| Protein ID: 51473246 |
 T4SS name [ID] | VirB [498] |
| Gene symbol | virB4a |
| Locus tag | RT0033 |
| Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 44546..46963 [-] |
| Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | Q68XX1 |
| KEGG ID | rty:RT0033 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 7e-68, Aligned region: 194..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 7.1e-37, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 1.3e-05, Aligned region: 444..576 |
| Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
| >gi|51473246|ref|YP_067003.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia typhi str. Wilmington] MKLFRTRTAKELRSKQERPTSHFIPYRCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDLDIKKNIRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGAKSFFNELYISILY KPDTGGAAIVEYFLKKLRQKSNKTAWENDMKEMKENLQEMSTRVINTFRSYGAKLLGVRQTQSGIYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEVRSPFGKKYAGIISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFANRTVAIGKMKLQQNRMIQSGDKATSQIVEINTALDMATSGDIGFGDHHLSLLCS AKNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLHLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LEKKDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQRARVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSSISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGIDAVVAKVNLEGMDNIISVL SGRVETVILLDQIRDKYGNDPDKWLPIFYEAVKTL |
| Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
| >gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c46963-44546 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGAAGTTATTTAGAACTAGAACAGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGAAAGACCAACTTCGCATTTTA TCCCTTATAGGTGTCATTGGGATAGTAATACTATTTTAACAAAAGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAA AATCAATGGATTTTCTTTTGAAACTGCCGATGATGAAGATTTAGACATTAAAAAGAATATCAGAAATGCC TTGCTTAAAAATATGGCTTCTGGAAACATTGTTATGTATTTCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAA TATTTGACGATACAGAATTTACTTATGATCCTACCGTAAAAGTACCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG TGCAGAGTGGCGTAAGAAACATGCAGGTGCTAAATCATTTTTTAATGAATTATATATTAGTATTTTATAT AAGCCTGATACTGGCGGTGCTGCTATAGTTGAGTATTTTTTAAAGAAGCTTAGACAGAAATCTAATAAAA CTGCTTGGGAAAATGACATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACGAGAGTGATTAATAC ATTCAGAAGTTATGGAGCAAAATTACTTGGAGTCCGTCAAACACAGTCAGGTATCTATTGTGAAATTTTA GAATTTCTTTCATCTTTAATTAATTGCGGTGATTCACCAGGACCTATAGCATTACCGCGTGGTACTATTG ATGAATATTTACCAACACATAGATTATTTTTTGATTCTCGTACTATTGAAGTCAGAAGTCCTTTTGGCAA GAAATATGCTGGCATCATCAGTATACTTGAATACGGTCCTAATACTTCTGCGGGAATTTTTGATGGATTT CTACAAATGCCTTTTGAATTTGTTATGACTCAAAGCTTTGTATTTGCTAATAGAACTGTAGCAATTGGTA AAATGAAATTACAGCAAAATAGAATGATACAATCCGGTGATAAGGCGACTTCACAAATTGTTGAAATCAA TACAGCACTTGATATGGCTACTAGCGGTGATATTGGTTTTGGAGATCATCATTTATCACTTTTATGTTCC GCAAAGAATATTAAAGCTTTAGAAGATATATTATCAATGGCAGCAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTC