Protein ID: 51473245 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RT0032 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 41020..44427 [-] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q68XX2 |
KEGG ID | rty:RT0032 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 3.4e-11, Aligned region: 505..580 |
Protein Sequence: 1135 a.a. [Download] |
>gi|51473245|ref|YP_067002.1| VirB6-like protein of the type IV secretion system [Rickettsia typhi str. Wilmington] MALFPRGILIALVLSFVLNLGLVTKIHAKDTLDSIIDILSGLTCETQGVGDLMRTEFSHTCIVAPFFTFA VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCTRENRIDPKNPELHFALCSNAKLIVSRAKSVT ESALAIAKAVLTWSDPWDDIKQAWENKKKEYHIPYRGKPGDDGFAFDVGFPVIYWKVIQDRDRICVSTKG FTGDVPVGCKYMKEPFPKSIYNSFIDVEDKNFIKDSTNDTPSDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAIV MTSPLIECIRQMIARLLISKDVCSFDNVDQVVNLASRQDSALFQFQVGMHKIVTAFLTLYVMFFGFKLLL AGKVPPKSEYINFILKIIFVTYFSIGININPSNGSQYDRLDGMIQWVFPFLLNGISGLANWVMNAAPSGL CKFNNISYDKSVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENSYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLIIPAII SGNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFAYTRNYFDSWVKLMISFLL QPMVVVTFMITMFAVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKMQGGIKSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDSV ESCKNSLGYMLNNPINTAFNFAKDNISEIVNSKPGETTTDEFLSKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKI KNIFLALITACFTLYLMYNFSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAALANAGTATKGIDQIAS RGGGGGARDLIGAKGLVSDNIASSGGAVGDNIASSGGAVGDNIAVSGAASTPTVTTTTASSSIANSMTKT IGDDVRSDIVTPHASTTAVPQHSSINTTIPTSVSPNIKSTSLKEIIRDNQENEKEIDNTTRAQEKIKSSS KVSGLIDYSFNLKEHDNPTGIKQIRENAEIRDKRVEVEKAWNELVASGGGRIRDQQSEETSEQRTNAEKK WNEFVDSGVVTEIREIDNSVNNKLADKLDKSEKSKIEENKNIENNIKVYNTNTLPQEKVNNTDKSSGLID YSFNLKEHDNPTGVKQIRENAEIRDKRVKVEKAWNELVASGGGRVKEQAGGKITERRANAEKVWDDLVKS GVVKEKKDNSSNENS |
Nucleotide Sequence: 3408 bp [Download] |
>gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c44427-41020 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGGCATTATTCCCTCGTGGTATACTGATAGCATTAGTACTGAGCTTTGTCCTAAATTTAGGTCTAGTGA CTAAAATTCATGCTAAAGATACTCTTGATAGCATTATAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACACA AGGTGTAGGTGATTTAATGCGTACTGAATTTTCACATACATGTATTGTCGCTCCGTTTTTTACTTTTGCG GTAATGAATCTTGTATCTCCCGTTTTATACATGAATACATTTTTAAAGCTTAAAATAAATGACAGTGATT TATTTAACGATAGTAATTTTGGGAATTTTCCCGGAGGTCAATGTACTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA AAATCCAGAATTACATTTTGCTCTATGTAGTAATGCTAAATTAATTGTATCGCGTGCAAAATCAGTTACA GAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTCTTAACATGGAGTGATCCTTGGGATGATATAAAGCAAGCGT GGGAAAATAAAAAAAAGGAATATCATATTCCATATAGAGGTAAGCCTGGTGATGACGGTTTTGCATTTGA TGTAGGCTTCCCTGTAATATATTGGAAAGTTATTCAAGATAGAGATAGAATATGTGTCTCAACAAAAGGG TTTACAGGAGATGTGCCAGTCGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCAAAATCCATATATAATAGTT TTATTGATGTAGAAGATAAGAATTTTATTAAAGATTCAACAAATGACACACCTAGCGATCCTTTAGCTTT