| Protein ID: 189182909 |
 T4SS name [ID] | VirB [507] |
| Gene symbol | virB4 |
| Locus tag | OTT_0002 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 4977..7430 [-] |
| Product | type IV secretion system protein VirB4 |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | B3CQG9 |
| KEGG ID | ott:OTT_0002 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 1.8e-36, Aligned region: 189..388 |
| Protein Sequence: 817 a.a. [Download] |
| >gi|189182909|ref|YP_001936694.1| type IV secretion system protein VirB4 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda] MGFIHKFLHSRKIDAKQFDSNAQNFIPITCHYNDETLLTKNGELIQILQIKGINSEYTNKDLLGIRAAIR NAIKNHINNSNFAVWIHVVRRCDNIDDSTPYSQALPNFIHNIWSKKNYWQDKFVSTLYISIVHHGCNLNI RNLDSFLNSLSFKTLDSFYDKFIASALKNLSMAINNIITELQGYNPCKLSIKIDNNKVYSDLLNFYKKII QLNTGLIEVKDVDCAVQLATHKYSFGGDKIEVIHKQEKKFASILGIKEYQDIKDELVSKCLHAPVEFIAT EIFYFADQVKAINSYSQQSKVISASRDSELALFKGIEPIVNSDNTLPQFCHQQISIMIMADSIDLLESRV AYMSQRLVKQGIIHVREDINLAQTFWSQLPGNFNYIRRVSYNIIDNVAALAALHHYPVGMQHSLWGRSVT IFRTECGTPYFMNFHDESAKGHTCIIGGAQSGRATIANFLLSEASKYSPTILYLTNRNNAQVFIKGIEGT WHDGDLPFNPLSYLESSDDLLELFKIITGNYFNNLTDSEIECITELAIAVMDMPPESRSLIKIIKDFNFK AYSAGASVKKRIKLFISDDKCSKIFNQSSTLELQDNNVTAINLADYTDYQFNQSYTPQVGEKPEIYHNKL QTLHCLRSGIIFSLIKKFSLLASPEPKILVVDNMPDLIVEQVFMNLIKQITEQLSENNGIILSVVQVNQN DQFYYSDFWKKWLKFNNTKIILPTNIRNLPIAEICNLSTREAKKFNTISPNSRLFMVKQDNNYVIVELNL EGFPAIRKLLSAEEEDLNLFHKIMQKIGDDAPSAWLSDVYDQFQNSE |
| Nucleotide Sequence: 2454 bp [Download] |
| >gi|189182907|ref|NC_010793.1|:c7430-4977 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome ATGGGGTTTATACATAAATTTTTACATAGTAGAAAAATAGATGCAAAACAGTTTGATAGCAATGCTCAGA ACTTTATTCCTATAACTTGCCACTACAATGATGAAACTTTATTAACTAAAAATGGCGAATTAATTCAAAT ATTACAAATAAAAGGTATTAATTCTGAATATACTAATAAGGATTTATTGGGTATCAGAGCAGCAATACGT AATGCTATTAAAAATCATATTAATAATAGCAACTTTGCAGTTTGGATACATGTTGTAAGGCGCTGTGATA ATATTGATGACTCTACTCCTTACAGTCAAGCATTGCCAAATTTTATTCATAACATTTGGAGCAAAAAAAA CTACTGGCAAGATAAATTTGTTAGTACATTATATATCTCAATTGTGCATCATGGATGTAACTTAAATATT AGAAACTTAGATAGTTTTTTGAACTCTTTATCGTTTAAGACATTGGATAGTTTTTATGATAAGTTCATAG CATCTGCATTAAAAAATTTATCCATGGCTATAAATAATATAATAACTGAGCTGCAAGGTTATAATCCATG CAAGTTAAGTATTAAAATTGATAATAATAAAGTATATTCTGACCTTTTAAATTTTTATAAAAAAATAATA CAACTTAATACTGGGTTAATAGAAGTAAAAGATGTTGATTGTGCTGTACAGTTAGCCACTCATAAATATT CTTTTGGAGGAGACAAAATAGAGGTTATACATAAACAAGAAAAAAAGTTTGCATCTATTTTAGGTATCAA GGAATATCAAGATATTAAAGATGAATTAGTGAGTAAGTGCTTACATGCTCCAGTCGAATTTATTGCTACA GAAATTTTTTATTTTGCTGACCAAGTAAAAGCTATTAATAGTTACTCTCAACAAAGTAAAGTTATTAGTG CAAGTCGTGACAGTGAACTAGCTCTATTCAAAGGAATAGAGCCAATTGTGAATTCTGATAACACATTACC ACAGTTTTGCCATCAACAAATTAGCATAATGATTATGGCTGATAGCATTGATCTGCTTGAGAGTAGAGTA GCTTATATGTCGCAAAGATTAGTAAAACAAGGTATAATACATGTTCGAGAGGATATTAATCTAGCGCAAA