AGCCGGTGAGAGAAAAAGTGAACATGGAACCTAGCTATTGGGGTCAATTACCTGGAAATATGGATTATAT AGTGCGTAAATCGACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTTGCTTCGCAACATAATTATCCACTCGGT AAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTGCTTGATACAACTTCAGGTACACCGTTTTATT TTAATTTTCATGTTAGAGATGTGGGACATACTCTAATTATAGGTCCAACGGGTGCCGGTAAAACAGTGCT TATGAACTTCTTATGTGCTGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGCGGA GCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAATGGAGTTTATACAGTAATTGATCCTGGTTTAAAATGCAACTTTA ATCCTTTGCATCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACGTTTATTTTAGAATGGCTTCGCGTACTTGTAAC TTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTATCACAAGCTGTAAGTGGCAATTTTAGA TTAGAAAAAAAAGACAGAAGGCTTAGTAACGTTATTGCATTCCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTAG CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTTGGTAAAGGTTCACACGCTAAGATATTTGATAATGAAATAGATGATAT CGATTTACAAAGAGCAAGGGTATTTGGTTTTGATATGACGGAATTACTTAAAGATCCTGTAAGTCTTGCA CCGGTATTGTTATATATTTTTCATCGTATTAATATATCTTTAGATGGACAAAAAACGATGATAGTACTTG ATGAAGCATGGGCTTTAATTGACAATCCAGTATTTGCGCCTAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAG AAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTAGAAGATGCTGCAAAAAGTAGTATTAGTGAT ACGTTGATTCAACAAACAGCCACACAGATTTTTTTACCTAATTTAAAAGCTACGGATATTTATCGTAGTG CATTTATGTTAAGTCAGCGCGAATATATTTTAATTAAAACTACCGATCCTACTACACGTTATTTTTTAAT AAAACAAGGAATAGATGCCGTAGTTGCGAAAGTTAACTTAGAAGGTATGGATAATATAATTAGTGTTTTA TCTGGCAGAGTTGAAACTGTAATATTGCTTGATCAAATTAGAGATAAATACGGCAATGATCCGGATAAGT GGTTACCTATATTTTATGAAGCAGTTAAAACATTATAG |
| Protein ID: 51473952 |
| T4SS name [ID] | VirB [498] |
| Gene symbol | virB4b |
| Locus tag | RT0771 |
| Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 982177..984609 [+] |
| Product | VirB4 protein precursor |
| Component type | VirB4 |
| UniProt ID | Q68VW5 |
| KEGG ID | rty:RT0771 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 3.9e-51, Aligned region: 183..383 AAA_10 [PF12846], Evalue: 3.5e-08, Aligned region: 436..612 |
| Protein Sequence: 810 a.a. [Download] |
| >gi|51473952|ref|YP_067709.1| VirB4 protein precursor [Rickettsia typhi str. Wilmington] MFSDLRKFDKDIYNYNAPNFIPIACHYNENTLLTKDGKLLQIVKIHGINSEKISDNIQNLREMVRLAIKK HITDYDFAFWLHTIREKQNLDDTTPYKKLLPANIHTLWQRKNHWNDKFVNTLYISIIHDSAKIQIKNFSS LINSLSYKLITNFENTYLDSAFKKLENITNNILDDLNEFGAEKLGIIFENDNVFSNTLFLYNRIANLNDN DCLVPIIDLSNALGRSIYTISGDKIVVTDHAKNNKFVSLLSIKEYQETPSNTLDKFLQLPIELIITEIFY FVSKKQIISKLHGQDHILKITNDSILLNHKGINKFDEANVDFQFCNQQISIAVIEEDENKLAKAVAKAST ELFKLGIIHVKEDINIEQIFWSQLPANFAFIRRISPLSVEHIASFTALHNTTLGNQYNPWGRAITLLRTE KGTPYFMNFHDKTNKGNTCIFGTEKTGKTVLLNFLISESTKYEPTIIYISNNNDSKIFIEAIEGKWLEPD KQIINPFLVDDTEQSQAFILEFLKLISGHYISPLSEIEISFLEKLKNKILSIEKEKRIFSNILKLANFKE EGGIQIFDKLKVFTEGQLYYGLFDGPSLNIKEGEVIGFNLYTLSDEPFSKQFYPMERKFLEQFNHNLKKH QSISAAVIYALSYNLSILGTKPKIFAADNFDQLYRPESYYDNINLIYNNLSENNGIFVSNFNFIYLKSYP KYTIKPWLDLINTKIILPSDVKIEDLDKILGLSELEIRKLSQLILSARMFLINKDNESIASELSIAALIG IVRILSSRQEEMDIYKKILQEHNGPPDNWINYLYNALNIY |
