| Protein ID: 67458481 |
 T4SS name [ID] | VirB [501] |
| Gene symbol | virB6_1 |
| Locus tag | RF_0089 |
| Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 94545..97961 [+] |
| Product | TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | Q4UNB8 |
| KEGG ID | rfe:RF_0089 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 5.5e-12, Aligned region: 504..580 |
| Protein Sequence: 1138 a.a. [Download] |
| >gi|67458481|ref|YP_246105.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia felis URRWXCal2] MKLFPRSILIILVLSFALNLGLVTKTHAKDTLDSIVDILSGLTCETQGVGDLLRTEFSHTCIVAPFFTFA VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCTRENRIDPKNPELRFALCNNAKLIVSRAKSVA ESALAIAKAVLTGGDPWDDIKKAWENKKKEYHIPYSGKPGDDGFAFDAGFPVIYWKIIQDKDRICVSTKG FTGDVPVGCKYMKEPFPKSMYNSFMDVADKDFIQDPKETPTDPLALVSCSAAGGGCYQKAYNASKTAVVM TSPLIECMRQMIARLLISKDVCSFDNVEQVVNLASRQDSALFQFQVGMYKIVTAFLTLYVMFFGFKLLLA GEIPPKSEYINFILKMIFVTYFSIGINITPGNGSPYDRLDGMIQWAFPFLLDGINGLASWVMNAAPSGLC KFNNLSYDGTVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENAYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLLIPAIIS GNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFTYTRNYFDSWVKLMISFLLQ PMVVVTFMITMFSVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIENLAQSGGTSSRDVLIFYINNDWDDISQYPDKDAVE SCQNSLGYMLNNPITTAFNFAKDSVSEIVDSKPGDTPTDKFLAKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKIK NILLALVTACFTLYLMYNFSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAGMAALAAAGAATKGVDQIASR GGVGDLKAGQGGGVSDNIAKSGGGGPNDNIAASGGTSAPTVTTPTASSSVATSSPKTVSSEARSDVVTPP PAPSEAVSPPPASIRTSISTPAPQSNIETESVGKIIRDNNQESKKEIDNTPPPQEKVDNAAPQEKVDSTS KGTGVIDYSFNLKEHENPAGVKQIRENAEIRDKRAEVEKAWNELVASGGGRIRDQQGEETSERRTNAEKK WNELVDSGVVTEIRERDNSVTNKFDKLADELNKSEKAKVEENKNIENDRKENNTTTSPQEKVDSTSRGSG VIDYSFNLKEHENPTGVKQIRENAEIRDKRVKVETAWNELVASGGGRVREQEGGEVSERRANAVKTWDEL VKSGVVTEKKDNSSNENS |
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| >gi|67458392|ref|NC_007109.1|:94545-97961 Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome, complete genome ATGAAATTATTTCCTCGTAGTATACTTATAATATTAGTATTAAGCTTTGCCCTAAATTTAGGGCTAGTTA CTAAAACCCATGCCAAGGATACTCTTGATAGCATTGTAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACCCA AGGCGTAGGGGATTTGCTGCGTACTGAATTTTCTCATACCTGTATTGTTGCTCCGTTCTTTACTTTTGCG GTAATGAATCTTGTCTCTCCCGTTTTATACATGAATACGTTTTTAAAGCTTAAAATAAACGACAGTGATT TATTTAACGATAGTAATTTTGGAAATTTCCCCGGAGGTCAATGTACTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA AAATCCAGAATTACGCTTTGCTTTATGTAATAATGCTAAATTAATTGTATCTCGGGCAAAATCTGTTGCT GAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTCTTAACAGGGGGCGACCCTTGGGATGATATAAAGAAAGCGT GGGAAAATAAAAAAAAGGAATATCATATTCCATATAGTGGTAAGCCCGGTGATGACGGTTTTGCATTTGA TGCAGGCTTCCCTGTAATATATTGGAAAATTATTCAAGATAAAGATAGAATATGTGTTTCAACAAAGGGG TTTACAGGAGATGTTCCCGTCGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCGAAATCCATGTATAATAGTT TTATGGATGTAGCAGATAAGGACTTTATTCAGGATCCTAAGGAAACGCCTACTGATCCTTTAGCTTTAGT TTCCTGTAGTGCAGCAGGCGGCGGATGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAGTAGTCATG ACTTCTCCTCTTATAGAATGTATGAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGATGTTTGTAGTT TTGATAATGTAGAACAAGTGGTTAATTTGGCTTCAAGGCAAGATAGTGCATTATTTCAGTTCCAAGTAGG