| Protein ID: 189183679 |
 T4SS name [ID] | VirB [507] |
| Gene symbol | virB6 |
| Locus tag | OTT_0772 |
| Strain | Orientia tsutsugamushi str. Ikeda |
| Replicon | chromosome [GenBank: NC_010793] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
| Location [Strand] | 804456..808343 [+] |
| Product | type IV secretion system protein VirB6 |
| Component type | VirB6 |
| UniProt ID | B3CRT1 |
| KEGG ID | ott:OTT_0772 |
| PDB ID | NA |
| Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.7e-18, Aligned region: 880..972 |
| Protein Sequence: 1295 a.a. [Download] |
| >gi|189183679|ref|YP_001937464.1| type IV secretion system protein VirB6 [Orientia tsutsugamushi str. Ikeda] MIKHLLYNFRVVINNHSVLKALKEAICSVLLLVIVLPSIAYAGKDCCSKQKNKLRCCTYDQQFCYPLVRS ECIKKEELRYQNPDILQEKIQLLESSAKQAWNNAQNHQFSSNIEKLNAVTNAGAKTREIISLSEQLKKAL VNEGNARWAAFKIEKGKTNGGKLSKDKDFQQHKSLLNEQKAALKLAQKFGNNASGQYKVIKASARDLVLV AGLDFWNALLLYKKIDDELDSKVRNGADKKSILIAKKKVLYEIEKVLKAFVEGRDMYNKFVEWVIGYSDI TEAKEKGAIEFLLQNLSYSTVMRSASFETTLKAVIEIYKNGDFINELKLQNESVKTDIAEIERSIQVAED EMKRKQEEEEAKKLLEFQNKVKKAKEEVDAAKDKFKEKQTQAQEAYDQANASGDLEDKIEALNKKKKEYE AAKKYKEALDKAIDIGNNNPDLVRERDSLGNDIDNLSQSIDQMTDDVNRDKEIYKQQFEEDKNSSVSANC DFSQYRSISPESSVFTLASFVYQNINFKCGNVCNTADKGFNLCLKVKKSDLCRDCIPIYIGPQSEFKSIR KLFDTSGVKKGRRDPILVTENAVKNIGFKVEHTDKISCLKIKTSYGDIPIVCKNISADIDLIPQARSNNR ICSLSTTKSRVPFNFSGRAIGCLKEALDKMFYADSITHDQVSSASILKPLSSFQRGMTLTVKAALMLYII FFGIKMIFVKRFFSLERLVTGVLQILIVMYFSVGLGPMTNKDGKISYNNGMQDHFLPFLSSVTSELAHMV FSSVGSDSAVGGTKLCYFDPNKDYTPDARYYALWDAIDCRIGYYLGFRLLHNYTVDRSKPSLGGKLVGSS IGTSANDDITKHLSNIKDGHALKKDDTFLVFPTLWGLLLSGEIIFFLVMLLFVIIFLTLFWRFMAVFITS LVNLYVMCYISPIFIPMVLFEKTKSMFNNWLHLTLSFALQPAIVAAFIALFVTLMDSITYKTCQFARYDY QQGNKILSTFELRVPDRYIQDHGLFDDAYNSDAAKICRESAGYRLVEYFNGKNWHQRIFLFFKAFVVYPE PDFLPTMIVVLLFCGIFYYFFQEAHRFAAVITSGITAVNMELPSLRIPSFRNKSTRTKGGKDDKEEEASD KFSSRGGIDKTATDKISSRSNIESSAQDKISTGLKSNGISGVKHGLKKDHDAIRAAKKFDISNNDEVIGA DKFSTSGNKQADKLSSENIKPRDTSVVSAEDKFSTSFKLKDHKDIVQSEIDKKLESNVSDKSNSTSSNQT IETRKSNIESDALSKKIDAKDLNEINKGSDDKKNI |
| Nucleotide Sequence: 3888 bp [Download] |
