| Protein ID: 188527701 |
 T4SS name [ID] | VirB [605] |
| Gene symbol | - |
| Locus tag | HPSH_04615 |
| Strain | Helicobacter pylori Shi470 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010698] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 908059..910557 [-] |
| Product | DNA transfer protein |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | B2UU26 |
| KEGG ID | hps:HPSH_04615 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 5.9e-58, Aligned region: 209..406 AAA_10 [PF12846], Evalue: 3.7e-25, Aligned region: 467..738 TrwB_AAD_bind [PF10412], Evalue: 1e-10, Aligned region: 466..500 TrwB_AAD_bind [PF10412], Evalue: 1e-10, Aligned region: 643..752 FtsK_SpoIIIE [PF01580], Evalue: 1.8e-08, Aligned region: 426..499 DUF87 [PF01935], Evalue: 3.3e-05, Aligned region: 466..505 TraG-D_C [PF12696], Evalue: 5e-05, Aligned region: 668..738 |
| Protein Sequence: 832 a.a. [Download] |
| >gi|188527701|ref|YP_001910388.1| DNA transfer protein [Helicobacter pylori Shi470] MFLGLEGFKKFIFNFLSSCIPRQYSLVQENNINGKFDEKFVLTHKGNLVGAISLNGITYSNFDKEDVATQ FLYRTQALNELIDGVTLRIVAKRRDIKTQTIYNKDGVSKYAKKIVNAYEKNKEFYITTYYLIIETKSVNI KGLLEKWKAKMTTDKYVNNDEEKPLKDNLKNSEAQKQEAYKIKKNAVENKELQDKATLLAEILNKMSSIL TDFEPKFLSSDDLLNLYAEYCNGHYCDFKYKQGRLSDGNIQSHLYFKKDHFIHDYNGIETFKRFIAVKAY DVDNITSLALSNLLCEKFNLDILLTIEAMDKERALFFIRERKKRSKDISYQNIEYLEQMVSTDRAQIQKV SLSIMVFANSKKELDKKSIIVYNTLKKEGFSAVLESINMRPIFFSFFPERNFLNSRLRPQTSQNIASLIM FEKYQEGFKENSWGDCPISVFKNQNGSAHFFNFQAKQGRDRNDNVVGHTMIIGSTGSGKSTFISFLIANL LTKYDMSVVALDRMNGLEIMTDFFEGQYNTANTDGGFYINPFSLKDTEENRQFLANWIKFMLNIDSNNQQ DNKASQSIDKVIRDTYNYMGEQKNQINLLEIAKNLGSSEQDFNEILKSQGEKVYFKKFQDCLDFSKSPLS VINMDVFANDKKLMGLIAMYLFHKLFFEAKEHNKPFFLFIDETKDYIMHPIMFNYIANALAQARKINGTL CMAFQKISQVKELGIDKAKSLIGNLSQVIIYPTKDTDELIECGVPLSDSEINFLHNTDMRARQVLVKNIV TNASAFIEIDLKKDLQELLYILDSNAGNRKILNDLKKSNQETYKEEYLKTKMKKESENIQYV |
| Nucleotide Sequence: 2499 bp [Download] |
| >gi|209406223|ref|NC_010698.2|:c910557-908059 Helicobacter pylori Shi470 chromosome, complete genome ATGTTTCTTGGTTTAGAAGGTTTTAAAAAATTTATTTTCAATTTCTTAAGTTCTTGTATTCCTAGACAAT ATTCTTTAGTTCAAGAAAACAATATTAATGGAAAATTTGATGAAAAGTTTGTGTTAACGCATAAAGGAAA CTTAGTAGGAGCAATATCTTTAAATGGAATAACTTATTCAAATTTTGATAAAGAAGATGTGGCTACACAA TTTTTATACAGAACACAAGCTTTAAATGAATTGATAGATGGTGTTACTCTAAGAATTGTTGCTAAACGAA