AATGTATAAAATAGTTACGGCTTTTCTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGCTTTAAACTATTACTTGCA GGTGAAATACCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATGATATTTGTAACTTATTTTTCAA TAGGAATTAATATAACCCCTGGTAATGGCTCTCCGTATGACCGACTAGACGGTATGATTCAGTGGGCGTT TCCTTTCTTACTTGACGGTATAAACGGTTTAGCAAGTTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCCGGTTTATGT AAATTTAACAATCTTTCTTATGACGGTACCGTTTCTTATATTGCATTATGGGATGCGTTAGATTGTAGGG TAGCTCATTATTTAGGGCTTGATATATTATCTACGTTACTTGTCGAAAATGCTTATCGAAGCCATGATTT TTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCTCCACCATATATTTATTTGCTAATTCCGGCGATAATCTCC GGTAATATGATGTTAGTGTCACTCGCTCTTTCTTATCCGTTACTTGTGATTTCGGTTGCTGCCTTTATGG TTAATGCAACGATTATGTGTATGATATCTATAGTAATACTCGGTATTTTAGCTCCTCTTTTTGTACCTAT GTTTTTATTCACATATACACGAAATTATTTTGACAGCTGGGTTAAGCTGATGATTTCGTTCTTGCTACAG CCTATGGTGGTAGTTACTTTTATGATTACGATGTTTTCGGTATATGATTATGGTTTCTACGGTAAATGTC AATATAAGAGCAAGTTAATTCACAATAGTATAGAAAATCTTGCACAGAGCGGCGGTACTTCAAGTCGTGA TGTTTTGATATTTTATATTAATAATGATTGGGATGATATATCACAATATCCTGATAAAGATGCCGTAGAA AGCTGTCAAAATAGTTTAGGTTATATGTTAAATAACCCTATTACCACGGCATTTAATTTTGCAAAAGATA GTGTAAGTGAAATCGTCGATAGTAAACCGGGAGATACCCCTACCGATAAATTTCTTGCTAAATTCCAGTT TTTATCGGGAGTAGTTTTGGGGCCCGGAATGTTTTTCATGTCTCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATTAAA AATATTTTACTTGCGTTAGTTACGGCATGTTTTACATTGTATTTGATGTATAATTTTAGTAGTCAGCTAG CTGAATTTGCTGCAGATATGACAGAAGGAGTAGCTCTTAATAATGTTGCTATAAAACCGCAAGCAATATT TAAGGCAGGCATGGCAGCCCTTGCTGCTGCGGGTGCGGCAACTAAGGGAGTAGATCAGATAGCAAGTAGA GGAGGAGTTGGTGATTTAAAAGCTGGTCAAGGTGGAGGTGTAAGTGATAATATTGCTAAGAGCGGAGGCG GAGGACCAAATGATAATATTGCTGCAAGTGGAGGTACATCGGCACCTACGGTAACAACACCGACAGCTTC GTCTTCTGTAGCAACTTCTAGCCCAAAAACAGTAAGTAGTGAAGCAAGATCAGATGTTGTTACTCCTCCT CCTGCTCCTTCAGAAGCTGTTTCACCACCGCCTGCTAGTATTAGAACTTCTATTTCTACACCTGCACCGC AAAGTAATATTGAAACTGAAAGTGTTGGAAAAATTATAAGAGATAATAATCAAGAAAGTAAAAAAGAGAT TGATAATACTCCGCCTCCACAGGAAAAAGTTGATAATGCAGCTCCACAAGAAAAAGTTGACAGCACAAGT AAAGGTACAGGAGTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGAAAATCCGGCAGGAGTAAAGCAAA TACGGGAAAATGCAGAGATTCGGGATAAACGTGCAGAAGTAGAGAAAGCATGGAACGAATTAGTAGCAAG CGGCGGAGGAAGAATAAGAGATCAGCAAGGTGAAGAAACATCGGAGCGACGTACGAATGCAGAAAAGAAA TGGAATGAATTAGTCGATAGCGGTGTAGTAACTGAAATAAGAGAAAGAGATAATAGTGTAACTAATAAAT TTGATAAATTAGCTGATGAACTTAATAAGTCAGAAAAAGCAAAGGTAGAAGAAAATAAAAATATAGAAAA TGACAGAAAAGAAAATAATACTACTACGTCACCGCAAGAAAAAGTTGACAGTACAAGTAGGGGTTCAGGA GTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGAAAATCCGACGGGAGTAAAGCAAATACGGGAAAATG CAGAGATTCGGGATAAACGTGTAAAAGTAGAAACAGCATGGAATGAACTAGTAGCAAGCGGAGGAGGAAG AGTAAGAGAACAAGAAGGAGGAGAAGTATCAGAACGACGTGCGAATGCTGTAAAAACATGGGATGAGTTA GTAAAAAGCGGCGTAGTAACAGAAAAAAAAGATAATAGTTCTAATGAAAACTCTTAA |
| Protein ID: 67458482 |
| T4SS name [ID] | VirB [501] |
| Gene symbol | virB6_2 |
| Locus tag | RF_0090 |
| Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 97948..99966 [+] |
| Product | TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | Q4UNB7 |
| KEGG ID | rfe:RF_0090 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.3e-14, Aligned region: 407..495 |
| Protein Sequence: 672 a.a. [Download] |
