Protein ID: 157803289 |
T4SS name [ID] | VirB [491] |
Gene symbol | - |
Locus tag | A1E_00515 |
Strain | Rickettsia canadensis str. McKiel |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_009879] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 120164..123070 [+] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | A8EXH0 |
KEGG ID | rcm:A1E_00515 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 9.8e-31, Aligned region: 607..846 |
Protein Sequence: 968 a.a. [Download] |
>gi|157803289|ref|YP_001491838.1| VirB6-like protein of the type IV secretion system [Rickettsia canadensis str. McKiel] MQSNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKIGNGCYMRYDADGKGGRDSITDTITLNANANYVYTSK MLSDGTTRLIPDPTRYGEWLNTKVLVENSQSVNLQVVGQVSLCLAYIPQDNVQRTGPGSNLDDNGKMIPI PRVTDSNIPPISLIMDAKNSEWRNIAELYANDRVLVSISPNFIGTEATVNDAFKGTAVTTDCSQGKTSYE PICGKYSFYSGQYVNACELKQNYWQGNQHREPCHCVFGCIYQEAVAKWVCDSANAASHCCLSLVCDSLPA WINHYGTMPESYKDDGSFTFSWSDNLGNLFIDYSNLQCSNNANILPNGKCPDVVSNRSPKDKDYIGGVHC TSGICNDGDFQKHRRFWYTADGKGGKGPTGLIYQMNDTGSVSQALPSNLEFAKFVADSDQLPEYKDKDGK YIYKVIYNIPFNSNIEKSYLQYRLWSPTSQDASKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFNDRGRVQYII VAGSENPNTSGKSYSPQGINVDSDGKANIIANGDGYIWMRILNDSNDYKDSDGNYKVHFSTFLKVGSFTV KVMNPLLQLFKTKVQGAATSIFRNMVCYKASDSSSCTNFFTYIKAILILYVMTYGAMFLLGFTKINQKEL VIRIAKIGVVSGLINGNTFEFFNSYLFDVITGFSDAIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAVMSKIFFS QTFIAQLLALLSLGLSGIIYFIITFIALGIVIVTALRAMAVYIMAFMVTCILIGIAPLFISFLLFDFTRY LFDNWVRFTIRYMIEPVIMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFC INWFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRMVVKLTSAAGPSATGMGEAMYNVAEQKT LSQVGMDAETRKGITGRAESRLKQRNKTLDQAEKNRKHTPQEGGEKTNEEPPKPETLK |
Nucleotide Sequence: 2907 bp [Download] |
>gi|157803189|ref|NC_009879.1|:120164-123070 Rickettsia canadensis str. McKiel, complete genome ATGCAGAGTAACTTGTTAAAAGTTTTAGGAGTACTCGCTATAGTAGCAACGTTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAATCGGTAACGGCTGCTACATGAGATATGACGCAGACGGTAA AGGTGGTAGAGATTCAATAACTGATACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATGTATACACTTCTAAG ATGCTGTCCGACGGTACAACTCGGCTTATTCCTGATCCTACTCGTTACGGTGAATGGTTAAATACTAAGG TGCTAGTAGAAAATAGCCAATCGGTGAATTTACAAGTCGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATAT ACCACAAGATAATGTCCAACGTACTGGACCTGGATCTAATTTAGATGATAACGGTAAAATGATTCCGATC CCTCGTGTCACCGATTCAAATATTCCTCCTATCTCTCTAATAATGGATGCCAAAAATAGTGAGTGGCGTA ATATTGCCGAATTATACGCCAATGATAGAGTTTTAGTTTCCATATCTCCTAATTTTATCGGTACAGAGGC AACAGTTAATGATGCCTTTAAAGGTACTGCGGTCACGACAGATTGTTCACAAGGCAAAACTTCTTATGAG