| Nucleotide Sequence: 2433 bp [Download] |
| >gi|51473215|ref|NC_006142.1|:982177-984609 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome GTGTTTAGTGATTTACGGAAATTTGACAAAGATATATATAATTATAATGCGCCTAATTTTATACCTATAG CATGTCATTATAATGAAAATACTTTACTTACCAAAGACGGTAAATTACTACAAATTGTAAAAATACACGG TATTAACTCAGAGAAAATAAGCGACAATATACAAAATTTACGTGAAATGGTTAGACTTGCTATAAAAAAG CATATAACCGATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACACACAATACGAGAAAAACAAAACTTAGACGATACCA CGCCTTATAAAAAATTATTACCAGCCAATATACATACACTATGGCAAAGAAAAAACCATTGGAATGATAA ATTCGTTAATACTTTATATATATCTATAATACATGATTCTGCTAAAATTCAGATCAAAAATTTTAGTTCT TTAATAAATTCATTATCTTATAAATTAATTACTAATTTTGAAAATACATACTTAGATTCAGCTTTTAAAA AACTAGAAAATATCACCAATAATATTTTGGACGATTTAAATGAATTTGGGGCTGAAAAACTTGGGATAAT ATTTGAAAATGATAATGTTTTTTCTAATACTTTATTTCTATATAATCGCATAGCTAATCTTAACGATAAT GATTGTTTGGTGCCTATAATAGATTTATCCAATGCATTAGGTAGAAGCATTTATACAATTAGCGGCGATA AAATAGTAGTTACAGATCATGCAAAAAATAACAAATTTGTTTCTTTATTATCTATCAAAGAATATCAAGA AACTCCTTCTAATACACTGGATAAATTTTTGCAATTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTAC TTTGTTAGCAAAAAACAAATAATATCCAAATTGCATGGTCAAGATCATATTCTTAAAATTACTAACGACT CAATTTTACTTAATCACAAAGGAATTAATAAATTTGATGAAGCTAACGTAGATTTTCAATTTTGTAACCA GCAAATTTCGATTGCAGTTATAGAAGAAGATGAAAATAAACTAGCCAAAGCTGTAGCAAAAGCATCAACA GAACTCTTTAAGCTTGGTATTATTCATGTAAAAGAAGATATTAATATCGAGCAAATATTTTGGTCACAAT TACCTGCTAACTTTGCTTTTATACGCAGAATATCACCACTATCTGTTGAACATATTGCGTCTTTTACTGC TCTACATAATACTACACTCGGTAATCAATATAATCCCTGGGGCAGGGCTATAACTTTACTGCGAACTGAA AAAGGTACACCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACAAATAAAGGTAATACTTGCATCTTTGGTACAG AAAAAACTGGCAAAACCGTATTATTGAACTTTTTAATATCAGAATCAACCAAATATGAACCAACAATAAT TTATATTTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATTGAGGCAATAGAAGGCAAATGGTTAGAACCGGAC AAACAAATTATCAATCCATTTTTAGTAGATGATACAGAACAATCACAAGCTTTCATTTTAGAATTTTTAA AATTAATCAGTGGTCATTATATTTCACCACTTAGTGAAATCGAGATATCTTTTCTAGAAAAATTGAAAAA TAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCTAACATTTTAAAATTAGCAAATTTTAAAGAG GAAGGAGGAATACAAATATTTGATAAACTTAAAGTTTTTACTGAAGGACAATTATATTACGGATTATTTG ATGGGCCATCTCTTAACATTAAAGAAGGCGAAGTGATAGGGTTTAACTTATATACACTTTCTGATGAGCC GTTTTCTAAACAATTCTATCCAATGGAGAGAAAATTTTTAGAACAATTTAATCATAATTTAAAAAAACAC CAAAGTATTAGTGCAGCAGTAATTTATGCTTTGAGTTATAATTTAAGCATACTTGGCACAAAACCTAAAA TATTTGCTGCTGATAATTTTGATCAACTTTACAGACCTGAATCTTATTATGATAATATAAATTTAATCTA TAATAATTTATCAGAAAATAATGGTATTTTTGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAATCATATCCA AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATACTGCCCTCTGACGTTAAAATAG AAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAGTGAATTGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGC AAGAATGTTCTTAATTAATAAAGATAATGAATCAATTGCTTCTGAATTAAGTATTGCAGCTTTAATAGGT ATTGTACGTATTTTATCAAGCAGACAAGAGGAAATGGATATTTATAAAAAAATACTTCAAGAACATAACG GTCCTCCAGATAATTGGATTAATTATCTATATAATGCGTTAAATATATACTAA |