| >gi|67458482|ref|YP_246106.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia felis URRWXCal2] MKTLKTLKIFIIICIASVSLASFAGFGESCSSLPTTSDGYLETDTAYGYIIRNIDMKDPRGNCNSAASSI TFCFKNIEGSSSPCTIYNLNEGDSKKISDLSTDNNPDLGANPVLKDIVLTVKKWDNDLCLVMPTSRGPMP VACKSLSATPTPTPPDDENCNIGKSCYTGANYSQSLINFSGLAVQCLSETLNKVFFAGNSCSSQDQNSRI TNLAAFSTFQGYLKRIIGAALILYTMFFAFNMALNKEYASTEKIALFVIKFLLVAYFSIGLGPLDFSGGQ PTKENGMLKYGLPLLTGAAPDFAQMIFNAAGSRGLCQFDNSKYKDGYKFYGLWDAIDCRIGYYLGLDLLY NIDKNGVLGNSIGNGPGGNNTPIPNFDPDGKKDRPKDLSKAGALRFFAVMFGFFMAGNVIILAAGLVFSV IFLSILLYFITHYLVCMITIYVMTYISPIFIPMALFTRTKAYFDGWLKVCISCALQPAVVAGFIALLITM YDSAIFKNCEFLRYDYEKGDIRFSTFELRLPNGGADKCQESFGYKMLQYYAGEGWEEHLLILFPIKSIVK DVVSILAELLCVLVFSVIFYYFSKSIGRFASDLTNGPNMDAVTASPTKIVDLVKKGAAFLKDAAMASQGK PSVGDKPDVGGKRKEGEQQGGDSESGAGGGLADLASGSGGGK |
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| >gi|67458392|ref|NC_007109.1|:97948-99966 Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome, complete genome ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATAATTTGTATAGCGTCTGTAAGCTTAGCTAGCTTTG CCGGCTTTGGAGAATCATGTTCTAGTTTACCGACTACTTCAGATGGGTATTTAGAAACGGACACGGCATA TGGCTATATAATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCGAGAGGTAATTGTAACTCAGCTGCGTCTAGTATA ACGTTTTGTTTTAAAAATATAGAAGGTAGTAGTAGCCCTTGCACCATATATAATTTAAATGAAGGGGACT CTAAGAAAATTAGTGATTTAAGTACTGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTAAAGGATAT CGTTTTAACGGTTAAAAAATGGGATAATGATCTATGTTTAGTTATGCCGACGTCAAGAGGACCGATGCCA GTAGCATGTAAATCTTTAAGTGCTACTCCGACGCCTACTCCGCCTGATGATGAAAATTGTAATATAGGAA AAAGTTGCTATACGGGAGCAAATTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAGTTCAGTGTTT GAGCGAAACGCTTAATAAAGTATTTTTTGCTGGAAATAGTTGTAGTTCTCAAGATCAAAATTCTAGAATA ACTAATCTTGCAGCTTTTTCTACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGGATTATAGGTGCGGCATTAATTCTTT ATACTATGTTTTTTGCCTTTAATATGGCTCTAAATAAAGAATATGCAAGTACTGAAAAAATAGCTCTTTT TGTAATAAAGTTCTTATTGGTTGCTTATTTTTCTATCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGCGGCGGTCAG CCGACAAAAGAAAACGGTATGTTAAAATATGGATTACCTCTTTTGACGGGAGCAGCACCGGACTTTGCAC AGATGATCTTTAATGCAGCAGGTTCTAGAGGATTATGTCAATTTGATAATTCAAAGTATAAGGATGGTTA TAAATTTTACGGTTTATGGGACGCAATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGCTTGGATTTACTTTAT AATATAGATAAGAATGGAGTTTTAGGGAATTCAATCGGCAATGGTCCGGGTGGTAATAATACACCTATAC CTAATTTTGATCCTGACGGCAAAAAAGACAGACCGAAAGATTTAAGTAAAGCAGGAGCACTTAGATTTTT TGCTGTTATGTTTGGATTCTTTATGGCTGGAAACGTTATTATACTTGCAGCAGGTCTAGTATTTTCTGTA ATATTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATTTAGTTTGCATGATTACTATTTACGTTATGA CATATATTTCTCCTATATTCATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGACGGGTGGTT AAAAGTATGTATTTCATGTGCATTGCAGCCGGCAGTAGTAGCAGGTTTTATAGCTTTATTAATAACTATG TATGATTCTGCAATATTTAAAAATTGTGAATTCCTTAGATATGATTATGAAAAAGGGGATATTAGATTTA GCACTTTTGAGTTAAGGCTACCTAACGGAGGAGCAGATAAATGTCAGGAAAGTTTTGGATATAAAATGTT ACAATATTATGCAGGTGAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTGATACTTTTCCCAATAAAATCAATTGTTAAA GATGTTGTATCTATTTTAGCGGAACTTTTGTGCGTATTAGTATTTTCGGTTATTTTTTATTATTTCTCTA AATCTATAGGGCGATTTGCTTCTGATTTAACTAACGGTCCTAATATGGATGCAGTAACGGCAAGTCCAAC TAAAATCGTTGATTTAGTAAAGAAAGGAGCAGCTTTCCTTAAGGATGCGGCCATGGCTTCACAAGGTAAG CCGTCGGTAGGAGATAAGCCGGATGTTGGAGGTAAGCGTAAAGAGGGAGAGCAGCAAGGCGGGGATTCAG AAAGCGGTGCAGGCGGAGGATTAGCTGATTTAGCAAGCGGTTCGGGTGGAGGTAAATGA |