CATTTTGGTCTCAGTTACCAGGTAATTTTAATTACATTAGACGTGTTTCTTATAATATTATTGATAATGT AGCTGCTTTAGCAGCACTACATCATTACCCTGTTGGCATGCAGCATAGTCTATGGGGTAGATCTGTCACT ATATTTCGAACAGAATGCGGTACTCCTTATTTCATGAATTTTCATGATGAGAGTGCAAAAGGGCATACTT GTATAATTGGTGGAGCTCAATCTGGTCGAGCTACTATCGCTAATTTTTTATTGTCTGAAGCATCAAAATA TTCTCCAACTATACTTTATTTAACTAATAGAAATAATGCTCAAGTTTTTATAAAAGGAATAGAAGGAACA TGGCACGATGGTGATTTACCATTTAATCCATTAAGCTACTTAGAAAGCTCTGATGACTTATTAGAACTAT TTAAGATAATAACAGGTAATTATTTTAATAATTTAACTGATAGTGAAATTGAATGCATTACAGAGTTAGC TATTGCAGTTATGGATATGCCACCTGAATCGCGTTCTTTGATTAAAATTATCAAAGATTTTAATTTTAAG GCTTATAGTGCTGGAGCTAGTGTAAAGAAGCGTATTAAGTTATTTATTAGTGATGATAAATGTAGTAAAA TTTTTAATCAATCTTCTACTTTAGAATTGCAAGATAATAATGTAACTGCTATAAACTTAGCTGATTATAC TGATTATCAATTTAATCAATCTTATACACCTCAAGTAGGAGAAAAGCCGGAAATTTATCATAACAAATTA CAAACTTTGCACTGTCTAAGGTCTGGAATTATATTTTCTTTAATAAAAAAATTCAGCTTACTAGCCTCTC CAGAGCCTAAAATACTAGTTGTTGATAATATGCCTGATTTAATAGTAGAGCAAGTGTTTATGAACTTAAT TAAACAAATCACTGAACAACTATCTGAAAATAATGGAATAATTCTTTCTGTTGTTCAAGTAAATCAGAAT GATCAATTTTATTATTCTGATTTCTGGAAGAAATGGTTAAAGTTTAATAATACTAAAATTATACTACCAA CTAATATAAGAAATTTACCTATTGCTGAAATCTGTAACCTAAGTACTAGAGAAGCTAAAAAATTTAATAC TATTTCACCAAATTCTAGATTATTTATGGTAAAACAAGATAATAATTATGTTATTGTAGAACTTAATTTG GAAGGATTTCCAGCAATTAGAAAGCTTCTATCAGCTGAAGAAGAAGATTTGAATCTTTTTCATAAAATTA TGCAAAAAATAGGCGATGATGCTCCTTCAGCTTGGTTAAGTGATGTTTATGATCAGTTTCAGAACAGTGA GTAA |
| Protein ID: 189183677 |
| T4SS name [ID] | VirB [507] |
| Gene symbol | virB4 |
| Locus tag | OTT_0770 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 799570..801987 [+] |
| Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | B3CRS9 |
| KEGG ID | ott:OTT_0770 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 2.4e-62, Aligned region: 195..398 AAA_10 [PF12846], Evalue: 1.4e-30, Aligned region: 451..727 |
| Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
| >gi|189183677|ref|YP_001937462.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda] MKFFKTKVAREYYSKREVHVAKFIPYAYHWNKSTIITKKNELIKVIKISGFAFETADDQDLDIRKRLRNL LFKGMASGSLNLYFHIIRRRKQLASAMDEGDVDPTVGMAKDFVTYVDNEWKKKYSDFQSFINDIYITILY KPDVEGGEILKYFYNKLLQKSDKNAWMQSMNEMYANLDEMVSRVVTTFSDYDAQILKVKNEPNGVFCEIL EFLATIVNCGSSMPVLLPRGSIDSYIPTHRLFFGDRSIEARGAGQRRYAGIVSIQEYGPKTSAGVLDSFL QLPFELIISQSFQFSSRTAAINKMQLQQNRMIQTEDKAVSQIAEISQALDMATSGEIGFGEHHLTVLCIA DSLKALENALSIASVEIANTGMQPVREKVNLEAAYWAQLPGNIEYAVRKSVINTLNLAGFASMHNYLPGK AKGNHWGDSVTVLDTSSGTPFYFNFHVRDVGHTLLIGPTGAGKTVLMNFLCAQAQKFYPRTFFFDKDRGA EIFIRALDGKYTVINPFQQCNFNPLQLPDTNENRNFLVEWIKTLVTSNGESISADDMHYITLAVEGNYKL NPSDRYLSNIVAFLGIGGPDTLAGRIAMWHGTGAKAGIFDNIHDNMDLQSGRVFGFEMGELLKDPVSLAP VLLYLFHRINLSLDGSPTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDASKSSISDT LIQQTATQIFLPNLKATDIYRTAFMLSEREFSIIKSTDPGSRYFLIKQGIGSVVAKLNLAGMNNIIGVLS GRVETVILLDQLRSEYGDDSRKWLPKFYKHLETAK |
| Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
| >gi|189182907|ref|NC_010793.1|:799570-801987 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome ATGAAATTTTTTAAGACTAAAGTAGCAAGGGAGTACTATTCTAAGAGAGAGGTTCATGTTGCTAAGTTTA TTCCATATGCTTATCATTGGAATAAATCTACTATTATTACAAAAAAAAATGAGCTAATTAAGGTTATTAA AATTAGCGGTTTTGCTTTTGAAACAGCAGATGATCAAGATTTAGACATTAGAAAAAGGCTTCGAAATCTT TTATTTAAAGGTATGGCTTCAGGTAGCCTAAATTTATATTTTCACATAATTAGACGTCGAAAGCAGCTAG CTTCAGCTATGGATGAAGGTGATGTTGATCCTACTGTAGGTATGGCAAAAGATTTTGTTACTTATGTTGA TAATGAGTGGAAAAAGAAATATTCTGATTTTCAGTCTTTTATAAATGATATTTATATCACTATTTTATAT AAACCTGATGTTGAAGGTGGGGAAATTTTAAAGTATTTTTACAATAAGTTATTGCAAAAGTCTGATAAAA ATGCATGGATGCAAAGTATGAATGAAATGTATGCTAACCTTGATGAGATGGTATCAAGAGTAGTGACTAC ATTTAGCGATTATGATGCACAAATATTAAAGGTTAAAAATGAACCTAATGGAGTTTTTTGTGAGATATTG GAATTTTTAGCTACTATAGTTAATTGCGGCAGTTCTATGCCTGTACTTTTACCTAGAGGATCAATAGATA GTTATATACCTACACATAGGTTATTTTTTGGAGATCGTTCAATTGAAGCTAGAGGGGCAGGGCAGCGTAG ATATGCTGGTATAGTTAGCATTCAAGAATATGGACCAAAAACTTCAGCTGGAGTATTAGATTCATTTTTG CAACTTCCTTTTGAGCTTATTATTAGCCAAAGTTTTCAGTTTTCTAGTCGTACAGCTGCAATTAATAAAA TGCAATTGCAACAAAATAGAATGATTCAAACTGAAGATAAAGCAGTATCCCAGATTGCTGAGATTTCTCA GGCATTAGATATGGCGACCAGTGGTGAAATTGGTTTTGGCGAACATCATTTAACAGTATTATGTATAGCT GATAGTTTGAAAGCCTTGGAAAACGCACTTTCTATTGCTTCAGTTGAAATTGCAAACACTGGTATGCAGC CAGTACGTGAAAAAGTGAATTTAGAAGCTGCTTATTGGGCGCAATTACCAGGGAATATAGAATATGCTGT AAGAAAATCAGTAATTAATACTTTAAATCTTGCAGGGTTTGCATCTATGCATAATTACTTGCCAGGAAAA GCTAAAGGAAATCATTGGGGAGATAGCGTTACAGTATTGGATACAAGCTCTGGTACTCCGTTTTACTTTA ACTTCCACGTACGTGATGTTGGACATACTTTATTAATTGGGCCTACTGGAGCTGGGAAAACAGTGTTAAT GAATTTTTTATGCGCTCAAGCTCAAAAATTTTATCCTCGAACTTTCTTTTTTGATAAAGATAGAGGTGCA GAGATTTTTATCAGAGCTCTAGATGGAAAGTATACTGTGATTAATCCGTTTCAACAATGTAATTTTAATC CTTTACAATTGCCTGATACTAATGAAAATCGTAATTTTTTAGTAGAATGGATAAAAACGTTAGTTACTTC AAACGGTGAATCTATTAGCGCCGACGATATGCATTATATTACGTTAGCTGTGGAAGGGAATTATAAGCTT AATCCATCTGATCGTTACTTAAGTAATATAGTAGCATTTTTAGGAATTGGAGGTCCTGATACTCTAGCTG GAAGGATTGCAATGTGGCATGGCACAGGTGCTAAAGCTGGAATATTTGATAATATTCATGATAATATGGA TTTGCAAAGTGGTAGAGTTTTTGGTTTTGAGATGGGGGAGTTATTAAAAGATCCTGTTAGCTTAGCTCCA GTATTATTATATTTGTTTCACCGTATCAATTTATCGTTGGATGGTTCACCAACTATGATAGTATTAGATG AGGCATGGGCTTTGATTGATAATCCTGTTTTTGCTCCTAAGATTAAAGATTGGTTGAAGGTATTGCGTAA GTTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACTCAGAGTGTAGAAGATGCTTCAAAGAGCTCAATTAGTGATACT CTGATTCAGCAAACTGCTACTCAGATTTTTTTACCAAATTTAAAAGCAACCGATATCTATAGAACTGCTT TTATGTTGAGTGAAAGGGAATTTTCTATTATTAAATCCACAGATCCTGGTTCACGGTATTTTCTAATAAA ACAAGGAATTGGTTCTGTAGTTGCTAAATTAAATTTAGCGGGCATGAATAATATTATAGGAGTGCTCTCA GGCCGAGTTGAAACTGTAATATTATTAGATCAGTTAAGAAGCGAATATGGAGATGATTCTAGAAAGTGGT TGCCTAAATTTTATAAGCACTTGGAAACAGCAAAATAA |