ref|NC_010793.1|:1437129-1439345 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome ATGATTCAACATAATTTCAGTGAATTTAATACTCGCAATTTGAACATAATGAATCAGCAAAATACATTAT TCTTAAAGTTTATTGTTAGTATTATACTATTCTGCTCTGTAATTAGTTATAGTATAGCTGAATGTATAGA TGCTGATGATTTTGGATTTCCTATAATTGCTATATCATCAAGATATGATGCTAAGCAGCTTACTGGACAA AAAGATAACCAAGTTGCACCTTGGGTCGATAGTAAACTTTTAGTTAATGGGAAGCCATTGGTTATCATGG TTAAACATTGGAATTATCATGAATACGATAATGATATCAGTCATCTTTCAGCTTGGTCAGCATGGTATGG AACTAATAAAAATAAACATACGCTTTCTAACATTACAAAAAGATTTCCAGAATGTAGGTTTAGCAATAAT AAAACTTTTTCTGATTCATATGATGATAATGATGATGTACCAGTTATTAATCCTCCATGTTTATTCAAAC ATGGTATTGGCCTTTATGCTTTGATTGCAAAGCCTGGTGTTGATCCAAACGCTAATGTTCATTCTCAATC TTATGGCATTTCAAAAAAAACTATTAATTTTCATGTAGGCCAAAACTACCTTAGCTCTCTTAATTCTACT GAGTTAGACTCAGGTTTTTTGGATACTACACCTGATGGAAATATAGTCAAAACTGGAGGATATTTTCACA AATATCAAGACCAGGAGGATGAACAGTATGTTGGAGGAAGATTGTATTTCAAAATCCTAGATAGATTTTA CGATGACAATAATGGACAATATAAGATCATTATTAAGTCTGGTGTTGGAGATGAAAAAGATTCACCAGAA ACATTTCTTATAAATATAGTTAAAGAAATGCTATTTGGTAACAAAAAAAATCAAAATAAAAATGGAGTAA TTCAAAACCTCTTTATAAACATTCTCAAAAATCCAAGCTATAAGATAGTTGTTAATCTTACTTTGATATT ATTCGTTGCATTTAGTGGGCTAGCTTTCTTAATAGGTAATATTAATATGACTGCTCATGAGTTAGTACTT AGAACAGTAAAAATTTTGGTAATATCTGTTTTGCTGAATTCTGATACAGCTTGGAAATTTTTCTATAATT ATCTATTCTTTATTTTTGTAGATGGCCCTCAATTTATTATTAAGACTATCAACCAAGCAACAGCAATAGG ACCAGGATCATCAAGCATATTAGGGCTGATGATTGCTCCTCATACTTTAAAAAAGTTATTTTCAATACTA TTTGTAGATTGGGGCGGGTTTATTTACATTATTTGTTACTTAATATTATTATACTATATCTTCATAATTA GCTTTAAAGCAACAGTACTATATCTTAATGCTTTAATTTTGGTTGGTATAGGAATAATTGTAGGTCCTGT TTTCCTCTGTTTTGTTTTATTTCAGTTTACTAAACCAATCTTTGAAAATTGGATTAAGCAACTAACTATA TATGCTCTTCAGCCAGTGATATTATTTGCTGGCATTGCGTTTGTCGGAATGTTTATCAGACATGAAATAT ATGCTTCTCTTGGTTTCAGAGTTTGTGAAGTGCCTTTTCCTCCAATTGCTAACACATTAATAAAAATTAT TAGCGGTGATAGCTCTAAAAAACAATCGCTCTTAAATTTGTGGTTTCCAGCTCAGGTACTTAAGAAAACA TTATTATTCAGTCAAAAATGCGCTAATATACCTGTGCCTGAGGATCATATTGTATATCTGGATCAAAACG CATGGAAATGCAGTGATGGAATATCTGGTAATAGCAAGCAATTAATTACTTCAACAAATTCATCAAAGGA AAAGCACTGTTCTGCATATGAATGCAAGGCAAACCGTTACGTAGAACTGCCATTTTTAGATCCTAATATC AATAAAGATAGATCTAGAATAAGAAACTTTTTTGCTGGTAACTTTGTGCAGTGGGATAGTTTATTACTAC TTGCAGCCTGTGTATTTTTACTTAGTATGTTTAATGATAATGCAATAGCACTTGCAAATTATATTAGCAG CGGAGGAGATAGATCATCAGCTAGCGAAAAATCAACTACAGCAATAGTATCAACAGTAACTCCGCCATCA CCAACAACATTCATACCAGCTGCATTTAGTAAAATTGGTCAACAACGTACCAAAAATAGTAACTCACATT CTAATTCTAATAGTAGATCTGGAATTAATACAGGCCCTAAAAAATAA |