| Protein ID: 67458483 |
| T4SS name [ID] | VirB [501] |
| Gene symbol | virB6_3 |
| Locus tag | RF_0091 |
| Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 99973..102906 [+] |
| Product | TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | Q4UNB6 |
| KEGG ID | rfe:RF_0091 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9.9e-32, Aligned region: 616..855 |
| Protein Sequence: 977 a.a. [Download] |
| >gi|67458483|ref|YP_246107.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia felis URRWXCal2] MQSNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKVGDGCYMRYAPDGKGGSDSITGTITLNANANYVNTSK MLPDGTTQLIPDPNRYGEWLNTQVLVENNQPVNLQVVGQVSLCLAYVPKDNVQFTESTRPGKSNLDDKGN MIPIPRITDANNPPLSLIMDAKNNEWRNIAELYANDRVLVSVSPNFANTDATVEDAFKGTKVTKNCSQGQ TSYEPICGKYSVYHGEYVNDCEWRDKYWKCNYHHSCDTSFWGGCGLGCPCAFGKICCGEWICDSCGAWVN IRTSMPEAYKDDGSVTKAWSDNINNLFFDLFNLECSNNSKTLPNGQCPDAVRDRSPKNLDFIKGRCSGTW VEDQCNDGTVSTPELSNYKYFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDAGSVSQALPSKLEFAKFVADTDQPADYK DKDGKYLYKVIYNIPFNSNTEKSYLQYRLWSPTSQDASKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFDDRGR VQYIIVKPSENPNTSGKTYSPQGINVNSDGKYNFNANEAGYIWMKILNDPSNNLRDYKDSEGNYKVHFST SLKVGSFTIKVMNPLLELFKTKVQGAATSIFKNMVCYKANDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLG FAKINQKELVTRIAKIGVVSGLMNGNTFEFFNNYLFDAITNFSDAIIANMSGYSLYTSTNTISNPFMFLD AVMSKIFFSQTFIAQLLSLLSLGLSGIIYFIITFIAVGIVIITALRAVAVYIMAFMATCILIGIAPLFIS FLLFDFTRYLFDNWVRFTIRYMIEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPI ALLNVPIFCINWFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVAKLTSAAGPSATEIGGR MSHDAGQKALSPIGMDDKTRQGITGRAEARLKQRNKTLDQAEKNRKNTPKEGGEKTNAEPPQPEARG |
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| >gi|67458392|ref|NC_007109.1|:99973-102906 Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome, complete genome ATGCAGAGTAACTTATTAAAAGTTTTAGGAGTACTCGCTATAGTAGCAACATTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAGTCGGTGACGGCTGCTACATGAGATATGCCCCGGACGGTAA AGGAGGTTCAGATTCAATAACCGGTACTATAACACTTAATGCTAATGCTAATTATGTAAACACTTCTAAG ATGTTGCCCGATGGCACGACTCAGCTTATTCCTGATCCTAATCGTTACGGTGAATGGTTAAATACTCAGG TGCTAGTAGAGAACAATCAACCGGTGAATTTACAAGTGGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATGT ACCAAAGGATAATGTACAATTTACTGAAAGTACAAGACCTGGTAAATCTAATTTAGATGATAAAGGTAAC ATGATTCCGATTCCTCGTATTACCGATGCAAATAATCCGCCTCTCTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATA ATGAATGGCGTAATATTGCCGAATTATACGCTAATGATAGAGTTTTAGTTTCCGTATCTCCTAATTTTGC TAATACTGATGCGACAGTTGAGGATGCTTTTAAAGGTACTAAGGTTACGAAAAATTGTTCCCAAGGCCAA ACTTCTTATGAGCCGATTTGTGGAAAATATTCTGTTTATCACGGTGAATATGTTAATGATTGTGAATGGA GAGACAAATATTGGAAATGTAATTATCATCATTCCTGTGATACGAGTTTTTGGGGGGGGTGCGGTCTTGG GTGTCCATGTGCCTTTGGAAAAATATGTTGTGGGGAATGGATATGCGATTCATGTGGAGCATGGGTTAAT ATTCGTACTTCAATGCCAGAAGCTTATAAAGATGATGGTAGTGTTACAAAAGCGTGGAGTGATAATATAA ACAATTTATTTTTTGACCTCTTTAATTTAGAGTGTTCTAATAACTCCAAGACTCTTCCAAATGGTCAATG TCCTGATGCTGTTAGAGATCGTAGTCCTAAAAATCTAGATTTTATCAAAGGACGTTGCAGTGGAACATGG GTTGAGGATCAATGTAATGACGGAACTGTTTCAACACCGGAGCTTTCAAATTATAAATATTTTTGGTATA CGGCGGATGGTAAAGGAGGCAAAGGACCAACCGGATTAATATATCAAATGAATGATGCGGGCTCTGTAAG TCAAGCTCTGCCTTCTAAGCTAGAATTTGCTAAATTTGTTGCAGATACAGATCAACCGGCTGACTATAAA