Protein ID: 189183680 |
T4SS name [ID] | VirB [507] |
Gene symbol | virB6 |
Locus tag | OTT_0773 |
Strain | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 808397..811669 [+] |
Product | type IV secretion system protein VirB6 |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | B3CRX4 |
KEGG ID | ott:OTT_0773 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.3e-22, Aligned region: 665..861 |
Protein Sequence: 1090 a.a. [Download] |
>gi|189183680|ref|YP_001937465.1| type IV secretion system protein VirB6 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda] MQSKIIKFAIIAVCIAVVSFILMLFGALRSGDDCWYRYNTDGQDLDVIRLTQNVRASGQYDSFRLGGIVD PGKPCGLWVKSDFYVSVPEENGQLKPVNIDFLIDGTVSLCQAYLPKNALTCKLKYNDGNECNISDINKFF NGEKSDCIEDCEDNTDDSGNLIPIPRILDPGDGLPVILKANVGEWRNLAQVSAGDEIEVKIGRNQNFSHG GVENTEIGYAYSRPEFDWFNDTSLDWQKGTNDTFGIIKRTKQVRADCQEGKKNYSPLCGRYSPWGEGDNY IKQCDECKGCTCEDCGMKPKCSGSKPVCPAPECEMAGAHGWASKAFWVFNTDLGKDKCFYKGTVRDFWGG KACPEKYLLDCKRGVLADGLPEEYRDDGTRTVPATLTEQDRNDIKSLGRIACSNRLDEQLVKNRQKVYSW RSATYATDLKYRFSSAQNKDSVLGNKCKSDFPSGKDLATGCYGITKVNQDLIIYKDQISETLFSGPRYLQ YMIRPDINIESMKNSVGGYVLYLKQNSCVRKSGVAFDDSKFHGRGKILYAIVPAGVDVNKLKSHELDVYT TGSLDVKVEDLVGKAKISSSQSGYIWFKILNDEKDYRASVGEYKITMSTIVPRGKFISKVLNPIIRIFEN KIANASKTMFKNMTCYQQNDKSRCTNFFNYIRAMLTLYIMGCGFAFMLGAVNFTAKELVIRIVKVIIVSG LINEGTFNFFNAYLYDLIMNFSKQLMVNVSGYEYDQNIGVFLFLDELMSKIFFNKTFYVQLLSLLSMGLM GVVYYIIIFVPIILIIISLLKTIMVYLVSTTAVALLVGLAPLFLSFMLFNRTWYLFDNWVRMLFRYLIEP VILMAGITILTQLFIVYLDFVLGYSVCWKCAIVFKLPKIDALGGILGSYGGQELFCINWFGPWGYDNRAD NNIGLAMNYIIALVIIAYCMYSYIDFSSLMVDILTAGGAGGIAPSAGHIAPQVWDTAVQWTEKAVMKVAS IGKKGSFAVRKGIGKGISHAKSKYSSSQTEKSKDKDNVVNRRTNLENKSLNDKGGSAIKRNSNVENVKPN QNTSLRVNNQEIDLNSQKPSHNESSVRRHDLNKKNFENND |
Nucleotide Sequence: 3273 bp [Download] |
>gi|189182907|ref|NC_010793.1|:808397-811669 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome ATGCAATCTAAAATTATCAAATTTGCAATTATAGCAGTTTGTATAGCTGTAGTAAGTTTTATCTTAATGC TTTTTGGCGCATTAAGATCAGGCGATGATTGTTGGTACCGTTATAATACAGATGGGCAAGATTTAGATGT TATTCGATTAACTCAGAATGTTAGAGCTTCTGGGCAGTATGATAGTTTTCGACTTGGAGGAATAGTTGAT CCTGGTAAGCCATGTGGTCTTTGGGTAAAATCAGATTTTTATGTTTCAGTACCTGAAGAAAATGGGCAAT TAAAACCTGTAAATATTGATTTTCTTATTGATGGAACAGTGAGCCTTTGTCAGGCATACTTACCAAAAAA TGCTTTAACTTGTAAGCTGAAATATAATGATGGTAACGAATGTAATATTAGTGATATTAATAAATTTTTT AATGGAGAGAAGAGTGATTGTATAGAAGATTGTGAAGATAATACTGATGATAGTGGTAATCTTATTCCTA TTCCTAGAATTTTAGATCCAGGCGATGGTTTACCAGTAATATTAAAGGCGAATGTTGGAGAGTGGCGTAA TCTTGCTCAGGTATCTGCTGGTGATGAAATAGAAGTCAAAATTGGTAGAAATCAAAATTTTAGTCACGGA GGGGTTGAGAATACCGAAATAGGCTATGCTTATAGTAGACCAGAATTTGATTGGTTTAACGATACAAGTC