Protein ID: 189182909 |
T4SS name [ID] | VirB [507] |
Gene symbol | virB4 |
Locus tag | OTT_0002 |
Strain | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 4977..7430 [-] |
Product | type IV secretion system protein VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | B3CQG9 |
KEGG ID | ott:OTT_0002 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 1.8e-36, Aligned region: 189..388 |
Protein Sequence: 817 a.a. [Download] |
>gi|189182909|ref|YP_001936694.1| type IV secretion system protein VirB4 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda] MGFIHKFLHSRKIDAKQFDSNAQNFIPITCHYNDETLLTKNGELIQILQIKGINSEYTNKDLLGIRAAIR NAIKNHINNSNFAVWIHVVRRCDNIDDSTPYSQALPNFIHNIWSKKNYWQDKFVSTLYISIVHHGCNLNI RNLDSFLNSLSFKTLDSFYDKFIASALKNLSMAINNIITELQGYNPCKLSIKIDNNKVYSDLLNFYKKII QLNTGLIEVKDVDCAVQLATHKYSFGGDKIEVIHKQEKKFASILGIKEYQDIKDELVSKCLHAPVEFIAT EIFYFADQVKAINSYSQQSKVISASRDSELALFKGIEPIVNSDNTLPQFCHQQISIMIMADSIDLLESRV AYMSQRLVKQGIIHVREDINLAQTFWSQLPGNFNYIRRVSYNIIDNVAALAALHHYPVGMQHSLWGRSVT IFRTECGTPYFMNFHDESAKGHTCIIGGAQSGRATIANFLLSEASKYSPTILYLTNRNNAQVFIKGIEGT WHDGDLPFNPLSYLESSDDLLELFKIITGNYFNNLTDSEIECITELAIAVMDMPPESRSLIKIIKDFNFK AYSAGASVKKRIKLFISDDKCSKIFNQSSTLELQDNNVTAINLADYTDYQFNQSYTPQVGEKPEIYHNKL QTLHCLRSGIIFSLIKKFSLLASPEPKILVVDNMPDLIVEQVFMNLIKQITEQLSENNGIILSVVQVNQN DQFYYSDFWKKWLKFNNTKIILPTNIRNLPIAEICNLSTREAKKFNTISPNSRLFMVKQDNNYVIVELNL EGFPAIRKLLSAEEEDLNLFHKIMQKIGDDAPSAWLSDVYDQFQNSE |
Nucleotide Sequence: 2454 bp [Download] |
>gi|189182907|ref|NC_010793.1|:c7430-4977 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome ATGGGGTTTATACATAAATTTTTACATAGTAGAAAAATAGATGCAAAACAGTTTGATAGCAATGCTCAGA ACTTTATTCCTATAACTTGCCACTACAATGATGAAACTTTATTAACTAAAAATGGCGAATTAATTCAAAT ATTACAAATAAAAGGTATTAATTCTGAATATACTAATAAGGATTTATTGGGTATCAGAGCAGCAATACGT AATGCTATTAAAAATCATATTAATAATAGCAACTTTGCAGTTTGGATACATGTTGTAAGGCGCTGTGATA ATATTGATGACTCTACTCCTTACAGTCAAGCATTGCCAAATTTTATTCATAACATTTGGAGCAAAAAAAA CTACTGGCAAGATAAATTTGTTAGTACATTATATATCTCAATTGTGCATCATGGATGTAACTTAAATATT AGAAACTTAGATAGTTTTTTGAACTCTTTATCGTTTAAGACATTGGATAGTTTTTATGATAAGTTCATAG