GATAAAGACGGTAAATATTTATATAAAGTTATATATAATATACCTTTTAATAGCAATACTGAAAAAAGCT ATTTACAATATAGGCTTTGGTCTCCCACCTCACAAGATGCTAGTAAGAATACGGGAGGATATGTTCTAAA TATTAAACAGACTAAATGTTATAGAGAAAACGGTAATAGTTTTAACGATACTTTTGATGATCGGGGGCGA GTGCAATACATAATAGTAAAGCCTTCGGAAAACCCGAATACTAGCGGTAAAACCTATTCACCTCAAGGAA TTAACGTTAATAGCGACGGTAAATATAACTTTAATGCGAATGAGGCGGGTTATATATGGATGAAAATTCT AAATGATCCTAGTAATAATTTAAGGGACTATAAAGATAGTGAAGGTAACTATAAAGTACATTTCTCAACA TCCTTAAAAGTAGGAAGTTTTACTATTAAAGTAATGAATCCGTTACTTGAGTTATTTAAAACTAAAGTAC AAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAAAAATATGGTATGTTATAAAGCTAATGATAGCTCGTCCTGTACTAA CTTTTTTACCTATATTAAAGCGATTTTAATTTTGTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTTTTGCTTGGT TTTGCTAAGATAAACCAAAAAGAGCTAGTAACTAGAATAGCAAAAATCGGGGTAGTTAGCGGACTTATGA ACGGTAATACCTTTGAATTTTTTAATAACTATCTTTTTGATGCAATTACTAATTTTTCAGACGCAATTAT TGCTAATATGAGTGGATATAGTTTGTATACTTCTACTAATACTATTTCTAATCCTTTCATGTTTTTAGAT GCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACCTTTATCGCTCAATTACTTTCACTTCTTTCTCTTGGGC TTAGCGGTATTATATATTTTATAATTACTTTTATTGCGGTTGGTATAGTAATTATTACGGCACTTAGAGC TGTTGCCGTTTATATTATGGCATTTATGGCAACTTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGT TTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTATTTATTTGATAATTGGGTGAGGTTTACGATCCGCTATATGATAG AACCGGTAGTTATGATGGCAGGTATTATAGTGCTAACCCAGCTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTT AGGTTATAGCGTTTGTTGGAAATGTGCTTTACCGATAAAAATTCCCTTTATCGGTACTATTTTACCTATT GCATTGCTGAATGTACCTATCTTCTGTATTAATTGGTTTGCCCCTTGGGGAATGGATTATATGTCGGGTA TGATGGGAGTAAATATGCAAAATATCGTAGCTCTAGTTATTATTGCTTATGGTATGTATGGTTATGTCGA ATTTTCAGGGCGTATGGTAGCAAAATTAACTAGTGCTGCCGGACCTTCGGCTACTGAAATTGGTGGTAGA ATGTCTCATGATGCAGGACAAAAAGCATTAAGTCCAATAGGAATGGATGATAAAACAAGACAAGGTATTA CCGGCAGAGCGGAAGCACGATTAAAACAACGCAATAAGACGCTCGATCAGGCTGAGAAAAATAGGAAAAA TACGCCAAAAGAAGGGGGCGAAAAGACAAATGCAGAACCGCCGCAGCCTGAAGCACGAGGATAG |
| Protein ID: 67458484 |
| T4SS name [ID] | VirB [501] |
| Gene symbol | virB6_4 |
| Locus tag | RF_0092 |
| Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 103135..105807 [+] |
| Product | TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | Q4UNB5 |
| KEGG ID | rfe:RF_0092 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2.9e-20, Aligned region: 520..714 |
| Protein Sequence: 890 a.a. [Download] |
| >gi|67458484|ref|YP_246108.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia felis URRWXCal2] MKILKSLVLLVLFMAMPAKADDAFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPEFTSFKEGNIGISLSTAGTWQSTGNS VEKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTDNNSATPGAI PPDKDLDALSFTKMSDSVKYFNYSNGNSRIEVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNTLDNILTQELDSSIFAAS ALYTQSNLGNFDNRIIYSSAKEVCDLIDASRDPDKPSGCSGTGSATKYKSINSNEALVGKPMITRAVQNF MGLINSCPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKERDQSFVNSGSTQSSFIYYQATSGGTMDFTSDW QVNNMFSNSVLMSDWSRNFSNYANFVDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGANSINPGDQQNISLEYL ITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFAADAPQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIKP ITDQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNIAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAVEVITRICKIAIVAFLIREE SWSFFNTYFFSAFTNGIDFFVTNVVGATSSRANIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAI ITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGLTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIF FLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISSSNILTN KANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYGLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMQDIGSVTKPIK KAAMAPARVFKDKIIDQNYKARKPEGGEHTNKFLAERNDVPKKEEGERKE |