CCGATTTGTGGAAAATATTCTTTTTATTCTGGTCAATATGTTAATGCTTGTGAATTGAAACAAAATTATT GGCAAGGTAATCAGCATAGGGAACCATGTCATTGTGTTTTTGGATGTATTTATCAAGAAGCAGTTGCTAA GTGGGTATGTGATTCTGCTAATGCAGCTTCTCATTGTTGTCTTAGTTTGGTATGTGACTCCCTACCTGCT TGGATAAATCACTATGGCACAATGCCAGAATCTTATAAAGACGATGGTAGTTTTACCTTTAGTTGGTCAG ATAATTTGGGTAATTTATTTATTGATTATTCAAATCTTCAATGTTCCAATAATGCTAATATTTTACCGAA TGGTAAATGTCCTGATGTTGTCTCTAATCGTAGTCCTAAAGATAAAGATTATATTGGAGGTGTACATTGT ACTTCAGGAATATGTAACGATGGAGATTTTCAAAAGCATCGGAGATTTTGGTATACAGCGGATGGTAAAG GAGGTAAAGGACCAACTGGATTAATATATCAAATGAATGATACGGGTTCTGTAAGTCAAGCTTTGCCTTC TAATCTAGAATTTGCTAAGTTTGTTGCAGATTCAGATCAACTGCCTGAATATAAAGATAAAGACGGTAAA TATATATATAAAGTTATATATAATATACCTTTTAACAGCAATATTGAAAAAAGTTATTTACAATATAGAC TTTGGTCTCCCACCTCACAAGATGCTAGTAAGAATACGGGTGGATATGTTCTAAATATTAAACAGACTAA ATGTTATAGAGAGAACGGTAATAGTTTTAATGATACTTTTAATGATCGGGGACGAGTGCAATACATAATA GTAGCTGGTTCAGAAAACCCGAATACTAGCGGTAAATCTTATTCACCTCAAGGAATTAACGTTGATAGTG ATGGTAAAGCTAACATTATTGCAAATGGAGATGGTTATATATGGATGAGAATTCTAAACGATTCTAATGA TTATAAAGATAGTGATGGTAACTATAAAGTACATTTCTCAACATTCTTAAAAGTAGGAAGTTTTACTGTT AAAGTAATGAATCCATTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTGCAAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAGAA ATATGGTATGTTATAAAGCTAGTGATAGCTCGTCCTGTACTAATTTTTTTACTTATATTAAAGCGATTTT AATTCTGTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTCTTGCTCGGCTTTACTAAGATAAACCAAAAAGAGCTA GTAATTAGAATAGCAAAAATTGGAGTAGTTAGCGGACTTATAAACGGTAATACTTTTGAGTTTTTTAATA GCTATCTTTTTGATGTAATTACCGGTTTTTCAGATGCAATTATTGCTAATATGAGTGGGTATAGTTTGTT TACTTCTACTAATACTATTTCTAATCCTTTTATGTTTTTAGATGCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGT CAAACATTTATTGCTCAATTACTTGCACTTCTTTCTCTTGGGCTGAGCGGTATTATATATTTTATAATTA CTTTTATTGCGCTTGGTATAGTAATTGTTACAGCACTTAGAGCTATGGCCGTTTATATTATGGCATTTAT GGTAACTTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTTATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTAT TTATTTGATAATTGGGTAAGGTTTACAATCCGCTATATGATAGAACCGGTAATTATGATGGCGGGTATTA TAGTACTAACACAGCTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTTAGGTTATAGTGTTTGTTGGAAATGTGC TTTACCGATAAAAATTCCATTTATCGGGACTATTTTACCTATTGCATTATTGAATGTACCGATCTTCTGT ATTAATTGGTTTGCCCCTTGGGGGATGGATTATATGTCAGGTATGATGGGAGTGAATATGCAAAATATCG TAGCTTTAGTTATTATTGCTTATGGTATGTACGGTTACGTCGAATTTTCAGGACGTATGGTAGTAAAATT AACTAGTGCTGCCGGACCTTCAGCTACTGGTATGGGCGAAGCAATGTATAATGTTGCAGAACAGAAAACG TTGAGTCAAGTAGGAATGGATGCCGAGACAAGAAAAGGTATTACTGGCAGAGCGGAATCACGATTGAAAC AACGCAATAAAACATTAGATCAAGCTGAGAAAAACAGAAAACATACGCCGCAAGAAGGAGGTGAAAAGAC AAATGAAGAACCGCCTAAACCTGAAACACTGAAATAA |