CATCTGCATTAAAAAATTTATCCATGGCTATAAATAATATAATAACTGAGCTGCAAGGTTATAATCCATG CAAGTTAAGTATTAAAATTGATAATAATAAAGTATATTCTGACCTTTTAAATTTTTATAAAAAAATAATA CAACTTAATACTGGGTTAATAGAAGTAAAAGATGTTGATTGTGCTGTACAGTTAGCCACTCATAAATATT CTTTTGGAGGAGACAAAATAGAGGTTATACATAAACAAGAAAAAAAGTTTGCATCTATTTTAGGTATCAA GGAATATCAAGATATTAAAGATGAATTAGTGAGTAAGTGCTTACATGCTCCAGTCGAATTTATTGCTACA GAAATTTTTTATTTTGCTGACCAAGTAAAAGCTATTAATAGTTACTCTCAACAAAGTAAAGTTATTAGTG CAAGTCGTGACAGTGAACTAGCTCTATTCAAAGGAATAGAGCCAATTGTGAATTCTGATAACACATTACC ACAGTTTTGCCATCAACAAATTAGCATAATGATTATGGCTGATAGCATTGATCTGCTTGAGAGTAGAGTA GCTTATATGTCGCAAAGATTAGTAAAACAAGGTATAATACATGTTCGAGAGGATATTAATCTAGCGCAAA CATTTTGGTCTCAGTTACCAGGTAATTTTAATTACATTAGACGTGTTTCTTATAATATTATTGATAATGT AGCTGCTTTAGCAGCACTACATCATTACCCTGTTGGCATGCAGCATAGTCTATGGGGTAGATCTGTCACT ATATTTCGAACAGAATGCGGTACTCCTTATTTCATGAATTTTCATGATGAGAGTGCAAAAGGGCATACTT GTATAATTGGTGGAGCTCAATCTGGTCGAGCTACTATCGCTAATTTTTTATTGTCTGAAGCATCAAAATA TTCTCCAACTATACTTTATTTAACTAATAGAAATAATGCTCAAGTTTTTATAAAAGGAATAGAAGGAACA TGGCACGATGGTGATTTACCATTTAATCCATTAAGCTACTTAGAAAGCTCTGATGACTTATTAGAACTAT TTAAGATAATAACAGGTAATTATTTTAATAATTTAACTGATAGTGAAATTGAATGCATTACAGAGTTAGC TATTGCAGTTATGGATATGCCACCTGAATCGCGTTCTTTGATTAAAATTATCAAAGATTTTAATTTTAAG GCTTATAGTGCTGGAGCTAGTGTAAAGAAGCGTATTAAGTTATTTATTAGTGATGATAAATGTAGTAAAA TTTTTAATCAATCTTCTACTTTAGAATTGCAAGATAATAATGTAACTGCTATAAACTTAGCTGATTATAC TGATTATCAATTTAATCAATCTTATACACCTCAAGTAGGAGAAAAGCCGGAAATTTATCATAACAAATTA CAAACTTTGCACTGTCTAAGGTCTGGAATTATATTTTCTTTAATAAAAAAATTCAGCTTACTAGCCTCTC CAGAGCCTAAAATACTAGTTGTTGATAATATGCCTGATTTAATAGTAGAGCAAGTGTTTATGAACTTAAT TAAACAAATCACTGAACAACTATCTGAAAATAATGGAATAATTCTTTCTGTTGTTCAAGTAAATCAGAAT GATCAATTTTATTATTCTGATTTCTGGAAGAAATGGTTAAAGTTTAATAATACTAAAATTATACTACCAA CTAATATAAGAAATTTACCTATTGCTGAAATCTGTAACCTAAGTACTAGAGAAGCTAAAAAATTTAATAC TATTTCACCAAATTCTAGATTATTTATGGTAAAACAAGATAATAATTATGTTATTGTAGAACTTAATTTG GAAGGATTTCCAGCAATTAGAAAGCTTCTATCAGCTGAAGAAGAAGATTTGAATCTTTTTCATAAAATTA TGCAAAAAATAGGCGATGATGCTCCTTCAGCTTGGTTAAGTGATGTTTATGATCAGTTTCAGAACAGTGA GTAA |