TAGATTGGCAAAAGGGTACTAATGATACTTTTGGTATAATTAAAAGGACTAAGCAGGTTAGAGCTGATTG TCAAGAAGGAAAAAAGAATTATAGTCCACTATGTGGAAGGTATTCCCCATGGGGAGAGGGTGATAATTAT ATCAAACAGTGTGATGAATGTAAAGGATGTACTTGTGAAGATTGTGGTATGAAACCAAAATGTTCAGGAT CAAAGCCGGTATGCCCAGCACCTGAATGTGAAATGGCTGGTGCGCATGGATGGGCTTCTAAAGCGTTTTG GGTATTTAACACTGATCTTGGTAAAGACAAATGTTTTTATAAAGGTACTGTTAGAGATTTTTGGGGAGGA AAGGCTTGTCCAGAGAAATATTTGCTAGACTGCAAGCGCGGTGTTTTAGCTGATGGATTGCCTGAAGAAT ATCGTGATGATGGTACTAGGACAGTACCTGCAACTTTAACTGAGCAAGATAGAAATGATATTAAGAGTTT AGGTAGAATAGCTTGCTCTAATCGACTAGATGAACAATTAGTAAAAAATAGACAAAAAGTTTATTCTTGG AGATCTGCTACTTATGCTACTGATTTAAAGTATCGCTTTAGTAGTGCACAGAACAAAGATTCTGTATTAG GCAATAAATGTAAAAGTGATTTTCCTTCAGGTAAGGATTTAGCTACTGGTTGTTATGGAATAACTAAAGT AAATCAGGATTTAATAATATATAAAGATCAGATTTCAGAAACGTTATTTAGTGGACCAAGATACTTACAA TATATGATTCGACCTGATATTAATATTGAAAGTATGAAAAATAGTGTTGGAGGATATGTATTATATTTAA AACAAAATTCATGTGTTAGAAAGTCTGGAGTCGCTTTTGATGATAGTAAATTTCATGGTCGAGGAAAAAT ATTATACGCGATAGTACCTGCTGGAGTAGATGTAAATAAACTAAAATCACATGAGCTTGATGTATATACT ACAGGATCACTTGATGTAAAGGTTGAGGATTTAGTAGGTAAAGCTAAAATCAGTTCTTCTCAGTCAGGGT ACATTTGGTTTAAAATTCTAAATGATGAAAAAGATTATAGAGCTAGTGTTGGTGAATATAAAATTACTAT GAGTACCATAGTACCTAGAGGAAAGTTTATAAGTAAAGTGTTAAATCCAATAATAAGGATATTTGAGAAT AAAATTGCTAATGCTTCAAAGACAATGTTTAAAAATATGACTTGTTATCAACAGAATGATAAGTCTAGAT GTACAAATTTCTTTAATTACATTAGAGCAATGTTAACTCTTTATATTATGGGTTGTGGATTTGCATTTAT GCTAGGAGCAGTTAATTTTACTGCTAAAGAATTAGTTATTAGAATTGTTAAGGTAATAATTGTTAGTGGC CTGATAAATGAAGGGACTTTTAATTTTTTTAATGCTTATCTATATGATTTAATTATGAATTTTAGCAAAC AGTTAATGGTTAATGTATCAGGGTATGAGTATGATCAAAATATAGGAGTGTTTCTATTTTTAGATGAATT GATGAGTAAAATATTTTTTAATAAAACATTTTATGTTCAGTTATTATCTCTTTTAAGCATGGGGCTAATG GGAGTAGTTTATTATATTATAATATTTGTTCCTATAATTTTGATAATTATATCTTTGTTAAAGACTATTA TGGTATATTTGGTATCAACTACTGCTGTTGCTTTATTGGTAGGACTTGCACCATTGTTTCTTTCTTTTAT GCTTTTTAATAGAACTTGGTATTTATTTGATAATTGGGTTAGAATGCTATTTCGGTATTTAATAGAGCCA GTTATATTAATGGCAGGAATAACAATTTTAACTCAGCTTTTTATTGTTTACTTAGATTTTGTGCTAGGAT ATAGCGTTTGCTGGAAATGTGCTATAGTATTTAAGCTTCCAAAAATAGATGCATTGGGAGGTATACTAGG TAGCTATGGTGGGCAAGAGTTATTTTGTATAAATTGGTTTGGTCCATGGGGGTATGATAATAGAGCTGAT AATAACATAGGATTAGCAATGAATTATATTATTGCTTTAGTAATTATTGCTTACTGTATGTATAGTTACA TTGACTTTTCAAGTTTAATGGTTGATATTCTTACAGCTGGAGGTGCTGGAGGGATTGCGCCTTCTGCAGG TCATATTGCACCTCAAGTTTGGGATACTGCAGTACAGTGGACTGAAAAGGCTGTTATGAAGGTGGCATCG ATAGGTAAAAAAGGTAGCTTTGCTGTACGGAAAGGAATAGGTAAGGGGATATCTCATGCGAAAAGTAAGT ATTCAAGTTCACAAACTGAAAAGTCTAAAGATAAAGATAATGTGGTTAATAGAAGAACCAATCTTGAAAA TAAAAGCCTAAATGACAAAGGAGGCTCTGCTATTAAAAGAAATAGCAATGTTGAGAATGTAAAGCCTAAC CAGAATACTTCCCTCAGGGTGAATAATCAAGAAATTGATTTGAATAGCCAAAAACCATCGCATAATGAAT CTTCTGTTAGAAGGCATGATTTGAATAAGAAAAATTTTGAGAATAATGACTAA |