Protein ID: 51473246 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | virB4a |
Locus tag | RT0033 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 44546..46963 [-] |
Product | type IV secretion system ATPase VirB4 |
Component type | VirB4 |
UniProt ID | Q68XX1 |
KEGG ID | rty:RT0033 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | CagE_TrbE_VirB [PF03135], Evalue: 7e-68, Aligned region: 194..399 AAA_10 [PF12846], Evalue: 7.1e-37, Aligned region: 452..727 AAA_23 [PF13476], Evalue: 1.3e-05, Aligned region: 444..576 |
Protein Sequence: 805 a.a. [Download] |
>gi|51473246|ref|YP_067003.1| type IV secretion system ATPase VirB4 [Rickettsia typhi str. Wilmington] MKLFRTRTAKELRSKQERPTSHFIPYRCHWDSNTILTKDNSLLQVIKINGFSFETADDEDLDIKKNIRNA LLKNMASGNIVMYFHTIRRRKAVIFDDTEFTYDPTVKVPNDFITYLGAEWRKKHAGAKSFFNELYISILY KPDTGGAAIVEYFLKKLRQKSNKTAWENDMKEMKENLQEMSTRVINTFRSYGAKLLGVRQTQSGIYCEIL EFLSSLINCGDSPGPIALPRGTIDEYLPTHRLFFDSRTIEVRSPFGKKYAGIISILEYGPNTSAGIFDGF LQMPFEFVMTQSFVFANRTVAIGKMKLQQNRMIQSGDKATSQIVEINTALDMATSGDIGFGDHHLSLLCS AKNIKALEDILSMAAVELSNSGIQPVREKVNMEPSYWGQLPGNMDYIVRKSTINTLNMASFASQHNYPLG KIRDNHWGEYVTVLDTTSGTPFYFNFHVRDVGHTLIIGPTGAGKTVLMNFLCAEAQKFKPRMFFFDKDRG AEIFIRALNGVYTVIDPGLKCNFNPLHLEDTSENRTFILEWLRVLVTSNGESLTAQDNKILSQAVSGNFR LEKKDRRLSNVIAFLGIDTPNSLASRIAMWVGKGSHAKIFDNEIDDIDLQRARVFGFDMTELLKDPVSLA PVLLYIFHRINISLDGQKTMIVLDEAWALIDNPVFAPKIKDWLKVLRKLNTFVIFATQSVEDAAKSSISD TLIQQTATQIFLPNLKATDIYRSAFMLSQREYILIKTTDPTTRYFLIKQGIDAVVAKVNLEGMDNIISVL SGRVETVILLDQIRDKYGNDPDKWLPIFYEAVKTL |
Nucleotide Sequence: 2418 bp [Download] |
>gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c46963-44546 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGAAGTTATTTAGAACTAGAACAGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGAAAGACCAACTTCGCATTTTA TCCCTTATAGGTGTCATTGGGATAGTAATACTATTTTAACAAAAGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAA AATCAATGGATTTTCTTTTGAAACTGCCGATGATGAAGATTTAGACATTAAAAAGAATATCAGAAATGCC TTGCTTAAAAATATGGCTTCTGGAAACATTGTTATGTATTTCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAA TATTTGACGATACAGAATTTACTTATGATCCTACCGTAAAAGTACCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG TGCAGAGTGGCGTAAGAAACATGCAGGTGCTAAATCATTTTTTAATGAATTATATATTAGTATTTTATAT AAGCCTGATACTGGCGGTGCTGCTATAGTTGAGTATTTTTTAAAGAAGCTTAGACAGAAATCTAATAAAA CTGCTTGGGAAAATGACATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACGAGAGTGATTAATAC ATTCAGAAGTTATGGAGCAAAATTACTTGGAGTCCGTCAAACACAGTCAGGTATCTATTGTGAAATTTTA GAATTTCTTTCATCTTTAATTAATTGCGGTGATTCACCAGGACCTATAGCATTACCGCGTGGTACTATTG ATGAATATTTACCAACACATAGATTATTTTTTGATTCTCGTACTATTGAAGTCAGAAGTCCTTTTGGCAA GAAATATGCTGGCATCATCAGTATACTTGAATACGGTCCTAATACTTCTGCGGGAATTTTTGATGGATTT CTACAAATGCCTTTTGAATTTGTTATGACTCAAAGCTTTGTATTTGCTAATAGAACTGTAGCAATTGGTA AAATGAAATTACAGCAAAATAGAATGATACAATCCGGTGATAAGGCGACTTCACAAATTGTTGAAATCAA TACAGCACTTGATATGGCTACTAGCGGTGATATTGGTTTTGGAGATCATCATTTATCACTTTTATGTTCC GCAAAGAATATTAAAGCTTTAGAAGATATATTATCAATGGCAGCAGTTGAGCTTTCTAATTCAGGAATTC AGCCGGTGAGAGAAAAAGTGAACATGGAACCTAGCTATTGGGGTCAATTACCTGGAAATATGGATTATAT AGTGCGTAAATCGACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTTGCTTCGCAACATAATTATCCACTCGGT AAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTGCTTGATACAACTTCAGGTACACCGTTTTATT TTAATTTTCATGTTAGAGATGTGGGACATACTCTAATTATAGGTCCAACGGGTGCCGGTAAAACAGTGCT TATGAACTTCTTATGTGCTGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCTTTTTTGATAAAGATCGCGGA GCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAATGGAGTTTATACAGTAATTGATCCTGGTTTAAAATGCAACTTTA ATCCTTTGCATCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACGTTTATTTTAGAATGGCTTCGCGTACTTGTAAC TTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATCTTATCACAAGCTGTAAGTGGCAATTTTAGA TTAGAAAAAAAAGACAGAAGGCTTAGTAACGTTATTGCATTCCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTAG CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTTGGTAAAGGTTCACACGCTAAGATATTTGATAATGAAATAGATGATAT CGATTTACAAAGAGCAAGGGTATTTGGTTTTGATATGACGGAATTACTTAAAGATCCTGTAAGTCTTGCA CCGGTATTGTTATATATTTTTCATCGTATTAATATATCTTTAGATGGACAAAAAACGATGATAGTACTTG ATGAAGCATGGGCTTTAATTGACAATCCAGTATTTGCGCCTAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAG AAAATTAAATACTTTTGTTATATTTGCTACGCAGAGTGTAGAAGATGCTGCAAAAAGTAGTATTAGTGAT ACGTTGATTCAACAAACAGCCACACAGATTTTTTTACCTAATTTAAAAGCTACGGATATTTATCGTAGTG CATTTATGTTAAGTCAGCGCGAATATATTTTAATTAAAACTACCGATCCTACTACACGTTATTTTTTAAT AAAACAAGGAATAGATGCCGTAGTTGCGAAAGTTAACTTAGAAGGTATGGATAATATAATTAGTGTTTTA TCTGGCAGAGTTGAAACTGTAATATTGCTTGATCAAATTAGAGATAAATACGGCAATGATCCGGATAAGT GGTTACCTATATTTTATGAAGCAGTTAAAACATTATAG |