| >gi|189182907|ref|NC_010793.1|:804456-808343 Orientia tsutsugamushi str. Ikeda, complete genome ATGATAAAGCATTTACTATATAACTTTAGGGTAGTAATTAACAATCATTCTGTTCTTAAAGCTCTTAAAG AGGCAATTTGTAGTGTATTGTTGCTAGTTATTGTACTGCCATCCATTGCTTACGCTGGAAAAGATTGCTG TAGTAAGCAGAAGAATAAGCTTAGATGTTGTACCTATGATCAACAATTTTGTTATCCATTAGTAAGGTCC GAATGTATCAAAAAAGAAGAATTACGTTATCAGAATCCTGATATATTACAAGAAAAGATACAGTTACTTG AATCTTCAGCTAAGCAAGCATGGAATAATGCTCAAAATCATCAATTTTCATCGAATATAGAAAAACTTAA TGCTGTAACTAATGCTGGTGCTAAAACTAGAGAGATCATTAGTTTATCTGAACAATTGAAAAAAGCTTTA GTAAATGAAGGTAATGCTAGGTGGGCTGCGTTTAAGATAGAAAAAGGTAAAACTAATGGTGGTAAATTAA GTAAAGATAAAGATTTTCAGCAACACAAATCATTACTAAATGAGCAAAAAGCTGCATTAAAATTAGCTCA AAAATTTGGTAACAATGCTTCAGGGCAATATAAGGTAATTAAAGCTAGCGCTAGAGATTTAGTATTAGTT GCTGGATTGGACTTTTGGAATGCGTTGTTACTATACAAAAAAATTGATGATGAGTTAGACTCGAAAGTGA GAAATGGTGCTGATAAGAAAAGTATATTAATTGCAAAAAAGAAAGTGCTTTATGAAATAGAAAAAGTTTT GAAAGCTTTTGTAGAAGGAAGAGATATGTACAATAAATTTGTAGAATGGGTTATAGGTTATTCTGATATA ACAGAAGCAAAAGAAAAAGGCGCTATTGAGTTTTTATTACAAAATCTGAGCTATAGTACAGTAATGAGAT CAGCCTCATTTGAGACCACTTTGAAAGCAGTAATAGAGATATATAAAAATGGTGATTTTATCAATGAATT AAAACTTCAAAATGAAAGTGTAAAAACTGATATTGCTGAAATAGAGCGTAGCATACAAGTTGCTGAAGAT GAGATGAAGAGAAAACAGGAAGAGGAAGAAGCTAAAAAATTATTAGAGTTTCAAAATAAAGTTAAAAAAG CTAAAGAAGAAGTTGATGCTGCTAAAGATAAATTTAAAGAAAAACAGACTCAAGCTCAGGAAGCTTATGA TCAAGCTAATGCTAGTGGAGATTTAGAAGATAAAATTGAAGCTCTAAATAAAAAGAAAAAAGAGTATGAA GCTGCTAAAAAATATAAGGAGGCTTTGGACAAAGCAATTGATATTGGTAACAACAATCCTGATTTAGTTA GAGAGCGTGATAGTTTAGGAAATGATATAGATAATTTATCTCAAAGTATTGATCAGATGACAGATGATGT TAATAGAGATAAAGAGATATATAAGCAACAATTTGAAGAAGATAAAAATTCATCAGTTAGTGCAAACTGT GATTTTAGCCAGTATAGAAGCATCTCTCCTGAAAGCAGCGTTTTTACTTTAGCTTCTTTTGTATATCAAA ATATTAATTTTAAGTGTGGAAATGTATGTAATACTGCAGATAAGGGATTTAATCTTTGTTTAAAGGTTAA AAAGTCAGATCTGTGTAGAGATTGTATTCCAATATATATTGGTCCGCAATCTGAATTTAAGTCTATTAGG AAGTTATTTGATACTAGTGGAGTAAAGAAAGGTAGAAGAGATCCTATACTAGTAACTGAAAATGCAGTAA AAAATATTGGATTTAAGGTTGAACATACTGATAAAATTTCTTGTTTAAAAATCAAAACATCTTATGGAGA TATTCCTATAGTCTGTAAAAATATTAGTGCTGATATTGATTTAATACCTCAAGCTAGGAGTAATAATAGA