AGTTTCCTGTAGTGCTGCAGGAGATGGGTGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAATAGTC ATGACTTCTCCTCTTATAGAATGTATAAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGATGTTTGTA GTTTTGATAATGTAGATCAAGTTGTGAATTTGGCATCAAGACAAGATAGTGCATTATTTCAGTTCCAAGT AGGCATGCATAAAATAGTTACGGCTTTTTTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGTTTTAAGTTATTACTT GCAGGTAAAGTGCCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATAATATTTGTAACTTATTTTT CAATAGGAATTAATATAAATCCTTCTAATGGTTCTCAGTATGATCGGTTAGATGGAATGATTCAGTGGGT GTTTCCTTTCTTACTTAACGGTATAAGCGGTTTAGCAAATTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCTGGTTTA TGTAAATTTAATAATATTTCTTATGATAAAAGTGTTTCATATATTGCATTATGGGATGCATTAGATTGTA GAGTTGCTCATTATTTAGGACTTGATATATTATCTACTTTACTTGTAGAAAATTCGTATCGAAGCCATGA TTTTTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCCCCACCATATATTTATTTAATAATTCCAGCAATAATC TCTGGTAATATGATGTTGGTATCACTTGCACTTTCTTACCCGTTACTGGTGATTTCTGTCGCTGCATTTA TGGTTAATGCAACAATTATGTGTATGATATCTATAGTCATACTCGGTATTCTAGCTCCTCTTTTCGTGCC TATGTTCTTATTTGCGTATACACGAAATTATTTTGATAGCTGGGTTAAGCTGATGATTTCATTCTTGCTA CAGCCTATGGTAGTAGTCACGTTTATGATTACGATGTTTGCAGTATATGATTATGGCTTTTATGGTAAAT GTCAATATAAGAGCAAGTTAATTCATAATAGCATAGAAGATAAAATGCAAGGTGGTATAAAATCTAAGAG AGATGTTTTAATATTTTATATTAATAATGATTGGGATGACACATCACAATATCCTGATAAAGATTCAGTA GAGAGTTGTAAAAATAGTTTAGGGTATATGTTAAATAACCCTATTAATACAGCATTTAACTTTGCAAAAG ATAATATCAGTGAAATAGTTAATAGTAAACCTGGTGAGACCACTACTGATGAATTTCTTTCTAAATTTCA GTTTTTATCAGGAGTTGTTTTGGGTCCTGGTATGTTTTTTATGTCGCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATT AAAAATATTTTTCTTGCATTAATTACTGCATGTTTTACATTGTATTTAATGTATAATTTTAGTAGTCAAC TAGCTGAATTTGCTGCAGATATGACAGAAGGAGTTGCGCTTAATAATGTTGCTATCAAGCCACAAGCAAT ATTTAAGGCAGCTATGGCAGCGCTTGCTAATGCTGGTACTGCAACTAAGGGTATAGATCAGATAGCAAGC CGTGGAGGAGGTGGAGGTGCACGTGATTTAATTGGAGCTAAAGGATTGGTAAGTGATAATATAGCTTCAA GTGGAGGTGCTGTCGGTGATAATATAGCTTCAAGTGGAGGTGCTGTCGGTGATAATATTGCTGTGAGTGG AGCTGCGTCAACACCTACAGTAACAACAACTACAGCTTCGTCTTCAATAGCAAATTCTATGACAAAAACT ATAGGTGATGATGTAAGATCAGATATTGTCACTCCTCATGCTTCTACAACAGCTGTTCCACAGCATTCTA GCATTAATACTACTATTCCTACATCTGTATCACCTAATATTAAATCTACAAGTCTTAAGGAAATTATTAG AGATAATCAAGAAAATGAAAAAGAGATCGATAATACTACGCGTGCACAAGAAAAAATTAAAAGTTCAAGT AAAGTTTCAGGACTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGATAATCCAACAGGAATAAAACAGA TAAGGGAAAATGCAGAGATTCGTGATAAACGTGTAGAAGTAGAGAAAGCATGGAACGAATTAGTGGCAAG TGGTGGAGGCAGAATAAGAGATCAACAAAGTGAAGAAACATCGGAGCAACGTACTAATGCAGAAAAGAAA TGGAATGAATTTGTTGATAGCGGTGTAGTAACTGAAATAAGAGAAATTGATAATAGTGTCAATAATAAAT TAGCTGATAAACTTGATAAATCAGAAAAATCAAAGATAGAAGAAAATAAAAATATAGAAAATAACATTAA AGTCTATAATACTAATACGTTGCCACAAGAAAAAGTCAATAATACAGATAAAAGTTCAGGACTAATTGAT TATAGTTTTAACTTAAAAGAACATGATAATCCAACAGGAGTAAAACAGATAAGGGAAAATGCAGAAATTC GTGATAAACGTGTAAAAGTAGAAAAAGCATGGAATGAACTAGTCGCAAGTGGAGGTGGAAGAGTAAAAGA ACAAGCAGGAGGAAAAATAACAGAACGACGTGCAAATGCAGAAAAGGTATGGGATGATTTAGTTAAAAGT GGTGTAGTAAAAGAAAAAAAAGATAATAGTTCTAATGAAAACTCTTAA |