GAGATATAAAAACTCAAACTATTTACAACAAAGATGGCGTGAGTAAATACGCTAAAAAAATTGTTAATGC TTATGAAAAAAATAAAGAATTTTATATCACGACTTACTATTTAATTATTGAAACAAAAAGCGTCAATATA AAAGGGCTTTTAGAAAAGTGGAAAGCAAAAATGACTACTGATAAGTATGTAAATAATGATGAAGAGAAAC CTTTAAAAGATAATCTTAAAAACTCAGAAGCACAAAAACAGGAAGCTTATAAAATAAAAAAGAATGCGGT AGAAAATAAAGAATTGCAAGATAAAGCAACTCTTTTAGCTGAGATTTTAAATAAGATGAGTTCCATACTA ACAGACTTTGAGCCTAAATTTTTAAGTTCAGACGATCTATTGAATTTATACGCTGAATATTGTAATGGTC ATTATTGTGATTTTAAATACAAACAAGGACGATTGAGCGATGGGAATATCCAATCTCATTTATATTTTAA AAAAGACCACTTTATACATGACTATAACGGAATAGAGACTTTTAAGCGTTTTATTGCTGTGAAAGCTTAT GATGTGGATAATATCACTTCTTTGGCTTTATCTAATCTTTTGTGTGAAAAGTTTAACTTAGATATTTTGC TCACTATAGAAGCTATGGATAAAGAAAGAGCTTTGTTTTTTATTAGAGAGCGTAAAAAACGCTCTAAAGA TATTAGCTATCAAAATATAGAATATTTAGAGCAAATGGTTTCTACTGACAGAGCGCAAATACAAAAAGTT AGTTTATCGATCATGGTTTTTGCTAATTCTAAAAAAGAATTAGATAAAAAATCAATTATTGTATATAACA CTTTGAAAAAAGAAGGCTTTTCAGCGGTTTTAGAAAGCATCAATATGCGTCCTATATTTTTTTCATTTTT TCCTGAAAGAAACTTTTTAAATTCACGCCTAAGACCTCAAACTAGCCAAAATATTGCTAGTTTGATTATG TTTGAAAAATATCAAGAAGGCTTTAAAGAAAATAGTTGGGGGGATTGTCCTATCAGCGTGTTTAAAAATC AAAATGGATCAGCCCACTTTTTCAATTTTCAAGCTAAGCAAGGTAGAGATAGAAACGACAATGTTGTAGG TCATACCATGATAATTGGTAGCACAGGGAGCGGTAAATCCACTTTTATTAGTTTTTTAATCGCCAATTTA CTGACTAAATACGATATGAGCGTGGTAGCTCTTGACAGAATGAATGGTTTGGAGATTATGACTGACTTTT TTGAAGGTCAATACAATACTGCTAATACAGATGGTGGTTTTTATATCAACCCTTTCAGTTTAAAAGATAC AGAAGAAAATAGGCAATTTCTAGCAAACTGGATTAAATTTATGCTCAATATTGATAGCAATAACCAACAA GATAATAAGGCTTCTCAGTCTATAGATAAGGTTATTAGAGATACTTATAATTACATGGGTGAACAAAAAA ATCAAATAAACTTATTAGAAATTGCCAAAAATTTAGGCTCTAGCGAACAAGATTTTAATGAGATTTTAAA ATCACAAGGGGAAAAAGTCTATTTTAAAAAATTTCAAGATTGTTTAGACTTTTCTAAAAGTCCTTTAAGT GTGATCAATATGGATGTTTTTGCTAATGATAAAAAACTTATGGGGCTAATTGCTATGTATTTGTTCCACA AATTGTTTTTTGAAGCAAAGGAACACAACAAACCTTTTTTTCTATTCATTGATGAAACTAAAGACTACAT TATGCATCCTATAATGTTTAACTATATCGCTAACGCACTCGCTCAAGCTAGAAAAATCAATGGAACACTT TGCATGGCGTTTCAAAAAATATCTCAAGTCAAAGAATTAGGTATTGATAAAGCAAAGAGTTTGATAGGCA ACCTTTCTCAAGTGATTATCTACCCCACAAAAGATACTGATGAACTAATAGAATGCGGTGTTCCATTAAG CGATAGCGAAATCAATTTCTTACACAACACGGATATGAGAGCCAGACAAGTGCTAGTAAAAAATATCGTT ACAAACGCTTCAGCTTTTATTGAAATTGATTTAAAAAAAGATTTGCAAGAACTACTTTATATTCTTGATA GCAATGCTGGTAATAGAAAAATCCTCAATGATCTTAAAAAATCAAACCAAGAAACTTATAAGGAAGAGTA TTTAAAAACTAAAATGAAAAAAGAAAGCGAGAATATTCAATATGTATAA |