ATTTGTAGTTTAAGTACTACAAAAAGTAGAGTGCCTTTTAATTTTTCTGGTAGAGCTATAGGTTGTTTAA AAGAAGCATTGGATAAGATGTTTTATGCTGATTCAATTACTCATGATCAGGTATCTTCTGCTAGTATATT GAAGCCTCTTTCAAGCTTTCAGCGTGGTATGACATTAACTGTTAAAGCTGCTTTAATGTTATACATAATA TTTTTTGGCATCAAAATGATATTTGTTAAGCGTTTTTTTAGCCTAGAGAGATTAGTTACTGGAGTATTAC AGATACTAATTGTAATGTATTTTTCTGTTGGGCTAGGTCCAATGACTAATAAAGATGGGAAAATAAGTTA TAATAACGGTATGCAAGATCATTTTTTGCCATTTTTAAGTTCAGTTACCTCAGAATTAGCTCATATGGTA TTTTCATCTGTTGGTAGTGATTCTGCTGTTGGCGGTACTAAATTATGTTATTTTGATCCTAACAAAGATT ATACACCTGATGCTCGTTATTATGCATTATGGGATGCAATAGATTGTAGAATAGGATATTACTTAGGTTT TAGATTATTACATAATTATACTGTAGATAGGTCAAAGCCATCACTTGGTGGTAAGTTAGTTGGATCATCT ATTGGAACTAGCGCTAATGATGATATTACCAAGCATTTGAGTAATATTAAGGATGGTCATGCACTTAAGA AAGATGATACTTTCTTAGTATTTCCTACTTTGTGGGGACTGTTATTAAGTGGTGAAATTATCTTTTTCTT GGTAATGCTACTGTTTGTTATAATCTTTTTAACGTTATTTTGGAGGTTTATGGCTGTATTTATTACTAGT TTAGTAAATTTATATGTCATGTGCTATATATCTCCTATTTTTATTCCTATGGTATTGTTTGAAAAGACAA AATCAATGTTTAATAATTGGTTACATTTGACATTATCTTTTGCATTACAGCCTGCAATTGTTGCAGCATT CATTGCGTTATTTGTGACTTTAATGGATTCAATAACGTATAAAACATGTCAATTTGCAAGGTATGATTAT CAGCAAGGGAATAAAATTTTGAGTACTTTTGAGCTTCGTGTACCTGATCGTTATATTCAAGACCATGGCC TCTTTGATGATGCGTATAATAGTGATGCTGCTAAAATATGTAGAGAGAGTGCTGGATATAGGTTAGTAGA ATATTTTAATGGAAAAAATTGGCATCAAAGAATATTTCTTTTCTTTAAAGCATTTGTAGTATATCCTGAA CCAGATTTTTTACCTACTATGATTGTTGTATTACTATTTTGTGGAATTTTTTATTACTTCTTTCAGGAAG CACATAGGTTTGCGGCAGTTATTACTAGTGGTATTACTGCTGTAAATATGGAGTTACCAAGCTTAAGAAT TCCTAGCTTTAGGAATAAGAGCACTAGAACCAAAGGTGGTAAAGATGATAAAGAAGAAGAGGCAAGTGAT AAGTTTAGCTCTAGAGGTGGTATAGATAAAACTGCTACAGATAAAATTAGCAGTCGGTCTAACATCGAAT CATCAGCTCAGGATAAAATTAGTACTGGATTAAAAAGTAATGGTATTAGTGGCGTTAAACATGGCTTAAA AAAAGATCATGATGCTATTAGAGCTGCTAAGAAGTTTGACATTAGTAATAATGATGAAGTTATTGGTGCT GATAAGTTTAGTACTAGTGGAAATAAGCAGGCTGATAAGTTAAGTTCTGAAAATATTAAGCCAAGAGATA CTAGTGTAGTTTCTGCAGAAGATAAATTTAGTACTTCTTTTAAACTTAAAGATCATAAAGATATTGTTCA ATCTGAGATTGATAAGAAACTAGAATCTAATGTTAGCGATAAGAGTAATAGTACTAGCAGTAATCAAACC ATCGAAACAAGAAAGAGTAATATTGAATCTGATGCCTTATCAAAAAAGATCGATGCTAAGGATTTAAATG AGATTAATAAAGGTAGTGATGATAAGAAAAACATCTAA |