| Protein ID: 121999291 |
 T4SS name [ID] | VirB [472] |
| Gene symbol | - |
| Locus tag | CJJ81176_pTet0040 |
| Strain | Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 |
| Replicon | plasmid pTet [GenBank: NC_008790] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 32239..34050 [+] |
| Product | cmgD4 |
| Component type | VirD4 |
| UniProt ID | Q69B94, A1WZY0 |
| KEGG ID | cjj:CJJ81176_pTet0040 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | T4SS-DNA_transf [PF02534], Evalue: 7.8e-105, Aligned region: 93..565 TraG-D_C [PF12696], Evalue: 3.9e-26, Aligned region: 406..528 TrwB_AAD_bind [PF10412], Evalue: 2.3e-17, Aligned region: 345..542 |
| Protein Sequence: 603 a.a. [Download] |
| >gi|121999291|ref|YP_001004044.1| cmgD4 [Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176] MQNNKSIQMIFLAIASFILTYLITPIVFFFLNKVKIMKAIEIYNINFTLQAISNGYPKIWLSLGITFGIC FVVFSVLVLSLKAKKSQFGEARFANFNEIKKMNLFSDNGIIIGKYKGKILRFSGQQFVALGAPTRSGKGV GIVIPNLLEWRESAVVQDIKQECFDYTSKYRKEILGQEVYLFNPFSRQTHRYNPLTYIDMSDKEHCDSQL MDLGNILYPQDGDSTSKFFNGLAQNLFIGLCYLWRDLQLTDYGKEFQSAFDINVGEFNFYNILQLSKGFS LKNEGKTLKGFDDTYNFLSYCEVLDEATIRRLETYFNINSDATKSGVMSSFNAPLVPFESETLRLSTETS DFDLRDLRKKKMTIYIGITPDQLANAQFILNIFWSQLILLNTKELPQSNKDLKYTCLMVMDEFTAPGRIP IYQSAISFMAGYWLRSLMIYQSNSQLETQPPLGYGKEGAKTLLTNHACQIFYAPREQEDAEAISRILGNT TFKTKSRSINTGNNGGGSHSISEASRALMLPQELREMPFENELITIDSGKPILCNKAFYYSDSYFMDKFK AVSKSLSTIRKIPSRKQLEDAILKGECKVKIQIIGENNDKKIA |
| Nucleotide Sequence: 1812 bp [Download] |
| >gi|121999251|ref|NC_008790.1|:32239-34050 Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet, complete sequence ATGCAAAATAATAAAAGCATTCAAATGATTTTTCTTGCTATAGCGAGTTTTATTCTCACTTACTTAATAA CGCCCATTGTTTTTTTCTTTTTAAATAAAGTAAAAATAATGAAAGCGATTGAAATTTATAACATAAATTT TACGCTACAAGCAATCTCTAATGGTTATCCAAAAATATGGCTTTCTTTAGGTATTACTTTTGGCATTTGT TTTGTTGTTTTTTCTGTTTTGGTGTTATCTTTAAAAGCCAAAAAATCTCAATTTGGCGAAGCTAGATTTG CAAATTTTAATGAAATTAAAAAAATGAATTTATTTTCAGATAATGGAATAATTATCGGAAAATACAAGGG AAAGATTTTAAGATTTAGCGGTCAGCAATTTGTAGCCTTAGGAGCACCCACAAGAAGTGGTAAAGGCGTA GGTATAGTAATACCAAACTTGTTAGAGTGGCGAGAAAGTGCTGTTGTTCAAGATATTAAACAAGAATGTT TTGACTACACAAGCAAATATAGAAAAGAGATTTTAGGACAAGAAGTTTATTTATTCAATCCATTTTCAAG ACAGACACATCGCTATAATCCTTTAACTTATATTGATATGAGTGATAAAGAGCATTGCGATAGTCAATTA ATGGATTTAGGTAACATACTCTACCCACAAGATGGGGATTCTACCTCAAAATTTTTCAATGGCTTAGCAC AAAACTTATTTATTGGGCTTTGTTATTTATGGCGTGATTTACAATTAACCGATTATGGAAAAGAATTTCA AAGTGCGTTTGATATTAATGTAGGAGAATTTAACTTTTACAATATTTTGCAACTCTCAAAAGGTTTCTCA CTTAAAAATGAAGGAAAAACTTTAAAAGGATTTGATGATACATACAATTTCTTATCTTATTGTGAAGTTT TAGATGAAGCAACCATAAGGCGTTTAGAAACTTATTTTAATATTAACTCAGATGCTACTAAATCAGGTGT AATGAGCTCTTTTAATGCTCCGCTTGTGCCATTTGAAAGTGAAACATTAAGATTAAGCACAGAAACAAGC GATTTTGATTTGCGAGATTTGCGTAAAAAGAAAATGACAATTTATATAGGAATTACGCCTGATCAATTAG CAAATGCACAATTTATTTTAAATATTTTTTGGTCGCAACTTATTTTATTAAACACCAAAGAATTGCCACA AAGCAATAAAGATTTAAAATATACTTGTTTAATGGTTATGGATGAATTTACTGCACCTGGTAGAATTCCT ATCTATCAATCAGCAATCAGTTTTATGGCTGGTTATTGGTTAAGATCTTTGATGATTTATCAATCAAATT CACAACTTGAAACACAACCACCTTTGGGCTATGGAAAAGAAGGAGCTAAAACACTCTTAACAAATCATGC TTGTCAGATTTTCTATGCGCCAAGAGAGCAAGAAGACGCAGAAGCTATCTCTAGGATTTTAGGAAATACT ACTTTTAAAACAAAATCAAGAAGTATTAATACAGGCAATAATGGAGGTGGATCACATAGTATTAGCGAAG CAAGTAGGGCTTTAATGTTGCCACAAGAACTTAGAGAAATGCCTTTTGAAAATGAACTAATTACTATTGA TAGTGGAAAACCTATTTTATGCAATAAAGCATTTTATTATTCAGATTCTTATTTTATGGATAAATTTAAA GCTGTTTCGAAAAGTTTATCAACAATAAGAAAAATCCCTTCACGCAAACAATTAGAAGATGCGATCTTAA AGGGAGAATGTAAAGTAAAAATTCAAATTATAGGAGAAAACAATGATAAAAAAATCGCTTGA |