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| >gi|67458392|ref|NC_007109.1|:103135-105807 Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome, complete genome ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATGGCGATGCCAGCTAAAGCTGATGATGCTT TTTCATGGATGTCAACCAGTTTTGGTGGGTTAAAAAGCTTATTTGGTTGTTTAGAAGTGCCTGAATTTAC AAGTTTTAAAGAAGGTAATATAGGAATTAGTTTATCTACAGCCGGAACTTGGCAATCAACAGGTAATAGC GTTGAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAACTGGTCTACTTCAGGTATTACTCCTGAACCTAGAAAATATC TAGTATTATATAGAATTGATCCAAGATTTAGTACGCCACAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAA ATTACAATTTGAAGCTTTAGGATTTCCTCGTTTTGTTACGGACAATAACAGTGCAACACCTGGGGCTATA CCGCCTGATAAAGACCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATTCTGTTAAATATTTTAACTATT CTAACGGTAATTCGAGAATTGAAGTTAAGGCTGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTGGTAAAGATAA TTTTTTTAGCCCTAATACTCTAGATAATATTTTAACGCAAGAACTTGATAGTTCAATATTTGCTGCTTCT GCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGAAATTTTGATAATAGAATAATTTACTCATCTGCAAAGGAGGTAT GCGATCTTATAGACGCTTCAAGAGATCCTGATAAACCAAGCGGGTGTAGCGGTACTGGCTCAGCTACAAA ATATAAAAGTATAAATAGTAACGAAGCATTAGTCGGCAAACCTATGATAACGAGAGCGGTACAGAATTTC ATGGGCTTAATTAATTCTTGTCCTGCTAATGCCGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTATTACGATCAAG GTAGAGGGATGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAAGGAACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTCAGG CAGCACTCAAAGTAGCTTTATATATTATCAAGCCACTAGCGGCGGTACTATGGATTTTACTAGCGATTGG CAAGTTAATAACATGTTTAGTAATTCAGTTTTAATGAGTGATTGGAGCCGAAATTTTTCAAATTATGCTA ATTTTGTAGATTATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTCGGTCGTTATTCGATGAT TGTTGAAATAGGTAATGGGGCAAATTCAATTAATCCGGGTGATCAGCAAAATATAAGTTTAGAATATTTA ATAACATCTGATGGTACATTACCTGATCCATCTGTTCGTGGTACACCGGTAGATTATAACTTTGCAGCCG ATGCACCGCAAGATGGATATTTATGGTTAAGGGTGGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTGGTTAG TGTAAATTATGCTAATTATACCGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATATATAACGGTGCTATTAAACCT ATTACCGATCAGTTTAGAACTTTTAGTCAAAACTTTTATATTAAGTTAGTTAAAAATTCTGCAGTACAGA ATATAGCTAAAGCTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGGCTAATGTTCGTTGCGGGAGCATTAAA ATTAACTGCCGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATAGCTATAGTAGCCTTTTTAATTAGAGAAGAA AGTTGGAGCTTTTTTAATACATACTTCTTTAGTGCATTTACTAACGGTATTGATTTCTTTGTAACTAACG TAGTAGGTGCTACAAGCTCTAGAGCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATACTAA CGGTAGGATTTGGGGATTACTATTTATTGAATTATTACAAATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCTATT ATAACCATTTATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGCTATGTTATTGCAT TTATAGGGCTAACTGTTATGATTTCATTAGCACCGTTTTTCATAATATTAATGTTATTTGAAAAAACTAA AAGTTTATTTGATAATTGGATATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTGCAGCCGACAATATTATTGATTTTC TTTTTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTAGTAGTTAGAGCTTGTTGGGATACTC TGATACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAACAAATCTTGGTATTCCGATTAATTTCTCTTTTACATTACC GTTCTTACCAGGAATACCTTTCTATGTACCGGATGTACCGGAAATTAGTAGCTCGAATATTCTAACGAAC AAGGCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTATTATTTTATTCATATTGCTTGATGTCATATG GTTTAGTAACTTTTGTAAATATAGTAGTTGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGAATATCAGGAAA TTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCGTTATGCAGGATATAGGTTCGGTAACAAAGCCGATTAAA AAGGCTGCAATGGCTCCGGCTAGAGTTTTCAAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAGAAAAC CGGAAGGAGGCGAGCATACAAATAAATTCCTTGCCGAGCGTAATGATGTACCGAAGAAAGAGGAAGGAGA GAGGAAAGAATAA |
| Protein ID: 67458485 |
| T4SS name [ID] | VirB [501] |
| Gene symbol | virB6_5 |
| Locus tag | RF_0093 |
| Strain | Rickettsia felis URRWXCal2 |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_007109] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 105951..109418 [+] |
| Product | TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | Q4UNB4 |
| KEGG ID | rfe:RF_0093 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 7.3e-25, Aligned region: 295..484 |
| Protein Sequence: 1155 a.a. [Download] |
| >gi|67458485|ref|YP_246109.1| TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein [Rickettsia felis URRWXCal2] MNKNIFITLLISSLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSSRYNPEEITSRQEGDQVAPWRDSAYKVNGYP LTVMVRPWSYILGDKNTSGQLSAWCPWYGQKNNTTTLAAFCVKLQPCTFWDNARLDMCTPNPANQNDAMI SNPPCIMTDGVGLYFLIAAKNTDPNISPDSQRKPQGITQHLGELTSSVGYEFYSISSTGQFLPAGGINYQ YKGEDKSKYAQSPLYFKIIDKFYDDNSGQYRLVIKSGVTDTRPDPLQFLTDLIKGVLFGKDGIIKKTYQQ IIDTPGYRMSVSAILTLYIMFTGFSFLIGNINLTHVELIVRILKVSIVSILLSTDKAWTFFHDYLFVFFI DGVQQILQIINEAAATGPGSQSLLGLLISPQTLSKLFSLLFVDWLGFIYIILYLIALYFIFFLIFKATII YLTALITIGMIIIMGPIFICFMLFNITRSLFENWLRQLISYALQPIILFAGIAFISMIIRTEIYSTLGFG VCKHDFPNLGPINEIFGSFLEDIDPSLGNSIFYWWFPVPMKGGINNFHKAKILVPEDHIIVDDSCKNDPD KCKHCAAYECIDERYIELPFLDLVKDAKRISNFINGKFVQLDGILLIFVSIYLLSKFNDTAISTAQFIAG TSGNLTDIQKVNQQSYESAAKQMNRPLSYVAKTVSVPVTTRVSAKLEETSMFFAKGFEDIMMGRLEKQAL GSSANKAVQNEVKRKYGIDSKDVKMNAITDYENGISGLLKNLPKGNELKAKELSQMKFTQLRDKIAANKY GVKDYAALSEEQKRELDKSLKDANLRELASDANFTKDYQDAYKYAHQEMSGRGVGLFGKNIKPLRSWQEM EHRVDTKRKLKEERRVGIGEKLYAGYTGIKRGALTAIVGKDLRDAYEGNLTSAEWHDFEYNDPRLRTYSE KLKDDEKAREREELQMHINKETLAAQADILSPEYLARLEKAGRQSDVEYYQELAQRKLIHEVRGRLFEEG EPVMMGDRFMREKATDSQMRDMIDNAHRKHAEFIEGDRYTRRQEHYDIMHEKAEGNLEQTYKELKDHFKR DDINIEEMPALIAQKIKDTEQGPEVDAKITEELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDQ INKYRENAKMEKYVRPIVNEGRKLRKLEDHLRGMK |
| Nucleotide Sequence: 3468 bp [Download] |
| >gi|67458392|ref|NC_007109.1|:105951-109418 Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome, complete genome ATGAACAAAAATATTTTTATTACATTATTAATATCATCGTTATTACTGCTTTCCGGTTGTACCGGCGATA CTTGTATTGACCCTGATGATTTCGGTTTTATCAAATTCAATGTCTCTTCTAGATATAATCCGGAAGAAAT TACTTCAAGACAGGAAGGTGATCAGGTAGCACCATGGCGTGATAGTGCTTATAAAGTAAATGGTTATCCT TTAACCGTTATGGTAAGACCGTGGAGTTATATACTTGGTGATAAAAATACTTCAGGTCAGTTATCTGCAT GGTGTCCGTGGTACGGTCAGAAAAATAACACAACTACTTTGGCTGCTTTTTGCGTTAAGCTACAACCGTG