Protein ID: 51473242 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RT0029 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 33268..35928 [-] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q68XX5 |
KEGG ID | rty:RT0029 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.5e-20, Aligned region: 516..710 |
Protein Sequence: 886 a.a. [Download] |
>gi|51473242|ref|YP_066999.1| VirB6-like protein of the type IV secretion system [Rickettsia typhi str. Wilmington] MKILKSLVLLVLFIVMPAKAHDTFSWMSTSFSGLKGLFGCLEVPEFTSFQESNIGINLSKAGTWQSTGHT VEKGKLLKINWSIAGVTTEPRKYLVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTNSNSSIPGAI PPDKELDALSFTKMSDSIKYYARNNVKIEVKAGDVVNISLVSKDNFFTSNTLDNILTEELDSSIFAASAL YTQSNLGNFDNRIIYASAKEVCDIIDPSRDPNKPSGCSGTGATTKYKSINSNEALVGKPMMIGAVHNFMG LINSCPEHSGINTRPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVKSGRNSFIYYQATRNGIMDFTSDWQVNN MFSNSVLMSDWIRRFLNYPSFIDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGANSISSDVQQNINLEYLITYD GTLPDPSIRGTPVDYNFSADAPKDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIVYNGAIKPITDQ FRTFSKNFYIKLIKNSAVQNIAKGSLTLYVIIFGLMFVAGTLKLTAIEVITRICKIAIVAFLIREESWSF FNTYFFSVFTDGIDFFITNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAIITIY SLITYFRAILEVIIGYIIAFIGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLI DQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLSIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEINRSNIFNNNTNT FLVLFTTALLFYVYCLMSYGLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQARSDPVGAVMQDIGSVTTPIKNASM VPARIFKDKIIDQNYKAKKLEGGVEFTNKFFAKRNDVTKKEEGVRE |
Nucleotide Sequence: 2661 bp [Download] |
>gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c35928-33268 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATTGTAATGCCAGCTAAAGCTCATGATACTT TTTCATGGATGTCAACTAGTTTTAGTGGATTAAAAGGCTTATTCGGTTGTTTAGAAGTACCTGAATTTAC AAGTTTTCAAGAAAGTAATATAGGAATTAATTTATCTAAAGCAGGGACTTGGCAATCAACAGGTCATACT GTTGAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAATTGGTCTATTGCAGGTGTTACTACTGAACCTAGAAAATATC TAGTATTATATAGAATTGATCCAAGATTTAGTACACCTCAAGTTTTTATTAAAACTTATAATTATTCGAA ATTACAATTTGAAGCTTTAGGATTCCCTCGTTTTGTTACGAACAGTAACAGTTCAATACCTGGAGCTATA CCACCCGATAAAGAGCTTGATGCACTTTCATTTACTAAAATGTCTGATTCTATAAAATATTATGCTAGAA ATAATGTAAAAATTGAAGTTAAGGCTGGTGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTAGTAAAGATAATTTTTT TACTTCTAATACTCTAGATAATATTTTAACAGAAGAACTTGATAGTTCAATATTTGCTGCTTCTGCACTT TATACTCAAAGTAACCTTGGAAATTTTGATAATAGAATAATTTATGCATCTGCAAAAGAGGTATGTGATA TTATAGATCCTTCAAGAGATCCTAATAAACCAAGTGGATGTAGCGGTACTGGTGCAACTACAAAATATAA AAGTATAAATAGTAATGAAGCATTAGTTGGCAAACCTATGATGATTGGGGCGGTACATAATTTCATGGGA TTAATTAATTCTTGCCCTGAGCACTCCGGTATAAATACTAGACCTGCTTGCTATTATGATCAAGGTAGAG GGATGATAATTAAAGTAGGGGGACAGGTTATTAAGGGACGAGATCAGAGTTTTGTAAAATCAGGCAGAAA TAGCTTTATATATTATCAAGCGACTAGGAATGGTATTATGGATTTTACTAGTGATTGGCAAGTTAATAAT ATGTTTAGTAATTCAGTTTTAATGAGTGATTGGATTAGACGTTTTTTAAATTATCCTAGTTTTATAGATT ATATCAATAAGAATGATTGGTCAGCTAATTTTTTATATTTTGGTCGTTATTCGATGATTGTTGAAATAGG TAATGGGGCTAATTCAATTAGTTCTGATGTCCAACAAAATATAAATTTAGAATATTTAATAACATATGAT GGTACATTACCTGATCCATCTATTCGTGGTACACCGGTAGATTATAATTTTTCAGCTGATGCACCGAAAG ATGGCTATTTATGGTTAAGGGTAGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGTGTGGTTAGTGTAAATTATGC TAATTACACTGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAGTATATAATGGGGCTATTAAACCTATTACGGATCAG TTTAGAACTTTTAGTAAAAATTTTTATATTAAGTTAATTAAAAATTCTGCAGTACAGAATATAGCTAAAG GTTCATTAACTCTTTATGTGATTATATTTGGTCTCATGTTTGTTGCAGGAACATTAAAATTAACTGCTAT AGAAGTAATAACACGTATATGTAAAATAGCTATAGTCGCTTTTTTAATCCGAGAAGAAAGTTGGAGTTTC TTTAATACGTACTTCTTTAGTGTATTTACTGATGGTATTGATTTCTTTATAACTAACGTAGTAGGTGCTA CAAGTTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCTATATTTGATAAATATACTAACGGTAGAATTTG GGGATTACTGTTTATTGAATTATTACAAATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCTATTATAACAATTTAT TCACTTATTACTTATTTTCGAGCTATTTTAGAAGTGATAATAGGTTATATTATTGCATTCATAGGTGTAA CAGTTATGATTTCATTAGCACCATTTTTTATAATATTAATGTTATTTGAAAAAACTAAAAGTTTATTTGA TAATTGGATATCAACATTGTTGAGTTATGTGGTGCAACCAACAATATTATTAATTTTCTTTTTATTGATA GATCAGGTTTTATCGGAGCAACTTTTAAAAGTGGTAGTTAGAGCTTGTTGGGATACTCTTATACCGATAA AAATAGGGCTTGATTTAACAAATCTTAGTATTCCTATCAATTTCTCTTTTACATTACCGTTTTTACCAGG CATACCTTTTTATGTACCTGATGTTCCAGAAATTAATAGATCGAATATTTTTAATAACAATACTAATACT TTCTTAGTATTGTTTACTACGGCTTTATTATTTTATGTATATTGCTTGATGTCATATGGCTTAGTAACCT TTGTTAATATAGTAGTTGGTATGCTTACAAATGTTACACCAGCACGAATATCAGGAAATTATCAAGCGCG TTCTGATCCTGTAGGGGCCGTGATGCAAGATATAGGTTCGGTAACAACACCGATTAAAAATGCTTCAATG GTCCCAGCTAGAATATTTAAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAAAAAATTGGAAGGAGGTG TTGAATTTACAAATAAATTCTTTGCCAAGCGTAATGATGTAACGAAGAAAGAGGAAGGAGTGAGGGAATA A |