Protein ID: 157964170 |
T4SS name [ID] | VirB [487] |
Gene symbol | virB4-1 |
Locus tag | RMA_0145 |
Strain | Rickettsia massiliae MTU5 |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_009900] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 136521..138965 [+] |
Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | A8F0L1 |
KEGG ID | rms:RMA_0145 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 7.1e-69, Aligned region: 203..408 AAA_10 [PF12846], Evalue: 1.6e-36, Aligned region: 461..736 AAA_23 [PF13476], Evalue: 7.6e-06, Aligned region: 453..585 |
Protein Sequence: 814 a.a. [Download] |
>gi|157964170|ref|YP_001498994.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia massiliae MTU5] MKIVKSGEVMKLFRTRAAKELRSQQERPTSHFIPYKCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDL DIKKNIRNALLKNMASGNIIMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGARSFF NELYVSILYKPDTGGIAIVEYFLRKLRQKSNKTAWENDMKEMKENLQEMSTRVVNTFRSYGARLLGVRQT QSGSYCEILEFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEARSPLGKKYAGMISILEYGPN TSAGIFDGFLQMPFEFVMTQSFVFVNRTVAIGRMQLQQNRMIQSGDKATSQIAEINTALDMATSGDIAFG EHHLSLLCSANNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASF ASQHNYPLGKIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPR MFFFDKDRGAEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLQLEDTSENRTFILEWFRVLVTSNGESLTAQDNKIL SQAVSGNFRLEKKDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQKARVFGFDMTE LLKDPVSLAPVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVE DAAKSRISDTLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGIDAVVAKVSLD GMDNIISVLSGRVETVVLLDQIREKHGNDPDKWLPIFYEAVKTL |
Nucleotide Sequence: 2445 bp [Download] |
>gi|157964072|ref|NC_009900.1|:136521-138965 Rickettsia massiliae MTU5 chromosome, complete genome ATCAAAATAGTTAAATCAGGTGAGGTAATGAAGTTATTTAGAACTAGAGCAGCTAAAGAATTAAGGTCTC AACAAGAAAGACCCACTTCGCATTTTATTCCTTATAAATGTCATTGGGATAGTAATACTATTTTAACAAA AGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAAAATAAATGGATTTTCTTTTGAAACTGCTGATGATGAAGATCTA GACATTAAAAAGAATATCAGAAATGCCTTACTTAAAAATATGGCTTCGGGAAATATCATTATGTATTTCC ATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAATATTTGACGATACGGAATTTACTTATGATCCTACCGTAAAAGT CCCTAATGATTTTATTACTTATTTAGGTGCAGAATGGCGTAAGAAACATGCTGGGGCTAGGTCGTTTTTT AACGAATTATATGTTAGTATTTTATATAAGCCTGATACTGGCGGTATTGCTATAGTTGAGTATTTTCTAA GGAAGCTTAGACAGAAATCTAATAAAACCGCTTGGGAAAACGATATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCA AGAAATGTCAACTAGAGTGGTTAATACATTCAGAAGTTACGGAGCAAGATTACTTGGAGTTCGTCAAACG CAGTCAGGTAGTTATTGTGAAATTTTAGAATTCCTTTCATCTTTAATCAATTGCGGCGATTCACCGGGTC CTATAGCATTACCACGTGGTACTATTGACGAATATTTACCGACTCATCGTTTATTTTTTGATTCTCGTAC TATTGAAGCAAGAAGTCCACTTGGCAAGAAATATGCCGGAATGATCAGTATACTTGAATACGGTCCTAAT ACTTCGGCAGGAATTTTTGACGGATTTCTGCAAATGCCTTTTGAATTTGTTATGACGCAAAGCTTTGTCT TTGTTAATAGAACAGTAGCGATCGGTAGAATGCAATTACAGCAAAATAGAATGATACAATCCGGTGATAA AGCTACTTCACAAATTGCTGAAATTAATACGGCCCTTGATATGGCCACTAGCGGTGATATCGCTTTCGGT GAGCATCATTTATCGCTTTTATGTTCCGCAAATAATATTAAAGCTTTGGAAGATATATTGTCAATGGCAG CAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTCAGCCGGTTAGAGAAAAAGTTAACATGGAACCTAGCTATTGGGG ACAGTTGCCGGGAAATATGGATTATATAGTGCGTAAATCCACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTT GCCTCACAACATAATTATCCGCTCGGTAAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTACTTG ATACTACTTCAGGTACACCGTTTTATTTTAATTTCCATGTAAGGGATGTTGGACATACTCTCATTATCGG TCCAACCGGTGCCGGTAAAACAGTTCTTATGAATTTCTTATGTGCTGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGT ATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGAGGAGCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAACGGAGTTTATACAGTAA TTGATCCGGGTTTAAAATGCAACTTTAACCCTTTACAGCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACGTTTAT TTTAGAGTGGTTTCGCGTGCTTGTAACTTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTA TCTCAAGCGGTAAGCGGTAATTTTAGATTAGAAAAAAAAGACAGAAGGCTTAGTAATGTTATAGCATTTC TTGGTATTGATACACCAAATAGTTTGGCAAGTAGGATTGCAATGTGGGTCGGTAAAGGTTCACACGCTAA GATATTTGACAATGAAATAGATGATATTGATTTACAAAAAGCAAGAGTATTCGGTTTTGATATGACTGAA TTACTTAAAGATCCTGTAAGTCTTGCACCGGTATTATTATATATTTTCCATCGTATTAATATCTCTTTAG ATGGGCAGAAAACTATGATAGTACTTGATGAAGCATGGGCTTTAATCGATAATCCGGTATTTGCACCTAA GATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAGAAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTTGAA GATGCCGCAAAAAGTAGAATTAGTGATACGTTGATTCAACAAACAGCCACGCAGATTTTTTTACCTAATT TGAAAGCTACGGATATTTATCGTAGTGCATTTATGTTAAGTCAGCGAGAATATATTTTAATTAAAACTAC CGACCCTACTACACGTTATTTTTTAATAAAACAAGGAATAGATGCCGTAGTTGCAAAAGTTAGCTTAGAT GGTATGGATAACATAATCAGTGTTTTATCCGGTAGAGTTGAGACTGTAGTATTGCTCGATCAAATTAGAG AGAAACACGGCAATGATCCGGATAAATGGTTACCTATATTTTATGAAGCAGTTAAAACATTATAG |
Protein ID: 157964933 |
T4SS name [ID] | VirB [487] |
Gene symbol | virB4-2 |
Locus tag | RMA_1234 |
Strain | Rickettsia massiliae MTU5 |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_009900] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 1204883..1207315 [+] |
Product | VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | A8F2S4 |
KEGG ID | rms:RMA_1234 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 3.5e-51, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 2.3e-10, Aligned region: 436..605 |
Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
>gi|157964933|ref|YP_001499757.1| VirB4 [Rickettsia massiliae MTU5] MFSDLRKFDKDIYNYNAPNFIPIACHYNENTLLTKDGKLLQIIKIHGINSEKISDNIQNLREIVRASIKK NINDYDFAFWLHTIREKQNLDDSTPYKKLLPANIHTLWQRKNHWNDKFVNTLYISIVHDSAKVNIKNFNS LINSLSNKLITDFENNYLDSAFQKLDNITNNILNDLNEFGAEKLGIIFENDNVFSNPLFLYNRIANLNNN DCLVPIIDLSDALGRSIYTISSDKMVVTDHEKNNKFASLLSIKEYHETPSNTLDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQVISKLRGQDYILKITNDSTLLNHKGINKLDAANLDFQFCNQQISIAVIEEDENKLDAAVAKAST ELFKLGIIHVKEDLNIEQIFWSQLPANFAFIRRMSPLSVEHIASLTALHNTTLGNQYNPWGKAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTEKTGKTVLLNFLISESTKYDPTIIYISNNNDSKIFIEAIEGKWLEPD KQIINPFLVDDTEKSQAFILEFLKLISGHYISPLSEIEISFLEKLKNKILSIEKEKRIFSDILQLEDFKE EGGIQILDKLKVFTKEQLYSGLFDGSSLNIEEGKVIGFNLYKLSDEPFSKQFYPTERKFLEQFNNNLKKH QSISAAVIYAFTYHLSLVGTKPKIFAADNFDKLYRPEVYYDNINLIYNNLSQNNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLSEPEIRKLSQLILSARMFLISKDNESIASELSIAALIG VVRILSSRQEEMDIYKKILEQHQGPPDNWVNYLYNELNTD |
Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
>gi|157964072|ref|NC_009900.1|:1204883-1207315 Rickettsia massiliae MTU5 chromosome, complete genome GTGTTTAGTGATTTACGAAAATTTGACAAAGATATATATAATTACAATGCTCCTAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATGAAAATACTTTACTTACCAAAGACGGTAAATTACTACAAATTATCAAAATACACGG CATTAACTCAGAGAAAATAAGCGATAACATACAAAATTTACGTGAAATAGTTAGAGCTTCTATTAAAAAA AATATAAACGATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACATACAATACGAGAAAAACAAAACTTAGACGATTCAA CTCCTTACAAAAAATTATTACCGGCAAATATTCATACCCTATGGCAAAGAAAAAACCATTGGAATGATAA ATTCGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCTGCTAAAGTTAACATCAAAAATTTTAACTCT TTAATAAATTCTTTATCTAATAAATTAATTACTGATTTTGAAAATAACTACTTAGATTCAGCTTTTCAAA AATTAGACAATATCACTAATAATATTTTAAACGATTTAAACGAATTCGGTGCTGAAAAACTCGGTATAAT ATTTGAAAATGATAATGTTTTTTCTAATCCTTTATTTTTATATAATCGAATAGCTAACCTTAATAATAAT GATTGTTTGGTACCTATAATAGATTTATCCGATGCACTAGGTAGAAGTATTTATACAATTAGCAGCGATA AAATGGTAGTTACGGATCATGAGAAAAATAATAAATTCGCTTCTTTACTATCTATAAAAGAATATCACGA AACTCCTTCTAATACACTGGATAAATTTTTACAGTTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTTAGCAAAAAACAAGTAATATCCAAATTGCGTGGTCAAGATTATATTCTCAAAATTACTAACGACT CAACTTTACTTAATCACAAAGGGATTAATAAGCTTGATGCAGCTAATTTAGATTTTCAATTTTGTAATCA GCAAATTTCAATTGCCGTTATAGAAGAAGATGAAAATAAACTAGATGCAGCTGTAGCTAAAGCATCAACC GAACTTTTTAAACTTGGTATTATTCATGTAAAAGAAGATCTTAATATTGAGCAAATATTTTGGTCGCAAT TACCTGCTAACTTTGCCTTTATACGTAGAATGTCGCCATTATCCGTAGAGCATATTGCTTCTCTTACTGC TCTTCATAATACTACACTCGGTAATCAATATAATCCTTGGGGTAAGGCTATAACTTTACTACGAACCGAG AAAGGTACTCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGAATAAAGGTAATACTTGCATCTTTGGTACGG AAAAAACCGGCAAAACCGTATTATTGAACTTTTTAATATCAGAATCGACTAAATATGATCCAACAATAAT TTATATCTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATCGAGGCAATAGAAGGCAAATGGTTAGAACCGGAC AAACAAATTATCAATCCATTTTTAGTAGATGATACAGAAAAATCACAAGCATTCATTTTAGAATTTTTAA AATTAATCAGTGGTCATTATATCTCACCTCTTAGCGAAATAGAGATATCATTTCTAGAGAAATTAAAAAA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCCGATATTTTACAATTAGAAGATTTTAAGGAG GAAGGAGGAATACAAATACTTGATAAACTTAAAGTTTTTACCAAAGAACAATTATATTCCGGATTATTTG ACGGATCGTCTCTTAACATTGAAGAAGGGAAAGTTATAGGGTTTAATTTATATAAACTTTCTGATGAGCC GTTTTCTAAACAATTTTACCCAACGGAGAGAAAATTTTTAGAACAATTTAATAATAATTTAAAGAAACAC CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTTACTTATCATTTAAGTCTAGTTGGCACAAAACCTAAAA TATTTGCTGCCGATAATTTTGATAAACTTTACAGACCTGAGGTTTATTATGATAATATAAATTTAATCTA TAATAATTTGTCTCAAAATAATGGTATTTTCGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAGTCATATCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCTACCGTCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAGCGAGCCGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGC AAGAATGTTCTTAATTAGTAAGGATAATGAATCGATAGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGCTTTAATAGGA GTTGTCCGTATTTTATCAAGCAGACAGGAGGAAATGGATATTTATAAAAAAATACTTGAACAACACCAAG GTCCTCCGGATAATTGGGTTAATTACCTATATAATGAGTTAAATACGGACTAA |