TACTTTTTGGGATAATGCTAGACTTGATATGTGTACTCCTAATCCCGCAAATCAAAATGACGCAATGATT AGTAATCCTCCATGTATAATGACAGACGGGGTCGGGCTTTATTTTCTTATTGCCGCTAAAAATACCGATC CCAATATTTCACCGGACTCACAGCGTAAACCGCAAGGTATAACTCAGCATTTAGGAGAACTTACTTCGAG TGTAGGCTATGAATTTTATAGTATTAGTAGTACAGGACAATTCTTGCCAGCAGGGGGAATAAATTATCAA TATAAAGGTGAGGATAAGTCAAAATATGCTCAATCTCCTCTTTATTTTAAGATTATAGATAAATTTTATG ATGATAATAGCGGGCAATATAGATTAGTAATCAAGTCCGGAGTTACTGATACTAGACCCGATCCGTTACA ATTTTTAACGGATTTAATAAAAGGAGTATTATTTGGTAAGGATGGGATTATAAAGAAAACTTATCAACAA ATAATTGATACTCCGGGTTATAGGATGAGTGTCTCGGCTATTTTAACTCTATATATAATGTTTACGGGCT TTTCCTTTTTAATAGGTAATATAAACCTTACTCATGTCGAACTTATAGTTAGAATATTAAAAGTTAGTAT AGTCTCAATATTATTAAGTACGGATAAAGCTTGGACATTTTTTCATGATTATTTATTCGTATTTTTTATT GACGGGGTTCAGCAAATACTGCAAATAATTAATGAAGCTGCGGCTACCGGTCCTGGTTCTCAAAGTTTGC TAGGGTTACTTATTTCTCCTCAAACTTTATCTAAATTATTTTCTTTACTATTTGTTGATTGGCTTGGTTT TATATATATCATTCTATATTTAATAGCCCTATATTTTATTTTCTTTCTTATATTTAAAGCTACTATTATA TATCTAACCGCTCTTATAACTATCGGTATGATTATAATTATGGGACCGATATTTATTTGTTTCATGTTAT TTAATATAACTCGTTCGTTATTTGAGAATTGGTTAAGACAATTAATATCATATGCATTACAGCCTATAAT TTTATTTGCCGGTATCGCTTTTATTTCAATGATCATCAGAACCGAAATATATTCAACTCTTGGTTTTGGG GTATGTAAACATGATTTTCCTAATTTAGGTCCGATAAATGAAATATTCGGTAGTTTTCTTGAGGATATAG ATCCAAGCCTTGGTAATTCAATATTTTATTGGTGGTTCCCTGTACCAATGAAAGGAGGTATAAATAATTT CCACAAAGCAAAGATATTAGTCCCTGAAGATCATATAATAGTAGATGATTCTTGTAAGAATGACCCTGAT AAATGTAAGCATTGTGCTGCGTATGAGTGTATAGATGAACGCTATATTGAATTACCGTTTTTAGATTTAG TTAAAGATGCAAAAAGGATTAGTAATTTTATAAACGGGAAATTTGTCCAACTTGATGGGATATTACTAAT TTTCGTGTCTATTTATTTGCTAAGTAAATTTAATGATACTGCTATATCGACGGCACAATTTATTGCCGGT ACTTCAGGTAATTTAACAGACATACAAAAAGTTAATCAGCAATCTTATGAATCTGCAGCGAAGCAAATGA ATAGACCATTAAGTTATGTAGCTAAGACGGTAAGTGTACCTGTAACTACCCGTGTAAGTGCAAAGTTAGA AGAAACTAGTATGTTCTTTGCTAAAGGATTTGAAGATATAATGATGGGAAGGCTTGAAAAGCAAGCTCTC GGTTCTTCAGCAAACAAAGCCGTACAAAATGAGGTTAAGAGAAAATACGGTATAGATTCTAAAGATGTAA AAATGAATGCTATTACTGATTATGAAAACGGTATTTCAGGATTGTTAAAGAATTTACCTAAAGGGAATGA ATTAAAAGCAAAAGAACTATCGCAAATGAAATTTACTCAGCTTCGAGATAAAATTGCTGCAAATAAATAT GGAGTAAAAGATTACGCCGCTTTAAGTGAAGAACAAAAAAGAGAGCTTGATAAGTCATTAAAAGATGCTA ACTTACGTGAACTCGCTAGCGATGCGAACTTTACTAAAGATTATCAAGATGCTTATAAATATGCTCACCA AGAAATGTCAGGGCGAGGTGTCGGTCTGTTCGGTAAAAATATAAAACCGCTTAGAAGTTGGCAAGAGATG GAGCATCGTGTTGATACAAAACGTAAATTAAAAGAAGAAAGGCGTGTAGGTATAGGTGAAAAACTCTATG CCGGTTATACGGGAATAAAAAGAGGAGCTTTAACTGCAATAGTCGGTAAAGATTTACGTGATGCTTATGA GGGTAATCTAACCAGTGCCGAATGGCATGATTTTGAATATAACGATCCAAGGCTTAGAACTTATAGCGAA AAATTAAAAGATGATGAAAAAGCACGGGAACGTGAAGAGCTCCAAATGCATATTAATAAGGAAACATTAG CTGCTCAAGCAGATATATTATCACCGGAATATCTAGCAAGACTAGAAAAAGCAGGTAGACAGAGTGATGT AGAATATTATCAAGAATTAGCTCAAAGAAAGCTTATTCATGAGGTGCGTGGTAGGTTATTCGAGGAAGGT GAACCGGTAATGATGGGCGACCGATTTATGCGTGAGAAAGCTACTGATTCTCAGATGCGAGATATGATAG ATAACGCCCATAGAAAACATGCAGAATTTATAGAAGGAGATCGATATACTCGTCGCCAAGAGCATTATGA TATTATGCACGAGAAAGCTGAAGGAAATTTAGAACAAACTTATAAAGAGCTTAAAGATCATTTCAAAAGA GATGATATCAACATTGAGGAAATGCCGGCATTAATAGCACAAAAGATCAAAGATACTGAGCAGGGACCTG AAGTAGACGCAAAGATTACGGAAGAGCTTAATAACTTTAATGCTGATGTTAAAAATTATGAATATAGTAC TGAAGTATTAAATAAAATAGAGGATAGAAAGCAAGCTATTACCGATGAAGTCAATGCTCAGATCGATCAG ATTAATAAATATAGGGAAAATGCCAAAATGGAAAAATATGTGAGACCAATAGTAAATGAAGGCAGAAAAC TAAGAAAATTAGAAGATCATTTGAGAGGGATGAAATAG |